FuNGI

A0A0C4DNR6

Protein Details

Accession

A0A0C4DNR6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

14.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
408-440	IPDVVLVKKHWQRRRRNRTRNWRLKRMAKDEGE	Hydrophilic
470-493	AALALYKSTKKSKRKPEADAMSVA	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
415-436	KKHWQRRRRNRTRNWRLKRMAK

Subcellular Location(s)

cyto 13, nucl 12

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR039768 Nmd3 IPR007064 Nmd3_N
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0005634 C:nucleus GO:0070180 F:large ribosomal subunit rRNA binding GO:0043023 F:ribosomal large subunit binding GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF04981 NMD3

Amino Acid Sequences

MMEVSMDLDAPVAINPPMGTAQTGATILCCNCGAPIDGTTAAGALCYDCIKTNVDISQGIQREAVLHFCRDCDRWLLPPNSWIMAAPESRELLALCLKKLKGLNKVRIVDASFVWTEPHSRRVRVKLTIQDAVQDGVLLQQSFEVIYVVSYQQCPDCAKSYTANVWRASVQVRQKVLHKRTFLFLEQLILKHGAHRDTINIKEAKDGIDFYFSARNQAEKFVDFLNSSVPIRMKKSQELISQDVHTSTKSYKFTFSVELIPICKEDLVVLPIKLAKQIGNISPLVLCHRIGTAVNFMDPSTLQTAEVSAPIYWRHPFHAIAESKDLVEFIIMDIEPSGTQKGKWILGEATVARASDLGVNDKTYFARTHLSGLLQAGDSVLGYMLTGTNFNNEEFQALEDSHAYGSTIPDVVLVKKHWQRRRRNRTRNWRLKRMAKDEGELLPKKADQERLDAEYEQFLRDVEEDDELRAALALYKSTKKSKRKPEADAMSVAETDMTAGDDDDAPKVSMDELLDDMEELALEDQ

