Proteins with Predicted NoLSs

Proteins containing predicted nucleolar localization signals available in the database.

A0A0C4E871

Protein Details
Accession A0A0C4E871    Localization Confidence Medium Confidence Score 12
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
15-47GLPFSPKPRSFIRKERKKKKKQKMAPENHLSVRBasic
390-416GQNAGGQVRRRRSRRARQARKARAVKAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-37KPRSFIRKERKKKKKQK
398-416RRRRSRRARQARKARAVKA
Subcellular Location(s) extr 25
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR044846  GH10  
IPR001000  GH10_dom  
IPR017853  Glycoside_hydrolase_SF  
Gene Ontology GO:0031176  F:endo-1,4-beta-xylanase activity  
GO:0045493  P:xylan catabolic process  
Pfam View protein in Pfam  
PF00331  Glyco_hydro_10  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51760  GH10_2  
Amino Acid Sequences MPTGSFRSLIIPNFGLPFSPKPRSFIRKERKKKKKQKMAPENHLSVRAVLAGLLAASGPGVVAAVPNGRLHELATAAGKLYFGTAVDNPEIKDNTYKTILGNKFDFGQVTVGNTQKWQFTEPNQGKFDYRQADEIVNFAKSNGQQIVRCHTLVWHNQLPSWVESGNWNRDSLTRVINTHVSNVVGHYKGQCYAWDVVNEALEDNGNFRNSVFYRVLGTDYLPIAFKAAAAADANTKLYYNDYNIEQAGNKQQQALKIVDIIKRGGARIDGVGLQGHFIVGQTGSRDQLAAVLNSFVAKGVDVAYTEVDVRHSSLPPNARALQQQADDYGNIVGACLAVKRCVGITVWGASDAHSWIPSVFPGQGAATLLDANNNPKPAYNKVRDVLGAAGQNAGGQVRRRRSRRARQARKARAVKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.22
3 0.22
4 0.27
5 0.3
6 0.38
7 0.38
8 0.4
9 0.5
10 0.58
11 0.62
12 0.66
13 0.7
14 0.72
15 0.82
16 0.89
17 0.91
18 0.93
19 0.96
20 0.96
21 0.96
22 0.95
23 0.95
24 0.96
25 0.95
26 0.95
27 0.93
28 0.88
29 0.79
30 0.73
31 0.62
32 0.51
33 0.4
34 0.3
35 0.21
36 0.14
37 0.11
38 0.07
39 0.06
40 0.05
41 0.04
42 0.03
43 0.03
44 0.03
45 0.03
46 0.02
47 0.02
48 0.02
49 0.03
50 0.04
51 0.06
52 0.07
53 0.08
54 0.1
55 0.11
56 0.11
57 0.11
58 0.12
59 0.11
60 0.11
61 0.12
62 0.11
63 0.11
64 0.11
65 0.1
66 0.08
67 0.08
68 0.07
69 0.06
70 0.08
71 0.09
72 0.12
73 0.14
74 0.16
75 0.16
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.23
80 0.21
81 0.24
82 0.25
83 0.25
84 0.22
85 0.31
86 0.33
87 0.32
88 0.32
89 0.29
90 0.28
91 0.27
92 0.26
93 0.17
94 0.16
95 0.12
96 0.14
97 0.16
98 0.16
99 0.16
100 0.17
101 0.17
102 0.18
103 0.18
104 0.19
105 0.19
106 0.22
107 0.33
108 0.37
109 0.43
110 0.42
111 0.43
112 0.41
113 0.4
114 0.42
115 0.36
116 0.32
117 0.27
118 0.26
119 0.27
120 0.26
121 0.25
122 0.2
123 0.16
124 0.14
125 0.12
126 0.14
127 0.12
128 0.15
129 0.17
130 0.18
131 0.2
132 0.22
133 0.28
134 0.27
135 0.27
136 0.24
137 0.23
138 0.26
139 0.28
140 0.33
141 0.31
142 0.29
143 0.3
144 0.32
145 0.31
146 0.26
147 0.23
148 0.16
149 0.12
150 0.17
151 0.21
152 0.26
153 0.25
154 0.24
155 0.23
156 0.24
157 0.27
158 0.23
159 0.22
160 0.18
161 0.18
162 0.2
163 0.23
164 0.22
165 0.2
166 0.19
167 0.15
168 0.14
169 0.14
170 0.15
171 0.11
172 0.11
173 0.11
174 0.11
175 0.12
176 0.12
177 0.12
178 0.12
179 0.14
180 0.15
181 0.14
182 0.14
183 0.13
184 0.13
185 0.13
186 0.09
187 0.07
188 0.06
189 0.05
190 0.06
191 0.07
192 0.07
193 0.06
194 0.07
195 0.1
196 0.11
197 0.16
198 0.15
199 0.14
200 0.15
201 0.16
202 0.17
203 0.13
204 0.13
205 0.1
206 0.09
207 0.09
208 0.08
209 0.07
210 0.07
211 0.07
212 0.06
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.05
217 0.05
218 0.06
219 0.07
220 0.07
221 0.07
222 0.07
223 0.07
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.11
228 0.11
229 0.12
230 0.12
231 0.13
232 0.12
233 0.12
234 0.18
235 0.19
236 0.19
237 0.2
238 0.22
239 0.23
240 0.26
241 0.26
242 0.18
243 0.2
244 0.23
245 0.23
246 0.23
247 0.21
248 0.2
249 0.19
250 0.19
251 0.15
252 0.12
253 0.11
254 0.09
255 0.1
256 0.09
257 0.08
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.07
262 0.07
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.04
267 0.05
268 0.06
269 0.07
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.08
274 0.11
275 0.12
276 0.11
277 0.1
278 0.1
279 0.1
280 0.1
281 0.1
282 0.07
283 0.05
284 0.05
285 0.05
286 0.05
287 0.06
288 0.06
289 0.07
290 0.07
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.1
297 0.12
298 0.13
299 0.14
300 0.19
301 0.24
302 0.25
303 0.3
304 0.3
305 0.3
306 0.32
307 0.34
308 0.33
309 0.3
310 0.28
311 0.25
312 0.24
313 0.22
314 0.2
315 0.16
316 0.12
317 0.1
318 0.09
319 0.07
320 0.06
321 0.06
322 0.07
323 0.07
324 0.08
325 0.08
326 0.09
327 0.09
328 0.11
329 0.11
330 0.12
331 0.14
332 0.15
333 0.15
334 0.16
335 0.16
336 0.15
337 0.16
338 0.14
339 0.12
340 0.1
341 0.1
342 0.09
343 0.1
344 0.1
345 0.11
346 0.1
347 0.09
348 0.11
349 0.1
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.12
357 0.13
358 0.17
359 0.19
360 0.21
361 0.2
362 0.23
363 0.27
364 0.33
365 0.42
366 0.45
367 0.49
368 0.49
369 0.52
370 0.49
371 0.47
372 0.41
373 0.35
374 0.3
375 0.23
376 0.21
377 0.17
378 0.17
379 0.15
380 0.14
381 0.13
382 0.18
383 0.26
384 0.35
385 0.46
386 0.51
387 0.62
388 0.72
389 0.79
390 0.84
391 0.87
392 0.89
393 0.9
394 0.96
395 0.96
396 0.96