Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RDG3

Protein Details
Accession F4RDG3    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-311EVVVTKPTKNTKKPTKASGAKRGAKAKKHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
292-311KNTKKPTKASGAKRGAKAKK
Subcellular Location(s) nucl 21.5, cyto_nucl 12.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001611  Leu-rich_rpt  
IPR003591  Leu-rich_rpt_typical-subtyp  
IPR032675  LRR_dom_sf  
IPR044640  RU2A  
Gene Ontology GO:0030620  F:U2 snRNA binding  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG mlr:MELLADRAFT_77115  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14580  LRR_9  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51450  LRR  
Amino Acid Sequences MPRMTPELLLSTHSYLNPLKDRELDLRGFQIPAIENLAVTKDSIDSLDLTDNIIRSVINLPKLNRLKHLYLSNNPITFISPNLSQSLPNLKSLVMSNCQLTNFNQLFKILSQFKHLEFLVLNGNPITKMSFYRDWCIYSCKKLRMLDHRRIKDQERKTSLELFYDPTTKLPTDLAKSLLILDVQTENNAIQMDYQQKDQQLPGQMGKTLTNEERDRIKLAIEKAETVDEVRRLKRMLEQGFVPKGEKEIQVEKEVEKETETQKDTEMVTEKETETENQMVVDEEVVVTKPTKNTKKPTKASGAKRGAKAKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.24
3 0.3
4 0.34
5 0.33
6 0.34
7 0.34
8 0.39
9 0.4
10 0.43
11 0.39
12 0.35
13 0.36
14 0.34
15 0.31
16 0.27
17 0.25
18 0.21
19 0.19
20 0.21
21 0.16
22 0.15
23 0.15
24 0.17
25 0.13
26 0.12
27 0.11
28 0.08
29 0.08
30 0.09
31 0.09
32 0.08
33 0.1
34 0.12
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.13
39 0.12
40 0.12
41 0.1
42 0.09
43 0.15
44 0.17
45 0.21
46 0.26
47 0.27
48 0.37
49 0.43
50 0.44
51 0.45
52 0.47
53 0.44
54 0.46
55 0.53
56 0.49
57 0.49
58 0.55
59 0.54
60 0.48
61 0.45
62 0.4
63 0.33
64 0.27
65 0.23
66 0.18
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.16
71 0.15
72 0.17
73 0.25
74 0.23
75 0.23
76 0.22
77 0.2
78 0.21
79 0.23
80 0.24
81 0.17
82 0.17
83 0.17
84 0.18
85 0.19
86 0.19
87 0.18
88 0.24
89 0.22
90 0.22
91 0.21
92 0.2
93 0.2
94 0.19
95 0.24
96 0.19
97 0.18
98 0.22
99 0.24
100 0.24
101 0.26
102 0.25
103 0.2
104 0.16
105 0.17
106 0.17
107 0.15
108 0.15
109 0.12
110 0.12
111 0.11
112 0.11
113 0.1
114 0.06
115 0.08
116 0.12
117 0.18
118 0.19
119 0.23
120 0.25
121 0.25
122 0.26
123 0.31
124 0.28
125 0.3
126 0.34
127 0.34
128 0.38
129 0.39
130 0.44
131 0.49
132 0.55
133 0.57
134 0.62
135 0.62
136 0.61
137 0.61
138 0.61
139 0.6
140 0.59
141 0.59
142 0.54
143 0.54
144 0.51
145 0.53
146 0.47
147 0.4
148 0.33
149 0.26
150 0.21
151 0.2
152 0.18
153 0.14
154 0.15
155 0.13
156 0.13
157 0.12
158 0.13
159 0.13
160 0.14
161 0.16
162 0.14
163 0.14
164 0.14
165 0.13
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.07
173 0.07
174 0.08
175 0.08
176 0.07
177 0.05
178 0.08
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.2
185 0.2
186 0.22
187 0.2
188 0.22
189 0.22
190 0.21
191 0.22
192 0.22
193 0.22
194 0.19
195 0.19
196 0.18
197 0.22
198 0.22
199 0.23
200 0.26
201 0.27
202 0.27
203 0.24
204 0.24
205 0.23
206 0.24
207 0.28
208 0.24
209 0.24
210 0.22
211 0.23
212 0.21
213 0.18
214 0.19
215 0.17
216 0.21
217 0.22
218 0.24
219 0.24
220 0.25
221 0.3
222 0.35
223 0.34
224 0.32
225 0.34
226 0.39
227 0.41
228 0.41
229 0.36
230 0.27
231 0.27
232 0.27
233 0.26
234 0.23
235 0.27
236 0.29
237 0.32
238 0.33
239 0.31
240 0.32
241 0.32
242 0.28
243 0.23
244 0.24
245 0.24
246 0.3
247 0.32
248 0.27
249 0.27
250 0.29
251 0.28
252 0.28
253 0.28
254 0.22
255 0.22
256 0.24
257 0.23
258 0.22
259 0.24
260 0.21
261 0.21
262 0.21
263 0.19
264 0.16
265 0.16
266 0.16
267 0.14
268 0.13
269 0.09
270 0.07
271 0.08
272 0.08
273 0.09
274 0.09
275 0.12
276 0.17
277 0.27
278 0.37
279 0.45
280 0.55
281 0.66
282 0.75
283 0.8
284 0.83
285 0.84
286 0.84
287 0.85
288 0.86
289 0.85
290 0.82
291 0.82