Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RXF6

Protein Details
Accession F4RXF6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
297-319SAPNTQTTDTTKQKKKKKDKTNNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
310-316KKKKKDK
Subcellular Location(s) nucl 7.5, mito 7, cyto_nucl 7, cyto 5.5, plas 2, pero 2, golg 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
KEGG mlr:MELLADRAFT_109732  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
CDD cd11372  RNase_PH_RRP46  
Amino Acid Sequences MLFRRSDARTNLDIRPLTISLSTLSRADGSCNFAFGDLKVLGAMTGPAEVKVWDEKPKHATVEVNVLPISSLPGPSSKSSAQSIKSFISPIIYLEQYPRSLIQINLQTLSKPSERWSSTRKPSRLGFEENESISERAALMNASSIALLDGGVGMSGVGIAVAVAIVKSELVQQIGEDEDRMKEDEDQEWVILLDPSPNEEAQATSLHLIGYQFGSHPTPSNPIIDNVRQSEPTLCFCESYGSFDQTQLKGVFEVSQTGIAQIYSLIRTSLEHQYLQTLSRPGTLNPSSLPPPPSTASAPNTQTTDTTKQKKKKKDKTNN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.41
3 0.35
4 0.3
5 0.25
6 0.23
7 0.17
8 0.18
9 0.19
10 0.14
11 0.15
12 0.15
13 0.15
14 0.18
15 0.18
16 0.23
17 0.21
18 0.22
19 0.21
20 0.2
21 0.2
22 0.17
23 0.2
24 0.13
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.1
31 0.05
32 0.06
33 0.07
34 0.07
35 0.08
36 0.08
37 0.1
38 0.14
39 0.17
40 0.23
41 0.25
42 0.3
43 0.36
44 0.39
45 0.39
46 0.37
47 0.37
48 0.31
49 0.38
50 0.34
51 0.3
52 0.26
53 0.24
54 0.21
55 0.18
56 0.19
57 0.1
58 0.09
59 0.08
60 0.11
61 0.13
62 0.15
63 0.19
64 0.18
65 0.2
66 0.24
67 0.28
68 0.29
69 0.3
70 0.32
71 0.29
72 0.29
73 0.26
74 0.22
75 0.2
76 0.16
77 0.15
78 0.15
79 0.14
80 0.13
81 0.15
82 0.17
83 0.15
84 0.16
85 0.15
86 0.14
87 0.15
88 0.15
89 0.18
90 0.22
91 0.22
92 0.23
93 0.22
94 0.21
95 0.2
96 0.24
97 0.19
98 0.14
99 0.16
100 0.22
101 0.24
102 0.28
103 0.35
104 0.4
105 0.49
106 0.58
107 0.57
108 0.54
109 0.56
110 0.59
111 0.56
112 0.53
113 0.45
114 0.4
115 0.41
116 0.36
117 0.34
118 0.28
119 0.23
120 0.17
121 0.15
122 0.1
123 0.07
124 0.07
125 0.06
126 0.04
127 0.04
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.02
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.01
145 0.01
146 0.01
147 0.01
148 0.01
149 0.01
150 0.01
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.04
156 0.04
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.07
162 0.06
163 0.06
164 0.06
165 0.06
166 0.07
167 0.08
168 0.08
169 0.08
170 0.1
171 0.11
172 0.12
173 0.12
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.09
178 0.08
179 0.07
180 0.06
181 0.06
182 0.08
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.08
189 0.09
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.08
194 0.08
195 0.08
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.06
200 0.08
201 0.09
202 0.09
203 0.11
204 0.11
205 0.15
206 0.16
207 0.18
208 0.18
209 0.19
210 0.23
211 0.24
212 0.27
213 0.27
214 0.27
215 0.26
216 0.26
217 0.27
218 0.25
219 0.26
220 0.26
221 0.22
222 0.21
223 0.2
224 0.24
225 0.2
226 0.24
227 0.24
228 0.23
229 0.23
230 0.25
231 0.3
232 0.26
233 0.3
234 0.24
235 0.22
236 0.19
237 0.19
238 0.18
239 0.14
240 0.16
241 0.12
242 0.14
243 0.13
244 0.13
245 0.13
246 0.1
247 0.1
248 0.08
249 0.09
250 0.08
251 0.08
252 0.08
253 0.08
254 0.09
255 0.13
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.22
260 0.26
261 0.27
262 0.27
263 0.27
264 0.22
265 0.2
266 0.24
267 0.25
268 0.22
269 0.3
270 0.29
271 0.27
272 0.26
273 0.3
274 0.29
275 0.32
276 0.34
277 0.27
278 0.3
279 0.3
280 0.32
281 0.31
282 0.35
283 0.34
284 0.39
285 0.41
286 0.39
287 0.39
288 0.36
289 0.35
290 0.35
291 0.39
292 0.42
293 0.49
294 0.55
295 0.63
296 0.72
297 0.81
298 0.86
299 0.88