Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0W4ZX27

Protein Details
Accession A0A0W4ZX27    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-61KESQNCEKERKERAQRIYECHydrophilic
371-392DKEEERKEIERKIKKKRKFNISBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
375-389ERKEIERKIKKKRKF
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12, mito 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013256  Chromatin_SPT2  
Pfam View protein in Pfam  
PF08243  SPT2  
Amino Acid Sequences MNSRSQYNSLLAIASSNDRKQQICLEELEKTKTLREADNRIKESQNCEKERKERAQRIYECGLDKKKRNEENSLSNSLKMKNESQGIEKDSIKKRSRSISFKEFISQTSNMNPEILKMNLIAKINSKTNVNSPLSSTTNKKDESDSKFLVKSGANFLLKHETSSKPFQTHKQPVSFTKVPLVKKNDSLSNYKGSSSLSSKFSINKGKKNHFSTPIRSKNLTKSKIITEFHPNDLILLHTGPKRDSRTIEEIQNSIWRKKGKNFPFLYKDTSETNKNTPETNNSSKIPSNNCVSGNISSQNSFSDYKKAKLDSSEKNKTLDYNISSEIWKIFGKRKEDYISNNYDSDSDMETNAAQLQKEEEFSSRIGKIEDKEEERKEIERKIKKKRKFNIS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.19
2 0.22
3 0.23
4 0.28
5 0.3
6 0.31
7 0.33
8 0.39
9 0.38
10 0.36
11 0.37
12 0.35
13 0.38
14 0.41
15 0.43
16 0.38
17 0.35
18 0.34
19 0.34
20 0.35
21 0.36
22 0.4
23 0.45
24 0.53
25 0.62
26 0.63
27 0.62
28 0.65
29 0.61
30 0.61
31 0.62
32 0.61
33 0.58
34 0.61
35 0.65
36 0.67
37 0.73
38 0.75
39 0.76
40 0.75
41 0.78
42 0.82
43 0.78
44 0.77
45 0.72
46 0.67
47 0.59
48 0.58
49 0.58
50 0.56
51 0.6
52 0.62
53 0.67
54 0.71
55 0.72
56 0.74
57 0.71
58 0.73
59 0.72
60 0.7
61 0.61
62 0.56
63 0.54
64 0.47
65 0.44
66 0.37
67 0.33
68 0.31
69 0.35
70 0.34
71 0.35
72 0.37
73 0.37
74 0.37
75 0.37
76 0.4
77 0.43
78 0.51
79 0.53
80 0.52
81 0.54
82 0.6
83 0.65
84 0.65
85 0.65
86 0.65
87 0.62
88 0.59
89 0.59
90 0.5
91 0.43
92 0.4
93 0.33
94 0.25
95 0.26
96 0.27
97 0.22
98 0.22
99 0.2
100 0.16
101 0.18
102 0.17
103 0.13
104 0.12
105 0.13
106 0.16
107 0.17
108 0.16
109 0.17
110 0.2
111 0.22
112 0.23
113 0.23
114 0.21
115 0.24
116 0.31
117 0.3
118 0.27
119 0.26
120 0.29
121 0.31
122 0.32
123 0.31
124 0.28
125 0.31
126 0.32
127 0.31
128 0.31
129 0.36
130 0.41
131 0.44
132 0.42
133 0.39
134 0.39
135 0.38
136 0.35
137 0.28
138 0.23
139 0.2
140 0.24
141 0.22
142 0.22
143 0.23
144 0.28
145 0.27
146 0.27
147 0.26
148 0.22
149 0.25
150 0.31
151 0.32
152 0.29
153 0.31
154 0.36
155 0.42
156 0.49
157 0.5
158 0.49
159 0.5
160 0.48
161 0.54
162 0.51
163 0.41
164 0.39
165 0.38
166 0.36
167 0.4
168 0.43
169 0.36
170 0.39
171 0.4
172 0.39
173 0.36
174 0.38
175 0.34
176 0.32
177 0.31
178 0.27
179 0.25
180 0.21
181 0.2
182 0.19
183 0.19
184 0.17
185 0.17
186 0.18
187 0.2
188 0.23
189 0.31
190 0.33
191 0.36
192 0.42
193 0.48
194 0.55
195 0.59
196 0.6
197 0.6
198 0.6
199 0.62
200 0.65
201 0.66
202 0.62
203 0.59
204 0.56
205 0.57
206 0.61
207 0.56
208 0.48
209 0.43
210 0.43
211 0.48
212 0.46
213 0.39
214 0.39
215 0.38
216 0.37
217 0.36
218 0.31
219 0.24
220 0.23
221 0.2
222 0.11
223 0.09
224 0.1
225 0.1
226 0.12
227 0.13
228 0.18
229 0.21
230 0.24
231 0.26
232 0.29
233 0.35
234 0.37
235 0.41
236 0.38
237 0.34
238 0.32
239 0.36
240 0.33
241 0.27
242 0.28
243 0.28
244 0.3
245 0.38
246 0.47
247 0.48
248 0.56
249 0.59
250 0.63
251 0.65
252 0.64
253 0.62
254 0.53
255 0.47
256 0.41
257 0.41
258 0.38
259 0.34
260 0.35
261 0.35
262 0.34
263 0.35
264 0.33
265 0.36
266 0.38
267 0.42
268 0.42
269 0.38
270 0.4
271 0.41
272 0.44
273 0.42
274 0.38
275 0.36
276 0.35
277 0.34
278 0.33
279 0.32
280 0.29
281 0.27
282 0.27
283 0.24
284 0.21
285 0.21
286 0.2
287 0.2
288 0.21
289 0.19
290 0.25
291 0.26
292 0.3
293 0.34
294 0.36
295 0.34
296 0.4
297 0.47
298 0.48
299 0.55
300 0.61
301 0.58
302 0.58
303 0.57
304 0.51
305 0.47
306 0.43
307 0.36
308 0.3
309 0.3
310 0.29
311 0.28
312 0.28
313 0.24
314 0.2
315 0.18
316 0.18
317 0.24
318 0.29
319 0.35
320 0.36
321 0.42
322 0.46
323 0.5
324 0.54
325 0.54
326 0.55
327 0.53
328 0.5
329 0.44
330 0.38
331 0.34
332 0.29
333 0.25
334 0.18
335 0.15
336 0.15
337 0.14
338 0.15
339 0.17
340 0.16
341 0.13
342 0.12
343 0.15
344 0.16
345 0.18
346 0.19
347 0.18
348 0.18
349 0.19
350 0.24
351 0.22
352 0.22
353 0.22
354 0.25
355 0.26
356 0.31
357 0.38
358 0.39
359 0.46
360 0.48
361 0.51
362 0.5
363 0.53
364 0.52
365 0.53
366 0.57
367 0.59
368 0.65
369 0.71
370 0.79
371 0.82
372 0.87