Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4RFN6

Protein Details
Accession F4RFN6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
132-156ILGKPTHKFNPKVNKKRRSDGTNGEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
313-319RKARKGK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 13.5, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR003107  HAT  
IPR045075  Syf1-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG mlr:MELLADRAFT_104717  -  
Amino Acid Sequences MSSNEKKSKTLDSFTSIFPITAELSTLFNSIDCLSNDPEHLLAEQDLLINPNNQTQWLNHIKNLTESIQREILEQRGKIDEIEIELLGQNLSSEIGRKGYQILVSVYERCLIYFPQSFQLWNDYLQMRQSFILGKPTHKFNPKVNKKRRSDGTNGEGLNVLDYLMKKDEELEENERDMDGGQWEGWLDSSLGWCEWKALASAHERALIWLPKMPRLWLSYLTLLTHPACPAPLSLSHTRHTFDRALRTLPHSLHERIWKPYLRWSEKVAGGETCVRVWRRYLSVDPSLTAHYVEFLRPHKALIAAKLLLGLVRKARKGKYKSPDGKSPYQMLIEFMELCERFPNQIGINLKTMERMRLQASEPKVTEESSKVPNDSSAPQPADGSAPFQGLVRFAGPPTAVQGKGWTPRPDPRLADQTEAYDPNTDPSNPQKLDIEKIIELEGFNVYKDQLGLIYSNLATYWIKKTEFEKAKEVFETGISKVLTIRDFTTIFDAYAEFSEQYISSLMESISNEEEDNEEEEKELDLKMKQFEELMDRRPFLVNDVLLRRNPNDVQEWEKRIVLFDKDQDEKIVETYVKAIETINPKKATANFNQLFVNFAKWYEESGLSANMGTDDGGEGVPDLVNARKVFERAVKVNFQRVDDLAEIWIEWAEMEVRNENYTEALKVMQRATMIPVDWKKKQISFHDESLPVQSRLFKSLKLWSFRVDLEESIGTVESTQKAYDSIFELKIANAQIVINYANFLEENEYWEESFKVYERGIELFSFPIVFEIWNTYLIRFIKRYQGNKIERARDLFEQALENCPEKFIKPIFLLYAELEENYGLAKRAMSVLERATTKVALTERFDMFTYYIAKATENFGLPATRSIYQRAIECLPNNQTAEMCLRFASLEQKLGEIDRARAIYAHASQFCDPRTAPEFWETYHTFEIQHGSEDTFREMLRIKRAVQASFNTETSYLAAKAAAARAGTLKVLQQQDAMTQLANGAQEKPTMAFVPSSKNPVVAEEEKSGNADEIEIDDEDEE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.47
2 0.47
3 0.38
4 0.31
5 0.25
6 0.22
7 0.18
8 0.15
9 0.15
10 0.12
11 0.13
12 0.14
13 0.14
14 0.13
15 0.11
16 0.12
17 0.12
18 0.15
19 0.15
20 0.18
21 0.2
22 0.22
23 0.23
24 0.23
25 0.22
26 0.19
27 0.18
28 0.16
29 0.13
30 0.12
31 0.12
32 0.12
33 0.12
34 0.13
35 0.14
36 0.15
37 0.15
38 0.19
39 0.19
40 0.2
41 0.21
42 0.2
43 0.27
44 0.35
45 0.37
46 0.36
47 0.39
48 0.38
49 0.4
50 0.43
51 0.38
52 0.35
53 0.34
54 0.36
55 0.36
56 0.35
57 0.34
58 0.33
59 0.37
60 0.35
61 0.34
62 0.32
63 0.31
64 0.32
65 0.3
66 0.28
67 0.22
68 0.19
69 0.2
70 0.17
71 0.14
72 0.14
73 0.14
74 0.12
75 0.1
76 0.07
77 0.05
78 0.06
79 0.06
80 0.08
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.14
85 0.16
86 0.18
87 0.2
88 0.2
89 0.2
90 0.22
91 0.24
92 0.25
93 0.23
94 0.23
95 0.22
96 0.19
97 0.2
98 0.16
99 0.2
100 0.23
101 0.24
102 0.27
103 0.28
104 0.29
105 0.28
106 0.33
107 0.28
108 0.25
109 0.28
110 0.23
111 0.23
112 0.28
113 0.27
114 0.23
115 0.22
116 0.22
117 0.21
118 0.21
119 0.29
120 0.26
121 0.3
122 0.33
123 0.4
124 0.46
125 0.5
126 0.54
127 0.54
128 0.63
129 0.69
130 0.76
131 0.8
132 0.83
133 0.82
134 0.87
135 0.87
136 0.83
137 0.8
138 0.78
139 0.74
140 0.71
141 0.63
142 0.54
143 0.46
144 0.38
145 0.3
146 0.21
147 0.15
148 0.1
149 0.1
150 0.12
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.14
155 0.18
156 0.2
157 0.25
158 0.28
159 0.28
160 0.29
161 0.29
162 0.27
163 0.23
164 0.2
165 0.15
166 0.11
167 0.09
168 0.08
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.08
174 0.07
175 0.06
176 0.08
177 0.09
178 0.09
179 0.09
180 0.09
181 0.1
182 0.1
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.14
187 0.18
188 0.21
189 0.21
190 0.23
191 0.23
192 0.23
193 0.28
194 0.26
195 0.22
196 0.24
197 0.24
198 0.26
199 0.27
200 0.27
201 0.26
202 0.26
203 0.28
204 0.27
205 0.29
206 0.27
207 0.27
208 0.27
209 0.24
210 0.23
211 0.21
212 0.2
213 0.17
214 0.14
215 0.13
216 0.12
217 0.12
218 0.12
219 0.14
220 0.18
221 0.25
222 0.28
223 0.31
224 0.33
225 0.34
226 0.33
227 0.35
228 0.34
229 0.31
230 0.36
231 0.36
232 0.37
233 0.38
234 0.41
235 0.41
236 0.36
237 0.36
238 0.33
239 0.32
240 0.34
241 0.4
242 0.39
243 0.39
244 0.45
245 0.44
246 0.41
247 0.47
248 0.52
249 0.5
250 0.49
251 0.5
252 0.49
253 0.49
254 0.49
255 0.43
256 0.32
257 0.28
258 0.29
259 0.25
260 0.19
261 0.21
262 0.2
263 0.19
264 0.21
265 0.23
266 0.22
267 0.26
268 0.29
269 0.3
270 0.35
271 0.34
272 0.33
273 0.31
274 0.29
275 0.25
276 0.22
277 0.15
278 0.11
279 0.11
280 0.12
281 0.15
282 0.15
283 0.19
284 0.19
285 0.19
286 0.19
287 0.22
288 0.23
289 0.22
290 0.24
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.19
295 0.15
296 0.14
297 0.13
298 0.14
299 0.17
300 0.21
301 0.26
302 0.31
303 0.4
304 0.47
305 0.54
306 0.58
307 0.66
308 0.72
309 0.73
310 0.76
311 0.74
312 0.73
313 0.68
314 0.62
315 0.53
316 0.45
317 0.39
318 0.31
319 0.25
320 0.2
321 0.16
322 0.12
323 0.15
324 0.13
325 0.13
326 0.13
327 0.12
328 0.12
329 0.13
330 0.15
331 0.11
332 0.17
333 0.2
334 0.2
335 0.22
336 0.22
337 0.21
338 0.22
339 0.23
340 0.21
341 0.19
342 0.19
343 0.19
344 0.2
345 0.22
346 0.24
347 0.27
348 0.29
349 0.28
350 0.29
351 0.28
352 0.26
353 0.26
354 0.22
355 0.22
356 0.22
357 0.23
358 0.21
359 0.2
360 0.21
361 0.21
362 0.21
363 0.21
364 0.21
365 0.21
366 0.2
367 0.2
368 0.2
369 0.19
370 0.16
371 0.15
372 0.1
373 0.09
374 0.09
375 0.1
376 0.09
377 0.08
378 0.09
379 0.08
380 0.08
381 0.07
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.1
386 0.13
387 0.12
388 0.12
389 0.14
390 0.16
391 0.21
392 0.26
393 0.27
394 0.27
395 0.33
396 0.38
397 0.4
398 0.4
399 0.39
400 0.42
401 0.4
402 0.39
403 0.33
404 0.31
405 0.29
406 0.27
407 0.23
408 0.17
409 0.15
410 0.14
411 0.15
412 0.13
413 0.12
414 0.16
415 0.24
416 0.22
417 0.23
418 0.25
419 0.25
420 0.28
421 0.28
422 0.25
423 0.17
424 0.17
425 0.17
426 0.14
427 0.12
428 0.1
429 0.1
430 0.07
431 0.07
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.06
436 0.05
437 0.04
438 0.05
439 0.05
440 0.05
441 0.06
442 0.06
443 0.06
444 0.06
445 0.07
446 0.06
447 0.08
448 0.11
449 0.12
450 0.13
451 0.15
452 0.17
453 0.25
454 0.32
455 0.34
456 0.38
457 0.36
458 0.38
459 0.36
460 0.35
461 0.26
462 0.2
463 0.19
464 0.12
465 0.14
466 0.13
467 0.12
468 0.12
469 0.14
470 0.13
471 0.12
472 0.13
473 0.11
474 0.12
475 0.12
476 0.14
477 0.13
478 0.12
479 0.11
480 0.1
481 0.08
482 0.08
483 0.08
484 0.05
485 0.05
486 0.06
487 0.05
488 0.06
489 0.06
490 0.06
491 0.05
492 0.05
493 0.05
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.07
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.07
502 0.07
503 0.09
504 0.08
505 0.08
506 0.07
507 0.08
508 0.08
509 0.08
510 0.07
511 0.07
512 0.08
513 0.09
514 0.11
515 0.11
516 0.11
517 0.11
518 0.12
519 0.17
520 0.18
521 0.22
522 0.22
523 0.22
524 0.23
525 0.24
526 0.23
527 0.18
528 0.18
529 0.13
530 0.14
531 0.18
532 0.19
533 0.19
534 0.21
535 0.19
536 0.2
537 0.2
538 0.19
539 0.19
540 0.19
541 0.25
542 0.29
543 0.31
544 0.29
545 0.29
546 0.27
547 0.25
548 0.25
549 0.21
550 0.17
551 0.17
552 0.2
553 0.21
554 0.22
555 0.21
556 0.2
557 0.18
558 0.16
559 0.14
560 0.1
561 0.08
562 0.09
563 0.09
564 0.08
565 0.08
566 0.08
567 0.1
568 0.19
569 0.22
570 0.27
571 0.27
572 0.28
573 0.3
574 0.34
575 0.35
576 0.31
577 0.38
578 0.33
579 0.34
580 0.34
581 0.32
582 0.3
583 0.25
584 0.23
585 0.13
586 0.12
587 0.12
588 0.11
589 0.13
590 0.12
591 0.12
592 0.1
593 0.11
594 0.11
595 0.09
596 0.09
597 0.08
598 0.06
599 0.06
600 0.05
601 0.04
602 0.04
603 0.04
604 0.04
605 0.04
606 0.04
607 0.04
608 0.04
609 0.04
610 0.04
611 0.05
612 0.08
613 0.08
614 0.1
615 0.11
616 0.12
617 0.14
618 0.18
619 0.22
620 0.23
621 0.27
622 0.32
623 0.33
624 0.39
625 0.39
626 0.35
627 0.32
628 0.28
629 0.27
630 0.21
631 0.2
632 0.13
633 0.11
634 0.1
635 0.08
636 0.08
637 0.05
638 0.04
639 0.04
640 0.04
641 0.05
642 0.07
643 0.09
644 0.09
645 0.1
646 0.11
647 0.11
648 0.11
649 0.1
650 0.1
651 0.08
652 0.09
653 0.1
654 0.12
655 0.12
656 0.12
657 0.12
658 0.12
659 0.14
660 0.14
661 0.13
662 0.17
663 0.22
664 0.26
665 0.28
666 0.33
667 0.33
668 0.35
669 0.41
670 0.43
671 0.47
672 0.46
673 0.48
674 0.49
675 0.47
676 0.44
677 0.44
678 0.39
679 0.31
680 0.26
681 0.27
682 0.22
683 0.27
684 0.27
685 0.22
686 0.22
687 0.3
688 0.35
689 0.36
690 0.36
691 0.33
692 0.35
693 0.34
694 0.35
695 0.28
696 0.22
697 0.2
698 0.18
699 0.15
700 0.13
701 0.13
702 0.09
703 0.07
704 0.09
705 0.08
706 0.09
707 0.08
708 0.08
709 0.09
710 0.09
711 0.1
712 0.12
713 0.14
714 0.14
715 0.15
716 0.15
717 0.15
718 0.17
719 0.16
720 0.13
721 0.1
722 0.09
723 0.08
724 0.09
725 0.1
726 0.07
727 0.07
728 0.07
729 0.07
730 0.07
731 0.07
732 0.09
733 0.09
734 0.12
735 0.14
736 0.14
737 0.14
738 0.15
739 0.15
740 0.12
741 0.13
742 0.11
743 0.11
744 0.11
745 0.12
746 0.13
747 0.14
748 0.15
749 0.15
750 0.14
751 0.12
752 0.12
753 0.11
754 0.09
755 0.08
756 0.07
757 0.07
758 0.06
759 0.1
760 0.1
761 0.13
762 0.14
763 0.13
764 0.18
765 0.2
766 0.23
767 0.21
768 0.23
769 0.29
770 0.36
771 0.41
772 0.44
773 0.53
774 0.56
775 0.63
776 0.68
777 0.65
778 0.61
779 0.61
780 0.55
781 0.47
782 0.45
783 0.37
784 0.3
785 0.27
786 0.25
787 0.26
788 0.24
789 0.23
790 0.19
791 0.2
792 0.19
793 0.17
794 0.21
795 0.18
796 0.21
797 0.21
798 0.23
799 0.23
800 0.23
801 0.24
802 0.19
803 0.2
804 0.16
805 0.14
806 0.12
807 0.11
808 0.09
809 0.08
810 0.08
811 0.06
812 0.06
813 0.06
814 0.07
815 0.09
816 0.1
817 0.11
818 0.14
819 0.15
820 0.19
821 0.2
822 0.21
823 0.21
824 0.2
825 0.18
826 0.19
827 0.2
828 0.19
829 0.22
830 0.26
831 0.25
832 0.26
833 0.27
834 0.24
835 0.22
836 0.21
837 0.21
838 0.17
839 0.17
840 0.16
841 0.16
842 0.16
843 0.18
844 0.19
845 0.16
846 0.16
847 0.15
848 0.16
849 0.17
850 0.19
851 0.19
852 0.19
853 0.2
854 0.23
855 0.26
856 0.27
857 0.29
858 0.3
859 0.3
860 0.32
861 0.32
862 0.34
863 0.35
864 0.37
865 0.35
866 0.32
867 0.28
868 0.25
869 0.29
870 0.24
871 0.2
872 0.16
873 0.15
874 0.15
875 0.16
876 0.21
877 0.18
878 0.21
879 0.21
880 0.22
881 0.22
882 0.23
883 0.27
884 0.22
885 0.22
886 0.21
887 0.21
888 0.21
889 0.2
890 0.21
891 0.21
892 0.23
893 0.28
894 0.26
895 0.29
896 0.31
897 0.34
898 0.34
899 0.33
900 0.29
901 0.28
902 0.32
903 0.3
904 0.3
905 0.32
906 0.32
907 0.28
908 0.36
909 0.31
910 0.31
911 0.31
912 0.29
913 0.25
914 0.25
915 0.28
916 0.21
917 0.23
918 0.19
919 0.19
920 0.2
921 0.21
922 0.22
923 0.2
924 0.19
925 0.19
926 0.22
927 0.25
928 0.31
929 0.34
930 0.34
931 0.39
932 0.44
933 0.44
934 0.44
935 0.44
936 0.42
937 0.42
938 0.41
939 0.35
940 0.31
941 0.29
942 0.25
943 0.23
944 0.17
945 0.13
946 0.13
947 0.12
948 0.14
949 0.15
950 0.15
951 0.12
952 0.13
953 0.14
954 0.15
955 0.15
956 0.14
957 0.16
958 0.21
959 0.24
960 0.24
961 0.24
962 0.23
963 0.24
964 0.26
965 0.24
966 0.17
967 0.14
968 0.14
969 0.13
970 0.15
971 0.14
972 0.13
973 0.14
974 0.15
975 0.16
976 0.16
977 0.17
978 0.16
979 0.16
980 0.18
981 0.19
982 0.26
983 0.29
984 0.34
985 0.32
986 0.33
987 0.32
988 0.32
989 0.38
990 0.33
991 0.34
992 0.32
993 0.34
994 0.32
995 0.33
996 0.31
997 0.24
998 0.2
999 0.16
1000 0.12
1001 0.11
1002 0.13
1003 0.12