Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EDX3

Protein Details
Accession A0A0C4EDX3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
938-959LYLNPPTRRRGHSRPTSGARSGHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 11.5cyto_mito 11.5, cyto 10.5, nucl 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR001180  CNH_dom  
IPR032914  Vam6/VPS39/TRAP1  
IPR019452  VPS39/TGF_beta_rcpt-assoc_1  
Gene Ontology GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
Pfam View protein in Pfam  
PF00780  CNH  
PF10366  Vps39_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50219  CNH  
Amino Acid Sequences MLSAFTARPIIELRQRDKSKIETVLAYGDRILVGLNTGVLRIYRLNDAAVNGHPEPKAKDGKPAVDGGDTHAASPPPAPRATDLLREVEKFSTRAVEQLAIIKEANTLVSLSNYAVSLHDLSSFEPIEAPLANTRNATCFAVTSNVVEDPTGVPEIVSRLAVAVKRRLFLWSWHEYELSPDVTEVVLPESIRSLTWASATKIVCGMNSEYMLVDVTTKETSSITGGHIGSGGGAGAGAQGGVSRFGAYSTAGMGYMGLGGYMPKPLATRLADGELLLAKDINTMFINDEGKLLEKRQVPWQFAPDSIGYSYPYLLALQPPAKGGLEVRNPDTLSLLQTITLSGATQMHFPAPAPSLPKGFHVSSDRCVWKMNATDYDEQVKELLAAARYDEAISILNMLEDALLKDKAEMLREVKMQKAELLFRQRKFRESMDLFNEDSVNAPPDRVLRLFPPAIAGELSAYTAKSNDEDAADHHDDNTNGKTDGAKDGQKPDSPPAGTSAAPAATTETTETYTRAGGFARMLLGGGRKAVDSDATSIASTKKSSGDADDDAKSTKAMPPADDGVLDGKELRDAVLELNGYLAGARARLQRVIDPVTGKLKPSRDASAEEAFKSLLGSHQDESEEQLEKDLQETFKLVDTSLFRAYMLANPNLARSLFRIPNFCDPDVVNAKLLEHNSYTWLIDFFHGKKLHRQALELLKRFGDREQQQPDDQGEVVADETLHGPERTVRYLQTLPPDMIDLILEFSEWTLKAAPDLAMEVFVADTENAETLPRHRVVEFLGKIDVELEVRYLDHIISELNDMTPDFHNRLVDILIKHLQTKPKGDEWNAMMDRLLRFLKEGQYGLHRAFDLIDKDDPAFYEAQAIVLSNMGSHRQALEIYVFDMKDYAKAEEYCNQVHKTEGPAGPKSSTSWSHSEKDPLKDDEEAQPSIHHTLLSLYLNPPTRRRGHSRPTSGARSGRPTA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.49
2 0.53
3 0.56
4 0.58
5 0.58
6 0.57
7 0.55
8 0.53
9 0.44
10 0.42
11 0.46
12 0.41
13 0.36
14 0.28
15 0.22
16 0.19
17 0.16
18 0.15
19 0.07
20 0.07
21 0.07
22 0.08
23 0.07
24 0.08
25 0.08
26 0.08
27 0.1
28 0.11
29 0.14
30 0.16
31 0.17
32 0.18
33 0.19
34 0.21
35 0.22
36 0.22
37 0.26
38 0.23
39 0.26
40 0.25
41 0.27
42 0.29
43 0.33
44 0.41
45 0.36
46 0.44
47 0.46
48 0.5
49 0.5
50 0.5
51 0.45
52 0.38
53 0.37
54 0.33
55 0.34
56 0.29
57 0.27
58 0.27
59 0.25
60 0.22
61 0.26
62 0.25
63 0.21
64 0.23
65 0.24
66 0.24
67 0.3
68 0.33
69 0.37
70 0.36
71 0.37
72 0.39
73 0.39
74 0.39
75 0.36
76 0.35
77 0.29
78 0.27
79 0.26
80 0.23
81 0.24
82 0.24
83 0.22
84 0.2
85 0.26
86 0.26
87 0.23
88 0.22
89 0.2
90 0.19
91 0.17
92 0.16
93 0.1
94 0.09
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.09
99 0.1
100 0.1
101 0.09
102 0.09
103 0.11
104 0.11
105 0.11
106 0.13
107 0.13
108 0.13
109 0.17
110 0.16
111 0.14
112 0.14
113 0.13
114 0.12
115 0.12
116 0.14
117 0.15
118 0.17
119 0.18
120 0.19
121 0.19
122 0.2
123 0.22
124 0.22
125 0.17
126 0.15
127 0.16
128 0.18
129 0.18
130 0.16
131 0.16
132 0.15
133 0.15
134 0.14
135 0.13
136 0.11
137 0.12
138 0.12
139 0.1
140 0.09
141 0.1
142 0.12
143 0.12
144 0.11
145 0.08
146 0.08
147 0.11
148 0.14
149 0.18
150 0.24
151 0.25
152 0.26
153 0.27
154 0.29
155 0.28
156 0.31
157 0.34
158 0.33
159 0.34
160 0.35
161 0.35
162 0.32
163 0.34
164 0.31
165 0.25
166 0.18
167 0.14
168 0.13
169 0.13
170 0.13
171 0.1
172 0.08
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.09
177 0.1
178 0.09
179 0.11
180 0.11
181 0.1
182 0.13
183 0.16
184 0.17
185 0.22
186 0.23
187 0.22
188 0.23
189 0.23
190 0.2
191 0.19
192 0.2
193 0.16
194 0.16
195 0.15
196 0.13
197 0.13
198 0.13
199 0.1
200 0.08
201 0.06
202 0.08
203 0.08
204 0.08
205 0.09
206 0.09
207 0.09
208 0.1
209 0.11
210 0.1
211 0.14
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.13
216 0.11
217 0.1
218 0.08
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.05
232 0.06
233 0.07
234 0.06
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.06
239 0.06
240 0.06
241 0.05
242 0.05
243 0.04
244 0.03
245 0.03
246 0.04
247 0.04
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.06
252 0.07
253 0.13
254 0.14
255 0.16
256 0.17
257 0.19
258 0.18
259 0.18
260 0.18
261 0.14
262 0.12
263 0.1
264 0.09
265 0.06
266 0.08
267 0.08
268 0.09
269 0.08
270 0.09
271 0.09
272 0.12
273 0.13
274 0.11
275 0.12
276 0.1
277 0.12
278 0.13
279 0.13
280 0.17
281 0.19
282 0.21
283 0.3
284 0.35
285 0.38
286 0.39
287 0.43
288 0.38
289 0.35
290 0.36
291 0.27
292 0.23
293 0.19
294 0.17
295 0.13
296 0.12
297 0.12
298 0.09
299 0.09
300 0.08
301 0.08
302 0.08
303 0.11
304 0.12
305 0.12
306 0.13
307 0.14
308 0.13
309 0.13
310 0.13
311 0.16
312 0.21
313 0.22
314 0.24
315 0.26
316 0.26
317 0.25
318 0.26
319 0.19
320 0.15
321 0.15
322 0.12
323 0.1
324 0.1
325 0.1
326 0.08
327 0.08
328 0.06
329 0.05
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.08
334 0.08
335 0.08
336 0.08
337 0.1
338 0.1
339 0.11
340 0.13
341 0.14
342 0.16
343 0.17
344 0.19
345 0.21
346 0.2
347 0.22
348 0.25
349 0.26
350 0.27
351 0.33
352 0.32
353 0.28
354 0.3
355 0.26
356 0.24
357 0.26
358 0.26
359 0.24
360 0.27
361 0.28
362 0.28
363 0.32
364 0.28
365 0.24
366 0.21
367 0.16
368 0.12
369 0.11
370 0.11
371 0.07
372 0.07
373 0.08
374 0.08
375 0.08
376 0.08
377 0.07
378 0.06
379 0.05
380 0.05
381 0.05
382 0.05
383 0.04
384 0.04
385 0.04
386 0.04
387 0.04
388 0.04
389 0.05
390 0.06
391 0.06
392 0.06
393 0.08
394 0.09
395 0.11
396 0.12
397 0.12
398 0.15
399 0.19
400 0.2
401 0.2
402 0.2
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.18
407 0.2
408 0.29
409 0.33
410 0.35
411 0.44
412 0.43
413 0.44
414 0.45
415 0.42
416 0.41
417 0.38
418 0.4
419 0.36
420 0.38
421 0.35
422 0.31
423 0.3
424 0.2
425 0.18
426 0.13
427 0.11
428 0.08
429 0.07
430 0.08
431 0.09
432 0.11
433 0.1
434 0.11
435 0.1
436 0.15
437 0.15
438 0.14
439 0.15
440 0.13
441 0.13
442 0.11
443 0.1
444 0.06
445 0.06
446 0.07
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.05
451 0.05
452 0.06
453 0.06
454 0.06
455 0.07
456 0.07
457 0.08
458 0.14
459 0.15
460 0.15
461 0.15
462 0.15
463 0.15
464 0.16
465 0.16
466 0.11
467 0.09
468 0.1
469 0.1
470 0.1
471 0.13
472 0.14
473 0.16
474 0.17
475 0.22
476 0.24
477 0.25
478 0.25
479 0.25
480 0.27
481 0.24
482 0.22
483 0.2
484 0.2
485 0.18
486 0.17
487 0.15
488 0.11
489 0.1
490 0.1
491 0.08
492 0.06
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.08
497 0.08
498 0.09
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.07
505 0.07
506 0.07
507 0.07
508 0.06
509 0.06
510 0.06
511 0.06
512 0.06
513 0.06
514 0.06
515 0.05
516 0.06
517 0.06
518 0.06
519 0.06
520 0.08
521 0.09
522 0.09
523 0.09
524 0.1
525 0.11
526 0.11
527 0.11
528 0.09
529 0.1
530 0.11
531 0.11
532 0.12
533 0.15
534 0.16
535 0.18
536 0.18
537 0.18
538 0.17
539 0.17
540 0.15
541 0.12
542 0.13
543 0.14
544 0.14
545 0.14
546 0.16
547 0.18
548 0.18
549 0.17
550 0.15
551 0.12
552 0.11
553 0.11
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.06
558 0.06
559 0.05
560 0.05
561 0.05
562 0.07
563 0.07
564 0.06
565 0.06
566 0.06
567 0.06
568 0.05
569 0.05
570 0.03
571 0.04
572 0.06
573 0.09
574 0.11
575 0.12
576 0.13
577 0.15
578 0.19
579 0.22
580 0.22
581 0.2
582 0.21
583 0.24
584 0.24
585 0.23
586 0.24
587 0.23
588 0.25
589 0.27
590 0.29
591 0.26
592 0.29
593 0.32
594 0.34
595 0.32
596 0.29
597 0.26
598 0.22
599 0.2
600 0.17
601 0.12
602 0.09
603 0.11
604 0.13
605 0.13
606 0.14
607 0.14
608 0.14
609 0.17
610 0.17
611 0.15
612 0.13
613 0.14
614 0.13
615 0.12
616 0.13
617 0.13
618 0.11
619 0.1
620 0.11
621 0.11
622 0.12
623 0.13
624 0.12
625 0.12
626 0.14
627 0.17
628 0.17
629 0.17
630 0.14
631 0.14
632 0.15
633 0.16
634 0.18
635 0.16
636 0.16
637 0.16
638 0.17
639 0.17
640 0.17
641 0.13
642 0.12
643 0.18
644 0.21
645 0.23
646 0.26
647 0.28
648 0.38
649 0.42
650 0.39
651 0.34
652 0.3
653 0.35
654 0.35
655 0.33
656 0.24
657 0.2
658 0.2
659 0.21
660 0.22
