Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4S9M0

Protein Details
Accession F4S9M0    Localization Confidence High Confidence Score 23.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-36MSKTKTETKKADKSAGRKKPSKSASPNNSNNKKLKEHydrophilic
284-311WLGNNRKFRKDWKPRVAREKHNQPKSEEHydrophilic
382-403VETISMPKSKNQPKKKKARKSTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
9-26KKADKSAGRKKPSKSASP
290-302KFRKDWKPRVARE
389-403KSKNQPKKKKARKST
Subcellular Location(s) nucl 26.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_45973  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSKTKTETKKADKSAGRKKPSKSASPNNSNNKKLKEHEAAEPASDIKAPTGSKPDVSSEVSSSKSKSTKPVKSALKKSDSHTEKLPNSLKKKSSKVQIKESSEFASISKETKPSTPKTKSTKSPVRVEQQVTEDLEDASLLTGFEIESAEGDDDSSDDDDDEESLPETSAFDLKDLPKASKRQKSCGKGDDASIDNTGVVYLGRIPHGFHEEEMKGYFSQFGEIRRVRLSRNRRTGKSKHYGFIEFKHKEVAEIVAETLHNYLLCGNMLQCQLLEKDEIHPRLWLGNNRKFRKDWKPRVAREKHNQPKSEEQQRVITDRLIERETLKRKRLETLGISYDYPGYCSSKDSSKPAKSIDKPEASATKTTTSTQDSSDKSKTEGVETISMPKSKNQPKKKKARKST
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.82
3 0.82
4 0.8
5 0.78
6 0.79
7 0.79
8 0.79
9 0.79
10 0.79
11 0.8
12 0.83
13 0.87
14 0.88
15 0.89
16 0.86
17 0.84
18 0.79
19 0.75
20 0.7
21 0.69
22 0.67
23 0.62
24 0.62
25 0.61
26 0.56
27 0.5
28 0.46
29 0.37
30 0.29
31 0.26
32 0.19
33 0.12
34 0.15
35 0.15
36 0.17
37 0.23
38 0.24
39 0.25
40 0.27
41 0.29
42 0.29
43 0.32
44 0.31
45 0.27
46 0.28
47 0.29
48 0.29
49 0.27
50 0.3
51 0.31
52 0.31
53 0.38
54 0.45
55 0.51
56 0.54
57 0.62
58 0.67
59 0.72
60 0.79
61 0.78
62 0.76
63 0.71
64 0.7
65 0.71
66 0.65
67 0.58
68 0.55
69 0.54
70 0.48
71 0.53
72 0.57
73 0.55
74 0.56
75 0.61
76 0.62
77 0.61
78 0.67
79 0.66
80 0.68
81 0.7
82 0.71
83 0.74
84 0.76
85 0.75
86 0.7
87 0.65
88 0.58
89 0.49
90 0.42
91 0.31
92 0.26
93 0.19
94 0.18
95 0.19
96 0.18
97 0.18
98 0.24
99 0.29
100 0.32
101 0.42
102 0.47
103 0.53
104 0.59
105 0.66
106 0.69
107 0.73
108 0.76
109 0.72
110 0.74
111 0.73
112 0.7
113 0.69
114 0.64
115 0.57
116 0.5
117 0.47
118 0.39
119 0.32
120 0.26
121 0.19
122 0.16
123 0.12
124 0.09
125 0.06
126 0.05
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.05
137 0.04
138 0.05
139 0.04
140 0.04
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.06
148 0.06
149 0.06
150 0.06
151 0.06
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.07
157 0.07
158 0.07
159 0.09
160 0.1
161 0.15
162 0.16
163 0.18
164 0.21
165 0.29
166 0.37
167 0.42
168 0.44
169 0.49
170 0.57
171 0.62
172 0.64
173 0.62
174 0.58
175 0.52
176 0.5
177 0.44
178 0.36
179 0.3
180 0.24
181 0.18
182 0.12
183 0.11
184 0.1
185 0.06
186 0.04
187 0.03
188 0.04
189 0.04
190 0.05
191 0.06
192 0.06
193 0.07
194 0.11
195 0.11
196 0.1
197 0.14
198 0.14
199 0.14
200 0.15
201 0.15
202 0.12
203 0.12
204 0.13
205 0.08
206 0.1
207 0.11
208 0.12
209 0.19
210 0.2
211 0.21
212 0.23
213 0.25
214 0.25
215 0.33
216 0.42
217 0.44
218 0.54
219 0.59
220 0.61
221 0.69
222 0.73
223 0.73
224 0.74
225 0.67
226 0.61
227 0.57
228 0.57
229 0.51
230 0.5
231 0.5
232 0.41
233 0.38
234 0.38
235 0.34
236 0.29
237 0.27
238 0.23
239 0.13
240 0.13
241 0.12
242 0.09
243 0.09
244 0.09
245 0.09
246 0.07
247 0.06
248 0.05
249 0.06
250 0.05
251 0.06
252 0.06
253 0.06
254 0.09
255 0.1
256 0.1
257 0.09
258 0.1
259 0.11
260 0.11
261 0.12
262 0.09
263 0.14
264 0.21
265 0.24
266 0.23
267 0.23
268 0.22
269 0.25
270 0.29
271 0.33
272 0.35
273 0.42
274 0.51
275 0.56
276 0.6
277 0.58
278 0.61
279 0.65
280 0.67
281 0.69
282 0.7
283 0.76
284 0.8
285 0.88
286 0.89
287 0.88
288 0.87
289 0.87
290 0.87
291 0.85
292 0.81
293 0.75
294 0.77
295 0.75
296 0.75
297 0.69
298 0.61
299 0.6
300 0.58
301 0.56
302 0.47
303 0.4
304 0.34
305 0.31
306 0.32
307 0.27
308 0.25
309 0.25
310 0.32
311 0.4
312 0.44
313 0.48
314 0.5
315 0.51
316 0.57
317 0.58
318 0.56
319 0.52
320 0.5
321 0.49
322 0.45
323 0.43
324 0.37
325 0.36
326 0.28
327 0.24
328 0.19
329 0.17
330 0.15
331 0.18
332 0.2
333 0.25
334 0.29
335 0.36
336 0.44
337 0.48
338 0.52
339 0.55
340 0.63
341 0.62
342 0.66
343 0.67
344 0.63
345 0.59
346 0.61
347 0.6
348 0.53
349 0.5
350 0.44
351 0.39
352 0.34
353 0.34
354 0.33
355 0.32
356 0.31
357 0.32
358 0.36
359 0.36
360 0.41
361 0.44
362 0.41
363 0.38
364 0.41
365 0.38
366 0.35
367 0.35
368 0.32
369 0.32
370 0.32
371 0.36
372 0.36
373 0.38
374 0.35
375 0.37
376 0.43
377 0.49
378 0.59
379 0.63
380 0.69
381 0.78
382 0.88
383 0.93