Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PFN8

Protein Details
Accession A0A1D8PFN8    Localization Confidence High Confidence Score 15.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
16-37LYLIYHRSKNQHRQQIWFKYLNHydrophilic
325-375IFESSKTKTKTKTKTKTKTFDNKKLKKKDTTTKPLKKIKKKKKSAIDDIFGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
332-368KTKTKTKTKTKTFDNKKLKKKDTTTKPLKKIKKKKKS
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 12.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR047205  RMP1  
IPR047204  RMP1_RBD  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0000172  C:ribonuclease MRP complex  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000466  P:maturation of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000294  P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, RNase MRP-dependent  
KEGG cal:CAALFM_C113360CA  -  
CDD cd22573  RMP1_RBD  
Amino Acid Sequences MDKSTFKQLTNEYDILYLIYHRSKNQHRQQIWFKYLNMMIRNLRKILKLQIDINRIRTTTTTTTTTTTTTTTTTTTKDKIDYKTNQIIQYSNKILKLMKSSYWNYNSILVLGQYITLGLGLIGSLSKITHLIINGINGVQKRGINRDSFINKMNNDRQRVDGVDVVGSKDLKSNNEDEIDFGEVIPYEEEVEKVSINDEVKNNCKINKSNTLQFQGKENLQRFDKIDDDTDIQQIKNDDDKSHSKKSKRNSLSLSEEEEEEEEDSNIIFKKSKSKSKSTTIHNQSNIHSEQISINDENNNKSTSTSTSTDTKKRKLIDTDTIDDIFESSKTKTKTKTKTKTKTFDNKKLKKKDTTTKPLKKIKKKKKSAIDDIFG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.29
3 0.24
4 0.18
5 0.14
6 0.19
7 0.2
8 0.24
9 0.33
10 0.42
11 0.53
12 0.62
13 0.68
14 0.67
15 0.74
16 0.81
17 0.82
18 0.8
19 0.74
20 0.64
21 0.6
22 0.59
23 0.56
24 0.48
25 0.43
26 0.43
27 0.46
28 0.49
29 0.46
30 0.46
31 0.42
32 0.43
33 0.46
34 0.47
35 0.44
36 0.47
37 0.51
38 0.57
39 0.58
40 0.59
41 0.54
42 0.45
43 0.42
44 0.36
45 0.35
46 0.3
47 0.31
48 0.29
49 0.28
50 0.3
51 0.3
52 0.3
53 0.25
54 0.21
55 0.19
56 0.16
57 0.16
58 0.16
59 0.17
60 0.19
61 0.22
62 0.24
63 0.25
64 0.29
65 0.34
66 0.36
67 0.44
68 0.46
69 0.49
70 0.56
71 0.58
72 0.56
73 0.51
74 0.49
75 0.44
76 0.45
77 0.43
78 0.37
79 0.33
80 0.31
81 0.31
82 0.31
83 0.34
84 0.3
85 0.28
86 0.32
87 0.35
88 0.41
89 0.43
90 0.42
91 0.37
92 0.37
93 0.34
94 0.27
95 0.24
96 0.16
97 0.13
98 0.1
99 0.09
100 0.05
101 0.05
102 0.04
103 0.04
104 0.03
105 0.03
106 0.02
107 0.02
108 0.02
109 0.02
110 0.02
111 0.03
112 0.03
113 0.03
114 0.04
115 0.04
116 0.06
117 0.06
118 0.08
119 0.09
120 0.1
121 0.1
122 0.1
123 0.12
124 0.1
125 0.11
126 0.11
127 0.12
128 0.13
129 0.18
130 0.21
131 0.2
132 0.21
133 0.28
134 0.29
135 0.3
136 0.32
137 0.32
138 0.29
139 0.35
140 0.42
141 0.41
142 0.42
143 0.41
144 0.39
145 0.36
146 0.37
147 0.31
148 0.25
149 0.19
150 0.16
151 0.15
152 0.13
153 0.12
154 0.11
155 0.09
156 0.1
157 0.11
158 0.11
159 0.13
160 0.14
161 0.15
162 0.17
163 0.17
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.08
170 0.06
171 0.07
172 0.06
173 0.05
174 0.04
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.06
179 0.06
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.08
184 0.11
185 0.13
186 0.15
187 0.18
188 0.23
189 0.24
190 0.24
191 0.28
192 0.28
193 0.32
194 0.39
195 0.4
196 0.4
197 0.44
198 0.47
199 0.46
200 0.43
201 0.42
202 0.36
203 0.35
204 0.36
205 0.33
206 0.32
207 0.3
208 0.32
209 0.29
210 0.28
211 0.27
212 0.21
213 0.2
214 0.18
215 0.2
216 0.19
217 0.2
218 0.19
219 0.17
220 0.17
221 0.17
222 0.16
223 0.19
224 0.19
225 0.17
226 0.21
227 0.29
228 0.35
229 0.44
230 0.49
231 0.51
232 0.55
233 0.63
234 0.69
235 0.66
236 0.67
237 0.63
238 0.63
239 0.64
240 0.61
241 0.57
242 0.46
243 0.41
244 0.33
245 0.28
246 0.22
247 0.15
248 0.13
249 0.08
250 0.07
251 0.07
252 0.08
253 0.08
254 0.08
255 0.09
256 0.1
257 0.2
258 0.27
259 0.36
260 0.42
261 0.5
262 0.56
263 0.64
264 0.71
265 0.69
266 0.73
267 0.73
268 0.75
269 0.71
270 0.67
271 0.59
272 0.58
273 0.51
274 0.41
275 0.32
276 0.25
277 0.21
278 0.21
279 0.23
280 0.18
281 0.18
282 0.22
283 0.24
284 0.25
285 0.26
286 0.25
287 0.21
288 0.21
289 0.21
290 0.2
291 0.23
292 0.23
293 0.24
294 0.3
295 0.36
296 0.45
297 0.5
298 0.53
299 0.54
300 0.56
301 0.6
302 0.6
303 0.62
304 0.62
305 0.62
306 0.59
307 0.57
308 0.53
309 0.46
310 0.38
311 0.31
312 0.21
313 0.15
314 0.13
315 0.11
316 0.17
317 0.21
318 0.27
319 0.35
320 0.45
321 0.55
322 0.64
323 0.73
324 0.78
325 0.85
326 0.91
327 0.91
328 0.91
329 0.92
330 0.91
331 0.91
332 0.91
333 0.91
334 0.91
335 0.92
336 0.9
337 0.89
338 0.88
339 0.88
340 0.88
341 0.89
342 0.9
343 0.89
344 0.91
345 0.91
346 0.92
347 0.92
348 0.93
349 0.93
350 0.93
351 0.93
352 0.93
353 0.94
354 0.94
355 0.94