Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4DVI0

Protein Details
Accession A0A0C4DVI0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-60NKAPDAKKAKPTAKKGAAKPKKDABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
40-61PDAKKAKPTAKKGAAKPKKDAG
Subcellular Location(s) cyto 14.5, cyto_nucl 12.833, nucl 10, mito_nucl 6.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019544  Tetratricopeptide_SHNi-TPR_dom  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Pfam View protein in Pfam  
PF10516  SHNi-TPR  
Amino Acid Sequences MQSEMNGEMSPKNAEICFLYGRALLKVGQSKSDVFGNKAPDAKKAKPTAKKGAAKPKKDAGEEKSSEAKPEEPTPAERITEEGVAIAAAEAGGAKEDSVQPKKPLFQFEGDDNLVDSDGDEEEGAEGEEQEEEDEDDLGTAFEILEIARVLYEKQLKELEEESSEAKGKDKAEGDTPSLRHVKERLADTHDLLAEISLEGERFKDAIPDSRKSLAYKKDLYPQEHELIAEAHFKLSLALEFASVVATDDDQSEGVQHVDQALREEAATELEAAIASTKLKLQNQEVELAMNHSPDDNDVTRKEITNTKEIIADMEQRLVDLRAMPVDVEKLLGKDNPLGGILGAALGETPGQVEARVQEATKNATDLSGLVRKKKAPTTEEEKPAADGANGSASNGKSNGKRKLDETEAEAEASDDSSAKKARVEEVVTSES
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.17
2 0.17
3 0.2
4 0.2
5 0.18
6 0.19
7 0.19
8 0.21
9 0.2
10 0.2
11 0.17
12 0.21
13 0.28
14 0.27
15 0.28
16 0.29
17 0.3
18 0.31
19 0.36
20 0.33
21 0.29
22 0.32
23 0.34
24 0.36
25 0.4
26 0.39
27 0.41
28 0.45
29 0.47
30 0.52
31 0.56
32 0.62
33 0.65
34 0.73
35 0.75
36 0.78
37 0.81
38 0.81
39 0.83
40 0.84
41 0.81
42 0.79
43 0.76
44 0.73
45 0.7
46 0.68
47 0.63
48 0.64
49 0.6
50 0.57
51 0.57
52 0.51
53 0.48
54 0.42
55 0.38
56 0.32
57 0.33
58 0.34
59 0.29
60 0.32
61 0.34
62 0.34
63 0.32
64 0.28
65 0.26
66 0.23
67 0.21
68 0.17
69 0.13
70 0.1
71 0.09
72 0.09
73 0.06
74 0.04
75 0.03
76 0.03
77 0.03
78 0.03
79 0.03
80 0.03
81 0.03
82 0.05
83 0.09
84 0.17
85 0.22
86 0.26
87 0.3
88 0.33
89 0.39
90 0.42
91 0.44
92 0.4
93 0.4
94 0.39
95 0.37
96 0.4
97 0.34
98 0.3
99 0.25
100 0.21
101 0.17
102 0.14
103 0.11
104 0.06
105 0.06
106 0.06
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.05
111 0.05
112 0.04
113 0.04
114 0.04
115 0.04
116 0.04
117 0.04
118 0.05
119 0.05
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.05
124 0.05
125 0.05
126 0.04
127 0.04
128 0.03
129 0.03
130 0.03
131 0.03
132 0.04
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.09
139 0.15
140 0.14
141 0.17
142 0.2
143 0.2
144 0.22
145 0.23
146 0.2
147 0.16
148 0.17
149 0.15
150 0.15
151 0.16
152 0.13
153 0.14
154 0.15
155 0.15
156 0.18
157 0.19
158 0.18
159 0.22
160 0.24
161 0.26
162 0.27
163 0.27
164 0.27
165 0.29
166 0.27
167 0.25
168 0.24
169 0.25
170 0.25
171 0.28
172 0.26
173 0.29
174 0.3
175 0.28
176 0.29
177 0.25
178 0.2
179 0.17
180 0.13
181 0.08
182 0.06
183 0.06
184 0.04
185 0.04
186 0.04
187 0.04
188 0.04
189 0.05
190 0.05
191 0.07
192 0.08
193 0.16
194 0.2
195 0.22
196 0.25
197 0.27
198 0.29
199 0.28
200 0.33
201 0.32
202 0.33
203 0.36
204 0.35
205 0.4
206 0.44
207 0.45
208 0.44
209 0.41
210 0.37
211 0.33
212 0.31
213 0.23
214 0.18
215 0.16
216 0.14
217 0.1
218 0.08
219 0.08
220 0.08
221 0.08
222 0.07
223 0.06
224 0.05
225 0.05
226 0.05
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.04
231 0.05
232 0.04
233 0.04
234 0.04
235 0.05
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.05
240 0.05
241 0.06
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.07
246 0.07
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.08
251 0.09
252 0.08
253 0.07
254 0.07
255 0.06
256 0.05
257 0.05
258 0.05
259 0.04
260 0.04
261 0.04
262 0.04
263 0.04
264 0.07
265 0.11
266 0.13
267 0.16
268 0.19
269 0.26
270 0.27
271 0.28
272 0.26
273 0.24
274 0.22
275 0.21
276 0.18
277 0.12
278 0.11
279 0.09
280 0.09
281 0.08
282 0.13
283 0.12
284 0.14
285 0.15
286 0.18
287 0.19
288 0.2
289 0.22
290 0.24
291 0.26
292 0.29
293 0.3
294 0.28
295 0.28
296 0.27
297 0.27
298 0.23
299 0.24
300 0.18
301 0.19
302 0.18
303 0.16
304 0.17
305 0.15
306 0.14
307 0.1
308 0.1
309 0.08
310 0.09
311 0.09
312 0.09
313 0.09
314 0.09
315 0.09
316 0.09
317 0.09
318 0.11
319 0.12
320 0.12
321 0.14
322 0.15
323 0.14
324 0.14
325 0.13
326 0.11
327 0.1
328 0.08
329 0.06
330 0.05
331 0.04
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.06
341 0.07
342 0.1
343 0.11
344 0.11
345 0.13
346 0.15
347 0.19
348 0.19
349 0.19
350 0.16
351 0.15
352 0.16
353 0.14
354 0.17
355 0.2
356 0.22
357 0.27
358 0.31
359 0.35
360 0.41
361 0.47
362 0.5
363 0.47
364 0.53
365 0.57
366 0.62
367 0.65
368 0.62
369 0.56
370 0.49
371 0.46
372 0.38
373 0.29
374 0.2
375 0.14
376 0.16
377 0.15
378 0.15
379 0.17
380 0.17
381 0.19
382 0.21
383 0.25
384 0.27
385 0.36
386 0.45
387 0.48
388 0.51
389 0.52
390 0.58
391 0.6
392 0.56
393 0.52
394 0.48
395 0.42
396 0.39
397 0.35
398 0.28
399 0.21
400 0.18
401 0.13
402 0.08
403 0.08
404 0.13
405 0.16
406 0.16
407 0.19
408 0.21
409 0.25
410 0.31
411 0.34
412 0.34