Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4E0I5

Protein Details
Accession A0A0C4E0I5    Localization Confidence High Confidence Score 21.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
65-85EYSSKKSHEEFKKHRAKKGFPBasic
175-197SEEDKKARKAKRPLKRKAPSSSSBasic
411-440LIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTNAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
76-82KKHRAKK
179-192KKARKAKRPLKRKA
416-433GKGFTKEKNKKKKGSYRG
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007718  Srp40_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05022  SRP40_C  
Amino Acid Sequences MTGSAPPAWLFGDNSTPAVIDTSGRPLNKTVMAATKDKKAAKPALAPESHPPAQLLDLVEAFLEEYSSKKSHEEFKKHRAKKGFPPTAPGPAIATSLVAVFQEWKAAQNGKASSIDDDSSSSSSSSSESSSSESESESESESGSESESGSEGAENADVDMMDIEADEADSESSDSEEDKKARKAKRPLKRKAPSSSSSSSSDSSDSSSEDERPQIKKQKTAKAASPPSSSSSSSSSSSSSSASSSSEADAESKADSDNDSSSSSSSSSSDSNSDSDSGSEAQAAASKVPLPGSDSDSSASSSSDSSDEGSPAPSTQIKKEAKEAIAAKSGSDSSVTLGQTSPQVFPVSQFAPLPPDPAVKANNRGKKNGDGPKAPNVPFSRIRKDIAVDPRLRSNAFNPADEWGQKAHEDLIVTKGKGFTKEKNKKKKGSYRGGRIDTNARNGIKFDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.17
5 0.17
6 0.15
7 0.11
8 0.12
9 0.18
10 0.23
11 0.23
12 0.25
13 0.25
14 0.29
15 0.3
16 0.3
17 0.27
18 0.3
19 0.33
20 0.39
21 0.4
22 0.43
23 0.47
24 0.51
25 0.5
26 0.51
27 0.54
28 0.53
29 0.57
30 0.57
31 0.59
32 0.56
33 0.55
34 0.53
35 0.55
36 0.5
37 0.43
38 0.36
39 0.28
40 0.27
41 0.27
42 0.22
43 0.16
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.11
48 0.11
49 0.08
50 0.07
51 0.05
52 0.06
53 0.11
54 0.12
55 0.13
56 0.16
57 0.19
58 0.29
59 0.39
60 0.49
61 0.53
62 0.63
63 0.73
64 0.77
65 0.81
66 0.81
67 0.78
68 0.77
69 0.8
70 0.79
71 0.69
72 0.71
73 0.66
74 0.65
75 0.58
76 0.48
77 0.39
78 0.29
79 0.29
80 0.21
81 0.18
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.07
86 0.06
87 0.07
88 0.06
89 0.1
90 0.09
91 0.11
92 0.14
93 0.17
94 0.19
95 0.23
96 0.24
97 0.24
98 0.25
99 0.24
100 0.23
101 0.23
102 0.21
103 0.16
104 0.16
105 0.15
106 0.14
107 0.14
108 0.12
109 0.1
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.12
117 0.13
118 0.14
119 0.13
120 0.12
121 0.12
122 0.12
123 0.13
124 0.12
125 0.11
126 0.1
127 0.1
128 0.1
129 0.09
130 0.08
131 0.08
132 0.06
133 0.06
134 0.06
135 0.06
136 0.06
137 0.06
138 0.05
139 0.05
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.04
146 0.04
147 0.04
148 0.03
149 0.03
150 0.03
151 0.03
152 0.03
153 0.03
154 0.03
155 0.03
156 0.03
157 0.03
158 0.03
159 0.04
160 0.04
161 0.05
162 0.07
163 0.11
164 0.13
165 0.17
166 0.23
167 0.31
168 0.37
169 0.46
170 0.54
171 0.6
172 0.68
173 0.75
174 0.79
175 0.83
176 0.85
177 0.84
178 0.81
179 0.79
180 0.72
181 0.68
182 0.61
183 0.54
184 0.48
185 0.43
186 0.35
187 0.29
188 0.26
189 0.19
190 0.17
191 0.14
192 0.12
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.12
197 0.15
198 0.18
199 0.21
200 0.26
201 0.34
202 0.34
203 0.41
204 0.48
205 0.53
206 0.56
207 0.57
208 0.56
209 0.57
210 0.6
211 0.56
212 0.51
213 0.43
214 0.39
215 0.38
216 0.33
217 0.25
218 0.22
219 0.2
220 0.2
221 0.19
222 0.17
223 0.15
224 0.15
225 0.14
226 0.12
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.08
234 0.08
235 0.08
236 0.08
237 0.08
238 0.07
239 0.07
240 0.06
241 0.06
242 0.06
243 0.07
244 0.07
245 0.08
246 0.09
247 0.09
248 0.09
249 0.1
250 0.1
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.09
255 0.1
256 0.11
257 0.12
258 0.12
259 0.12
260 0.13
261 0.11
262 0.11
263 0.11
264 0.1
265 0.09
266 0.08
267 0.07
268 0.07
269 0.09
270 0.09
271 0.08
272 0.07
273 0.08
274 0.08
275 0.09
276 0.09
277 0.09
278 0.1
279 0.15
280 0.16
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.17
285 0.15
286 0.14
287 0.1
288 0.09
289 0.09
290 0.09
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.11
297 0.1
298 0.1
299 0.12
300 0.14
301 0.15
302 0.17
303 0.26
304 0.29
305 0.3
306 0.36
307 0.4
308 0.36
309 0.41
310 0.41
311 0.35
312 0.37
313 0.35
314 0.29
315 0.25
316 0.24
317 0.18
318 0.16
319 0.13
320 0.09
321 0.13
322 0.13
323 0.12
324 0.12
325 0.13
326 0.16
327 0.17
328 0.16
329 0.14
330 0.15
331 0.14
332 0.16
333 0.2
334 0.17
335 0.17
336 0.17
337 0.15
338 0.2
339 0.2
340 0.21
341 0.18
342 0.19
343 0.19
344 0.22
345 0.27
346 0.25
347 0.35
348 0.41
349 0.48
350 0.5
351 0.53
352 0.54
353 0.56
354 0.62
355 0.61
356 0.6
357 0.59
358 0.6
359 0.65
360 0.68
361 0.61
362 0.59
363 0.53
364 0.52
365 0.54
366 0.56
367 0.55
368 0.51
369 0.53
370 0.48
371 0.48
372 0.5
373 0.51
374 0.52
375 0.49
376 0.48
377 0.53
378 0.53
379 0.51
380 0.45
381 0.38
382 0.39
383 0.37
384 0.36
385 0.3
386 0.3
387 0.33
388 0.31
389 0.3
390 0.22
391 0.21
392 0.2
393 0.2
394 0.18
395 0.16
396 0.17
397 0.16
398 0.21
399 0.25
400 0.25
401 0.26
402 0.29
403 0.3
404 0.36
405 0.4
406 0.42
407 0.48
408 0.59
409 0.68
410 0.75
411 0.82
412 0.84
413 0.9
414 0.91
415 0.91
416 0.91
417 0.91
418 0.91
419 0.91
420 0.88
421 0.81
422 0.75
423 0.74
424 0.68
425 0.65
426 0.62
427 0.53
428 0.48