Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5A1E3

Protein Details
Accession Q5A1E3    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
147-166EEWHRQRRENHKEVERKRREBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011598  bHLH_dom  
IPR047206  bHLHzip_scCBP1-like  
IPR036638  HLH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0043565  F:sequence-specific DNA binding  
GO:0007059  P:chromosome segregation  
GO:0009086  P:methionine biosynthetic process  
GO:0009303  P:rRNA transcription  
GO:0000103  P:sulfate assimilation  
KEGG cal:CAALFM_C406580WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00010  HLH  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50888  BHLH  
CDD cd11398  bHLHzip_scCBP1  
Amino Acid Sequences MVKSHKRTLEKDEEHQEKKKANKISKDDMEIDAELLTQQASDSAHTDTATAAVAAVNNEQGKELEQTESSTNQTSALDKDDKETKDNLNPREETQSSHQEIDIPKDQLTNQQNLADQHQQYQYHQQLAQTNFKTEPTNSAKPPHGSEEWHRQRRENHKEVERKRRESINTGIRELARLIPTTDTNKAQILQRAVEYIKRLKENENNNIEKWTLEKLLTEQAVSELSASNEKLKHELESAYREIEQLKRGKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.71
2 0.73
3 0.7
4 0.65
5 0.67
6 0.67
7 0.66
8 0.65
9 0.69
10 0.7
11 0.74
12 0.74
13 0.71
14 0.67
15 0.59
16 0.54
17 0.44
18 0.36
19 0.26
20 0.2
21 0.14
22 0.11
23 0.08
24 0.05
25 0.04
26 0.05
27 0.06
28 0.07
29 0.09
30 0.1
31 0.11
32 0.11
33 0.12
34 0.1
35 0.1
36 0.09
37 0.08
38 0.06
39 0.05
40 0.06
41 0.06
42 0.07
43 0.09
44 0.09
45 0.09
46 0.1
47 0.1
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.12
52 0.12
53 0.14
54 0.15
55 0.17
56 0.17
57 0.16
58 0.15
59 0.14
60 0.15
61 0.14
62 0.13
63 0.16
64 0.17
65 0.16
66 0.19
67 0.25
68 0.26
69 0.27
70 0.29
71 0.27
72 0.33
73 0.39
74 0.4
75 0.39
76 0.39
77 0.38
78 0.42
79 0.39
80 0.34
81 0.33
82 0.37
83 0.33
84 0.32
85 0.3
86 0.27
87 0.28
88 0.3
89 0.29
90 0.22
91 0.2
92 0.2
93 0.21
94 0.25
95 0.27
96 0.25
97 0.21
98 0.22
99 0.24
100 0.24
101 0.27
102 0.24
103 0.21
104 0.22
105 0.24
106 0.23
107 0.22
108 0.29
109 0.27
110 0.25
111 0.25
112 0.24
113 0.26
114 0.29
115 0.35
116 0.28
117 0.28
118 0.26
119 0.26
120 0.26
121 0.2
122 0.24
123 0.25
124 0.29
125 0.29
126 0.32
127 0.34
128 0.34
129 0.36
130 0.33
131 0.27
132 0.25
133 0.29
134 0.36
135 0.44
136 0.49
137 0.49
138 0.48
139 0.55
140 0.63
141 0.68
142 0.65
143 0.62
144 0.64
145 0.73
146 0.77
147 0.8
148 0.78
149 0.73
150 0.7
151 0.69
152 0.64
153 0.6
154 0.6
155 0.57
156 0.52
157 0.48
158 0.46
159 0.39
160 0.36
161 0.31
162 0.26
163 0.18
164 0.15
165 0.15
166 0.15
167 0.17
168 0.2
169 0.23
170 0.21
171 0.21
172 0.22
173 0.23
174 0.24
175 0.26
176 0.25
177 0.23
178 0.22
179 0.23
180 0.23
181 0.24
182 0.25
183 0.26
184 0.28
185 0.31
186 0.32
187 0.37
188 0.44
189 0.5
190 0.55
191 0.58
192 0.57
193 0.53
194 0.54
195 0.47
196 0.39
197 0.33
198 0.27
199 0.2
200 0.17
201 0.17
202 0.17
203 0.24
204 0.24
205 0.22
206 0.18
207 0.17
208 0.17
209 0.16
210 0.14
211 0.09
212 0.1
213 0.13
214 0.13
215 0.17
216 0.19
217 0.2
218 0.23
219 0.24
220 0.25
221 0.25
222 0.28
223 0.28
224 0.32
225 0.33
226 0.32
227 0.31
228 0.29
229 0.3
230 0.3
231 0.33