Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4S878

Protein Details
Accession F4S878    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
317-342NGLDHKGSQKKRGSQNNRRKRPIVVDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
326-336KKRGSQNNRRK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 14, cyto 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR026846  Nse2(Mms21)  
IPR004181  Znf_MIZ  
IPR001841  Znf_RING  
IPR013083  Znf_RING/FYVE/PHD  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0030915  C:Smc5-Smc6 complex  
GO:0019789  F:SUMO transferase activity  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
GO:0000724  P:double-strand break repair via homologous recombination  
GO:0016925  P:protein sumoylation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_112952  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF11789  zf-Nse  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50089  ZF_RING_2  
PS51044  ZF_SP_RING  
Amino Acid Sequences MAPSYPNLEKWLETGILPDLSTESRTIKDYMKKIEPDNLQTKLDNRMTETKLKTLINETLSEIRDLKGPFESLIDLGCGLVECEETDQEILQVNQEVLDLIETIKVLEIRKDVLSDLRETIYHFDQQDQDQDQQHHQTPPDLNREFKKQFENKLVDWNSLSTRKKFATHPSFKEFRKAIWTARGTSDVMPPVKSYLPIEEGDSDDDSDDEELAIGGGTQTYKCPLCIKFLTNPYRSKLCRHAFCQTCFDQHFIQNNSTVVGCPQSGCHQSLTRNDVELDERFMAEIKRAKRRIERQEAEAEEEEEEEEEEENQEDGNGLDHKGSQKKRGSQNNRRKRPIVVDDEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.16
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.16
10 0.15
11 0.16
12 0.19
13 0.21
14 0.26
15 0.33
16 0.38
17 0.45
18 0.5
19 0.53
20 0.54
21 0.6
22 0.58
23 0.58
24 0.59
25 0.55
26 0.49
27 0.46
28 0.45
29 0.46
30 0.44
31 0.37
32 0.35
33 0.39
34 0.41
35 0.47
36 0.48
37 0.43
38 0.44
39 0.43
40 0.4
41 0.37
42 0.38
43 0.32
44 0.31
45 0.3
46 0.3
47 0.3
48 0.3
49 0.26
50 0.21
51 0.24
52 0.23
53 0.21
54 0.18
55 0.18
56 0.16
57 0.17
58 0.17
59 0.12
60 0.12
61 0.11
62 0.08
63 0.07
64 0.07
65 0.06
66 0.05
67 0.05
68 0.04
69 0.04
70 0.05
71 0.06
72 0.06
73 0.07
74 0.07
75 0.07
76 0.08
77 0.08
78 0.08
79 0.09
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.07
84 0.06
85 0.06
86 0.05
87 0.05
88 0.05
89 0.05
90 0.05
91 0.06
92 0.08
93 0.08
94 0.1
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.13
99 0.13
100 0.16
101 0.17
102 0.16
103 0.17
104 0.15
105 0.15
106 0.16
107 0.18
108 0.16
109 0.18
110 0.17
111 0.17
112 0.19
113 0.2
114 0.24
115 0.23
116 0.24
117 0.24
118 0.26
119 0.26
120 0.28
121 0.3
122 0.28
123 0.25
124 0.27
125 0.28
126 0.31
127 0.37
128 0.35
129 0.35
130 0.35
131 0.43
132 0.4
133 0.39
134 0.43
135 0.39
136 0.43
137 0.48
138 0.49
139 0.42
140 0.49
141 0.48
142 0.4
143 0.35
144 0.31
145 0.26
146 0.29
147 0.3
148 0.22
149 0.25
150 0.25
151 0.27
152 0.29
153 0.36
154 0.4
155 0.45
156 0.49
157 0.52
158 0.56
159 0.54
160 0.58
161 0.48
162 0.38
163 0.36
164 0.33
165 0.29
166 0.31
167 0.33
168 0.27
169 0.28
170 0.29
171 0.24
172 0.23
173 0.23
174 0.19
175 0.18
176 0.17
177 0.15
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.13
182 0.11
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.13
187 0.13
188 0.14
189 0.13
190 0.12
191 0.09
192 0.09
193 0.08
194 0.07
195 0.06
196 0.04
197 0.04
198 0.03
199 0.03
200 0.03
201 0.03
202 0.02
203 0.03
204 0.03
205 0.04
206 0.04
207 0.07
208 0.07
209 0.09
210 0.13
211 0.14
212 0.2
213 0.23
214 0.26
215 0.3
216 0.39
217 0.46
218 0.47
219 0.5
220 0.48
221 0.52
222 0.51
223 0.49
224 0.5
225 0.51
226 0.51
227 0.52
228 0.58
229 0.57
230 0.59
231 0.6
232 0.51
233 0.49
234 0.44
235 0.42
236 0.35
237 0.34
238 0.38
239 0.34
240 0.34
241 0.3
242 0.29
243 0.27
244 0.24
245 0.19
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.09
250 0.1
251 0.15
252 0.17
253 0.19
254 0.22
255 0.23
256 0.28
257 0.34
258 0.38
259 0.34
260 0.32
261 0.31
262 0.29
263 0.29
264 0.26
265 0.23
266 0.19
267 0.17
268 0.16
269 0.17
270 0.16
271 0.18
272 0.23
273 0.26
274 0.35
275 0.4
276 0.47
277 0.55
278 0.65
279 0.71
280 0.76
281 0.74
282 0.69
283 0.74
284 0.69
285 0.65
286 0.56
287 0.46
288 0.35
289 0.31
290 0.25
291 0.17
292 0.15
293 0.09
294 0.08
295 0.08
296 0.08
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.09
304 0.1
305 0.09
306 0.1
307 0.13
308 0.2
309 0.29
310 0.34
311 0.4
312 0.47
313 0.56
314 0.66
315 0.74
316 0.79
317 0.81
318 0.87
319 0.9
320 0.92
321 0.91
322 0.84
323 0.81
324 0.79
325 0.78
326 0.76