FuNGI

M2N340

Protein Details

Accession

M2N340

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.5

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
144-167	SKDMMRLRNDPKRRKPNNLDKDDP	Basic
397-417	QRTAIRPKRKIGRQAVTQTDE	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17, cyto_nucl 12, cyto 5, mito 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007133 RNA_pol_II-assoc_Paf1
Gene Ontology	GO:0016593 C:Cdc73/Paf1 complex GO:0016570 P:histone modification GO:0006368 P:transcription elongation by RNA polymerase II
KEGG	bcom:BAUCODRAFT_27377 -
Pfam	View protein in Pfam PF03985 Paf1

Amino Acid Sequences

MSSSQRPERVVHQDYIARIRYSNALPPPPNPPKLLEIPGTGLAGGQYTSAAYASKLAREQPLNIEADAELGMRIDLVGIPGVFDGDERAISVRPNAQIHPADKQLLKPLSALGKSNASAGAVSFLRRTEYTASSNVQQMVSNTSKDMMRLRNDPKRRKPNNLDKDDPVNIIRNIVKGFDLAYPSDAYKGDDSTSNIRGAAVTDAEVKAWSNPKHPTKPELQLLDSYPVLPDLEALPTSGYYMVAKFISNPLGTDGYDQRLDTAILRPVDDPQMQAEYQRRLAEWDPNSGKPQPLPEYEYDYYVPSEVSAVRGIKRKFDVNDTENDDPELYTDDTPEGRAFKYERLRTYETYNQHGNATDLYNDSVALALHDTEGDVGTTPGAKQRLEKAAYYYPIIQRTAIRPKRKIGRQAVTQTDEERVDEINITVVNFTEEERARALEKQAELDPSLKGGAAIVEAAA

