Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4S9F4

Protein Details
Accession F4S9F4    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
437-477MLEARAKKEDNRNAHRKRKREGESTEKPKKERQKGLLALQSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
441-470RAKKEDNRNAHRKRKREGESTEKPKKERQK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR020472  G-protein_beta_WD-40_rep  
IPR007287  Sof1  
IPR013979  TIF_beta_prop-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR019775  WD40_repeat_CS  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0032040  C:small-subunit processome  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0016567  P:protein ubiquitination  
KEGG mlr:MELLADRAFT_50904  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08662  eIF2A  
PF04158  Sof1  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00678  WD_REPEATS_1  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MKIKVLARSLDNHQPQSHGAPAPIHKNLDPSLHPHARSREYTRAVTASKLNRMFAKPFIGQLDGHRDGIYVMGKDPLKLTQVVSGAADGEVRVWDLGTRACTISLTEAHRGRVTGVTFLPAKFQGEEAESRTSRLGSRKVLTCGIDKVVKMWDLGPRNDPGADRLVNTYQGKHGFNDIDHHHTEPVFVTASDKLHIWDVTKSSPISDLSWNSARSGANHCVTFSPSEHNVLASAGSSSDRSICLYDMRSNKALGRLIMQMRMNCLRFNPQQPSVLLAAGEDHQLYTFDIRYMKSATQVFKDHVGPVMSCDWSPTGQGFISGSYDRTLRIWSTSDTTFHRKGRSIDVYHTKRMQRVFSSIFTLDGKFSLTGSDDGSIRIWKSTAAEGLGVKSGREMASKEYRDELRQKWNAVEGVGKLERQRYLPKPIYHAQKLRTEMLEARAKKEDNRNAHRKRKREGESTEKPKKERQKGLLALQS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.45
3 0.44
4 0.44
5 0.36
6 0.31
7 0.32
8 0.36
9 0.4
10 0.42
11 0.41
12 0.36
13 0.39
14 0.39
15 0.39
16 0.36
17 0.35
18 0.4
19 0.43
20 0.44
21 0.47
22 0.51
23 0.52
24 0.57
25 0.59
26 0.59
27 0.58
28 0.58
29 0.56
30 0.53
31 0.48
32 0.45
33 0.45
34 0.42
35 0.45
36 0.44
37 0.43
38 0.43
39 0.46
40 0.46
41 0.42
42 0.42
43 0.34
44 0.35
45 0.35
46 0.31
47 0.28
48 0.29
49 0.35
50 0.31
51 0.31
52 0.27
53 0.25
54 0.23
55 0.25
56 0.23
57 0.14
58 0.12
59 0.17
60 0.18
61 0.18
62 0.19
63 0.19
64 0.19
65 0.19
66 0.19
67 0.18
68 0.19
69 0.19
70 0.18
71 0.16
72 0.14
73 0.13
74 0.12
75 0.07
76 0.07
77 0.06
78 0.06
79 0.06
80 0.05
81 0.06
82 0.07
83 0.09
84 0.1
85 0.12
86 0.12
87 0.12
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.17
92 0.19
93 0.24
94 0.26
95 0.28
96 0.29
97 0.28
98 0.27
99 0.26
100 0.24
101 0.2
102 0.18
103 0.19
104 0.2
105 0.19
106 0.21
107 0.17
108 0.18
109 0.15
110 0.16
111 0.14
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.23
116 0.22
117 0.22
118 0.23
119 0.22
120 0.23
121 0.27
122 0.29
123 0.28
124 0.33
125 0.36
126 0.38
127 0.41
128 0.4
129 0.36
130 0.33
131 0.31
132 0.28
133 0.24
134 0.22
135 0.21
136 0.2
137 0.18
138 0.17
139 0.2
140 0.22
141 0.24
142 0.26
143 0.24
144 0.25
145 0.25
146 0.24
147 0.19
148 0.19
149 0.18
150 0.16
151 0.18
152 0.18
153 0.22
154 0.23
