Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C4DT00

Protein Details
Accession A0A0C4DT00    Localization Confidence Medium Confidence Score 10
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
284-306LKDEIWKNKQQRKKLFNYCPELSHydrophilic
346-366HEEGERKKQQDQENKKKQEEEAcidic
NLS Segment(s)
PositionSequence
336-389KRKEEDEKRKHEEGERKKQQDQENKKKQEEEQRKAAETKKAEEDKKAEEKKKAE
Subcellular Location(s) mito 6.5, golg 5, cyto_mito 5, E.R. 4, plas 3, extr 3, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR043729  DUF5672  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF18922  DUF5672  
CDD cd22249  UDM1_RNF168_RNF169-like  
Amino Acid Sequences MMAAPQTQPGPLAITKGKLIILASLVFTWWVAFLLPHYTPAIQAGIQSRLDEARKKLPAIKLDWKPAANPRSHYNASKIALIVEHRPIPHLVPQILHMIGVIPPDWRMVFVGSEKSTVSIGRSVAIKHQQVIGKMDILVLPEPWQIDSKENVHRLMTDIRFYDEFLPGVEWILRFESDSILCSNSETSLNEWLGWSWAGAPRSVEDRFAGNGGLSLRKVSAIRRVLGFQARFNNSEPEDEWFGKRLWILPGEKVAAGVDGALTFEDVYVENPMGFHVRDGGRNLKDEIWKNKQQRKKLFNYCPELSLIMDMKLERQRCKGDNGESNLSQSQLDAAKRKEEDEKRKHEEGERKKQQDQENKKKQEEEQRKAAETKKAEEDKKAEEKKKAEQQKGQ
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.23
3 0.24
4 0.24
5 0.2
6 0.2
7 0.16
8 0.16
9 0.14
10 0.14
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.1
15 0.09
16 0.07
17 0.06
18 0.05
19 0.05
20 0.07
21 0.12
22 0.13
23 0.14
24 0.16
25 0.16
26 0.16
27 0.18
28 0.18
29 0.13
30 0.16
31 0.17
32 0.2
33 0.2
34 0.2
35 0.2
36 0.23
37 0.27
38 0.29
39 0.3
40 0.35
41 0.38
42 0.41
43 0.46
44 0.47
45 0.5
46 0.52
47 0.57
48 0.55
49 0.6
50 0.62
51 0.56
52 0.55
53 0.57
54 0.56
55 0.5
56 0.47
57 0.43
58 0.46
59 0.49
60 0.48
61 0.44
62 0.45
63 0.42
64 0.41
65 0.36
66 0.28
67 0.26
68 0.25
69 0.24
70 0.21
71 0.22
72 0.2
73 0.22
74 0.22
75 0.22
76 0.26
77 0.28
78 0.24
79 0.22
80 0.24
81 0.25
82 0.24
83 0.22
84 0.16
85 0.12
86 0.11
87 0.11
88 0.1
89 0.07
90 0.07
91 0.08
92 0.08
93 0.08
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.11
98 0.16
99 0.15
100 0.16
101 0.16
102 0.16
103 0.15
104 0.14
105 0.14
106 0.12
107 0.11
108 0.12
109 0.13
110 0.13
111 0.18
112 0.24
113 0.24
114 0.22
115 0.27
116 0.27
117 0.28
118 0.31
119 0.26
120 0.2
121 0.19
122 0.19
123 0.14
124 0.13
125 0.12
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.11
132 0.11
133 0.13
134 0.15
135 0.19
136 0.24
137 0.27
138 0.27
139 0.25
140 0.24
141 0.25
142 0.29
143 0.25
144 0.21
145 0.19
146 0.2
147 0.2
148 0.21
149 0.2
150 0.14
151 0.13
152 0.11
153 0.11
154 0.09
155 0.09
156 0.09
157 0.07
158 0.07
159 0.08
160 0.07
161 0.07
162 0.07
163 0.08
164 0.07
165 0.09
166 0.09
167 0.09
168 0.08
169 0.09
170 0.08
171 0.08
172 0.09
173 0.08
174 0.09
175 0.11
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.1
180 0.1
181 0.09
182 0.08
183 0.05
184 0.08
185 0.08
186 0.09
187 0.09
188 0.09
189 0.13
190 0.13
191 0.13
192 0.11
193 0.11
194 0.11
195 0.12
196 0.11
197 0.07
198 0.08
199 0.08
200 0.09
201 0.08
202 0.08
203 0.07
204 0.08
205 0.1
206 0.1
207 0.17
208 0.19
209 0.2
210 0.21
211 0.22
212 0.24
213 0.29
214 0.28
215 0.24
216 0.27
217 0.29
218 0.29
219 0.3
220 0.31
221 0.26
222 0.27
223 0.24
224 0.2
225 0.22
226 0.22
227 0.21
228 0.19
229 0.18
230 0.18
231 0.17
232 0.16
233 0.14
234 0.18
235 0.19
236 0.18
237 0.2
238 0.21
239 0.2
240 0.18
241 0.16
242 0.11
243 0.09
244 0.07
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.03
249 0.03
250 0.03
251 0.03
252 0.04
253 0.04
254 0.05
255 0.06
256 0.06
257 0.06
258 0.06
259 0.07
260 0.08
261 0.08
262 0.07
263 0.12
264 0.13
265 0.16
266 0.19
267 0.26
268 0.26
269 0.28
270 0.3
271 0.29
272 0.35
273 0.39
274 0.44
275 0.45
276 0.52
277 0.59
278 0.66
279 0.69
280 0.73
281 0.76
282 0.77
283 0.79
284 0.81
285 0.82
286 0.82
287 0.83
288 0.75
289 0.66
290 0.59
291 0.49
292 0.38
293 0.31
294 0.23
295 0.15
296 0.15
297 0.13
298 0.17
299 0.22
300 0.26
301 0.26
302 0.31
303 0.37
304 0.38
305 0.45
306 0.46
307 0.49
308 0.53
309 0.56
310 0.57
311 0.51
312 0.52
313 0.46
314 0.4
315 0.32
316 0.23
317 0.2
318 0.18
319 0.21
320 0.24
321 0.25
322 0.31
323 0.32
324 0.35
325 0.42
326 0.48
327 0.55
328 0.59
329 0.67
330 0.68
331 0.72
332 0.74
333 0.72
334 0.73
335 0.73
336 0.74
337 0.75
338 0.73
339 0.74
340 0.77
341 0.78
342 0.79
343 0.79
344 0.79
345 0.79
346 0.82
347 0.82
348 0.79
349 0.77
350 0.78
351 0.77
352 0.74
353 0.73
354 0.71
355 0.7
356 0.7
357 0.69
358 0.66
359 0.59
360 0.57
361 0.57
362 0.6
363 0.59
364 0.61
365 0.6
366 0.6
367 0.66
368 0.7
369 0.68
370 0.67
371 0.69
372 0.71
373 0.77
374 0.78