Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2MDH7

Protein Details
Accession M2MDH7    Localization Confidence High Confidence Score 15
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-48SSPPTTPVPNRGKRARKAIKTEDDGDHydrophilic
69-102PDLDNSPPKKRAKRAVRNERTKKTPKKANYGLTPHydrophilic
330-349GWVPKTVKKGQPKVDRNTTYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
36-36R
76-95PKKRAKRAVRNERTKKTPKK
Subcellular Location(s) mito 21.5, mito_nucl 11.833, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011257  DNA_glycosylase  
IPR003265  HhH-GPD_domain  
IPR023170  HhH_base_excis_C  
Gene Ontology GO:0000702  F:oxidized base lesion DNA N-glycosylase activity  
GO:0006285  P:base-excision repair, AP site formation  
KEGG bcom:BAUCODRAFT_73567  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00730  HhH-GPD  
CDD cd00056  ENDO3c  
Amino Acid Sequences MPRATRASAARAAAVQVEPQQLSSPPTTPVPNRGKRARKAIKTEDDGDVNALPHNLGTAMPTPGADDDPDLDNSPPKKRAKRAVRNERTKKTPKKANYGLTPGASPYPDYLRPTAEECREVVRLLEKVHGKVVVPKAVPPPSLDVSGCGEVPSVLDALVRTRLSANTTNKNSSTAFQGLVKRFGTLQEGIGKGSVDWDAVRRAPQKEVFKAIERGGLADRKSKDIQAILQLAYEENQERKAALTAESANATAVGAEQEAESEKHAEVEKASQNIISLDHLHLLSTSAAIEKMLSYPGIGPKTASCVALFCLQRPSFAVDTHVFRLCQYLGWVPKTVKKGQPKVDRNTTYSHCDVRIPDEYKYPLHQLLIKHGKTCPRCRAITGQSSAGWEQGCPIEHLVKRHGTKKGGVSVVERKKAMEAAGLGAEEAGKIAEAEVEAEESELSDALEEEER
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.2
3 0.19
4 0.22
5 0.21
6 0.21
7 0.22
8 0.21
9 0.24
10 0.25
11 0.22
12 0.2
13 0.24
14 0.29
15 0.31
16 0.39
17 0.46
18 0.52
19 0.59
20 0.67
21 0.73
22 0.75
23 0.83
24 0.83
25 0.82
26 0.83
27 0.85
28 0.84
29 0.8
30 0.77
31 0.7
32 0.61
33 0.52
34 0.45
35 0.36
36 0.26
37 0.21
38 0.17
39 0.12
40 0.1
41 0.1
42 0.08
43 0.07
44 0.09
45 0.1
46 0.11
47 0.11
48 0.11
49 0.12
50 0.13
51 0.14
52 0.12
53 0.1
54 0.11
55 0.13
56 0.15
57 0.16
58 0.15
59 0.21
60 0.24
61 0.29
62 0.35
63 0.42
64 0.49
65 0.56
66 0.66
67 0.71
68 0.79
69 0.84
70 0.87
71 0.9
72 0.92
73 0.94
74 0.91
75 0.9
76 0.89
77 0.89
78 0.87
79 0.86
80 0.83
81 0.83
82 0.84
83 0.82
84 0.79
85 0.75
86 0.68
87 0.6
88 0.52
89 0.42
90 0.35
91 0.27
92 0.2
93 0.15
94 0.17
95 0.19
96 0.21
97 0.22
98 0.22
99 0.24
100 0.27
101 0.31
102 0.29
103 0.28
104 0.25
105 0.28
106 0.27
107 0.25
108 0.22
109 0.19
110 0.19
111 0.18
112 0.23
113 0.22
114 0.22
115 0.24
116 0.24
117 0.21
118 0.26
119 0.29
120 0.29
121 0.26
122 0.28
123 0.33
124 0.35
125 0.35
126 0.29
127 0.3
128 0.26
129 0.28
130 0.24
131 0.2
132 0.2
133 0.2
134 0.19
135 0.14
136 0.12
137 0.1
138 0.1
139 0.09
140 0.05
141 0.04
142 0.05
143 0.05
144 0.06
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.11
149 0.11
150 0.16
151 0.23
