FuNGI

A0A0C4DY88

Protein Details

Accession

A0A0C4DY88

Localization Confidence

High

Confidence Score

19.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
51-70	NPLVGRRKHDPSKTMNRPAS	Hydrophilic
234-257	NAEPAQKKTQKKEKPFNAHFHTKK	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
460-463	KKVR
514-550	SKDAKDKKAAAKGSASASGKSKADTAKGSKSLKRPGS
563-567	RKKAK
610-612	KKR

Subcellular Location(s)

nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSAPGPNPPNGPSANAPNPNGPNPTAPNAAQNAAAMRIPASLRRRTAAASNPLVGRRKHDPSKTMNRPASTQRPSSTAYVKATPKDPLIALKEQNEKRLKEFEAQRKKNGGWTNPPPQGEYMDYPLVISKRALKDGARFHVMRFSKAKGGNIDHNVDPTDPSDFTRPVTLHRRDARQPAPGREVKEEPVVEEEPAKPTIDEKEAERLEKLKAEKEAQRQEDLAKIAPGVKTNTNAEPAQKKTQKKEKPFNAHFHTKKSADPTAGELRYVESLPWHIEDADGKNVWVGQYVAPLSRANVGLVISGQGFKMIPLEKYYRFIAKPAFKGFTIEEAEAQMKQKLKMPIWADKGESKEAKAELAATRRWMSGGSMVKQESSTYRAAPRSEKIDHDDVDMSGDEFQDDDEAPTMERDNDEDAKDARERQRRDHLGANLFGEADEKEVDEEETAKMLEDAVRKMHGKKVRKALTRHEKHLEYQSDSDSNPYASSSDEEEEKAEEEKKDEANGKDGEKESESKDAKDKKAAAKGSASASGKSKADTAKGSKSLKRPGSPNLSESSGNESSRKKAKKTVTSSVQPSRSGTPLPQRTKVKPPGGATSDGEGEMSDGGLKKKRSKLGGTGTPGGSRAGSPVPTQGPVASSSAGVSPKKAAPVPDGSGQIITREELLAALEANPNGISIGDLLKRYFSDRVGDGENKLQKNKFISLVTRNSIFRKADKLLLPKPKKEAS

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.42
2	0.46
3	0.47
4	0.49
5	0.53
6	0.53
7	0.52
8	0.46
9	0.43
10	0.41
11	0.44
12	0.41
13	0.37
14	0.39
15	0.37
16	0.36
17	0.31
18	0.27
19	0.24
20	0.21
21	0.2
22	0.15
23	0.12
24	0.14
25	0.14
26	0.21
27	0.26
28	0.31
29	0.34
30	0.36
31	0.37
32	0.37
33	0.43
34	0.44
35	0.46
36	0.44
37	0.45
38	0.46
39	0.5
40	0.54
41	0.48
42	0.45
43	0.44
44	0.49
45	0.54
46	0.58
47	0.59
48	0.63
49	0.73
50	0.78
51	0.8
52	0.77
53	0.71
54	0.69
55	0.7
56	0.71
57	0.66
58	0.61
59	0.53
60	0.51
61	0.52
62	0.51
63	0.47
64	0.43
65	0.4
66	0.42
67	0.44
68	0.44
69	0.43
70	0.42
71	0.39
72	0.36
73	0.33
74	0.32
75	0.33
76	0.36
77	0.37
78	0.4
79	0.48
80	0.48
81	0.56
82	0.56
83	0.53
84	0.51
85	0.53
86	0.5
87	0.49
88	0.56
89	0.58
90	0.62
91	0.65
92	0.68
93	0.68
94	0.66
95	0.65
96	0.63
97	0.59
98	0.58
99	0.61
100	0.63
101	0.63
102	0.63
103	0.57
104	0.5
105	0.46
106	0.4
107	0.34
108	0.3
109	0.25
110	0.24
111	0.22
112	0.24
113	0.22
114	0.19
115	0.17
116	0.2
117	0.22
118	0.25
119	0.28
120	0.27
121	0.34
122	0.41
123	0.45
124	0.44
125	0.4
126	0.38
127	0.45
128	0.43
129	0.41
130	0.37
131	0.34
132	0.36
133	0.38
134	0.42
135	0.39
136	0.43
137	0.45
138	0.46
139	0.47
140	0.4
141	0.38
142	0.36
143	0.3
144	0.26
145	0.19
146	0.17
147	0.13
148	0.15
149	0.18
150	0.17
151	0.18
152	0.22
153	0.21
154	0.25
155	0.35
156	0.38
157	0.42
158	0.48
159	0.54
160	0.55
161	0.63
162	0.61
163	0.6
164	0.62
165	0.58
166	0.6
167	0.58
168	0.55
169	0.51
170	0.5
171	0.43
172	0.43
173	0.37
174	0.3
175	0.3
176	0.28
177	0.23
178	0.23
179	0.21
180	0.18
181	0.19
182	0.18
183	0.13
184	0.14
185	0.17
186	0.18
187	0.18
188	0.17
189	0.25
190	0.26
191	0.27
192	0.27
193	0.25
194	0.24
195	0.27
196	0.28
197	0.23
198	0.26
199	0.3
200	0.35
201	0.43
202	0.5
203	0.48
204	0.48
205	0.45
206	0.42
207	0.41
208	0.36
209	0.27
210	0.19
211	0.16
212	0.17
213	0.17
214	0.18
215	0.17
216	0.17
217	0.19
218	0.21
219	0.22
220	0.24
221	0.23
222	0.26
223	0.29
224	0.32
225	0.39
226	0.43
227	0.47
228	0.53
229	0.62
230	0.67
231	0.71
232	0.77
233	0.77
234	0.81
235	0.83
236	0.82
237	0.79
238	0.81
239	0.73
240	0.68
241	0.64
242	0.55
243	0.5
244	0.47
245	0.43
246	0.34
247	0.32
248	0.32
249	0.33
250	0.32
251	0.29
252	0.23
253	0.21
254	0.21
255	0.2
256	0.15
257	0.08
258	0.09
259	0.1
260	0.1
261	0.1
262	0.08
263	0.09
264	0.11
265	0.13
266	0.15
267	0.14
268	0.13
269	0.13
270	0.13
271	0.12
272	0.11
273	0.09
274	0.06
275	0.08
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.1
280	0.1
281	0.11
282	0.12
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.08
287	0.08
288	0.08
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.05
293	0.05
294	0.05
295	0.08
296	0.08
297	0.09
298	0.12
299	0.16
300	0.16
301	0.19
302	0.21
303	0.22
304	0.21
305	0.23
306	0.27
307	0.28
308	0.31
309	0.32
310	0.32
311	0.28
312	0.3
313	0.28
314	0.26
315	0.22
316	0.18
317	0.15
318	0.15
319	0.15
320	0.14
321	0.15
322	0.13
323	0.12
324	0.13
325	0.18
326	0.21
327	0.21
328	0.26
329	0.29
330	0.34
331	0.36
332	0.37
333	0.33
334	0.32
335	0.34
336	0.32
337	0.29
338	0.22
339	0.2
340	0.19
341	0.17
342	0.14
343	0.14
344	0.12
345	0.15
346	0.15
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.15
351	0.13
352	0.11
353	0.14
354	0.17
355	0.17
356	0.19
357	0.19
358	0.19