661 0.17
662 0.14
663 0.13
664 0.15
665 0.15
666 0.15
667 0.12
668 0.12
669 0.11
670 0.11
671 0.15
672 0.14
673 0.21
674 0.24
675 0.25
676 0.32
677 0.4
678 0.46
679 0.42
680 0.43
681 0.42
682 0.5
683 0.58
684 0.53
685 0.46
686 0.41
687 0.41
688 0.4
689 0.35
690 0.33
691 0.28
692 0.33
693 0.39
694 0.41
695 0.41
696 0.43
697 0.43
698 0.35
699 0.31
700 0.23
701 0.15
702 0.12
703 0.11
704 0.08
705 0.06
706 0.05
707 0.06
708 0.06
709 0.08
710 0.08
711 0.08
712 0.12
713 0.16
714 0.18
715 0.19
716 0.19
717 0.23
718 0.26
719 0.28
720 0.31
721 0.31
722 0.28
723 0.27
724 0.28
725 0.22
726 0.19
727 0.16
728 0.09
729 0.07
730 0.07
731 0.06
732 0.05
733 0.05
734 0.07
735 0.07
736 0.08
737 0.08
738 0.08
739 0.09
740 0.11
741 0.11
742 0.09
743 0.11
744 0.1
745 0.08
746 0.08
747 0.08
748 0.06
749 0.06
750 0.06
751 0.04
752 0.05
753 0.05
754 0.05
755 0.05
756 0.06
757 0.07
758 0.09
759 0.15
760 0.17
761 0.18
762 0.18
763 0.19
764 0.22
765 0.31
766 0.3
767 0.26
768 0.26
769 0.24
770 0.24
771 0.23
772 0.2
773 0.1
774 0.09
775 0.08
776 0.07
777 0.07
778 0.08
779 0.08
780 0.07
781 0.07
782 0.07
783 0.06
784 0.07
785 0.09
786 0.09
787 0.08
788 0.09
789 0.09
790 0.11
791 0.13
792 0.16
793 0.16
794 0.18
795 0.18
796 0.18
797 0.19
798 0.18
799 0.2
800 0.17
801 0.2
802 0.22
803 0.23
804 0.26
805 0.29
806 0.34
807 0.35
808 0.41
809 0.41
810 0.45
811 0.5
812 0.5
813 0.53
814 0.48
815 0.53
816 0.47
817 0.42
818 0.35
819 0.32
820 0.29
821 0.27
822 0.25
823 0.15
824 0.17
825 0.2
826 0.25
827 0.26
828 0.26
829 0.24
830 0.3
831 0.33
832 0.32
833 0.31
834 0.26
835 0.22
836 0.22
837 0.24
838 0.21
839 0.21
840 0.22
841 0.21
842 0.21
843 0.22
844 0.21
845 0.19
846 0.16
847 0.13
848 0.16
849 0.14
850 0.14
851 0.13
852 0.13
853 0.11
854 0.11
855 0.11
856 0.07
857 0.08
858 0.1
859 0.1
860 0.11
861 0.11
862 0.11
863 0.12
864 0.13
865 0.14
866 0.12
867 0.14
868 0.17
869 0.16
870 0.15
871 0.16
872 0.15
873 0.16
874 0.17
875 0.18
876 0.19
877 0.21
878 0.24
879 0.29
880 0.33
881 0.35
882 0.38
883 0.38
884 0.34
885 0.35
886 0.34
887 0.33
888 0.37
889 0.36
890 0.36
891 0.39
892 0.41
893 0.4
894 0.39
895 0.36
896 0.34
897 0.35
898 0.34
899 0.37
900 0.4
901 0.42
902 0.45
903 0.52
904 0.53
905 0.55
906 0.57
907 0.53
908 0.5
909 0.49
910 0.48
911 0.47
912 0.45
913 0.39
914 0.33
915 0.31
916 0.31
917 0.3
918 0.28
919 0.19
920 0.14
921 0.15
922 0.19
923 0.2
924 0.19
925 0.18
926 0.24
927 0.32
928 0.36
929 0.38
930 0.42
931 0.47
932 0.52
933 0.6
934 0.64
935 0.67
936 0.74
937 0.79
938 0.81
939 0.82
940 0.82
941 0.8
942 0.77
943 0.72