Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4CSB5

Protein Details
Accession A0A0C4CSB5    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
382-414GMRASVQPRLLRRRRRRRRQPVRRQQRVAEPTWHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
390-405RLLRRRRRRRRQPVRR
Subcellular Location(s) nucl 23, cyto_nucl 13.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR034772  CPSF6/7  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0006397  P:mRNA processing  
Amino Acid Sequences MAEEEFEIDIYGDSNADQADHKEGHAYEAGDANGHDQYNDDQQNKDGAAAEGEGQNRGGTHESSTTPLATPAPTHGVKRKEGSDERPIDPGATSAIMVSDLNWWTTDDDLRGWIREAGCESELKDITFSEHKVNGKSKGQVYIELKSQQAATAVKHRIEAHVDESNAQAKRHSVLYSSPTVNPFRTLPKDQPRAGKDGQNRAPSGPGYNDRNNMGNNNYGGGYRGGRGGYNNMRGGGMGNNQGGGGFQNRGFNNNNAYNSNGNMGGGGGFGGNPMGGNFGGGGGGGPITSTNRHSAFEHNQERLDCTLPTVTCGGMRGGRGGMGGMMGGGMNPMGNMGGMGGMGGMGGMTGMGGMGGPMGGNMGGGMGGMGMMGGGMPGFQGMRASVQPRLLRRRRRRRRQPVRRQQRVAEPTWRQASPTGVGIRLQTGGHGSQERSPWTL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.07
3 0.08
4 0.09
5 0.1
6 0.16
7 0.16
8 0.17
9 0.2
10 0.21
11 0.23
12 0.25
13 0.24
14 0.2
15 0.22
16 0.22
17 0.18
18 0.17
19 0.16
20 0.16
21 0.15
22 0.13
23 0.12
24 0.14
25 0.23
26 0.29
27 0.29
28 0.27
29 0.29
30 0.33
31 0.32
32 0.3
33 0.23
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.16
38 0.15
39 0.16
40 0.15
41 0.14
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.12
47 0.14
48 0.17
49 0.17
50 0.2
51 0.21
52 0.21
53 0.18
54 0.19
55 0.18
56 0.15
57 0.15
58 0.15
59 0.2
60 0.21
61 0.25
62 0.31
63 0.35
64 0.39
65 0.42
66 0.43
67 0.46
68 0.51
69 0.53
70 0.56
71 0.56
72 0.53
73 0.52
74 0.48
75 0.39
76 0.33
77 0.27
78 0.18
79 0.13
80 0.11
81 0.08
82 0.07
83 0.07
84 0.07
85 0.07
86 0.09
87 0.1
88 0.1
89 0.11
90 0.11
91 0.11
92 0.13
93 0.14
94 0.11
95 0.11
96 0.14
97 0.15
98 0.15
99 0.15
100 0.17
101 0.16
102 0.17
103 0.18
104 0.17
105 0.17
106 0.17
107 0.17
108 0.19
109 0.2
110 0.18
111 0.17
112 0.14
113 0.17
114 0.19
115 0.19
116 0.18
117 0.22
118 0.24
119 0.29
120 0.33
121 0.35
122 0.36
123 0.4
124 0.38
125 0.4
126 0.39
127 0.41
128 0.4
129 0.37
130 0.37
131 0.34
132 0.32
133 0.26
134 0.25
135 0.18
136 0.18
137 0.17
138 0.14
139 0.2
140 0.23
141 0.23
142 0.26
143 0.26
144 0.25
145 0.26
146 0.26
147 0.22
148 0.22
149 0.22
150 0.2
151 0.2
152 0.24
153 0.23
154 0.21
155 0.17
156 0.15
157 0.16
158 0.18
159 0.17
160 0.13
161 0.14
162 0.18
163 0.22
164 0.23
165 0.23
166 0.24
167 0.26
168 0.25
169 0.24
170 0.22
171 0.23
172 0.26
173 0.28
174 0.34
175 0.41
176 0.48
177 0.5
178 0.56
179 0.53
180 0.54
181 0.52
182 0.5
183 0.46
184 0.49
185 0.51
186 0.48
187 0.46
188 0.4
189 0.4
190 0.33
191 0.29
192 0.22
193 0.21
194 0.22
195 0.24
196 0.26
197 0.25
198 0.27
199 0.26
200 0.24
201 0.21
202 0.18
203 0.15
204 0.14
205 0.13
206 0.11
207 0.11
208 0.11
209 0.1
210 0.08
211 0.09
212 0.08
213 0.08
214 0.09
215 0.13
216 0.16
217 0.2
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.19
222 0.19
223 0.15
224 0.13
225 0.11
226 0.11
227 0.1
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.08
232 0.08
233 0.07
234 0.08
235 0.13
236 0.13
237 0.17
238 0.19
239 0.2
240 0.25
241 0.27
242 0.28
243 0.23
244 0.26
245 0.23
246 0.21
247 0.21
248 0.15
249 0.11
250 0.09
251 0.08
252 0.06
253 0.05
254 0.05
255 0.03
256 0.03
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.03
262 0.04
263 0.04
264 0.04
265 0.04
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.03
271 0.03
272 0.02
273 0.02
274 0.03
275 0.04
276 0.06
277 0.08
278 0.12
279 0.14
280 0.15
281 0.17
282 0.23
283 0.28
284 0.37
285 0.41
286 0.39
287 0.4
288 0.39
289 0.4
290 0.35
291 0.31
292 0.2
293 0.16
294 0.18
295 0.16
296 0.17
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.13
301 0.13
302 0.11
303 0.12
304 0.12
305 0.11
306 0.11
307 0.11
308 0.1
309 0.08
310 0.06
311 0.05
312 0.04
313 0.03
314 0.03
315 0.03
316 0.03
317 0.03
318 0.02
319 0.02
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.03
326 0.03
327 0.03
328 0.02
329 0.02
330 0.02
331 0.02
332 0.02
333 0.02
334 0.02
335 0.01
336 0.01
337 0.01
338 0.02
339 0.02
340 0.02
341 0.02
342 0.02
343 0.02
344 0.02
345 0.02
346 0.03
347 0.03
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.03
354 0.02
355 0.02
356 0.02
357 0.02
358 0.02
359 0.02
360 0.02
361 0.02
362 0.02
363 0.02
364 0.02
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.05
370 0.08
371 0.12
372 0.15
373 0.18
374 0.24
375 0.29
376 0.37
377 0.48
378 0.55
379 0.63
380 0.71
381 0.8
382 0.85
383 0.91
384 0.94
385 0.95
386 0.97
387 0.97
388 0.98
389 0.98
390 0.98
391 0.97
392 0.93
393 0.89
394 0.88
395 0.84
396 0.78
397 0.77
398 0.71
399 0.69
400 0.67
401 0.6
402 0.51
403 0.46
404 0.44
405 0.37
406 0.37
407 0.32
408 0.27
409 0.29
410 0.28
411 0.27
412 0.25
413 0.22
414 0.16
415 0.17
416 0.17
417 0.2
418 0.23
419 0.23
420 0.26
421 0.31