Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4E2U6

Protein Details
Accession A0A0C4E2U6    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-64ALGVKLGHRRKLQRRIANSRGVAHydrophilic
100-123AVGIITKRKYRRHPKADENAPERPHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
IPR001660  SAM  
IPR013761  SAM/pointed_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF00536  SAM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MSQSLGEIFGELGISQYLDAFVDQGFDTWDTILDITESDLDALGVKLGHRRKLQRRIANSRGVAPEAALASPTISPTQRNLEEQQRQDAHRAETPRADAAVGIITKRKYRRHPKADENAPERPPSAYVLFSNKMRDDLKDQHLTFTEIAKLVGEHWQALAPSEKEPYETQAQTAKDKYNHDLAEYKKTPQYKEYLAYLQDFKLKHAAPSGEKENLKRVKLSEGSASPCHPSAPRRARSHTTPAGGSSTASSSVGATGASSEGRKTSEPPPGSRDQRVGSVASVPEYGSSANYPIDRSSVERSPSRSSSPHEGSVHHAPYSNPNAPPTIDGHAQYQHTPQQQQHHTLPSLSNILENPGQGEEGRGGFNPFQGGSPALHEHHAPALKKEFSSGASPSSSAASVCHPRTPVEGSLPIHLLLVSGQGKAGAVPGLEQSAMGRPSERSNPLKRSASPESRPSSLLHYAHHHHLASDPLIKAQGITTPKPWRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.06
6 0.06
7 0.06
8 0.06
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.1
13 0.1
14 0.11
15 0.1
16 0.11
17 0.1
18 0.1
19 0.1
20 0.08
21 0.07
22 0.08
23 0.09
24 0.08
25 0.08
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.07
30 0.07
31 0.07
32 0.08
33 0.15
34 0.2
35 0.28
36 0.35
37 0.45
38 0.55
39 0.65
40 0.74
41 0.77
42 0.82
43 0.85
44 0.85
45 0.84
46 0.76
47 0.71
48 0.64
49 0.56
50 0.46
51 0.36
52 0.3
53 0.22
54 0.2
55 0.13
56 0.1
57 0.09
58 0.1
59 0.11
60 0.11
61 0.11
62 0.13
63 0.16
64 0.24
65 0.26
66 0.3
67 0.34
68 0.42
69 0.49
70 0.5
71 0.56
72 0.53
73 0.52
74 0.53
75 0.52
76 0.46
77 0.43
78 0.44
79 0.38
80 0.36
81 0.37
82 0.33
83 0.29
84 0.25
85 0.19
86 0.17
87 0.18
88 0.14
89 0.13
90 0.15
91 0.17
92 0.23
93 0.3
94 0.37
95 0.44
96 0.55
97 0.65
98 0.71
99 0.79
100 0.84
101 0.88
102 0.89
103 0.88
104 0.83
105 0.78
106 0.7
107 0.62
108 0.52
109 0.42
110 0.34
111 0.27
112 0.23
113 0.18
114 0.18
115 0.22
116 0.24
117 0.25
118 0.28
119 0.26
120 0.28
121 0.27
122 0.27
123 0.28
124 0.33
125 0.38
126 0.42
127 0.42
128 0.41
129 0.41
130 0.41
131 0.35
132 0.29
133 0.24
134 0.16
135 0.16
136 0.13
137 0.12
138 0.1
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.11
143 0.12
144 0.12
145 0.13
146 0.16
147 0.12
148 0.13
149 0.14
150 0.14
151 0.16
152 0.16
153 0.19
154 0.21
155 0.2
156 0.21
157 0.24
158 0.26
159 0.27
160 0.3
161 0.3
162 0.29
163 0.31
164 0.33
165 0.34
166 0.33
167 0.31
168 0.34
169 0.31
170 0.37
171 0.36
172 0.36
173 0.32
174 0.35
175 0.35
176 0.32
177 0.34
178 0.28
179 0.29
180 0.29
181 0.29
182 0.27
183 0.28
184 0.26
185 0.23
186 0.24
