Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C4EDX0

Protein Details
Accession A0A0C4EDX0    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
804-823NTSPAGTKRRRPSGVKADDDHydrophilic
840-863NGVPNKTKPPTPRMQKRLKSNPASHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 11.5, cyto_nucl 11, cyto 7.5, mito 4, extr 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR029005  LIM-bd/SEUSS  
IPR044522  TSO1-like  
Gene Ontology GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF01803  LIM_bind  
Amino Acid Sequences MSVSGPGPQVNPAAALMGGVGIPPGANPNAHAMQHLSQQQQQQLFQQQQQMGPMAYNNPQAVLQHQMRQQQIHQQIQQQQARQVLMAQQGMYGNITPGIPIGIPMGQMGQMNPQQIAQIQQQMRLRQAQAQHQQAQQQQQQQQQQQQQQQQHPSQQQQLMAAQQLALQQQQAAQQGQGPNQGGQMGAQHQMQPAQLAALQQAQQAHVQQQAQQQAQQQAQQQQQAQQQHQQQQHAHQHQQAQHQQQAQHQQQAQHQQQAQHQQAAQHQQQAQHQQQQHAQQQAQQQHAQQHAQQQHAQQQQHAQQQQHAQQHPAQQQAQQQPPQQPPQQPQQQPQQGPQGPQGPQGPQGPQQQQPSAQSQPPQQAPTPQPQQGPQQPPTPQPQQGQPGPGQVGPPGQPPNQPAPQVGHAPSTGPGSQPPTPITAQHAFAGNVSLQKRETMKGHCLLKLMQFAEHLSGYPGTKHKDDLSYWTDFVQRFFSPRGVWRQTLHTVDDQEGDKQYEIGFPTLARYFTTHFESGVTNIQLIMEKGTTDKPLTGDCHYIENSRASLQYWFEGGSHLVATGTVRAQFDQEQKIDLFEFICTGFEEYISRSMVIQAAKPNHMWIKEWKKLNTQDPKASPEMSKKSKRTAKSPIAPPPDLDLPQSLIRRGTHVTEAVHQFLEISEIIGQMTPLFNYFHTHPHLGPYQALDQYVHTQINGPGQQAVFQQQQQHQQQQAQQQAQQQQQQQQQQQMPQQHQQQQMPQPGPRTPGFGQFPIGASPHAAHLQLPQSPHIGSPVPGGNMTPQMQMQQSQQGTSSSGPSTNTSPAGTKRRRPSGVKADDDGSGLIQVPTPGGGPHLNGVPNKTKPPTPRMQKRLKSNPAS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.11
3 0.08
4 0.07
5 0.06
6 0.05
7 0.05
8 0.04
9 0.04
10 0.04
11 0.08
12 0.09
13 0.09
14 0.1
15 0.17
16 0.21
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.25
21 0.31
22 0.36
23 0.33
24 0.35
25 0.4
26 0.44
27 0.45
28 0.44
29 0.44
30 0.46
31 0.48
32 0.48
33 0.5
34 0.47
35 0.45
36 0.46
37 0.42
38 0.33
39 0.29
40 0.26
41 0.22
42 0.23
43 0.26
44 0.23
45 0.21
46 0.22
47 0.22
48 0.22
49 0.26
50 0.26
51 0.28
52 0.33
53 0.39
54 0.41
55 0.44
56 0.45
57 0.47
58 0.52
59 0.54
60 0.54
61 0.55
62 0.59
63 0.65
64 0.67
65 0.61
66 0.57
67 0.53
68 0.5
69 0.42
70 0.36
71 0.31
72 0.31
73 0.28
74 0.24
75 0.21
76 0.2
77 0.21
78 0.2
79 0.15
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.08
85 0.08
86 0.07
87 0.07
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.09
93 0.09
94 0.1
95 0.1
96 0.15
97 0.17
98 0.18
99 0.18
100 0.18
101 0.17
102 0.17
103 0.21
104 0.19
105 0.25
106 0.25
107 0.31
108 0.35
109 0.37
110 0.4
111 0.41
112 0.4
113 0.36
114 0.4
115 0.44
116 0.48
117 0.53
118 0.55
119 0.52
120 0.57
121 0.57
122 0.6
123 0.56
124 0.56
125 0.55
126 0.56
127 0.62
128 0.62
129 0.65
130 0.65
131 0.68
132 0.68
133 0.69
134 0.7
135 0.69
136 0.72
137 0.69
138 0.69
139 0.67
140 0.65
141 0.65
142 0.59
143 0.53
144 0.47
145 0.43
146 0.37
147 0.31
148 0.25
149 0.18
150 0.16
151 0.17
152 0.16
153 0.14
154 0.12
155 0.11
156 0.12
157 0.16
158 0.18
159 0.17
160 0.16
161 0.19
162 0.22
163 0.24
164 0.27
165 0.25
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.17
170 0.14
171 0.15
172 0.12
173 0.13
174 0.13
175 0.14
176 0.15
177 0.17
178 0.16
