FuNGI

M2N1V3

Protein Details

Accession

M2N1V3

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
16-41	KPPVNIFNTKTKKKPVGKPLPAQTYT	Hydrophilic
123-143	AQFQRPVKLYRRRPQDKPTAT	Hydrophilic
180-203	PTGDNGKKPVKKKQQKKVEDVFYD	Hydrophilic
410-436	AEAEERKRQKRIRKQLRKKEYRAEYDS	Basic
550-569	TDTSRAGRPRPKHNTSPPGS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
186-193	KKPVKKKQ
414-428	ERKRQKRIRKQLRKK

Subcellular Location(s)

nucl 21, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter
KEGG	bcom:BAUCODRAFT_159657 -

Amino Acid Sequences

MAASPAKATAPVTRRKPPVNIFNTKTKKKPVGKPLPAQTYTAGGQIPASGTQALAPQVPLAQASANGVQPVPSSEDGPKLYEEYPILISKSELMRGLHLHGFKLQSRVDSRGQLERVNPYDEAQFQRPVKLYRRRPQDKPTATEQSNVASDVDDRDREQREAKRAERQAEREANQLLIAPTGDNGKKPVKKKQQKKVEDVFYDETNLKNQERSQLRYEEARPWHLEDFEGKNKWVASFEKPLMNRHILFELSENGFTMVPVEKWYRMSATDRVKLLSDDKVEKLMAAKHRPAKWFRNEQEAAEDARREAIKAKQEKMRQAQRHRQRDEYPSGEGIKEEYTADVDEIDFDMNDEFADDDEGFIFGEQNDEDAKETEKKLRAEQRTANLPDATIKDADEINWIDEEREEKEAEAEERKRQKRIRKQLRKKEYRAEYDSDDERNQFESSSDDEDSEEERERLEEERKKEEAQKAAQNGDKSGTSSRGNNTPNGRQEKRLKRDAELSELSGNESSRKKTKLNGTVTAPNGARSLSPDGAAARRIPSGYGSGSDTDTSRAGRPRPKHNTSPPGSPHDGTPNRSPAGSPTGSRAGSPGAPPAPGPFPTLDEVKAAVPDEGITIPELIVKFKPRLAGKAQDFIAMVKQVGKQDPKTKGRIVPKRD

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.7
4	0.7
5	0.73
6	0.73
7	0.76
8	0.72
9	0.75
10	0.79
11	0.78
12	0.76
13	0.75
14	0.76
15	0.76
16	0.81
17	0.82
18	0.83
19	0.85
20	0.87
21	0.87
22	0.87
23	0.79
24	0.71
25	0.6
26	0.53
27	0.45
28	0.37
29	0.28
30	0.18
31	0.16
32	0.15
33	0.15
34	0.11
35	0.12
36	0.1
37	0.09
38	0.1
39	0.13
40	0.13
41	0.12
42	0.12
43	0.11
44	0.12
45	0.12
46	0.11
47	0.1
48	0.09
49	0.09
50	0.12
51	0.13
52	0.13
53	0.14
54	0.13
55	0.13
56	0.13
57	0.15
58	0.16
59	0.15
60	0.17
61	0.18
62	0.23
63	0.24
64	0.26
65	0.25
66	0.23
67	0.23
68	0.23
69	0.22
70	0.19
71	0.21
72	0.21
73	0.2
74	0.17
75	0.17
76	0.18
77	0.19
78	0.19
79	0.2
80	0.18
81	0.2
82	0.22
83	0.26
84	0.26
85	0.25
86	0.24
87	0.24
88	0.27
89	0.27
90	0.31
91	0.28
92	0.29
93	0.32
94	0.36
95	0.36
96	0.38
97	0.39
98	0.42
99	0.42
100	0.4
101	0.4
102	0.42
103	0.41
104	0.38
105	0.35
106	0.29
107	0.3
108	0.31
109	0.33
110	0.29
111	0.34
112	0.31
113	0.36
114	0.38
115	0.41
116	0.46
117	0.51
118	0.58
119	0.6
120	0.71
121	0.74
122	0.77
123	0.81
124	0.82
125	0.8
126	0.74
127	0.73
128	0.71
129	0.64
130	0.6
131	0.51
132	0.43
133	0.36
134	0.32
135	0.23
136	0.15
137	0.14
138	0.15
139	0.17
140	0.15
141	0.16
142	0.21
143	0.24
144	0.25
145	0.32
146	0.35
147	0.41
148	0.48
149	0.51
150	0.55
151	0.57
152	0.63
153	0.63
154	0.61
155	0.62
156	0.62
157	0.59
158	0.54
159	0.49
160	0.42
161	0.34
162	0.31
163	0.21
164	0.14
165	0.13
166	0.08
167	0.08
168	0.13
169	0.13
170	0.12
171	0.16
172	0.24
173	0.3
174	0.35
175	0.45
176	0.51
177	0.61
178	0.71
179	0.77
180	0.8
181	0.83
182	0.87
183	0.86
184	0.83
185	0.75
186	0.7
187	0.63
188	0.52
189	0.46
190	0.37
191	0.29
192	0.23
193	0.24
194	0.19
195	0.18
196	0.19
197	0.25
198	0.29
199	0.33
200	0.35
201	0.35
202	0.36
203	0.39
204	0.41
205	0.4
206	0.38
207	0.38
208	0.35
209	0.35
210	0.34
211	0.29
212	0.27
213	0.24
214	0.27
215	0.29
216	0.29
217	0.26
218	0.26
219	0.26
220	0.26
221	0.24
222	0.21
223	0.19
224	0.24
225	0.26
226	0.3
227	0.3
228	0.33
229	0.35
230	0.36
231	0.32
232	0.27
233	0.27
234	0.22
235	0.21
236	0.19
237	0.17
238	0.14
239	0.14
240	0.12
241	0.11
242	0.11
243	0.1
244	0.1
245	0.08
246	0.07
247	0.09
248	0.11
249	0.11
250	0.13
251	0.14
252	0.13
253	0.14
254	0.18
255	0.23
256	0.28
257	0.31
258	0.3
259	0.3
260	0.3
261	0.29
262	0.27
263	0.24
264	0.2
265	0.19
266	0.19
267	0.2
268	0.19
269	0.18
270	0.17
271	0.18
272	0.21
273	0.23
274	0.28
275	0.33
276	0.37
277	0.43
278	0.47
279	0.51
280	0.53
281	0.59
282	0.55
283	0.58
284	0.55
285	0.5
286	0.47
287	0.4
288	0.34
289	0.25
290	0.23
291	0.14
292	0.15
293	0.15
294	0.12
295	0.13
296	0.15
297	0.21
298	0.26
299	0.31
300	0.35
301	0.39
302	0.46
303	0.51
304	0.57
305	0.58
306	0.62
307	0.68
308	0.71
309	0.77
310	0.74
311	0.71
312	0.66
313	0.64
314	0.61
315	0.53
316	0.45
317	0.37
318	0.34
319	0.29
320	0.24
321	0.18
322	0.12
323	0.1
324	0.09
325	0.07
326	0.06
327	0.06
328	0.06
