Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RD78

Protein Details
Accession F4RD78    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
222-261YSRYRESDRRGSPRRSRHDESPPRRRRRSVSRSRSPAPRGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
230-266RRGSPRRSRHDESPPRRRRRSVSRSRSPAPRGSARRA
Subcellular Location(s) nucl 25.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG mlr:MELLADRAFT_42536  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12363  RRM_TRA2  
Amino Acid Sequences MPGPDSDRQPSRSPGAYGGSSRRSVSPSRPGEESVNHRDRPIVSGPPVRPRHAPQDVQPTNVLGVFGLSIRTRESDLEAEFSRYGKVEKVVIVYDQRSDRSRGFGFVTMRDVQDASTCISELNGLDLHGRPIRVDYSVTTKPHQPTPGQYMGTKREEEERAAYDRFGSSGGGYGHGGYQSRGYGGGGYHSSYGYGGGFRRDDWRSRGDEGYGYGRSRDDPGYSRYRESDRRGSPRRSRHDESPPRRRRRSVSRSRSPAPRGSARRASLPRDYDDVNGEAAITNGNGLSASAPPPPPPPAETARW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.4
3 0.39
4 0.39
5 0.4
6 0.4
7 0.37
8 0.37
9 0.36
10 0.35
11 0.36
12 0.39
13 0.43
14 0.44
15 0.45
16 0.46
17 0.47
18 0.47
19 0.49
20 0.5
21 0.5
22 0.51
23 0.48
24 0.46
25 0.46
26 0.43
27 0.41
28 0.38
29 0.34
30 0.32
31 0.39
32 0.43
33 0.49
34 0.53
35 0.51
36 0.51
37 0.5
38 0.54
39 0.54
40 0.54
41 0.51
42 0.58
43 0.56
44 0.54
45 0.49
46 0.4
47 0.33
48 0.3
49 0.23
50 0.11
51 0.1
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.07
56 0.07
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.14
62 0.16
63 0.16
64 0.19
65 0.19
66 0.21
67 0.2
68 0.2
69 0.17
70 0.15
71 0.15
72 0.13
73 0.14
74 0.13
75 0.13
76 0.15
77 0.15
78 0.16
79 0.18
80 0.17
81 0.2
82 0.2
83 0.21
84 0.21
85 0.24
86 0.23
87 0.25
88 0.25
89 0.23
90 0.24
91 0.26
92 0.25
93 0.23
94 0.27
95 0.23
96 0.22
97 0.2
98 0.18
99 0.14
100 0.13
101 0.13
102 0.1
103 0.08
104 0.08
105 0.08
106 0.07
107 0.08
108 0.06
109 0.07
110 0.06
111 0.06
112 0.07
113 0.08
114 0.1
115 0.11
116 0.11
117 0.09
118 0.1
119 0.11
120 0.11
121 0.11
122 0.1
123 0.15
124 0.2
125 0.22
126 0.22
127 0.26
128 0.27
129 0.3
130 0.32
131 0.27
132 0.26
133 0.31
134 0.34
135 0.3
136 0.3
137 0.3
138 0.32
139 0.33
140 0.3
141 0.24
142 0.24
143 0.24
144 0.24
145 0.23
146 0.2
147 0.21
148 0.21
149 0.2
150 0.15
151 0.14
152 0.13
153 0.11
154 0.09
155 0.05
156 0.08
157 0.08
158 0.09
159 0.09
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.07
165 0.08
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.06
172 0.08
173 0.08
174 0.09
175 0.09
176 0.09
177 0.09
178 0.08
179 0.08
180 0.06
181 0.07
182 0.07
183 0.09
184 0.1
185 0.11
186 0.16
187 0.19
188 0.22
189 0.24
190 0.29
191 0.3
192 0.33
193 0.33
194 0.28
195 0.27
196 0.25
197 0.26
198 0.24
199 0.21
200 0.18
201 0.18
202 0.18
203 0.2
204 0.19
205 0.17
206 0.18
207 0.23
208 0.31
209 0.32
210 0.34
211 0.34
212 0.4
213 0.44
214 0.47
215 0.52
216 0.52
217 0.6
218 0.66
219 0.72
220 0.75
221 0.78
222 0.81
223 0.81
224 0.78
225 0.76
226 0.79
227 0.81
228 0.82
229 0.83
230 0.84
231 0.85
232 0.86
233 0.84
234 0.82
235 0.82
236 0.83
237 0.83
238 0.83
239 0.83
240 0.85
241 0.85
242 0.85
243 0.8
244 0.76
245 0.71
246 0.71
247 0.67
248 0.67
249 0.68
250 0.61
251 0.65
252 0.63
253 0.62
254 0.6
255 0.57
256 0.52
257 0.48
258 0.47
259 0.39
260 0.38
261 0.33
262 0.25
263 0.21
264 0.17
265 0.14
266 0.12
267 0.11
268 0.07
269 0.06
270 0.05
271 0.05
272 0.05
273 0.05
274 0.06
275 0.07
276 0.09
277 0.14
278 0.15
279 0.17
280 0.21
281 0.24
282 0.26
283 0.27
284 0.31