179 0.14
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.12
186 0.12
187 0.13
188 0.14
189 0.15
190 0.15
191 0.16
192 0.17
193 0.18
194 0.18
195 0.21
196 0.25
197 0.31
198 0.3
199 0.32
200 0.34
201 0.36
202 0.37
203 0.37
204 0.37
205 0.37
206 0.4
207 0.42
208 0.39
209 0.39
210 0.44
211 0.46
212 0.44
213 0.44
214 0.47
215 0.51
216 0.53
217 0.53
218 0.5
219 0.52
220 0.59
221 0.59
222 0.57
223 0.53
224 0.55
225 0.54
226 0.6
227 0.58
228 0.53
229 0.52
230 0.51
231 0.5
232 0.48
233 0.53
234 0.48
235 0.47
236 0.45
237 0.44
238 0.45
239 0.52
240 0.5
241 0.47
242 0.46
243 0.44
244 0.46
245 0.51
246 0.48
247 0.42
248 0.4
249 0.36
250 0.38
251 0.42
252 0.39
253 0.36
254 0.35
255 0.36
256 0.39
257 0.45
258 0.44
259 0.44
260 0.45
261 0.43
262 0.45
263 0.49
264 0.5
265 0.47
266 0.43
267 0.4
268 0.43
269 0.45
270 0.44
271 0.39
272 0.36
273 0.36
274 0.38
275 0.36
276 0.32
277 0.34
278 0.34
279 0.35
280 0.35
281 0.33
282 0.38
283 0.43
284 0.41
285 0.35
286 0.37
287 0.4
288 0.45
289 0.47
290 0.39
291 0.36
292 0.42
293 0.47
294 0.49
295 0.44
296 0.38
297 0.37
298 0.44
299 0.44
300 0.43
301 0.38
302 0.34
303 0.4
304 0.45
305 0.47
306 0.45
307 0.45
308 0.46
309 0.5
310 0.53
311 0.51
312 0.49
313 0.47
314 0.51
315 0.56
316 0.54
317 0.55
318 0.58
319 0.6
320 0.57
321 0.56
322 0.57
323 0.5
324 0.47
325 0.46
326 0.42
327 0.35
328 0.37
329 0.35
330 0.27
331 0.28
332 0.28
333 0.26
334 0.26
335 0.32
336 0.32
337 0.35
338 0.37
339 0.35
340 0.35
341 0.36
342 0.35
343 0.31
344 0.29
345 0.28
346 0.28
347 0.32
348 0.33
349 0.32
350 0.28
351 0.31
352 0.32
353 0.36
354 0.38
355 0.36
356 0.34
357 0.35
358 0.41
359 0.43
360 0.46
361 0.42
362 0.42
363 0.41
364 0.43
365 0.47
366 0.44
367 0.41
368 0.37
369 0.38
370 0.39
371 0.38
372 0.38
373 0.32
374 0.3
375 0.26
376 0.25
377 0.2
378 0.15
379 0.14
380 0.12
381 0.15
382 0.16
383 0.16
384 0.17
385 0.2
386 0.25
387 0.26
388 0.26
389 0.24
390 0.23
391 0.24
392 0.25
393 0.23
394 0.19
395 0.16
396 0.15
397 0.15
398 0.15
399 0.13
400 0.1
401 0.1
402 0.13
403 0.15
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.17
408 0.17
409 0.21
410 0.19
411 0.18
412 0.17
413 0.18
414 0.15
415 0.14
416 0.15
417 0.1
418 0.12
419 0.12
420 0.12
421 0.1
422 0.13
423 0.14
424 0.15
425 0.18
426 0.18
427 0.22
428 0.27
429 0.29
430 0.28
431 0.28
432 0.27
433 0.26
434 0.26
435 0.22
436 0.17
437 0.15
438 0.14
439 0.15
440 0.13
441 0.11
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.09
446 0.12
447 0.13
448 0.14
449 0.15
450 0.16
451 0.18
452 0.19
453 0.23
454 0.24
455 0.23
456 0.23
457 0.22
458 0.24
459 0.22
460 0.22
461 0.19
462 0.16
463 0.16
464 0.17
465 0.18
466 0.16
467 0.19
468 0.27
469 0.27
470 0.29
471 0.28
472 0.32
473 0.35
474 0.35
475 0.33
476 0.27
477 0.24
478 0.23
479 0.24
480 0.2
481 0.17
482 0.16
483 0.14
484 0.12
485 0.11
486 0.11
487 0.1
488 0.11
489 0.1
490 0.09
491 0.08
492 0.1
493 0.11
494 0.11
495 0.1
496 0.1
497 0.12
498 0.14
499 0.19
500 0.17
501 0.16
502 0.16
503 0.16
504 0.17
505 0.18
506 0.16
507 0.11
508 0.11
509 0.11
510 0.1