329	0.05
330	0.05
331	0.04
332	0.05
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.04
339	0.03
340	0.03
341	0.03
342	0.05
343	0.04
344	0.04
345	0.04
346	0.05
347	0.04
348	0.04
349	0.05
350	0.03
351	0.04
352	0.04
353	0.05
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.07
358	0.09
359	0.11
360	0.13
361	0.18
362	0.23
363	0.24
364	0.3
365	0.39
366	0.42
367	0.45
368	0.49
369	0.48
370	0.51
371	0.51
372	0.47
373	0.38
374	0.33
375	0.3
376	0.26
377	0.23
378	0.15
379	0.13
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.1
387	0.1
388	0.09
389	0.1
390	0.11
391	0.09
392	0.11
393	0.1
394	0.1
395	0.11
396	0.12
397	0.13
398	0.19
399	0.2
400	0.26
401	0.36
402	0.39
403	0.46
404	0.51
405	0.6
406	0.64
407	0.73
408	0.77
409	0.79
410	0.87
411	0.9
412	0.95
413	0.95
414	0.9
415	0.89
416	0.86
417	0.82
418	0.76
419	0.68
420	0.6
421	0.55
422	0.5
423	0.43
424	0.36
425	0.29
426	0.25
427	0.23
428	0.2
429	0.16
430	0.13
431	0.13
432	0.14
433	0.16
434	0.16
435	0.14
436	0.14
437	0.15
438	0.16
439	0.16
440	0.15
441	0.11
442	0.11
443	0.11
444	0.12
445	0.14
446	0.21
447	0.25
448	0.28
449	0.35
450	0.37
451	0.39
452	0.46
453	0.48
454	0.47
455	0.47
456	0.49
457	0.46
458	0.49
459	0.49
460	0.42
461	0.37
462	0.32
463	0.27
464	0.22
465	0.21
466	0.2
467	0.19
468	0.22
469	0.24
470	0.3
471	0.31
472	0.35
473	0.38
474	0.41
475	0.48
476	0.54
477	0.53
478	0.54
479	0.62
480	0.67
481	0.69
482	0.71
483	0.65
484	0.6
485	0.66
486	0.61
487	0.58
488	0.49
489	0.44
490	0.37
491	0.34
492	0.32
493	0.24
494	0.22
495	0.19
496	0.2
497	0.23
498	0.27
499	0.31
500	0.31
501	0.37
502	0.47
503	0.52
504	0.55
505	0.57
506	0.56
507	0.59
508	0.59
509	0.57
510	0.47
511	0.39
512	0.33
513	0.27
514	0.21
515	0.18
516	0.22
517	0.17
518	0.17
519	0.17
520	0.19
521	0.2
522	0.22
523	0.2
524	0.16
525	0.17
526	0.16
527	0.16
528	0.15
529	0.16
530	0.16
531	0.16
532	0.16
533	0.16
534	0.17
535	0.18
536	0.17
537	0.16
538	0.16
539	0.16
540	0.19
541	0.23
542	0.29
543	0.36
544	0.43
545	0.52
546	0.61
547	0.67
548	0.72
549	0.77
550	0.81
551	0.77
552	0.8
553	0.74
554	0.72
555	0.69
556	0.6
557	0.52
558	0.53
559	0.53
560	0.48
561	0.5
562	0.48
563	0.44
564	0.43
565	0.41
566	0.34
567	0.36
568	0.34
569	0.28
570	0.27
571	0.32
572	0.32
573	0.32
574	0.29
575	0.25
576	0.25
577	0.25
578	0.25
579	0.2
580	0.21
581	0.21
582	0.23
583	0.24
584	0.22
585	0.24
586	0.19
587	0.21
588	0.24
589	0.26
590	0.23
591	0.2
592	0.21
593	0.19
594	0.19
595	0.17
596	0.14
597	0.12
598	0.11
599	0.12
600	0.11
601	0.11
602	0.1
603	0.09
604	0.09
605	0.12
606	0.12
607	0.13
608	0.16
609	0.21
610	0.22
611	0.24
612	0.32
613	0.32
614	0.38
615	0.42
616	0.49
617	0.48
618	0.53
619	0.52
620	0.47
621	0.44
622	0.39
623	0.37
624	0.28
625	0.24
626	0.2
627	0.23
628	0.26
629	0.33
630	0.39
631	0.42
632	0.5
633	0.59
634	0.63
635	0.67
636	0.68
637	0.69
638	0.73

M2N1V3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer