Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

Q5ADL6

Protein Details
Accession Q5ADL6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-63RTNLSSRNSKEQKWKNNSYYRNIQFHydrophilic
153-173GKNTKIKKPKFPKSTKIKGGTBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
157-170KIKKPKFPKSTKIK
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 10.833, mito_nucl 10.666, mito 6.5, cyto 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
KEGG cal:CAALFM_C306780CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
CDD cd07323  LAM  
Amino Acid Sequences MSTFKRLLPAPPPSKNAWGVNQSIDGNDPSTITQHNDNRTNLSSRNSKEQKWKNNSYYRNIQFTNLTDKPPNLTEDIEMISNNMKFISFSQSPILPPTRDTGTTSVPFPTSISDYNYKLANMANTNDNHKYTHSGKYENVTEEDDREILISVGKNTKIKKPKFPKSTKIKGGTGWYKYRISGDSPKEIPAYTTNAINTYPIPFEILPFEAQPFDIIPSPHDSITTSIGSASSFPNSAPPMVFYPQFGIPVYQIPIFNEGHPSSSLPISPISPSLQSQQSHSSPIFPPPPSSSSQLQQLSSAITVKKENIKHQIEYYFSTENLCKDTYLRSLFNKSDGSIQLSQLLSFNRMRMLTNNGKYTNLVLESIEEIPILELLLDENDKNNDSVRLVNWKSWII
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.62
2 0.62
3 0.59
4 0.55
5 0.51
6 0.47
7 0.45
8 0.44
9 0.38
10 0.33
11 0.3
12 0.24
13 0.2
14 0.18
15 0.16
16 0.13
17 0.14
18 0.16
19 0.16
20 0.24
21 0.29
22 0.37
23 0.42
24 0.44
25 0.47
26 0.49
27 0.51
28 0.45
29 0.45
30 0.46
31 0.43
32 0.52
33 0.52
34 0.55
35 0.61
36 0.68
37 0.72
38 0.74
39 0.8
40 0.79
41 0.83
42 0.84
43 0.81
44 0.82
45 0.77
46 0.74
47 0.65
48 0.58
49 0.52
50 0.47
51 0.49
52 0.4
53 0.39
54 0.34
55 0.34
56 0.35
57 0.33
58 0.33
59 0.26
60 0.24
61 0.21
62 0.2
63 0.21
64 0.18
65 0.15
66 0.14
67 0.15
68 0.14
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.11
74 0.18
75 0.16
76 0.17
77 0.2
78 0.22
79 0.22
80 0.27
81 0.3
82 0.22
83 0.22
84 0.24
85 0.24
86 0.24
87 0.26
88 0.24
89 0.26
90 0.27
91 0.27
92 0.25
93 0.22
94 0.21
95 0.19
96 0.17
97 0.15
98 0.15
99 0.19
100 0.21
101 0.22
102 0.24
103 0.24
104 0.22
105 0.2
106 0.19
107 0.18
108 0.16
109 0.16
110 0.19
111 0.2
112 0.25
113 0.26
114 0.26
115 0.24
116 0.23
117 0.27
118 0.25
119 0.32
120 0.31
121 0.31
122 0.32
123 0.35
124 0.38
125 0.34
126 0.33
127 0.27
128 0.24
129 0.23
130 0.22
131 0.18
132 0.14
133 0.12
134 0.1
135 0.07
136 0.09
137 0.08
138 0.09
139 0.12
140 0.14
141 0.17
142 0.19
143 0.27
144 0.35
145 0.4
146 0.48
147 0.56
148 0.64
149 0.71
150 0.77
151 0.79
152 0.8
153 0.85
154 0.83
155 0.78
156 0.7
157 0.61
158 0.61
159 0.57
160 0.52
161 0.46
162 0.41
163 0.36
164 0.35
165 0.34
166 0.28
167 0.26
168 0.29
169 0.28
170 0.3
171 0.3
172 0.31
173 0.3
174 0.28
175 0.25
176 0.19
177 0.2
178 0.15
179 0.15
180 0.14
181 0.14
182 0.14
183 0.14
184 0.12
185 0.09
186 0.08
187 0.07
188 0.09
189 0.08
190 0.08
191 0.09
192 0.1
193 0.09
194 0.09
195 0.09
196 0.08
197 0.08
198 0.08
199 0.06
200 0.07
201 0.08
202 0.08
203 0.08
204 0.12
205 0.14
206 0.13
207 0.13
208 0.13
209 0.13
210 0.15
211 0.15
212 0.1
213 0.09
214 0.09
215 0.09
216 0.1
217 0.09
218 0.07
219 0.07
220 0.07
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.11
226 0.13
227 0.14
228 0.15
229 0.12
230 0.14
231 0.14
232 0.16
233 0.14
234 0.12
235 0.11
236 0.12
237 0.14
238 0.13
239 0.12
240 0.12
241 0.16
242 0.16
243 0.15
244 0.18
245 0.17
246 0.17
247 0.17
248 0.17
249 0.15
250 0.15
251 0.14
252 0.11
253 0.11
254 0.1
255 0.11
256 0.12
257 0.12
258 0.12
259 0.13
260 0.16
261 0.21
262 0.21
263 0.23
264 0.28
265 0.27
266 0.3
267 0.29
268 0.29
269 0.24
270 0.3
271 0.33
272 0.27
273 0.29
274 0.29
275 0.32
276 0.31
277 0.35
278 0.31
279 0.29
280 0.36
281 0.36
282 0.32
283 0.3
284 0.28
285 0.24
286 0.22
287 0.23
288 0.15
289 0.14
290 0.15
291 0.18
292 0.25
293 0.28
294 0.34
295 0.41
296 0.44
297 0.45
298 0.48
299 0.49
300 0.44
301 0.43
302 0.41
303 0.32
304 0.28
305 0.28
306 0.26
307 0.23
308 0.23
309 0.21
310 0.17
311 0.16
312 0.2
313 0.24
314 0.27
315 0.29
316 0.3
317 0.36
318 0.37
319 0.4
320 0.38
321 0.33
322 0.34
323 0.32
324 0.34
325 0.3
326 0.29
327 0.3
328 0.28
329 0.28
330 0.24
331 0.24
332 0.21
333 0.21
334 0.21
335 0.2
336 0.2
337 0.22
338 0.22
339 0.3
340 0.35
341 0.4
342 0.46
343 0.44
344 0.44
345 0.43
346 0.42
347 0.38
348 0.29
349 0.24
350 0.17
351 0.17
352 0.19
353 0.19
354 0.17
355 0.12
356 0.11
357 0.1
358 0.1
359 0.08
360 0.05
361 0.04
362 0.05
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.12
367 0.14
368 0.16
369 0.17
370 0.18
371 0.18
372 0.18
373 0.21
374 0.22
375 0.3
376 0.31
377 0.34