187 0.21
188 0.19
189 0.22
190 0.21
191 0.19
192 0.21
193 0.23
194 0.21
195 0.25
196 0.28
197 0.27
198 0.29
199 0.29
200 0.35
201 0.37
202 0.35
203 0.33
204 0.3
205 0.3
206 0.31
207 0.31
208 0.26
209 0.24
210 0.26
211 0.26
212 0.26
213 0.21
214 0.19
215 0.18
216 0.16
217 0.16
218 0.23
219 0.31
220 0.38
221 0.42
222 0.47
223 0.51
224 0.54
225 0.59
226 0.53
227 0.46
228 0.38
229 0.34
230 0.3
231 0.26
232 0.21
233 0.14
234 0.1
235 0.08
236 0.08
237 0.07
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.05
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.05
246 0.05
247 0.05
248 0.05
249 0.07
250 0.08
251 0.11
252 0.15
253 0.22
254 0.25
255 0.27
256 0.32
257 0.37
258 0.41
259 0.4
260 0.39
261 0.32
262 0.32
263 0.32
264 0.27
265 0.2
266 0.18
267 0.16
268 0.14
269 0.13
270 0.1
271 0.09
272 0.08
273 0.08
274 0.06
275 0.06
276 0.07
277 0.08
278 0.08
279 0.09
280 0.09
281 0.1
282 0.1
283 0.12
284 0.16
285 0.18
286 0.21
287 0.23
288 0.27
289 0.31
290 0.33
291 0.34
292 0.32
293 0.33
294 0.38
295 0.39
296 0.41
297 0.37
298 0.36
299 0.38
300 0.42
301 0.39
302 0.31
303 0.28
304 0.23
305 0.28
306 0.33
307 0.33
308 0.27
309 0.26
310 0.27
311 0.26
312 0.27
313 0.23
314 0.2
315 0.18
316 0.18
317 0.19
318 0.21
319 0.22
320 0.22
321 0.22
322 0.24
323 0.27
324 0.29
325 0.3
326 0.36
327 0.39
328 0.44
329 0.45
330 0.44
331 0.41
332 0.4
333 0.37
334 0.3
335 0.28
336 0.22
337 0.19
338 0.14
339 0.16
340 0.15
341 0.14
342 0.13
343 0.11
344 0.11
345 0.1
346 0.11
347 0.09
348 0.09
349 0.11
350 0.1
351 0.12
352 0.12
353 0.13
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.12
358 0.12
359 0.11
360 0.13
361 0.16
362 0.15
363 0.16
364 0.16
365 0.16
366 0.2
367 0.24
368 0.22
369 0.23
370 0.29
371 0.29
372 0.29
373 0.3
374 0.26
375 0.23
376 0.26
377 0.23
378 0.2
379 0.19
380 0.19
381 0.18
382 0.18
383 0.16
384 0.12
385 0.12
386 0.15
387 0.21
388 0.23
389 0.26
390 0.25
391 0.26
392 0.3
393 0.33
394 0.3
395 0.28
396 0.32
397 0.3
398 0.32
399 0.32
400 0.28
401 0.24
402 0.21
403 0.16
404 0.1
405 0.15
406 0.13
407 0.12
408 0.11
409 0.11
410 0.11
411 0.11
412 0.12
413 0.07
414 0.06
415 0.07
416 0.08
417 0.09
418 0.09
419 0.09
420 0.09
421 0.13
422 0.14
423 0.14
424 0.15
425 0.16
426 0.21
427 0.29
428 0.35
429 0.38
430 0.46
431 0.53
432 0.6
433 0.64
434 0.62
435 0.63
436 0.66
437 0.67
438 0.65
439 0.67
440 0.64
441 0.6
442 0.59
443 0.52
444 0.48
445 0.47
446 0.42
447 0.37
448 0.38
449 0.4
450 0.45
451 0.49
452 0.42
453 0.34
454 0.35
455 0.35
456 0.32
457 0.33
458 0.27
459 0.24
460 0.25
461 0.24
462 0.22
463 0.19
464 0.21
465 0.21
466 0.24
467 0.31