155 0.22
156 0.21
157 0.24
158 0.24
159 0.22
160 0.24
161 0.2
162 0.2
163 0.24
164 0.23
165 0.24
166 0.24
167 0.24
168 0.22
169 0.2
170 0.2
171 0.16
172 0.14
173 0.1
174 0.08
175 0.09
176 0.1
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.1
181 0.11
182 0.12
183 0.11
184 0.11
185 0.13
186 0.13
187 0.15
188 0.15
189 0.13
190 0.15
191 0.14
192 0.14
193 0.16
194 0.15
195 0.18
196 0.21
197 0.21
198 0.2
199 0.21
200 0.19
201 0.18
202 0.23
203 0.23
204 0.22
205 0.21
206 0.21
207 0.19
208 0.2
209 0.2
210 0.15
211 0.15
212 0.13
213 0.16
214 0.15
215 0.15
216 0.14
217 0.12
218 0.11
219 0.07
220 0.06
221 0.04
222 0.05
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.06
227 0.06
228 0.07
229 0.07
230 0.08
231 0.1
232 0.16
233 0.18
234 0.21
235 0.22
236 0.22
237 0.23
238 0.25
239 0.24
240 0.19
241 0.18
242 0.19
243 0.19
244 0.22
245 0.23
246 0.19
247 0.21
248 0.25
249 0.24
250 0.19
251 0.19
252 0.22
253 0.24
254 0.29
255 0.32
256 0.3
257 0.32
258 0.32
259 0.34
260 0.28
261 0.24
262 0.19
263 0.13
264 0.12
265 0.09
266 0.09
267 0.06
268 0.05
269 0.05
270 0.06
271 0.06
272 0.06
273 0.06
274 0.07
275 0.09
276 0.1
277 0.11
278 0.13
279 0.14
280 0.17
281 0.21
282 0.21
283 0.23
284 0.25
285 0.24
286 0.25
287 0.26
288 0.22
289 0.21
290 0.2
291 0.16
292 0.16
293 0.17
294 0.15
295 0.13
296 0.14
297 0.12
298 0.11
299 0.12
300 0.1
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.08
306 0.11
307 0.1
308 0.11
309 0.1
310 0.11
311 0.11
312 0.11
313 0.12
314 0.1
315 0.12
316 0.13
317 0.14
318 0.18
319 0.18
320 0.21
321 0.24
322 0.3
323 0.34
324 0.36
325 0.38
326 0.38
327 0.39
328 0.45
329 0.49
330 0.45
331 0.46
332 0.53
333 0.55
334 0.57
335 0.61
336 0.55
337 0.51
338 0.52
339 0.49
340 0.41
341 0.42
342 0.4
343 0.36
344 0.38
345 0.33
346 0.31
347 0.28
348 0.26
349 0.2
350 0.16
351 0.16
352 0.11
353 0.11
354 0.1
355 0.1
356 0.1
357 0.11
358 0.12
359 0.11
360 0.12
361 0.13
362 0.14
363 0.13
364 0.13
365 0.12
366 0.11
367 0.13
368 0.14
369 0.15
370 0.14
371 0.15
372 0.15
373 0.16
374 0.19
375 0.17
376 0.14
377 0.13
378 0.15
379 0.14
380 0.15
381 0.15
382 0.18
383 0.28
384 0.3
385 0.32
386 0.35
387 0.37
388 0.42
389 0.48
390 0.47
391 0.48
392 0.51
393 0.51
394 0.48
395 0.49
396 0.44
397 0.38
398 0.35
399 0.26
400 0.28
401 0.27
402 0.26
403 0.24
404 0.27
405 0.29
406 0.29
407 0.37
408 0.36
409 0.45
410 0.51
411 0.53
412 0.56
413 0.61
414 0.67
415 0.67
416 0.69
417 0.64
418 0.64
419 0.64
420 0.62
421 0.56
422 0.49
423 0.44
424 0.44
425 0.48
426 0.42
427 0.42
428 0.43
429 0.44
430 0.47
431 0.54
432 0.56
433 0.57
434 0.66
435 0.73
436 0.77
437 0.86
438 0.88
439 0.86
440 0.86
441 0.86
442 0.84
443 0.83
444 0.82
445 0.82
446 0.84
447 0.86
448 0.87
449 0.83
450 0.79
451 0.79
452 0.8
453 0.8
454 0.8
455 0.77
456 0.78
457 0.78