Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A0C4DXQ1

Protein Details
Accession A0A0C4DXQ1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
26-54VPPTPPVSTSPSKRKRSRKSDGRGDGQSMHydrophilic
56-88EPDREGRQGTTPRRRWQRRQERHRRRVQAVTASHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
37-48SKRKRSRKSDGR
62-81RQGTTPRRRWQRRQERHRRR
Subcellular Location(s) mito 8, cyto_nucl 8, nucl 7.5, cyto 7.5, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR046797  PDDEXK_12  
Pfam View protein in Pfam  
PF20516  PDDEXK_12  
Amino Acid Sequences MEASRILSWLDACEPQLAPPPGSVAVPPTPPVSTSPSKRKRSRKSDGRGDGQSMLEPDREGRQGTTPRRRWQRRQERHRRRVQAVTASSRIRPAPASSASVPSASGSESSRPSRRSTSPVKHVFHLKLLAKPVEFTAVSGDPLSRLPDDVHDLFSKINRIVEYREAFIPDASRECLARLLPDLPALATTRTDEDPSWLAWRQHDAFLAIQQEALQCQRQGRGELAWNTLVHSQVLRLAAGSITGGVACEPIVSASIAGQWLPDLAQQSAAASVKEVASGKMVDFALVLDLFDPLPEHATLAKSLMHTLSRLPSGAQSINQTMYEPLMLKPIGVSIETKVAASAGNTGSVQLGIWVAAWHRRITELLDVAPGGIITLPLVLCHGHEWNLHFACDRGERIEMVGPISSGKTSDVVSLYSLHETLRELCGWVGGNPEARDGGGDLWIQPVELPHS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.18
2 0.19
3 0.28
4 0.28
5 0.26
6 0.24
7 0.26
8 0.24
9 0.24
10 0.23
11 0.18
12 0.19
13 0.2
14 0.22
15 0.21
16 0.2
17 0.21
18 0.24
19 0.26
20 0.31
21 0.38
22 0.48
23 0.56
24 0.66
25 0.75
26 0.83
27 0.86
28 0.89
29 0.91
30 0.9
31 0.91
32 0.92
33 0.91
34 0.88
35 0.81
36 0.74
37 0.66
38 0.56
39 0.48
40 0.38
41 0.31
42 0.24
43 0.2
44 0.18
45 0.19
46 0.2
47 0.19
48 0.19
49 0.25
50 0.33
51 0.43
52 0.52
53 0.57
54 0.65
55 0.75
56 0.83
57 0.86
58 0.88
59 0.89
60 0.89
61 0.93
62 0.94
63 0.95
64 0.95
65 0.95
66 0.93
67 0.88
68 0.86
69 0.82
70 0.8
71 0.75
72 0.71
73 0.66
74 0.59
75 0.53
76 0.48
77 0.41
78 0.33
79 0.28
80 0.23
81 0.24
82 0.24
83 0.28
84 0.26
85 0.29
86 0.28
87 0.26
88 0.24
89 0.18
90 0.16
91 0.12
92 0.12
93 0.1
94 0.13
95 0.17
96 0.23
97 0.28
98 0.3
99 0.33
100 0.38
101 0.41
102 0.45
103 0.51
104 0.54
105 0.59
106 0.66
107 0.65
108 0.62
109 0.65
110 0.59
111 0.53
112 0.51
113 0.43
114 0.37
115 0.4
116 0.39
117 0.31
118 0.3
119 0.27
120 0.23
121 0.2
122 0.17
123 0.16
124 0.14
125 0.14
126 0.14
127 0.13
128 0.1
129 0.11
130 0.13
131 0.09
132 0.09
133 0.09
134 0.11
135 0.17
136 0.17
137 0.19
138 0.17
139 0.18
140 0.17
141 0.18
142 0.2
143 0.15
144 0.16
145 0.14
146 0.15
147 0.17
148 0.23
149 0.23
150 0.23
151 0.23
152 0.22
153 0.21
154 0.2
155 0.19
156 0.14
157 0.13
158 0.12
159 0.12
160 0.11
161 0.11
162 0.12
163 0.11
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.1
168 0.11
169 0.1
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.07
175 0.08
176 0.1
177 0.1
178 0.12
179 0.11
180 0.12
181 0.13
182 0.13
183 0.15
184 0.16
185 0.16
186 0.16
187 0.2
188 0.19
189 0.19
190 0.19
191 0.17
192 0.15
193 0.16
194 0.17
195 0.12
196 0.1
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.09
204 0.12
205 0.13
206 0.14
207 0.14
208 0.15
209 0.18
210 0.19
211 0.2
212 0.18
213 0.17
214 0.17
215 0.17
216 0.16
217 0.11
218 0.09
219 0.08
220 0.09
221 0.09
222 0.08
223 0.07
224 0.07
225 0.06
226 0.06
227 0.06
228 0.04
229 0.03
230 0.03
231 0.03
232 0.03
233 0.03
234 0.03
235 0.03
236 0.02
237 0.03
238 0.03
239 0.03
240 0.03
241 0.03
242 0.04
243 0.04
244 0.04
245 0.04
246 0.04
247 0.04
248 0.04
249 0.05
250 0.06
251 0.06
252 0.07
253 0.07
254 0.07
255 0.09
256 0.09
257 0.08
258 0.07
259 0.08
260 0.07
261 0.09
262 0.09
263 0.08
264 0.08
265 0.09
266 0.09
267 0.12
268 0.11
269 0.1
270 0.09
271 0.09
272 0.09
273 0.08
274 0.08
275 0.04
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.05
280 0.04
281 0.06
282 0.06
283 0.07
284 0.07
285 0.09
286 0.09
287 0.1
288 0.11
289 0.1
290 0.11
291 0.12
292 0.11
293 0.11
294 0.12
295 0.14
296 0.13
297 0.13
298 0.13
299 0.13
300 0.16
301 0.16
302 0.16
303 0.16
304 0.17
305 0.19
306 0.18
307 0.17
308 0.14
309 0.13
310 0.13
311 0.11
312 0.1
313 0.12
314 0.12
315 0.11
316 0.11
317 0.11
318 0.11
319 0.1
320 0.11
321 0.08
322 0.12
323 0.13
324 0.13
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.12
330 0.09
331 0.1
332 0.1
333 0.1
334 0.1
335 0.1
336 0.09
337 0.06
338 0.06
339 0.05
340 0.05
341 0.05
342 0.06
343 0.11
344 0.13
345 0.13
346 0.13
347 0.15
348 0.15
349 0.18
350 0.22
351 0.19
352 0.18
353 0.19
354 0.18
355 0.17
356 0.16
357 0.13
358 0.07
359 0.05
360 0.04
361 0.03
362 0.05
363 0.05
364 0.05
365 0.06
366 0.06
367 0.06
368 0.09
369 0.1
370 0.12
371 0.14
372 0.17
373 0.25
374 0.26
375 0.26
376 0.24
377 0.23
378 0.25
379 0.27
380 0.26
381 0.2
382 0.2
383 0.2
384 0.22
385 0.25
386 0.22
387 0.19
388 0.18
389 0.15
390 0.15
391 0.16
392 0.14
393 0.1
394 0.11
395 0.11
396 0.11
397 0.14
398 0.13
399 0.13
400 0.14
401 0.16
402 0.16
403 0.17
404 0.17
405 0.14
406 0.14
407 0.15
408 0.16
409 0.18
410 0.16
411 0.16
412 0.15
413 0.18
414 0.18
415 0.17
416 0.18
417 0.18
418 0.23
419 0.22
420 0.24
421 0.21
422 0.2
423 0.2
424 0.17
425 0.16
426 0.13
427 0.13
428 0.12
429 0.14
430 0.14
431 0.13
432 0.12