Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RB35

Protein Details
Accession F4RB35    Localization Confidence Low Confidence Score 5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
106-125NIISKPSKKTAKARNTQSCIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR015350  Beta-trefoil_DNA-bd_dom  
IPR036358  BTD_sf  
IPR040159  CLS_fam  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
IPR015351  RBP-J/Cbf11/Cbf12_DNA-bd  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0001228  F:DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0000978  F:RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_94461  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09270  BTD  
PF09271  LAG1-DNAbind  
Amino Acid Sequences MSTSTVRITGPYRQLPKYTRPILSMSILNEEGDRHLSQTAYLGEEESSVHFKSLHISGAAKKAKHVTLELSLHPPSNSPNHNIHGLGPDVNELALPFATFTSNECNIISKPSKKTAKARNTQSCIFNGSTICLFNRINSQTVRTKYLCVEQDQLAARASQWSAFTINVVRRAEDAGRDGSPPLATKTLLSSSIPGADRTVTYGSEVELIDFVTGVSSGPLVVRKVEKNKVQKDATGPISQMQKLAFCKVDRNDGSAIYVSALEPGRFPSPPELGSPFEMSGGNESNGMSYGQTCQPAPPPALHALQYQAPRATLPPEERGGMTLDEIDDSVAWTVIGVAHFSHTFFDLSQIYPQIPHEPITPLPVIISRPEIELEAMTLTMSLTGFFDAEARPMEIWMGPIGPLPVNVIGTTGITLASEHATTGGGVRLQMNDRSRQETILVVSLPAIEMMYWTLHGKEMKAGTMIVLDESNKMIGELIGKRADSVETAIPTLPLTVIRPDGMSSVMAYSICLVENESGHSSLQHHQLSGFGSDGSHTNGNAEDERSSVGPVCILKVI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.59
3 0.65
4 0.67
5 0.66
6 0.61
7 0.57
8 0.57
9 0.53
10 0.51
11 0.46
12 0.37
13 0.34
14 0.31
15 0.29
16 0.25
17 0.22
18 0.2
19 0.2
20 0.19
21 0.15
22 0.16
23 0.15
24 0.15
25 0.18
26 0.18
27 0.16
28 0.16
29 0.15
30 0.14
31 0.14
32 0.15
33 0.13
34 0.15
35 0.13
36 0.14
37 0.13
38 0.13
39 0.17
40 0.18
41 0.18
42 0.17
43 0.19
44 0.23
45 0.32
46 0.38
47 0.34
48 0.35
49 0.39
50 0.4
51 0.4
52 0.38
53 0.33
54 0.35
55 0.39
56 0.38
57 0.37
58 0.35
59 0.34
60 0.32
61 0.28
62 0.24
63 0.28
64 0.29
65 0.29
66 0.33
67 0.35
68 0.37
69 0.37
70 0.35
71 0.3
72 0.28
73 0.25
74 0.2
75 0.18
76 0.15
77 0.14
78 0.12
79 0.09
80 0.08
81 0.07
82 0.06
83 0.06
84 0.06
85 0.07
86 0.07
87 0.09
88 0.14
89 0.16
90 0.17
91 0.17
92 0.19
93 0.19
94 0.27
95 0.32
96 0.32
97 0.36
98 0.44
99 0.52
100 0.56
101 0.65
102 0.68
103 0.72
104 0.74
105 0.8
106 0.81
107 0.79
108 0.78
109 0.72
110 0.63
111 0.57
112 0.48
113 0.39
114 0.29
115 0.25
116 0.21
117 0.19
118 0.17
119 0.17
120 0.16
121 0.15
122 0.22
123 0.22
124 0.25
125 0.25
126 0.3
127 0.33
128 0.36
129 0.41
130 0.34
131 0.35
132 0.33
133 0.39
134 0.37
135 0.33
136 0.34
137 0.28
138 0.33
139 0.32
140 0.31
141 0.24
142 0.21
143 0.18
144 0.16
145 0.16
146 0.12
147 0.11
148 0.11
149 0.12
150 0.11
151 0.12
152 0.15
153 0.17
154 0.22
155 0.22
156 0.21
157 0.21
158 0.23
159 0.23
160 0.2
161 0.2
162 0.16
163 0.16
164 0.17
165 0.16
166 0.15
167 0.14
168 0.14
169 0.13
170 0.12
171 0.11
172 0.11
173 0.13
174 0.14
175 0.14
176 0.14
177 0.13
178 0.12
179 0.17
180 0.17
181 0.15
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.14
186 0.14
187 0.1
188 0.1
189 0.1
190 0.1
191 0.11
192 0.11
193 0.09
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.06
198 0.06
199 0.03