511 0.1
512 0.09
513 0.06
514 0.06
515 0.07
516 0.08
517 0.1
518 0.1
519 0.11
520 0.11
521 0.13
522 0.16
523 0.16
524 0.18
525 0.17
526 0.2
527 0.2
528 0.2
529 0.2
530 0.18
531 0.17
532 0.16
533 0.15
534 0.13
535 0.14
536 0.13
537 0.12
538 0.11
539 0.11
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.08
544 0.07
545 0.07
546 0.06
547 0.05
548 0.06
549 0.06
550 0.06
551 0.08
552 0.08
553 0.09
554 0.1
555 0.14
556 0.19
557 0.22
558 0.22
559 0.22
560 0.22
561 0.22
562 0.21
563 0.18
564 0.13
565 0.09
566 0.09
567 0.07
568 0.08
569 0.07
570 0.08
571 0.07
572 0.07
573 0.08
574 0.08
575 0.11
576 0.11
577 0.11
578 0.1
579 0.11
580 0.14
581 0.14
582 0.15
583 0.18
584 0.2
585 0.22
586 0.22
587 0.25
588 0.25
589 0.25
590 0.26
591 0.3
592 0.36
593 0.41
594 0.47
595 0.47
596 0.52
597 0.58
598 0.65
599 0.66
600 0.62
601 0.64
602 0.61
603 0.62
604 0.56
605 0.52
606 0.45
607 0.44
608 0.46
609 0.47
610 0.53
611 0.52
612 0.59
613 0.65
614 0.66
615 0.65
616 0.67
617 0.68
618 0.68
619 0.73
620 0.72
621 0.72
622 0.68
623 0.61
624 0.55
625 0.49
626 0.41
627 0.34
628 0.25
629 0.21
630 0.25
631 0.26
632 0.22
633 0.22
634 0.21
635 0.23
636 0.24
637 0.23
638 0.21
639 0.22
640 0.22
641 0.26
642 0.28
643 0.26
644 0.25
645 0.22
646 0.19
647 0.16
648 0.16
649 0.1
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.08
654 0.07
655 0.07
656 0.06
657 0.06
658 0.06
659 0.06
660 0.07
661 0.08
662 0.11
663 0.13
664 0.18
665 0.22
666 0.24
667 0.24
668 0.28
669 0.31
670 0.28
671 0.28
672 0.25
673 0.25
674 0.24
675 0.24
676 0.2
677 0.18
678 0.21
679 0.23
680 0.2
681 0.16
682 0.17
683 0.18
684 0.25
685 0.25
686 0.22
687 0.21
688 0.2
689 0.22
690 0.21
691 0.25
692 0.21
693 0.22
694 0.28
695 0.3
696 0.4
697 0.44
698 0.5
699 0.49
700 0.5
701 0.53
702 0.54
703 0.58
704 0.52
705 0.5
706 0.5
707 0.53
708 0.54
709 0.55
710 0.52
711 0.52
712 0.56
713 0.6
714 0.59
715 0.6
716 0.59
717 0.58
718 0.59
719 0.59
720 0.57
721 0.56
722 0.6
723 0.6
724 0.63
725 0.61
726 0.62
727 0.63
728 0.66
729 0.63
730 0.57
731 0.54
732 0.5
733 0.51
734 0.43
735 0.42
736 0.35
737 0.39
738 0.4
739 0.37
740 0.36
741 0.33
742 0.33
743 0.28
744 0.27
745 0.19
746 0.15
747 0.15
748 0.15
749 0.15
750 0.14
751 0.13
752 0.17
753 0.2
754 0.22
755 0.23
756 0.22
757 0.22
758 0.23
759 0.22
760 0.21
761 0.19
762 0.17
763 0.2
764 0.21
765 0.2
766 0.2
767 0.2
768 0.19
769 0.23
770 0.24
771 0.21
772 0.18
773 0.2
774 0.22
775 0.24
776 0.24
777 0.27
778 0.27
779 0.26
780 0.27
781 0.25
782 0.26
783 0.24
784 0.25
785 0.18
786 0.19
787 0.2
788 0.21
789 0.23
790 0.24
791 0.25
792 0.23
793 0.26
794 0.32
795 0.41
796 0.47
797 0.53
798 0.59
799 0.68
800 0.74
801 0.76
802 0.78
803 0.79
804 0.8
805 0.77
806 0.7
807 0.62
808 0.55
809 0.5
810 0.4
811 0.29
812 0.2
813 0.15
814 0.12
815 0.11
816 0.1
817 0.09
818 0.09
819 0.09
820 0.08
821 0.1
822 0.11
823 0.12
824 0.14
825 0.18
826 0.22
827 0.23
828 0.29
829 0.34
830 0.38
831 0.44
832 0.46
833 0.48
834 0.52
835 0.59
836 0.64
837 0.67
838 0.73
839 0.76
840 0.83
841 0.85
842 0.89
843 0.91