Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2NDX1

Protein Details
Accession M2NDX1    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-73GTLQRVKKTKIIKRKRRPARPQQDPSTFKSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-63VKKTKIIKRKRRPAR
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039171  Cwc2/Slt11  
IPR032297  Torus  
IPR000571  Znf_CCCH  
IPR036855  Znf_CCCH_sf  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0008380  P:RNA splicing  
KEGG bcom:BAUCODRAFT_33129  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF16131  Torus  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50103  ZF_C3H1  
Amino Acid Sequences MAEVETASVPTAPAAIFEDLTQPANTDSALVTTNTDPATTTTDGTLQRVKKTKIIKRKRRPARPQQDPSTFKSEPPPQTGTIFNIWYNKWSGGDREDSLLSKHQAKGRCNVALDSGYTRADRVTGSYFCLFFARGLCPRGQDCEYLHRLPNSRIGKEGEGGLGDIYPSNVDCFGRDKFSDYRDDMGGVG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.11
3 0.11
4 0.11
5 0.14
6 0.14
7 0.17
8 0.15
9 0.13
10 0.13
11 0.13
12 0.12
13 0.1
14 0.09
15 0.08
16 0.09
17 0.09
18 0.1
19 0.1
20 0.13
21 0.13
22 0.12
23 0.12
24 0.12
25 0.17
26 0.15
27 0.16
28 0.14
29 0.18
30 0.19
31 0.21
32 0.26
33 0.23
34 0.29
35 0.36
36 0.37
37 0.39
38 0.48
39 0.54
40 0.59
41 0.68
42 0.72
43 0.76
44 0.85
45 0.9
46 0.91
47 0.93
48 0.94
49 0.93
50 0.93
51 0.91
52 0.89
53 0.88
54 0.81
55 0.74
56 0.71
57 0.6
58 0.5
59 0.48
60 0.47
61 0.41
62 0.42
63 0.4
64 0.33
65 0.35
66 0.35
67 0.3
68 0.25
69 0.22
70 0.19
71 0.18
72 0.17
73 0.16
74 0.17
75 0.14
76 0.13
77 0.13
78 0.13
79 0.13
80 0.15
81 0.14
82 0.14
83 0.14
84 0.14
85 0.14
86 0.15
87 0.15
88 0.15
89 0.18
90 0.2
91 0.26
92 0.28
93 0.32
94 0.34
95 0.35
96 0.32
97 0.3
98 0.28
99 0.22
100 0.21
101 0.17
102 0.15
103 0.13
104 0.12
105 0.12
106 0.1
107 0.1
108 0.09
109 0.1
110 0.12
111 0.12
112 0.15
113 0.17
114 0.17
115 0.17
116 0.18
117 0.16
118 0.12
119 0.14
120 0.14
121 0.16
122 0.18
123 0.18
124 0.2
125 0.21
126 0.25
127 0.25
128 0.24
129 0.23
130 0.29
131 0.34
132 0.34
133 0.37
134 0.36
135 0.38
136 0.36
137 0.43
138 0.41
139 0.37
140 0.37
141 0.38
142 0.35
143 0.33
144 0.32
145 0.24
146 0.18
147 0.17
148 0.14
149 0.1
150 0.09
151 0.07
152 0.07
153 0.06
154 0.06
155 0.07
156 0.08
157 0.09
158 0.1
159 0.14
160 0.16
161 0.21
162 0.21
163 0.25
164 0.28
165 0.31
166 0.37
167 0.36
168 0.37
169 0.33