359	0.19
360	0.19
361	0.14
362	0.14
363	0.13
364	0.12
365	0.16
366	0.18
367	0.2
368	0.22
369	0.23
370	0.25
371	0.26
372	0.26
373	0.27
374	0.28
375	0.27
376	0.26
377	0.24
378	0.19
379	0.18
380	0.16
381	0.12
382	0.08
383	0.08
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.05
389	0.05
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.06
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.1
399	0.12
400	0.12
401	0.13
402	0.13
403	0.16
404	0.17
405	0.21
406	0.26
407	0.32
408	0.33
409	0.38
410	0.47
411	0.49
412	0.52
413	0.53
414	0.51
415	0.47
416	0.46
417	0.41
418	0.31
419	0.26
420	0.22
421	0.16
422	0.11
423	0.08
424	0.06
425	0.05
426	0.05
427	0.06
428	0.06
429	0.06
430	0.07
431	0.06
432	0.06
433	0.06
434	0.06
435	0.06
436	0.06
437	0.09
438	0.1
439	0.11
440	0.11
441	0.14
442	0.16
443	0.18
444	0.24
445	0.29
446	0.35
447	0.41
448	0.5
449	0.56
450	0.62
451	0.65
452	0.69
453	0.73
454	0.71
455	0.71
456	0.67
457	0.6
458	0.56
459	0.6
460	0.53
461	0.45
462	0.4
463	0.36
464	0.31
465	0.3
466	0.28
467	0.2
468	0.17
469	0.13
470	0.12
471	0.09
472	0.08
473	0.1
474	0.1
475	0.11
476	0.11
477	0.12
478	0.12
479	0.12
480	0.12
481	0.13
482	0.14
483	0.13
484	0.14
485	0.16
486	0.16
487	0.19
488	0.24
489	0.23
490	0.26
491	0.28
492	0.27
493	0.29
494	0.29
495	0.28
496	0.24
497	0.26
498	0.22
499	0.28
500	0.29
501	0.26
502	0.34
503	0.39
504	0.4
505	0.44
506	0.48
507	0.45
508	0.52
509	0.52
510	0.47
511	0.42
512	0.42
513	0.38
514	0.38
515	0.33
516	0.27
517	0.27
518	0.28
519	0.25
520	0.23
521	0.24
522	0.2
523	0.22
524	0.26
525	0.28
526	0.32
527	0.39
528	0.43
529	0.46
530	0.51
531	0.57
532	0.58
533	0.59
534	0.56
535	0.57
536	0.62
537	0.58
538	0.54
539	0.48
540	0.44
541	0.39
542	0.36
543	0.36
544	0.29
545	0.28
546	0.29
547	0.28
548	0.31
549	0.4
550	0.44
551	0.4
552	0.45
553	0.53
554	0.59
555	0.65
556	0.7
557	0.69
558	0.71
559	0.75
560	0.75
561	0.7
562	0.61
563	0.56
564	0.49
565	0.42
566	0.37
567	0.34
568	0.36
569	0.42
570	0.46
571	0.51
572	0.55
573	0.58
574	0.67
575	0.72
576	0.68
577	0.65
578	0.62
579	0.63
580	0.6
581	0.58
582	0.49
583	0.42
584	0.36
585	0.3
586	0.26
587	0.17
588	0.14
589	0.1
590	0.08
591	0.07
592	0.08
593	0.11
594	0.17
595	0.21
596	0.29
597	0.36
598	0.43
599	0.48
600	0.52
601	0.58
602	0.62
603	0.66
604	0.65
605	0.63
606	0.57
607	0.52
608	0.47
609	0.39
610	0.29
611	0.21
612	0.17
613	0.15
614	0.15
615	0.15
616	0.19
617	0.21
618	0.21
619	0.22
620	0.2
621	0.18
622	0.18
623	0.19
624	0.15
625	0.13
626	0.12
627	0.15
628	0.19
629	0.18
630	0.18
631	0.2
632	0.22
633	0.26
634	0.28
635	0.27
636	0.27
637	0.33
638	0.35
639	0.36
640	0.36
641	0.33
642	0.33
643	0.3
644	0.27
645	0.22
646	0.18
647	0.14
648	0.12
649	0.11
650	0.09
651	0.1
652	0.08
653	0.08
654	0.09
655	0.1
656	0.1
657	0.11
658	0.1
659	0.1
660	0.09
661	0.09
662	0.08
663	0.06
664	0.11
665	0.13
666	0.15
667	0.15
668	0.17
669	0.18
670	0.21
671	0.23
672	0.21
673	0.23
674	0.23
675	0.27
676	0.32
677	0.34
678	0.33
679	0.39
680	0.45
681	0.44
682	0.49
683	0.47
684	0.46
685	0.48
686	0.5
687	0.47
688	0.44
689	0.46
690	0.49
691	0.54
692	0.54
693	0.53
694	0.52
695	0.5
696	0.53
697	0.49
698	0.44
699	0.44
700	0.43
701	0.46
702	0.5
703	0.55
704	0.57
705	0.65
706	0.69
707	0.68

A0A0C4DY88

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer