Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4E934

Protein Details
Accession A0A0C4E934    Localization Confidence High Confidence Score 15.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
299-321TTTTSGGRRKKRKGALTDKTGHSHydrophilic
386-407GAQPNRGGKRGKKHYKGGLAELBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
306-312RRKKRKG
391-401RGGKRGKKHYK
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, mito 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007307  Ltv1  
Gene Ontology GO:0042274  P:ribosomal small subunit biogenesis  
Pfam View protein in Pfam  
PF04180  LTV  
Amino Acid Sequences MARGKWIDKKTATHFTLVHRPQNDPLIHDESAPSMVLNPTQPPNASSSKGKKLDDLASELGSDALSIRDNEGEAANHGIYFDDTEYDYMQHMRDLGAGEGEAVFVEAKIGQKEGKGKQKQSLEDALREMDLQNRSSDLLDAEILPTRDLPRATYQAQQDVPDAIAGFQPDMDPRLREVLEALEDEAYVDEDGDDDLFRELAKDAKELKEHEFEDEFYDGEDGWESDATAKPGKDSNDDCDDEAPQLVRTGEQPNEGPSQEWLEDFKQFKKDQGGERRPAAAAARTGAAAPSELQSSVWTTTTSGGRRKKRKGALTDKTGHSMTSASLVRTEGLSLLDARFERIEEEYTADFGDDELGSVVSGMSTASSVQGPMRSDFDGILDDFLGAQPNRGGKRGKKHYKGGLAELDEIRKGLGPARISTR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.55
2 0.52
3 0.58
4 0.58
5 0.58
6 0.5
7 0.51
8 0.5
9 0.56
10 0.5
11 0.42
12 0.42
13 0.4
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.25
18 0.25
19 0.22
20 0.15
21 0.11
22 0.12
23 0.13
24 0.14
25 0.17
26 0.19
27 0.22
28 0.23
29 0.22
30 0.27
31 0.29
32 0.31
33 0.36
34 0.4
35 0.47
36 0.53
37 0.53
38 0.51
39 0.53
40 0.55
41 0.5
42 0.47
43 0.39
44 0.33
45 0.32
46 0.29
47 0.23
48 0.16
49 0.13
50 0.08
51 0.06
52 0.07
53 0.07
54 0.08
55 0.09
56 0.1
57 0.11
58 0.11
59 0.11
60 0.11
61 0.13
62 0.12
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.09
67 0.1
68 0.09
69 0.07
70 0.08
71 0.09
72 0.1
73 0.1
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.1
80 0.11
81 0.11
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.08
86 0.08
87 0.07
88 0.06
89 0.05
90 0.04
91 0.04
92 0.04
93 0.05
94 0.07
95 0.08
96 0.09
97 0.1
98 0.12
99 0.2
100 0.27
101 0.36
102 0.42
103 0.45
104 0.52
105 0.58
106 0.58
107 0.56
108 0.57
109 0.5
110 0.45
111 0.42
112 0.36
113 0.3
114 0.27
115 0.22
116 0.19
117 0.18
118 0.16
119 0.15
120 0.15
121 0.16
122 0.16
123 0.16
124 0.1
125 0.09
126 0.08
127 0.08
128 0.08
129 0.1
130 0.1
131 0.09
132 0.1
133 0.11
134 0.13
135 0.13
136 0.15
137 0.17
138 0.21
139 0.23
140 0.27
141 0.28
142 0.3
143 0.31
144 0.3
145 0.26
146 0.22
147 0.2
148 0.15
149 0.13
150 0.08
151 0.08
152 0.07
153 0.06
154 0.05
155 0.06
156 0.06
157 0.08
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.13
162 0.12
163 0.12
164 0.12
165 0.11
166 0.12
167 0.11
168 0.11
169 0.07
170 0.07
171 0.07
172 0.06
173 0.06
174 0.04
175 0.04
176 0.03
177 0.03
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.03
182 0.04
183 0.04
184 0.04
185 0.04
186 0.05
187 0.07
188 0.08
189 0.1
190 0.12
191 0.15
192 0.17
193 0.19
194 0.22
195 0.24
196 0.24
197 0.24
198 0.22
199 0.21
200 0.2
201 0.18
202 0.15
203 0.1
204 0.1
205 0.07
206 0.07
207 0.06
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.04
212 0.05
213 0.06
214 0.08
215 0.1
216 0.1
217 0.11
218 0.14
219 0.15
220 0.18
221 0.19
222 0.22
223 0.26
224 0.27
225 0.26
226 0.24
227 0.23
228 0.19
229 0.18
230 0.14
231 0.08
232 0.08
233 0.08
234 0.08
235 0.09
236 0.12
237 0.13
238 0.14
239 0.15
240 0.16
241 0.19
242 0.18
243 0.17
244 0.14
245 0.15
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.13
250 0.18
251 0.19
252 0.22
253 0.26
254 0.26
255 0.29
256 0.33
257 0.37
258 0.41
259 0.51
260 0.55
261 0.54
262 0.55
263 0.54
264 0.47
265 0.43
266 0.35
267 0.26
268 0.19
269 0.15
270 0.14
271 0.12
272 0.12
273 0.11
274 0.09
275 0.07
276 0.07
277 0.07
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.08
282 0.1
283 0.1
284 0.1
285 0.1
286 0.1
287 0.13
288 0.18
289 0.22
290 0.28
291 0.36
292 0.45
293 0.55
294 0.63
295 0.69
296 0.73
297 0.78
298 0.8
299 0.82
300 0.82
301 0.81
302 0.8
303 0.73
304 0.67
305 0.59
306 0.48
307 0.37
308 0.29
309 0.2
310 0.18
311 0.17
312 0.14
313 0.15
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.14
318 0.09
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.09
323 0.12
324 0.11
325 0.13
326 0.12
327 0.12
328 0.13
329 0.13
330 0.16
331 0.13
332 0.17
333 0.16
334 0.16
335 0.16
336 0.14
337 0.12
338 0.1
339 0.11
340 0.07
341 0.07
342 0.07
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.04
348 0.04
349 0.04
350 0.03
351 0.04
352 0.04
353 0.05
354 0.06
355 0.07
356 0.09
357 0.13
358 0.15
359 0.17
360 0.19
361 0.19
362 0.2
363 0.19
364 0.18
365 0.17
366 0.15
367 0.14
368 0.12
369 0.11
370 0.1
371 0.1
372 0.15
373 0.12
374 0.13
375 0.15
376 0.22
377 0.24
378 0.29
379 0.36
380 0.38
381 0.49
382 0.59
383 0.67
384 0.7
385 0.77
386 0.82
387 0.84
388 0.81
389 0.77
390 0.74
391 0.66
392 0.62
393 0.56
394 0.49
395 0.39
396 0.34
397 0.28
398 0.22
399 0.19
400 0.19
401 0.21
402 0.21