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.08
2	0.08
3	0.09
4	0.11
5	0.11
6	0.11
7	0.11
8	0.11
9	0.12
10	0.13
11	0.11
12	0.11
13	0.14
14	0.13
15	0.14
16	0.13
17	0.12
18	0.12
19	0.13
20	0.14
21	0.13
22	0.14
23	0.15
24	0.16
25	0.16
26	0.15
27	0.14
28	0.12
29	0.1
30	0.08
31	0.05
32	0.06
33	0.07
34	0.08
35	0.09
36	0.11
37	0.13
38	0.15
39	0.18
40	0.19
41	0.21
42	0.21
43	0.21
44	0.27
45	0.26
46	0.26
47	0.22
48	0.2
49	0.2
50	0.2
51	0.25
52	0.2
53	0.21
54	0.21
55	0.22
56	0.26
57	0.26
58	0.27
59	0.25
60	0.25
61	0.29
62	0.37
63	0.39
64	0.37
65	0.39
66	0.39
67	0.35
68	0.33
69	0.26
70	0.21
71	0.21
72	0.21
73	0.19
74	0.18
75	0.18
76	0.18
77	0.18
78	0.15
79	0.13
80	0.19
81	0.19
82	0.17
83	0.23
84	0.22
85	0.26
86	0.31
87	0.36
88	0.39
89	0.47
90	0.56
91	0.59
92	0.61
93	0.58
94	0.57
95	0.52
96	0.44
97	0.35
98	0.29
99	0.21
100	0.18
101	0.18
102	0.15
103	0.18
104	0.18
105	0.27
106	0.27
107	0.31
108	0.38
109	0.45
110	0.51
111	0.52
112	0.58
113	0.56
114	0.58
115	0.57
116	0.51
117	0.45
118	0.4
119	0.34
120	0.26
121	0.18
122	0.12
123	0.1
124	0.11
125	0.08
126	0.07
127	0.06
128	0.07
129	0.07
130	0.07
131	0.05
132	0.04
133	0.04
134	0.06
135	0.07
136	0.08
137	0.08
138	0.09
139	0.09
140	0.12
141	0.14
142	0.15
143	0.17
144	0.18
145	0.2
146	0.22
147	0.24
148	0.3
149	0.34
150	0.37
151	0.34
152	0.33
153	0.31
154	0.31
155	0.3
156	0.29
157	0.28
158	0.29
159	0.31
160	0.32
161	0.39
162	0.47
163	0.52
164	0.53
165	0.51
166	0.46
167	0.47
168	0.49
169	0.43
170	0.36
171	0.29
172	0.25
173	0.23
174	0.21
175	0.19
176	0.17
177	0.15
178	0.15
179	0.17
180	0.15
181	0.15
182	0.15
183	0.18
184	0.21
185	0.23
186	0.26
187	0.25
188	0.24
189	0.25
190	0.25
191	0.23
192	0.19
193	0.19
194	0.13
195	0.13
196	0.13
197	0.12
198	0.18
199	0.16
200	0.19
201	0.18
202	0.19
203	0.18
204	0.21
205	0.21
206	0.16
207	0.17
208	0.14
209	0.15
210	0.13
211	0.13
212	0.11
213	0.11
214	0.11
215	0.11
216	0.12
217	0.13
218	0.17
219	0.22
220	0.23
221	0.25
222	0.3
223	0.33
224	0.36
225	0.39
226	0.38
227	0.35
228	0.33
229	0.3
230	0.26
231	0.21
232	0.17
233	0.13
234	0.12
235	0.15
236	0.17
237	0.18
238	0.19
239	0.19
240	0.21
241	0.22
242	0.22
243	0.19
244	0.18
245	0.17
246	0.16
247	0.15
248	0.14
249	0.11
250	0.09
251	0.07
252	0.06
253	0.06
254	0.07
255	0.08
256	0.08
257	0.08
258	0.09
259	0.09
260	0.1
261	0.1
262	0.08
263	0.09
264	0.12
265	0.12
266	0.14
267	0.14
268	0.14
269	0.13
270	0.13
271	0.13
272	0.12
273	0.11
274	0.09
275	0.09
276	0.09
277	0.09
278	0.1
279	0.11
280	0.1
281	0.1
282	0.1
283	0.09
284	0.09
285	0.09
286	0.09
287	0.08
288	0.08
289	0.08
290	0.08
291	0.09
292	0.08
293	0.09
294	0.08
295	0.06
296	0.07
297	0.08
298	0.1
299	0.11
300	0.11
301	0.13
302	0.15
303	0.16
304	0.17
305	0.25
306	0.24
307	0.25
308	0.27
309	0.25
310	0.22
311	0.22
312	0.19
313	0.11
314	0.09
315	0.07
316	0.04
317	0.05
318	0.05
319	0.05
320	0.05
321	0.06
322	0.06
323	0.06
324	0.08
325	0.07
326	0.07
327	0.11
328	0.14
329	0.15
330	0.16
331	0.17
332	0.16
333	0.17
334	0.19
335	0.15
336	0.15
337	0.13
338	0.13
339	0.11
340	0.1
341	0.1
342	0.09
343	0.1
344	0.11
345	0.12
346	0.13
347	0.14
348	0.15
349	0.15
350	0.14
351	0.14
352	0.12
353	0.15
354	0.14
355	0.17
356	0.18
357	0.18
358	0.17
359	0.17
360	0.16
361	0.13
362	0.12
363	0.09
364	0.07
365	0.06
366	0.05
367	0.04
368	0.03
369	0.03
370	0.03
371	0.04
372	0.04
373	0.05
374	0.05
375	0.08
376	0.1
377	0.1
378	0.11
379	0.11
380	0.11
381	0.11
382	0.12
383	0.1
384	0.1
385	0.1
386	0.09
387	0.1
388	0.09
389	0.09
390	0.08
391	0.07
392	0.07
393	0.08
394	0.08
395	0.07
396	0.08
397	0.1
398	0.1
399	0.13
400	0.15
401	0.22
402	0.28
403	0.38
404	0.45
405	0.53
406	0.64
407	0.72
408	0.82
409	0.85
410	0.9
411	0.92
412	0.95
413	0.97
414	0.97
415	0.95
416	0.94
417	0.92
418	0.91
419	0.9
420	0.86
421	0.84
422	0.76
423	0.68
424	0.61
425	0.57
426	0.56
427	0.48
428	0.41
429	0.34
430	0.32
431	0.34
432	0.34
433	0.37
434	0.3
435	0.36
436	0.39
437	0.4
438	0.42
439	0.39
440	0.35
441	0.33
442	0.32
443	0.25
444	0.21
445	0.17
446	0.15
447	0.15
448	0.16
449	0.12
450	0.15
451	0.14
452	0.15
453	0.16
454	0.14
455	0.13
456	0.11
457	0.1
458	0.1
459	0.1
460	0.12
461	0.16
462	0.22
463	0.27
464	0.37
465	0.47
466	0.54
467	0.63
468	0.72
469	0.79
470	0.82
471	0.86
472	0.87
473	0.87
474	0.81
475	0.74
476	0.66
477	0.57
478	0.47
479	0.38
480	0.27
481	0.18
482	0.13
483	0.09
484	0.07
485	0.05
486	0.06
487	0.07
488	0.09
489	0.1
490	0.11
491	0.13
492	0.13
493	0.13
494	0.13
495	0.12
496	0.12
497	0.12
498	0.13
499	0.12
500	0.12
501	0.12
502	0.12
503	0.12
504	0.09
505	0.08

A0A0C4DNR6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer