FuNGI

M2NLV9

Protein Details

Accession

M2NLV9

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
35-60	RGGCITCKARRVKCDEQRPLCRRCTS	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 9.5, cyto_nucl 8, cyto 5.5, mito 5, plas 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008193 RNA_pol_Rpb11_13-16kDa_CS IPR036864 Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf IPR001138 Zn2Cys6_DnaBD
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0000981 F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific GO:0003899 F:DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity GO:0008270 F:zinc ion binding
KEGG	bcom:BAUCODRAFT_170444 -
Pfam	View protein in Pfam PF00172 Zn_clus
PROSITE	View protein in PROSITE PS01154 RNA_POL_L_13KD PS00463 ZN2_CY6_FUNGAL_1 PS50048 ZN2_CY6_FUNGAL_2
CDD	cd00067 GAL4

Amino Acid Sequences

MADGRPALPHWHTATSAHLLDARQRNGRLGSRKSRGGCITCKARRVKCDEQRPLCRRCTSVGRKCEGYVERISRSSSSGNALVASPTATQFLAGRENDTRTFDFFVSFSAPRMAGCFDKTFWCGYLLQLSHSEPLVLDCVLAISTLYEHPQYLTSFHRVRQHTAKPEKGAITSTESASDLDEHHAKALQVYNRAISEVRRRVEDASASPLIVLLSCVLFVCIELIRDNIFSALALLSKGNQLLKQFANMTLIGDEHTIFRHIKPMLARIDVLAGAFGIPHPVEVPAEFVVIGQHRVFSSTMDARTAIYGLMAESHDFIKAAAVYKASILDGQLYAESECVMCDLMSETGAAVLPATVNLRTGDGATKDNNETGLGGETCPSKKGHKGRTRLFGPKDVLMYESVSQFCDCEEEPCLAAQHHGKDEQPSMWLPLHGKASVIVDTVSAPEQATSPNLAFTSTPLLSGSSPPLSMPTAPPSALLDKQRYFENRLGQWYDALHWTRTSATPQDTEAASNLLMYYHISQIWLTTRLVLNQTVFDEYTHHFQQILHHAETLLGSRPDDDPPVFTFEVGIVPPLYFVATKCRIPSLRRQALRLLARAPKKECMWGANSTRQMAARIVAIEEEGLDLPEPELNVVQSCEGTTACDVDDSRLPPEANRVHNVEILANKVTGVFEVRVTRYRLQRGGLRKVVQDYPI

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.33
2	0.33
3	0.32
4	0.27
5	0.26
6	0.24
7	0.32
8	0.39
9	0.39
10	0.4
11	0.41
12	0.44
13	0.47
14	0.55
15	0.55
16	0.57
17	0.62
18	0.62
19	0.69
20	0.68
21	0.69
22	0.68
23	0.66
24	0.62
25	0.6
26	0.64
27	0.62
28	0.67
29	0.69
30	0.68
31	0.7
32	0.73
33	0.75
34	0.75
35	0.8
36	0.83
37	0.83
38	0.87
39	0.87
40	0.85
41	0.82
42	0.76
43	0.68
44	0.63
45	0.64
46	0.64
47	0.66
48	0.68
49	0.66
50	0.64
51	0.62
52	0.64
53	0.56
54	0.5
55	0.49
56	0.46
57	0.44
58	0.43
59	0.45
60	0.37
61	0.37
62	0.34
63	0.27
64	0.26
65	0.24
66	0.22
67	0.21
68	0.2
69	0.17
70	0.16
71	0.15
72	0.11
73	0.1
74	0.11
75	0.1
76	0.1
77	0.1
78	0.12
79	0.18
80	0.17
81	0.21
82	0.23
83	0.27
84	0.28
85	0.32
86	0.31
87	0.27
88	0.3
89	0.26
90	0.24
91	0.2
92	0.2
93	0.2
94	0.19
95	0.18
96	0.17
97	0.17
98	0.16
99	0.17
100	0.18
101	0.15
102	0.18
103	0.19
104	0.18
105	0.21
106	0.23
107	0.23
108	0.21
109	0.21
110	0.19
111	0.17
112	0.23
113	0.2
114	0.21
115	0.22
116	0.22
117	0.21
118	0.21
119	0.2
120	0.12
121	0.13
122	0.13
123	0.1
124	0.08
125	0.07
126	0.07
127	0.07
128	0.07
129	0.05
130	0.04
131	0.05
132	0.06
133	0.08
134	0.08
135	0.08
136	0.09
137	0.12
138	0.12
139	0.14
140	0.17
141	0.23
142	0.25
143	0.29
144	0.37
145	0.37
146	0.43
147	0.49
148	0.54
149	0.57
150	0.63
151	0.65
152	0.6
153	0.62
154	0.58
155	0.5
156	0.43
157	0.35
158	0.33
159	0.28
160	0.25
161	0.21
162	0.2
163	0.19
164	0.18
165	0.16
166	0.11
167	0.13
168	0.15
169	0.14
170	0.14
171	0.15
172	0.14
173	0.16
174	0.21
175	0.2
176	0.23
177	0.24
178	0.25
179	0.23
180	0.25
181	0.23
182	0.22
183	0.28
184	0.31
185	0.31
186	0.31
187	0.33
188	0.34
189	0.36
190	0.34
191	0.26
192	0.25
193	0.24
194	0.22
195	0.2
196	0.19
197	0.16
198	0.12
199	0.11
200	0.05
201	0.04
202	0.04
203	0.04
204	0.04
205	0.04
206	0.04
207	0.05
208	0.05
209	0.06
210	0.06
211	0.07
212	0.08
213	0.08
214	0.08
215	0.07
216	0.07
217	0.06
218	0.06
219	0.06
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.06
224	0.07
225	0.08
226	0.09
227	0.1
228	0.11
229	0.15
230	0.15
231	0.17
232	0.17
233	0.17
234	0.18
235	0.16
236	0.16
237	0.12
238	0.12
239	0.1
240	0.09
241	0.08
242	0.07
243	0.07
244	0.09
245	0.09
246	0.1
247	0.15
248	0.15
249	0.17
250	0.18
251	0.24
252	0.24
253	0.24
254	0.24
255	0.19
256	0.19
257	0.16
258	0.15
259	0.09
260	0.06
261	0.04
262	0.04
263	0.04
264	0.04
265	0.04
266	0.04
267	0.04
268	0.05
269	0.05
270	0.05
271	0.07
272	0.06
273	0.07
274	0.07
275	0.06
276	0.08
277	0.08
278	0.09
279	0.07
280	0.08
281	0.08
282	0.09
283	0.1
284	0.08
285	0.12
286	0.14
287	0.14
288	0.14
289	0.14
290	0.13
291	0.13
292	0.13
293	0.09
294	0.05
295	0.05
296	0.04
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.05
301	0.06
302	0.06
303	0.06
304	0.06
305	0.05
306	0.06
307	0.07
308	0.07
309	0.07
310	0.07
311	0.07
312	0.08
313	0.07
314	0.07
315	0.05
316	0.06
317	0.05
318	0.06
319	0.05
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.04
325	0.04
326	0.04
327	0.04
328	0.03
329	0.03
330	0.04
331	0.04
332	0.04
333	0.05
334	0.04
335	0.04
336	0.04
337	0.04
338	0.03
339	0.03
340	0.02
341	0.03
342	0.04
343	0.04
344	0.04
345	0.05
346	0.05
347	0.06
348	0.06
349	0.08
350	0.08
351	0.1
352	0.1
353	0.12
354	0.12
355	0.13
356	0.12
357	0.11
358	0.09
359	0.08
360	0.09
361	0.07
362	0.07
363	0.08
364	0.09
365	0.09
366	0.11
367	0.11
368	0.12
369	0.19
370	0.27
371	0.37
372	0.43
373	0.52
374	0.57
375	0.65
376	0.68
377	0.7
378	0.64
379	0.59
380	0.54
381	0.46
382	0.41
383	0.32
384	0.27
385	0.2
386	0.18
387	0.13
388	0.13
389	0.11
390	0.11
391	0.11
392	0.09
393	0.09
394	0.1
395	0.09
396	0.08
397	0.09
398	0.1
399	0.1
400	0.11
401	0.11
402	0.09
403	0.11
404	0.13
405	0.14
406	0.15
407	0.16
408	0.16
409	0.18
410	0.2
411	0.18
412	0.17
413	0.15
414	0.16
415	0.15
416	0.16
417	0.15
418	0.16
419	0.17
420	0.15
421	0.15
422	0.13
423	0.14
424	0.13
425	0.12
426	0.09
427	0.07
428	0.07
429	0.08
430	0.08
431	0.07
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.07
436	0.08
437	0.08
438	0.08
439	0.09
440	0.09
441	0.09
442	0.09
443	0.09
444	0.13
445	0.12
446	0.12
447	0.11
448	0.12
449	0.12
450	0.13
451	0.15
452	0.11
453	0.11
454	0.11
455	0.12
456	0.12
457	0.12
458	0.13
459	0.14
460	0.15
461	0.15
462	0.16
463	0.16
464	0.19
465	0.22
466	0.24
467	0.26
468	0.26
469	0.28
470	0.32
471	0.33
472	0.35
473	0.35
474	0.38
475	0.35
476	0.39
477	0.4
478	0.35
479	0.33
480	0.29
481	0.26
482	0.24
483	0.24
484	0.19
485	0.17
486	0.18
487	0.18
488	0.19
489	0.21
490	0.2
491	0.2
492	0.21
493	0.22
494	0.23
495	0.22
496	0.21
497	0.18
498	0.15
499	0.12
500	0.1
501	0.09
502	0.07
503	0.07
504	0.07
505	0.08
506	0.08
507	0.09
508	0.09
509	0.09
510	0.11
511	0.14
512	0.15
513	0.13
514	0.15
515	0.15
516	0.17
517	0.2
518	0.2
519	0.18
520	0.17
521	0.18
522	0.17
523	0.17
524	0.14
525	0.16
526	0.16
527	0.21
528	0.2
529	0.19
530	0.18
531	0.18
532	0.24
533	0.3
534	0.34
535	0.29
536	0.28
537	0.28
538	0.28
539	0.28
540	0.23
541	0.18
542	0.13
543	0.13
544	0.14
545	0.15
546	0.16
547	0.19
548	0.18
549	0.16
550	0.18
551	0.24
552	0.22
553	0.21
554	0.19
555	0.16
556	0.18
557	0.15
558	0.14
559	0.08
560	0.08
561	0.08
562	0.08
563	0.08
564	0.07
565	0.08
566	0.15
567	0.2
568	0.22
569	0.23
570	0.3
571	0.34
572	0.38
573	0.48
574	0.51
575	0.56
576	0.58
577	0.59
578	0.58
579	0.62
580	0.64
581	0.56
582	0.51
583	0.49
584	0.53
585	0.57
586	0.55
587	0.52
588	0.49
589	0.52
590	0.48
591	0.45
592	0.42
593	0.44
594	0.46
595	0.48
596	0.5
597	0.45
598	0.44
599	0.4
600	0.38
601	0.31
602	0.26
603	0.2
604	0.17
605	0.16
606	0.14
607	0.13
608	0.11
609	0.1
610	0.1
611	0.08
612	0.07
613	0.07
614	0.07
615	0.07
616	0.08
617	0.08
618	0.08
619	0.08
620	0.09
621	0.1
622	0.1
623	0.11
624	0.1
625	0.1
626	0.11
627	0.1
628	0.11
629	0.11
630	0.11
631	0.1
632	0.13
633	0.13
634	0.15
635	0.2
636	0.2
637	0.22
638	0.25
639	0.25
640	0.24
641	0.33
642	0.36
643	0.37
644	0.4
645	0.42
646	0.4
647	0.42
648	0.42
649	0.36
650	0.31
651	0.29
652	0.26
653	0.22
654	0.19
655	0.18
656	0.17
657	0.14
658	0.15
659	0.13
660	0.15
661	0.2
662	0.24
663	0.29
664	0.34
665	0.4
666	0.45
667	0.52
668	0.53
669	0.53
670	0.57
671	0.61
672	0.65
673	0.67
674	0.63
675	0.59
676	0.61

M2NLV9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer