Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3HIG6

Protein Details
Accession M3HIG6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-404GHNKIRIRSYGISRRRRRGGRGNBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
388-404IRSYGISRRRRRGGRGN
Subcellular Location(s) nucl 17, mito_nucl 12.833, cyto_nucl 10.333, mito 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007133  RNA_pol_II-assoc_Paf1  
Gene Ontology GO:0016593  C:Cdc73/Paf1 complex  
GO:0016570  P:histone modification  
GO:0006368  P:transcription elongation by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF03985  Paf1  
Amino Acid Sequences LIFDCCLILYHQMSSSSSSSSHKKTVRQDYIAKVRYTNNLPPPPLNPKFIKYNTTDPISTQQEGEHLISSLFRKENFQSLMGRIDESFGLELNLINNHGFLSEDKMNESIGKLEYSQLHPKDRALLRDAGIGKISKVEPGVSFLRRTEYIAEERSGSKSGTNLSTVENEEIKNNKKMTNDDHFDPDSQLLNVEKGFTVANESLHNLKNLKHPRKKHLRAVNTWPLLPDTSMMDNSFLDLKFVGSASINREMQMLKQQRGAKFNAKAANQALESAIFKPIKSEDGEWVSMYKLDEQKDEEKVVDLYDKLHSTVREQPINLLDEEDEPSEAYNFKYVKNYDMTYQGFQHENEELAIKFVSDEQEVNGKTTKKRKIAYYYPIGNGHNKIRIRSYGISRRRRRGGRGN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.21
4 0.21
5 0.25
6 0.29
7 0.33
8 0.41
9 0.42
10 0.48
11 0.57
12 0.66
13 0.7
14 0.7
15 0.72
16 0.73
17 0.79
18 0.77
19 0.69
20 0.61
21 0.56
22 0.56
23 0.55
24 0.54
25 0.53
26 0.53
27 0.55
28 0.54
29 0.56
30 0.59
31 0.57
32 0.55
33 0.49
34 0.46
35 0.52
36 0.53
37 0.53
38 0.48
39 0.52
40 0.51
41 0.52
42 0.48
43 0.41
44 0.45
45 0.45
46 0.4
47 0.32
48 0.27
49 0.24
50 0.27
51 0.26
52 0.19
53 0.14
54 0.13
55 0.15
56 0.16
57 0.19
58 0.18
59 0.17
60 0.21
61 0.22
62 0.3
63 0.3
64 0.31
65 0.29
66 0.3
67 0.33
68 0.3
69 0.29
70 0.21
71 0.2
72 0.17
73 0.15
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.08
79 0.08
80 0.08
81 0.08
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.07
88 0.13
89 0.15
90 0.15
91 0.16
92 0.17
93 0.17
94 0.17
95 0.17
96 0.13
97 0.11
98 0.11
99 0.11
100 0.13
101 0.16
102 0.2
103 0.28
104 0.29
105 0.33
106 0.33
107 0.34
108 0.39
109 0.39
110 0.38
111 0.34
112 0.33
113 0.29
114 0.34
115 0.34
116 0.26
117 0.25
118 0.22
119 0.18
120 0.18
121 0.17
122 0.12
123 0.12
124 0.13
125 0.11
126 0.15
127 0.19
128 0.18
129 0.19
130 0.18
131 0.21
132 0.2
133 0.21
134 0.19
135 0.19
136 0.21
137 0.22
138 0.22
139 0.2
140 0.21
141 0.22
142 0.2
143 0.17
144 0.13
145 0.12
146 0.14
147 0.14
148 0.14
149 0.13
150 0.13
151 0.15
152 0.16
153 0.16
154 0.15
155 0.14
156 0.15
157 0.19
158 0.21
159 0.24
160 0.24
161 0.25
162 0.26
163 0.29
164 0.33
165 0.37
166 0.37
167 0.34
168 0.37
169 0.35
170 0.34
171 0.31
172 0.26
173 0.18
174 0.14
175 0.14
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.07
181 0.06
182 0.06
183 0.05
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.1
189 0.13
190 0.14
191 0.15
192 0.13
193 0.14
194 0.22
195 0.32
196 0.41
197 0.46
198 0.51
199 0.6
200 0.71
201 0.76
202 0.76
203 0.76
204 0.73
205 0.72
206 0.75
207 0.74
208 0.64
209 0.57
210 0.48
211 0.39
212 0.32
213 0.26
214 0.17
215 0.1
216 0.1
217 0.1
218 0.1
219 0.1
220 0.09
221 0.1
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.07
228 0.07
229 0.07
230 0.06
231 0.07
232 0.11
233 0.16
234 0.16
235 0.15
236 0.17
237 0.16
238 0.17
239 0.25
240 0.27
241 0.23
242 0.29
243 0.34
244 0.37
245 0.41
246 0.44
247 0.42
248 0.41
249 0.44
250 0.44
251 0.39
252 0.39
253 0.37
254 0.35
255 0.27
256 0.24
257 0.19
258 0.14
259 0.15
260 0.12
261 0.16
262 0.14
263 0.13
264 0.15
265 0.15
266 0.17
267 0.18
268 0.19
269 0.19
270 0.23
271 0.24
272 0.22
273 0.22
274 0.2
275 0.19
276 0.18
277 0.18
278 0.18
279 0.18
280 0.2
281 0.24
282 0.28
283 0.29
284 0.3
285 0.25
286 0.22
287 0.21
288 0.2
289 0.18
290 0.14
291 0.13
292 0.15
293 0.15
294 0.15
295 0.18
296 0.17
297 0.19
298 0.28
299 0.33
300 0.34
301 0.33
302 0.36
303 0.37
304 0.38
305 0.34
306 0.26
307 0.2
308 0.18
309 0.19
310 0.17
311 0.13
312 0.11
313 0.11
314 0.11
315 0.11
316 0.1
317 0.14
318 0.14
319 0.15
320 0.23
321 0.23
322 0.27
323 0.31
324 0.32
325 0.28
326 0.35
327 0.37
328 0.32
329 0.34
330 0.32
331 0.3
332 0.29
333 0.29
334 0.23
335 0.21
336 0.18
337 0.19
338 0.15
339 0.14
340 0.14
341 0.11
342 0.1
343 0.11
344 0.13
345 0.12
346 0.12
347 0.13
348 0.2
349 0.21
350 0.23
351 0.26
352 0.28
353 0.34
354 0.43
355 0.51
356 0.52
357 0.57
358 0.64
359 0.68
360 0.74
361 0.76
362 0.76
363 0.73
364 0.7
365 0.7
366 0.64
367 0.6
368 0.55
369 0.52
370 0.5
371 0.46
372 0.44
373 0.44
374 0.46
375 0.47
376 0.49
377 0.53
378 0.56
379 0.64
380 0.71
381 0.76
382 0.81
383 0.84
384 0.85