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.47
2	0.51
3	0.48
4	0.39
5	0.34
6	0.34
7	0.35
8	0.33
9	0.37
10	0.37
11	0.41
12	0.42
13	0.44
14	0.52
15	0.56
16	0.57
17	0.52
18	0.48
19	0.46
20	0.49
21	0.51
22	0.44
23	0.37
24	0.37
25	0.36
26	0.33
27	0.26
28	0.2
29	0.15
30	0.13
31	0.11
32	0.07
33	0.05
34	0.05
35	0.05
36	0.06
37	0.06
38	0.06
39	0.11
40	0.12
41	0.16
42	0.18
43	0.21
44	0.26
45	0.28
46	0.31
47	0.31
48	0.35
49	0.34
50	0.31
51	0.29
52	0.23
53	0.21
54	0.19
55	0.14
56	0.08
57	0.06
58	0.06
59	0.05
60	0.05
61	0.04
62	0.04
63	0.04
64	0.06
65	0.05
66	0.06
67	0.06
68	0.06
69	0.06
70	0.06
71	0.07
72	0.06
73	0.06
74	0.07
75	0.08
76	0.09
77	0.1
78	0.12
79	0.15
80	0.19
81	0.22
82	0.22
83	0.27
84	0.32
85	0.33
86	0.35
87	0.33
88	0.33
89	0.32
90	0.33
91	0.35
92	0.32
93	0.3
94	0.26
95	0.27
96	0.28
97	0.28
98	0.28
99	0.22
100	0.23
101	0.23
102	0.23
103	0.2
104	0.14
105	0.13
106	0.11
107	0.12
108	0.1
109	0.1
110	0.1
111	0.1
112	0.12
113	0.13
114	0.15
115	0.16
116	0.19
117	0.21
118	0.24
119	0.25
120	0.25
121	0.28
122	0.27
123	0.23
124	0.2
125	0.18
126	0.21
127	0.21
128	0.19
129	0.17
130	0.17
131	0.17
132	0.18
133	0.22
134	0.22
135	0.24
136	0.31
137	0.39
138	0.47
139	0.57
140	0.65
141	0.71
142	0.77
143	0.79
144	0.82
145	0.85
146	0.86
147	0.87
148	0.85
149	0.79
150	0.71
151	0.7
152	0.61
153	0.52
154	0.43
155	0.36
156	0.28
157	0.26
158	0.23
159	0.19
160	0.18
161	0.16
162	0.15
163	0.11
164	0.12
165	0.11
166	0.11
167	0.1
168	0.11
169	0.11
170	0.11
171	0.12
172	0.11
173	0.11
174	0.1
175	0.11
176	0.1
177	0.11
178	0.13
179	0.16
180	0.17
181	0.16
182	0.16
183	0.15
184	0.14
185	0.13
186	0.11
187	0.08
188	0.06
189	0.07
190	0.07
191	0.08
192	0.08
193	0.07
194	0.08
195	0.14
196	0.15
197	0.17
198	0.25
199	0.32
200	0.39
201	0.4
202	0.42
203	0.43
204	0.47
205	0.49
206	0.44
207	0.38
208	0.33
209	0.32
210	0.3
211	0.24
212	0.18
213	0.13
214	0.1
215	0.09
216	0.07
217	0.06
218	0.04
219	0.05
220	0.05
221	0.05
222	0.05
223	0.05
224	0.06
225	0.05
226	0.05
227	0.05
228	0.05
229	0.06
230	0.06
231	0.06
232	0.06
233	0.08
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.1
238	0.11
239	0.11
240	0.13
241	0.13
242	0.13
243	0.14
244	0.13
245	0.12
246	0.11
247	0.12
248	0.1
249	0.12
250	0.14
251	0.13
252	0.14
253	0.14
254	0.15
255	0.18
256	0.17
257	0.15
258	0.13
259	0.15
260	0.14
261	0.16
262	0.2
263	0.19
264	0.21
265	0.21
266	0.2
267	0.21
268	0.23
269	0.28
270	0.25
271	0.3
272	0.31
273	0.32
274	0.35
275	0.34
276	0.33
277	0.27
278	0.3
279	0.26
280	0.25
281	0.27
282	0.25
283	0.32
284	0.31
285	0.32
286	0.28
287	0.25
288	0.23
289	0.19
290	0.17
291	0.09
292	0.1
293	0.07
294	0.08
295	0.1
296	0.11
297	0.15
298	0.22
299	0.23
300	0.26
301	0.29
302	0.33
303	0.32
304	0.37
305	0.41
306	0.37
307	0.43
308	0.44
309	0.43
310	0.38
311	0.37
312	0.31
313	0.23
314	0.2
315	0.17
316	0.12
317	0.11
318	0.11
319	0.12
320	0.12
321	0.13
322	0.14
323	0.13
324	0.11
325	0.14
326	0.15
327	0.21
328	0.31
329	0.35
330	0.38
331	0.44
332	0.49
333	0.48
334	0.53
335	0.54
336	0.48
337	0.48
338	0.47
339	0.4
340	0.37
341	0.35
342	0.29
343	0.23
344	0.2
345	0.16
346	0.14
347	0.13
348	0.12
349	0.11
350	0.1
351	0.09
352	0.07
353	0.07
354	0.06
355	0.06
356	0.06
357	0.06
358	0.06
359	0.06
360	0.06
361	0.06
362	0.05
363	0.05
364	0.06
365	0.06
366	0.07
367	0.11
368	0.14
369	0.14
370	0.17
371	0.24
372	0.33
373	0.35
374	0.36
375	0.37
376	0.41
377	0.43
378	0.43
379	0.41
380	0.37
381	0.39
382	0.38
383	0.34
384	0.32
385	0.37
386	0.45
387	0.49
388	0.53
389	0.54
390	0.62
391	0.71
392	0.75
393	0.78
394	0.77
395	0.77
396	0.78
397	0.82
398	0.81
399	0.75
400	0.68
401	0.6
402	0.53
403	0.45
404	0.36
405	0.29
406	0.21
407	0.18
408	0.17
409	0.15
410	0.13
411	0.13
412	0.12
413	0.11
414	0.1
415	0.1
416	0.1
417	0.11
418	0.16
419	0.17
420	0.18
421	0.2
422	0.21
423	0.22
424	0.25
425	0.29
426	0.28
427	0.28
428	0.3
429	0.31
430	0.33
431	0.33
432	0.31
433	0.27
434	0.22
435	0.21
436	0.17
437	0.14
438	0.11
439	0.1
440	0.09

M2N340

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer