Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EGJ7

Protein Details
Accession A0A0C4EGJ7    Localization Confidence High Confidence Score 16.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-20MPPAKKRKTTRSSKAVVQEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
283-288KKRKAR
Subcellular Location(s) nucl 21, mito 3, cyto 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPPAKKRKTTRSSKAVVQEEPAAAKAPTPDETAASDEPTNTKEPMKSNDEATGDRPEEPTDPTATGSHSEDPAPAAAAAESDTQSAAEKAADRMARFRALQERAKKSSDQNLKAATAESRRQATDTSQLTALHRRHAIASHKILKADVEEAGGDFERKRAWDWTIEESEQWDKRMKKKESARDNNAFQDFRQEAQKIYKRQLKNMPPDMERYANDKMAAINKAAAEGTLDIVETEDGELIAVDRAGTFYSTADSTSFANNRPTKAAIDRLVNDMKKAEDVAAKKRKARMAKNGDDDDVTYINDKNKQFNQKLARFYNKYTAEIRESFERGTMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.82
2 0.77
3 0.69
4 0.61
5 0.55
6 0.46
7 0.42
8 0.35
9 0.27
10 0.2
11 0.2
12 0.19
13 0.17
14 0.17
15 0.2
16 0.2
17 0.19
18 0.21
19 0.25
20 0.23
21 0.23
22 0.22
23 0.2
24 0.21
25 0.22
26 0.23
27 0.19
28 0.22
29 0.23
30 0.27
31 0.33
32 0.38
33 0.37
34 0.37
35 0.41
36 0.4
37 0.38
38 0.36
39 0.36
40 0.31
41 0.3
42 0.28
43 0.25
44 0.23
45 0.25
46 0.24
47 0.19
48 0.19
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.19
53 0.19
54 0.19
55 0.18
56 0.17
57 0.16
58 0.16
59 0.15
60 0.14
61 0.11
62 0.09
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.07
71 0.08
72 0.08
73 0.08
74 0.07
75 0.08
76 0.09
77 0.14
78 0.16
79 0.15
80 0.18
81 0.21
82 0.23
83 0.22
84 0.24
85 0.28
86 0.32
87 0.38
88 0.44
89 0.49
90 0.5
91 0.53
92 0.52
93 0.48
94 0.52
95 0.54
96 0.49
97 0.46
98 0.44
99 0.42
100 0.4
101 0.37
102 0.3
103 0.25
104 0.24
105 0.23
106 0.22
107 0.22
108 0.22
109 0.22
110 0.21
111 0.25
112 0.23
113 0.22
114 0.21
115 0.22
116 0.22
117 0.29
118 0.28
119 0.24
120 0.23
121 0.22
122 0.21
123 0.25
124 0.29
125 0.28
126 0.33
127 0.37
128 0.37
129 0.37
130 0.36
131 0.31
132 0.27
133 0.22
134 0.15
135 0.08
136 0.07
137 0.07
138 0.08
139 0.07
140 0.07
141 0.06
142 0.06
143 0.06
144 0.07
145 0.08
146 0.1
147 0.11
148 0.15
149 0.18
150 0.22
151 0.24
152 0.24
153 0.22
154 0.22
155 0.25
156 0.21
157 0.2
158 0.21
159 0.22
160 0.29
161 0.39
162 0.4
163 0.45
164 0.53
165 0.61
166 0.66
167 0.73
168 0.74
169 0.7
170 0.7
171 0.66
172 0.61
173 0.51
174 0.4
175 0.37
176 0.29
177 0.24
178 0.26
179 0.21
180 0.2
181 0.28
182 0.35
183 0.31
184 0.38
185 0.45
186 0.42
187 0.49
188 0.57
189 0.56
190 0.59
191 0.65
192 0.62
193 0.55
194 0.58
195 0.54
196 0.48
197 0.41
198 0.36
199 0.3
200 0.26
201 0.25
202 0.21
203 0.19
204 0.2
205 0.2
206 0.16
207 0.15
208 0.13
209 0.14
210 0.13
211 0.11
212 0.08
213 0.07
214 0.07
215 0.06
216 0.06
217 0.05
218 0.05
219 0.05
220 0.05
221 0.04
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.04
226 0.04
227 0.04
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.04
232 0.05
233 0.05
234 0.05
235 0.05
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.1
242 0.14
243 0.16
244 0.17
245 0.26
246 0.28
247 0.29
248 0.31
249 0.32
250 0.31
251 0.33
252 0.37
253 0.32
254 0.35
255 0.35
256 0.38
257 0.43
258 0.4
259 0.37
260 0.32
261 0.29
262 0.24
263 0.23
264 0.2
265 0.18
266 0.22
267 0.32
268 0.4
269 0.44
270 0.48
271 0.54
272 0.59
273 0.63
274 0.68
275 0.68
276 0.69
277 0.74
278 0.78
279 0.75
280 0.69
281 0.6
282 0.52
283 0.44
284 0.34
285 0.25
286 0.18
287 0.18
288 0.2
289 0.26
290 0.27
291 0.32
292 0.39
293 0.49
294 0.5
295 0.57
296 0.64
297 0.64
298 0.71
299 0.72
300 0.74
301 0.68
302 0.69
303 0.7
304 0.63
305 0.6
306 0.54
307 0.51
308 0.48
309 0.46
310 0.45
311 0.42
312 0.41
313 0.37