Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4E9Z9

Protein Details
Accession A0A0C4E9Z9    Localization Confidence High Confidence Score 19.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
23-45TASRTRPNRTLLKLWRRRLRYSTHydrophilic
282-302PAKPVEPKPRRPKASKVAPKVBasic
410-432SKDTSPTKFKAPKKKPRTITELAHydrophilic
469-494HGHPVSRPRKPDRKRKGKQGRRQLLLBasic
775-798ASRAVTKSPVKKPRGRPTKDGPTPHydrophilic
824-859TASSPKPRGRPKKTDSPEGSPKPRGRPKKTGSPEGSBasic
871-907SPERSPKSRGRTKKTASPERSPRPWGRTKKNSSSATTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-266VKPAARKPSAPSRRKKAE
284-298KPVEPKPRRPKASKV
417-425KFKAPKKKP
474-490SRPRKPDRKRKGKQGRR
781-793KSPVKKPRGRPTK
813-906KPRGRPKKTAATASSPKPRGRPKKTDSPEGSPKPRGRPKKTGSPEGSPKPRGRAKKAGSPERSPKSRGRTKKTASPERSPRPWGRTKKNSSSAT
908-908K
Subcellular Location(s) mito 21, nucl 6
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR027784  Slx4_ascomycetes  
IPR018574  Structure-sp_endonuc_su_Slx4  
Gene Ontology GO:0033557  C:Slx1-Slx4 complex  
GO:0017108  F:5'-flap endonuclease activity  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006281  P:DNA repair  
GO:0006260  P:DNA replication  
GO:0006996  P:organelle organization  
Pfam View protein in Pfam  
PF09494  Slx4  
CDD cd22999  SAP_SLX4  
Amino Acid Sequences MKARAACRTKIGAISITTPSATTASRTRPNRTLLKLWRRRLRYSTLSLPIRFACALRRDVVRRRLAIAMTSPSRFLPSSPPRPPTHAPRSSSPDLPSVGELVARYTRKPPLSSGSSARPIPTNATASFTTASSLLRTSQATSAETQAFDPRRPLPKTTPQRSSAACDIIEISPDVSVVELEPLPRTEGRGRNIAAPTAVAPRAGENHGVELLDTTSPKTQPRKAFNSPPPKDVSEADPQPIVQAPSKVVKPAARKPSAPSRRKKAETVSRHFAPHAAEQTDPAKPVEPKPRRPKASKVAPKVNIAPVPEPVPVDAEVICLEPALPRRSDWTPPRETAAQQPQSGSPVDTQGASTIGPRGVFETLQDTFACPLAQTLSRSHSPEKDVPPVAVLKKRKAIQLIGPSREASASKDTSPTKFKAPKKKPRTITELATAAYVAPASNGASETAKPDSILNYLEPEQSGEHVLQHGHPVSRPRKPDRKRKGKQGRRQLLLSPISAMDQSARQDFVFGTSSQLAQEQSPTFLKELHQALRASNELLEDPFASPPVAEPGKGRKLWAAGARGEDGDVVDVEVIDLLDSPAFPEDPMAIVMAEMQKSPSDRLGKEKTKTAPAIDIESSASDSESEQFTAPAPNTQSNNIYFATQRPSSSPQLAPEPPASKPHMTQTIVLDEGAGDYELPPSNQEAQQIQQLQQQTRKNTQTTAPRPNFELMTDVQLASQVAKYGFKAIKRRTAMVALLEQCWVSKTGGVATAAGSGASMSTTASMARSGSKESASRAVTKSPVKKPRGRPTKDGPTPAAAPDLVSDATIPVKPRGRPKKTAATASSPKPRGRPKKTDSPEGSPKPRGRPKKTGSPEGSPKPRGRAKKAGSPERSPKSRGRTKKTASPERSPRPWGRTKKNSSSATTKTKTKATSTSRSPSPFAARARTPTRGKKTATQSAIEIADSDGEGGLSISSRSSPERIFSSPGAVDLSISEDVDMSLAASPRTTSRQSEVFGFIAKAVTTAPRSDDPANPSWHEKMLMYDPIVLEDLAAWLNSGQLDRVGFDGEVSSEEVKMWCESKSICCLWRMNLRGKERKRY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.36
2 0.33
3 0.29
4 0.25
5 0.22
6 0.2
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.2
11 0.27
12 0.36
13 0.42
14 0.49
15 0.53
16 0.61
17 0.66
18 0.66
19 0.68
20 0.7
21 0.76
22 0.78
23 0.82
24 0.84
25 0.81
26 0.82
27 0.79
28 0.77
29 0.74
30 0.72
31 0.71
32 0.71
33 0.72
34 0.65
35 0.62
36 0.53
37 0.49
38 0.42
39 0.33
40 0.31
41 0.29
42 0.31
43 0.32
44 0.39
45 0.43
46 0.52
47 0.6
48 0.61
49 0.57
50 0.58
51 0.58
52 0.52
53 0.47
54 0.42
55 0.4
56 0.37
57 0.36
58 0.33
59 0.29
60 0.31
61 0.28
62 0.25
63 0.28
64 0.34
65 0.43
66 0.5
67 0.56
68 0.56
69 0.64
70 0.69
71 0.69
72 0.69
73 0.67
74 0.64
75 0.65
76 0.7
77 0.68
78 0.65
79 0.58
80 0.51
81 0.45
82 0.42
83 0.35
84 0.27
85 0.23
86 0.19
87 0.16
88 0.15
89 0.2
90 0.2
91 0.21
92 0.25
93 0.32
94 0.36
95 0.38
96 0.39
97 0.4
98 0.45
99 0.48
100 0.49
101 0.49
102 0.5
103 0.49
104 0.47
105 0.41
106 0.36
107 0.36
108 0.35
109 0.32
110 0.27
111 0.3
112 0.29
113 0.28
114 0.28
115 0.23
116 0.19
117 0.15
118 0.15
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.14
123 0.15
124 0.16
125 0.18
126 0.2
127 0.2
128 0.21
129 0.24
130 0.24
131 0.23
132 0.22
133 0.27
134 0.27
135 0.27
136 0.3
137 0.32
138 0.39
139 0.42
140 0.47
141 0.47
142 0.55
143 0.65
144 0.7
145 0.71
146 0.66
147 0.68
148 0.65
149 0.63
150 0.57
151 0.5
152 0.4
153 0.33
154 0.31
155 0.26
156 0.25
157 0.18
158 0.13
159 0.09
160 0.09
161 0.09
162 0.06
163 0.06
164 0.05
165 0.07
166 0.07
167 0.08
168 0.1
169 0.11
170 0.13
171 0.14
172 0.18
173 0.23
174 0.29
175 0.32
176 0.38
177 0.38
178 0.42
179 0.43
180 0.4
181 0.32
182 0.26
183 0.24
184 0.22
185 0.21
186 0.15
187 0.14
188 0.14
189 0.17
190 0.18
191 0.19
192 0.15
193 0.17
194 0.17
195 0.17
196 0.15
197 0.13
198 0.12
199 0.11
200 0.1
201 0.1
202 0.13
203 0.15
204 0.22
205 0.28
206 0.35
207 0.42
208 0.51
209 0.58
210 0.62
211 0.71
212 0.74
213 0.79
214 0.74
215 0.7
216 0.66
217 0.59
218 0.54
219 0.45
220 0.4
221 0.38
222 0.37
223 0.33
224 0.29
225 0.27
226 0.26
227 0.26
228 0.23
229 0.16
230 0.16
231 0.17
232 0.21
233 0.22
234 0.23
235 0.24
236 0.27
237 0.33
238 0.4
239 0.48
240 0.47
241 0.48
242 0.52
243 0.6
244 0.65
245 0.67
246 0.67
247 0.67
248 0.73
249 0.76
250 0.75
251 0.74
252 0.74
253 0.75
254 0.74
255 0.72
256 0.65
257 0.62
258 0.57
259 0.49
260 0.42
261 0.36
262 0.33
263 0.27
264 0.24
265 0.25
266 0.27
267 0.26
268 0.24
269 0.2
270 0.19
271 0.19
272 0.27
273 0.35
274 0.41
275 0.5
276 0.6
277 0.69
278 0.74
279 0.77
280 0.79
281 0.79
282 0.81
283 0.81
284 0.79
285 0.79
286 0.75
287 0.73
288 0.67
289 0.62
290 0.53
291 0.46
292 0.38
293 0.29
294 0.28
295 0.25
296 0.21
297 0.16
298 0.15
299 0.13
300 0.13
301 0.11
302 0.1
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.07
307 0.06
308 0.08
309 0.13
310 0.15
311 0.15
312 0.15
313 0.2
314 0.23
315 0.31
316 0.36
317 0.39
318 0.42
319 0.43
320 0.47
321 0.45
322 0.43
323 0.44
324 0.47
325 0.44
326 0.39
327 0.39
328 0.35
329 0.35
330 0.34
331 0.26
332 0.16
333 0.14
334 0.13
335 0.12
336 0.11
337 0.1
338 0.1
339 0.09
340 0.09
341 0.08
342 0.09
343 0.09
344 0.09
345 0.1
346 0.1
347 0.1
348 0.1
349 0.12
350 0.12
351 0.13
352 0.13
353 0.12
354 0.12
355 0.13
356 0.12
357 0.08
358 0.08
359 0.08
360 0.1
361 0.11
362 0.13
363 0.16
364 0.2
365 0.23
366 0.25
367 0.26
368 0.3
369 0.34
370 0.36
371 0.39
372 0.36
373 0.34
374 0.32
375 0.33
376 0.31
377 0.32
378 0.32
379 0.3
380 0.35
381 0.38
382 0.39
383 0.38
384 0.38
385 0.37
386 0.44
387 0.47
388 0.43
389 0.42
390 0.39
391 0.36
392 0.34
393 0.28
394 0.2
395 0.18
396 0.17
397 0.16
398 0.21
399 0.23
400 0.26
401 0.3
402 0.29
403 0.32
404 0.39
405 0.46
406 0.52
407 0.62
408 0.69
409 0.74
410 0.82
411 0.82
412 0.79
413 0.81
414 0.74
415 0.67
416 0.61
417 0.53
418 0.44
419 0.35
420 0.28
421 0.19
422 0.15
423 0.11
424 0.05
425 0.03
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.05
431 0.06
432 0.06
433 0.09
434 0.1
435 0.09
436 0.1
437 0.1
438 0.1
439 0.11
440 0.11
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.12
445 0.11
446 0.11
447 0.1
448 0.1
449 0.1
450 0.08
451 0.07
452 0.08
453 0.08
454 0.08
455 0.1
456 0.11
457 0.1
458 0.12
459 0.2
460 0.24
461 0.3
462 0.36
463 0.43
464 0.52
465 0.6
466 0.69
467 0.72
468 0.79
469 0.8
470 0.85
471 0.88
472 0.88
473 0.89
474 0.89
475 0.87
476 0.79
477 0.74
478 0.65
479 0.61
480 0.52
481 0.43
482 0.32
483 0.23
484 0.19
485 0.17
486 0.15
487 0.08
488 0.07
489 0.08
490 0.08
491 0.09
492 0.08
493 0.09
494 0.09
495 0.1
496 0.11
497 0.1
498 0.11
499 0.11
500 0.11
501 0.11
502 0.12
503 0.1
504 0.08
505 0.11
506 0.09
507 0.1
508 0.11
509 0.12
510 0.11
511 0.11
512 0.12
513 0.14
514 0.17
515 0.17
516 0.21
517 0.2
518 0.2
519 0.21
520 0.21
521 0.16
522 0.14
523 0.12
524 0.08
525 0.08
526 0.08
527 0.06
528 0.07
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.05
533 0.05
534 0.09
535 0.09
536 0.09
537 0.1
538 0.16
539 0.22
540 0.23
541 0.23
542 0.2
543 0.21
544 0.24
545 0.27
546 0.23
547 0.19
548 0.2
549 0.2
550 0.19
551 0.18
552 0.14
553 0.1
554 0.07
555 0.05
556 0.04
557 0.03
558 0.03
559 0.03
560 0.03
561 0.03
562 0.02
563 0.02
564 0.02
565 0.03
566 0.03
567 0.03
568 0.03
569 0.04
570 0.04
571 0.04
572 0.04
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.04
577 0.04
578 0.05
579 0.06
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.08
585 0.09
586 0.13
587 0.16
588 0.17
589 0.24
590 0.33
591 0.38
592 0.39
593 0.44
594 0.42
595 0.44
596 0.44
597 0.38
598 0.33
599 0.28
600 0.29
601 0.23
602 0.21
603 0.16
604 0.14
605 0.14
606 0.1
607 0.09
608 0.06
609 0.06
610 0.07
611 0.07
612 0.08
613 0.07
614 0.07
615 0.08
616 0.1
617 0.1
618 0.11
619 0.13
620 0.15
621 0.17
622 0.18
623 0.2
624 0.19
625 0.22
626 0.19
627 0.18
628 0.15
629 0.16
630 0.19
631 0.18
632 0.17
633 0.18
634 0.22
635 0.25
636 0.28
637 0.27
638 0.24
639 0.29
640 0.29
641 0.29
642 0.28
643 0.27
644 0.23
645 0.26
646 0.28
647 0.24
648 0.24
649 0.27
650 0.29
651 0.29
652 0.3
653 0.27
654 0.26
655 0.25
656 0.24
657 0.19
658 0.12
659 0.1
660 0.08
661 0.06
662 0.04
663 0.03
664 0.06
665 0.06
666 0.06
667 0.07
668 0.08
669 0.12
670 0.13
671 0.15
672 0.14
673 0.15
674 0.2
675 0.22
676 0.21
677 0.21
678 0.25
679 0.26
680 0.31
681 0.35
682 0.35
683 0.41
684 0.45
685 0.43
686 0.41
687 0.44
688 0.47
689 0.5
690 0.56
691 0.52
692 0.49
693 0.5
694 0.49
695 0.44
696 0.34
697 0.28
698 0.18
699 0.19
700 0.18
701 0.15
702 0.13
703 0.13
704 0.13
705 0.11
706 0.1
707 0.08
708 0.08
709 0.08
710 0.09
711 0.15
712 0.17
713 0.21
714 0.3
715 0.33
716 0.42
717 0.44
718 0.46
719 0.42
720 0.42
721 0.39
722 0.32
723 0.33
724 0.26
725 0.23
726 0.22
727 0.19
728 0.16
729 0.15
730 0.14
731 0.09
732 0.08
733 0.08
734 0.09
735 0.12
736 0.12
737 0.11
738 0.1
739 0.11
740 0.1
741 0.09
742 0.07
743 0.05
744 0.04
745 0.04
746 0.04
747 0.03
748 0.03
749 0.04
750 0.04
751 0.05
752 0.05
753 0.06
754 0.08
755 0.1
756 0.12
757 0.13
758 0.15
759 0.16
760 0.18
761 0.24
762 0.24
763 0.27
764 0.26
765 0.28
766 0.31
767 0.37
768 0.43
769 0.47
770 0.55
771 0.58
772 0.66
773 0.73
774 0.79
775 0.82
776 0.8
777 0.78
778 0.78
779 0.81
780 0.78
781 0.73
782 0.65
783 0.58
784 0.53
785 0.46
786 0.38
787 0.27
788 0.2
789 0.16
790 0.15
791 0.11
792 0.09
793 0.08
794 0.07
795 0.09
796 0.1
797 0.12
798 0.15
799 0.2
800 0.25
801 0.35
802 0.46
803 0.52
804 0.58
805 0.64
806 0.69
807 0.7
808 0.75
809 0.68
810 0.66
811 0.66
812 0.66
813 0.68
814 0.62
815 0.59
816 0.58
817 0.65
818 0.67
819 0.7
820 0.73
821 0.7
822 0.76
823 0.79
824 0.82
825 0.78
826 0.75
827 0.76
828 0.74
829 0.73
830 0.71
831 0.7
832 0.7
833 0.74
834 0.76
835 0.74
836 0.76
837 0.76
838 0.79
839 0.81
840 0.81
841 0.77
842 0.75
843 0.76
844 0.75
845 0.76
846 0.72
847 0.68
848 0.66
849 0.68
850 0.68
851 0.67
852 0.68
853 0.65
854 0.67
855 0.74
856 0.76
857 0.75
858 0.74
859 0.76
860 0.75
861 0.74
862 0.69
863 0.67
864 0.67
865 0.7
866 0.72
867 0.71
868 0.73
869 0.74
870 0.78
871 0.81
872 0.82
873 0.79
874 0.79
875 0.81
876 0.79
877 0.79
878 0.79
879 0.76
880 0.73
881 0.76
882 0.76
883 0.76
884 0.78
885 0.81
886 0.83
887 0.85
888 0.83
889 0.78
890 0.76
891 0.73
892 0.73
893 0.68
894 0.64
895 0.58
896 0.58
897 0.56
898 0.52
899 0.54
900 0.52
901 0.56
902 0.58
903 0.61
904 0.62
905 0.62
906 0.59
907 0.54
908 0.53
909 0.51
910 0.48
911 0.47
912 0.44
913 0.48
914 0.52
915 0.55
916 0.57
917 0.6
918 0.65
919 0.66
920 0.67
921 0.68
922 0.71
923 0.72
924 0.68
925 0.6
926 0.52
927 0.49
928 0.45
929 0.36
930 0.28
931 0.18
932 0.15
933 0.12
934 0.11
935 0.07
936 0.06
937 0.06
938 0.05
939 0.05
940 0.04
941 0.05
942 0.05
943 0.06
944 0.08
945 0.11
946 0.15
947 0.16
948 0.19
949 0.24
950 0.26
951 0.3
952 0.29
953 0.31
954 0.28
955 0.27
956 0.26
957 0.21
958 0.18
959 0.14
960 0.17
961 0.13
962 0.12
963 0.11
964 0.09
965 0.09
966 0.09
967 0.09
968 0.05
969 0.07
970 0.08
971 0.08
972 0.09
973 0.1
974 0.13
975 0.18
976 0.21
977 0.23
978 0.27
979 0.32
980 0.34
981 0.37
982 0.38
983 0.33
984 0.32
985 0.28
986 0.24
987 0.2
988 0.18
989 0.14
990 0.11
991 0.14
992 0.15
993 0.16
994 0.19
995 0.21
996 0.26
997 0.29
998 0.33
999 0.35
1000 0.4
1001 0.44
1002 0.42
1003 0.45
1004 0.43
1005 0.42
1006 0.38
1007 0.32
1008 0.3
1009 0.31
1010 0.32
1011 0.28
1012 0.29
1013 0.27
1014 0.26
1015 0.27
1016 0.22
1017 0.16
1018 0.12
1019 0.12
1020 0.09
1021 0.09
1022 0.07
1023 0.06
1024 0.07
1025 0.08
1026 0.08
1027 0.08
1028 0.1
1029 0.1
1030 0.11
1031 0.12
1032 0.13
1033 0.12
1034 0.12
1035 0.12
1036 0.1
1037 0.11
1038 0.13
1039 0.13
1040 0.11
1041 0.12
1042 0.13
1043 0.14
1044 0.16
1045 0.16
1046 0.14
1047 0.17
1048 0.19
1049 0.23
1050 0.3
1051 0.33
1052 0.34
1053 0.38
1054 0.41
1055 0.44
1056 0.51
1057 0.53
1058 0.55
1059 0.59
1060 0.66
1061 0.71