152 0.28
153 0.33
154 0.37
155 0.39
156 0.39
157 0.4
158 0.37
159 0.3
160 0.29
161 0.22
162 0.19
163 0.2
164 0.26
165 0.25
166 0.28
167 0.27
168 0.23
169 0.22
170 0.22
171 0.21
172 0.15
173 0.16
174 0.16
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.15
179 0.11
180 0.12
181 0.1
182 0.06
183 0.06
184 0.07
185 0.08
186 0.09
187 0.13
188 0.17
189 0.18
190 0.22
191 0.28
192 0.32
193 0.33
194 0.37
195 0.35
196 0.34
197 0.36
198 0.32
199 0.29
200 0.23
201 0.22
202 0.19
203 0.19
204 0.17
205 0.2
206 0.2
207 0.22
208 0.23
209 0.22
210 0.21
211 0.19
212 0.2
213 0.18
214 0.19
215 0.15
216 0.15
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.08
222 0.07
223 0.08
224 0.08
225 0.08
226 0.09
227 0.09
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.11
233 0.11
234 0.11
235 0.09
236 0.09
237 0.07
238 0.05
239 0.04
240 0.04
241 0.03
242 0.03
243 0.03
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.07
249 0.07
250 0.09
251 0.09
252 0.09
253 0.09
254 0.14
255 0.17
256 0.16
257 0.17
258 0.15
259 0.15
260 0.15
261 0.15
262 0.11
263 0.09
264 0.09
265 0.1
266 0.1
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.07
272 0.06
273 0.05
274 0.05
275 0.05
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.06
282 0.08
283 0.12
284 0.14
285 0.13
286 0.13
287 0.13
288 0.18
289 0.19
290 0.18
291 0.13
292 0.13
293 0.15
294 0.21
295 0.21
296 0.16
297 0.24
298 0.23
299 0.24
300 0.25
301 0.28
302 0.23
303 0.23
304 0.26
305 0.2
306 0.24
307 0.26
308 0.27
309 0.22
310 0.21
311 0.23
312 0.19
313 0.17
314 0.15
315 0.18
316 0.21
317 0.23
318 0.27
319 0.26
320 0.31
321 0.36
322 0.4
323 0.42
324 0.47
325 0.54
326 0.6
327 0.7
328 0.73
329 0.76
330 0.8
331 0.77
332 0.7
333 0.67
334 0.61
335 0.56
336 0.51
337 0.45
338 0.36
339 0.35
340 0.33
341 0.32
342 0.37
343 0.34
344 0.31
345 0.34
346 0.35
347 0.35
348 0.37
349 0.36
350 0.29
351 0.28
352 0.3
353 0.26
354 0.34
355 0.42
356 0.4
357 0.38
358 0.4
359 0.47
360 0.52
361 0.59
362 0.58
363 0.55
364 0.56
365 0.58
366 0.63
367 0.63
368 0.63
369 0.58
370 0.51
371 0.45
372 0.47
373 0.43
374 0.36
375 0.28
376 0.19
377 0.17
378 0.17
379 0.17
380 0.15
381 0.17
382 0.22
383 0.25
384 0.29
385 0.32
386 0.38
387 0.42
388 0.48
389 0.52
390 0.49
391 0.52
392 0.56
393 0.58
394 0.54
395 0.51
396 0.5
397 0.53
398 0.58
399 0.58
400 0.51
401 0.44
402 0.42
403 0.42
404 0.36
405 0.3
406 0.22
407 0.19
408 0.2
409 0.19
410 0.17
411 0.15
412 0.14
413 0.09
414 0.08
415 0.05
416 0.04
417 0.04
418 0.04
419 0.05
420 0.05
421 0.07
422 0.07
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.07
428 0.08
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06