Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4EDS2

Protein Details
Accession A0A0C4EDS2    Localization Confidence High Confidence Score 16.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
270-289RADLRRKKAGRQHLRTSQQAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
213-222KKKKSSSKSK
275-280RKKAGR
306-307KR
Subcellular Location(s) nucl 18, cyto_nucl 14.5, cyto 9
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007109  Brix  
IPR026532  BRX1  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0008097  F:5S rRNA binding  
GO:0042134  F:rRNA primary transcript binding  
GO:0000464  P:endonucleolytic cleavage in ITS1 upstream of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000465  P:exonucleolytic trimming to generate mature 5'-end of 5.8S rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
GO:0000027  P:ribosomal large subunit assembly  
Pfam View protein in Pfam  
PF04427  Brix  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50833  BRIX  
Amino Acid Sequences MASVYKSLSKGTSDKDGAPSTGPRKNKQRVLILSSRGVTFRHRHLLNDLAAMLPHGKKDVKFDSKSKLYQLNELAELYNCNNVLFFEARKGQDLYVWASKVPNGPTVKMHLQNLHTMDELNFTGNCLKGSRPILSFDAAFEKEAHYRVIKELFLHIFGVPEGARKSKPFVDHVMGFSIADGKIWVRNYQINEVEQTKGGGGDGEDGEEEEGGKKKKSSSKSKSGSGKDTDINLVEIGPRFVLTPVVIQEGAFGGPIIYENKQFVSPNQVRADLRRKKAGRQHLRTSQQADRTAKKGDLGLRTEGGKRKREDALDTQKLFA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.37
2 0.41
3 0.41
4 0.38
5 0.37
6 0.4
7 0.38
8 0.42
9 0.46
10 0.48
11 0.57
12 0.65
13 0.7
14 0.7
15 0.73
16 0.73
17 0.75
18 0.74
19 0.69
20 0.64
21 0.58
22 0.51
23 0.42
24 0.36
25 0.34
26 0.31
27 0.33
28 0.38
29 0.37
30 0.38
31 0.41
32 0.46
33 0.42
34 0.39
35 0.32
36 0.23
37 0.22
38 0.21
39 0.19
40 0.13
41 0.12
42 0.14
43 0.16
44 0.17
45 0.24
46 0.33
47 0.39
48 0.43
49 0.47
50 0.53
51 0.57
52 0.59
53 0.57
54 0.55
55 0.48
56 0.49
57 0.49
58 0.42
59 0.37
60 0.35
61 0.3
62 0.23
63 0.23
64 0.18
65 0.16
66 0.13
67 0.11
68 0.11
69 0.1
70 0.12
71 0.12
72 0.12
73 0.14
74 0.19
75 0.19
76 0.22
77 0.23
78 0.2
79 0.21
80 0.22
81 0.23
82 0.22
83 0.21
84 0.19
85 0.18
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.23
90 0.21
91 0.22
92 0.23
93 0.28
94 0.32
95 0.31
96 0.32
97 0.3
98 0.3
99 0.33
100 0.33
101 0.29
102 0.24
103 0.21
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.12
108 0.1
109 0.09
110 0.1
111 0.1
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.13
116 0.16
117 0.18
118 0.18
119 0.2
120 0.21
121 0.21
122 0.21
123 0.16
124 0.18
125 0.15
126 0.15
127 0.13
128 0.13
129 0.13
130 0.14
131 0.14
132 0.11
133 0.11
134 0.13
135 0.15
136 0.14
137 0.13
138 0.15
139 0.14
140 0.14
141 0.14
142 0.12
143 0.1
144 0.09
145 0.1
146 0.07
147 0.08
148 0.08
149 0.09
150 0.1
151 0.1
152 0.14
153 0.16
154 0.19
155 0.19
156 0.23
157 0.25
158 0.25
159 0.26
160 0.24
161 0.21
162 0.18
163 0.15
164 0.13
165 0.09
166 0.07
167 0.06
168 0.05
169 0.08
170 0.09
171 0.1
172 0.11
173 0.14
174 0.17
175 0.22
176 0.23
177 0.21
178 0.23
179 0.24
180 0.23
181 0.19
182 0.17
183 0.12
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.05
188 0.06
189 0.06
190 0.06
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.1
198 0.11
199 0.12
200 0.14
201 0.19
202 0.26
203 0.35
204 0.45
205 0.5
206 0.59
207 0.64
208 0.71
209 0.74
210 0.72
211 0.7
212 0.62
213 0.57
214 0.49
215 0.45
216 0.38
217 0.3
218 0.26
219 0.19
220 0.15
221 0.14
222 0.12
223 0.1
224 0.09
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.09
229 0.07
230 0.09
231 0.1
232 0.12
233 0.12
234 0.11
235 0.11
236 0.11
237 0.11
238 0.09
239 0.07
240 0.05
241 0.05
242 0.06
243 0.08
244 0.09
245 0.1
246 0.11
247 0.13
248 0.15
249 0.16
250 0.16
251 0.25
252 0.27
253 0.33
254 0.35
255 0.39
256 0.38
257 0.45
258 0.54
259 0.53
260 0.55
261 0.58
262 0.58
263 0.62
264 0.7
265 0.74
266 0.74
267 0.74
268 0.78
269 0.78
270 0.82
271 0.8
272 0.77
273 0.73
274 0.69
275 0.69
276 0.65
277 0.6
278 0.57
279 0.55
280 0.49
281 0.44
282 0.42
283 0.39
284 0.4
285 0.39
286 0.39
287 0.37
288 0.39
289 0.43
290 0.46
291 0.47
292 0.48
293 0.47
294 0.49
295 0.54
296 0.55
297 0.56
298 0.59
299 0.62
300 0.64