Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4R557

Protein Details
Accession F4R557    Localization Confidence Low Confidence Score 6.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
246-272SLDKDRNLKKPLRQVRNTRYYNKRVDEHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cyto 15, cyto_nucl 12, nucl 5, pero 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR030374  PABS  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR001045  Spermi_synthase  
IPR035246  Spermidine_synt_N  
IPR037163  Spermidine_synt_N_sf  
Gene Ontology GO:0004766  F:spermidine synthase activity  
GO:0015940  P:pantothenate biosynthetic process  
GO:0008295  P:spermidine biosynthetic process  
KEGG mlr:MELLADRAFT_28197  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF17284  Spermine_synt_N  
PF01564  Spermine_synth  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51006  PABS_2  
CDD cd02440  AdoMet_MTases  
Amino Acid Sequences ISGLTHPSVQDGWFKEEIPLWPGQATSLQVKKVLHVDKSKFQDVLLFESVAHGNVLVLDGAIQCVEIDEFSYQEMIAHIPLNSHPNPEHFLVIGGGDGGVLREVLKHPSVKTAVLCDIDEAFPRVSKDYLPHMAVGVNDPRVTLFIRDGFQALRDQVGKFDVIITDSSDPNEGPAQTLFGMPYFQFMKNALRPNGSISTQGECIWLPLPLIHSLIKGPKDLFPQVDYAYTSISTYPSGTIGFVVCSLDKDRNLKKPLRQVRNTRYYNKRVDEAAFVLPEFARATI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.27
3 0.3
4 0.3
5 0.27
6 0.25
7 0.21
8 0.2
9 0.19
10 0.18
11 0.17
12 0.18
13 0.22
14 0.24
15 0.24
16 0.28
17 0.28
18 0.3
19 0.36
20 0.38
21 0.38
22 0.43
23 0.47
24 0.51
25 0.58
26 0.59
27 0.5
28 0.45
29 0.43
30 0.36
31 0.37
32 0.31
33 0.24
34 0.2
35 0.22
36 0.22
37 0.18
38 0.16
39 0.09
40 0.07
41 0.07
42 0.07
43 0.05
44 0.04
45 0.04
46 0.04
47 0.05
48 0.04
49 0.04
50 0.04
51 0.04
52 0.05
53 0.04
54 0.05
55 0.05
56 0.06
57 0.06
58 0.07
59 0.06
60 0.06
61 0.07
62 0.06
63 0.07
64 0.07
65 0.07
66 0.08
67 0.1
68 0.15
69 0.15
70 0.18
71 0.18
72 0.19
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.16
77 0.16
78 0.13
79 0.12
80 0.1
81 0.06
82 0.05
83 0.04
84 0.04
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.03
89 0.04
90 0.05
91 0.08
92 0.1
93 0.12
94 0.13
95 0.17
96 0.19
97 0.19
98 0.19
99 0.19
100 0.19
101 0.19
102 0.18
103 0.14
104 0.14
105 0.13
106 0.13
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.11
112 0.1
113 0.1
114 0.12
115 0.15
116 0.18
117 0.18
118 0.17
119 0.17
120 0.17
121 0.16
122 0.16
123 0.13
124 0.1
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.08
131 0.07
132 0.09
133 0.09
134 0.1
135 0.1
136 0.1
137 0.1
138 0.11
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.11
145 0.1
146 0.08
147 0.09
148 0.07
149 0.06
150 0.07
151 0.08
152 0.09
153 0.09
154 0.09
155 0.1
156 0.09
157 0.09
158 0.11
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.09
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.07
169 0.09
170 0.11
171 0.11
172 0.12
173 0.13
174 0.19
175 0.23
176 0.3
177 0.29
178 0.28
179 0.28
180 0.32
181 0.34
182 0.29
183 0.26
184 0.21
185 0.22
186 0.21
187 0.21
188 0.18
189 0.14
190 0.14
191 0.12
192 0.11
193 0.08
194 0.08
195 0.1
196 0.1
197 0.12
198 0.11
199 0.11
200 0.13
201 0.18
202 0.19
203 0.19
204 0.19
205 0.21
206 0.26
207 0.28
208 0.28
209 0.24
210 0.26
211 0.24
212 0.25
213 0.22
214 0.18
215 0.16
216 0.14
217 0.13
218 0.11
219 0.11
220 0.1
221 0.1
222 0.1
223 0.1
224 0.1
225 0.09
226 0.1
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.1
233 0.13
234 0.17
235 0.2
236 0.28
237 0.35
238 0.42
239 0.5
240 0.55
241 0.6
242 0.66
243 0.73
244 0.76
245 0.79
246 0.81
247 0.84
248 0.87
249 0.87
250 0.86
251 0.85
252 0.83
253 0.83
254 0.77
255 0.7
256 0.63
257 0.59
258 0.54
259 0.47
260 0.42
261 0.34
262 0.28
263 0.26
264 0.22
265 0.21