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.06
207 0.06
208 0.08
209 0.11
210 0.16
211 0.22
212 0.29
213 0.36
214 0.44
215 0.49
216 0.55
217 0.53
218 0.51
219 0.49
220 0.48
221 0.45
222 0.37
223 0.31
224 0.27
225 0.29
226 0.27
227 0.24
228 0.18
229 0.18
230 0.17
231 0.2
232 0.18
233 0.16
234 0.21
235 0.21
236 0.29
237 0.27
238 0.29
239 0.27
240 0.25
241 0.25
242 0.2
243 0.18
244 0.1
245 0.1
246 0.07
247 0.08
248 0.09
249 0.07
250 0.07
251 0.09
252 0.1
253 0.1
254 0.11
255 0.12
256 0.13
257 0.14
258 0.15
259 0.16
260 0.16
261 0.18
262 0.18
263 0.14
264 0.14
265 0.13
266 0.11
267 0.1
268 0.1
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.07
273 0.07
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.07
278 0.08
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.13
283 0.15
284 0.15
285 0.14
286 0.15
287 0.17
288 0.18
289 0.18
290 0.16
291 0.15
292 0.18
293 0.19
294 0.18
295 0.15
296 0.14
297 0.14
298 0.14
299 0.14
300 0.14
301 0.15
302 0.16
303 0.17
304 0.18
305 0.17
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.11
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.06
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.04
323 0.04
324 0.04
325 0.04
326 0.06
327 0.06
328 0.07
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.12
337 0.12
338 0.11
339 0.11
340 0.12
341 0.14
342 0.13
343 0.14
344 0.14
345 0.15
346 0.16
347 0.19
348 0.18
349 0.14
350 0.14
351 0.14
352 0.13
353 0.12
354 0.14
355 0.11
356 0.12
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.1
361 0.09
362 0.07
363 0.06
364 0.05
365 0.05
366 0.04
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.08
378 0.08
379 0.08
380 0.08
381 0.09
382 0.08
383 0.09
384 0.08
385 0.07
386 0.06
387 0.07
388 0.08
389 0.08
390 0.07
391 0.08
392 0.09
393 0.09
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.07
398 0.08
399 0.06
400 0.05
401 0.05
402 0.05
403 0.05
404 0.06
405 0.06
406 0.06
407 0.06
408 0.06
409 0.06
410 0.07
411 0.08
412 0.07
413 0.08
414 0.09
415 0.11
416 0.13
417 0.19
418 0.22
419 0.28
420 0.31
421 0.35
422 0.35
423 0.34
424 0.32
425 0.29
426 0.27
427 0.23
428 0.2
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.12
433 0.09
434 0.07
435 0.04
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.08
442 0.11
443 0.13
444 0.13
445 0.17
446 0.18
447 0.18
448 0.18
449 0.18
450 0.15
451 0.15
452 0.15
453 0.1
454 0.1
455 0.1
456 0.1
457 0.1
458 0.1
459 0.09
460 0.09
461 0.08
462 0.08
463 0.12
464 0.14
465 0.18
466 0.2
467 0.2
468 0.2
469 0.2
470 0.21
471 0.16
472 0.17
473 0.17
474 0.15
475 0.17
476 0.17
477 0.16
478 0.16
479 0.15
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.15
489 0.15
490 0.13
491 0.11
492 0.1
493 0.11
494 0.1
495 0.09
496 0.1
497 0.09
498 0.09
499 0.09
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.15
504 0.16
505 0.16
506 0.16
507 0.18
508 0.19
509 0.23
510 0.31
511 0.28
512 0.26
513 0.25
514 0.28
515 0.28
516 0.27
517 0.22
518 0.14
519 0.12
520 0.13
521 0.14
522 0.16
523 0.16
524 0.14
525 0.15
526 0.16
527 0.2
528 0.21
529 0.21
530 0.17
531 0.17
532 0.19
533 0.18
534 0.18
535 0.17
536 0.15
537 0.17
538 0.17