FuNGI

L8WPB9

Protein Details

Accession

L8WPB9

Localization Confidence

High

Confidence Score

23.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
17-40	REGHDHQRSRYGRRYKRASEEVSF	Basic
263-302	ETSDDESSRKKKRRKKDKEKSSSSNSKKGKKRPRDDSGSD	Basic
310-332	GSNVSVGRKKKRRKATDNGSDSD	Hydrophilic
342-375	SDEEDARAKKRRKSKSRSKSKSKSKSRRASSDSE	Basic
391-431	SDDERGRRKSKSKSKSKSSSKSKSKSKSKVKREPSPVEVQF	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
271-296	RKKKRRKKDKEKSSSSNSKKGKKRPR
317-323	RKKKRRK
348-369	RAKKRRKSKSRSKSKSKSKSRR
395-423	RGRRKSKSKSKSKSSSKSKSKSKSKVKRE

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto_nucl 14

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007832 RNA_pol_Rpc34 IPR016049 RNA_pol_Rpc34-like IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Gene Ontology	GO:0005666 C:RNA polymerase III complex GO:0006383 P:transcription by RNA polymerase III
Pfam	View protein in Pfam PF05158 RNA_pol_Rpc34

Amino Acid Sequences

MLSGRGWKVDAPPKGAREGHDHQRSRYGRRYKRASEEVSFENYEGFQGCIVVQSCGQGRCQNTDSVGLMDADESIVYKKIQEAKNEGIWTKHLKSTELHQSIITRALKSLEKKGLVKSIKSVKHPTRKIYILANLQPSVEVSGGPWYNNSEFESEFVQTLCKACLNFIQQQSYPVHKSKSKLSPRALFPTSASSRYPTAAAVLSFLKGSHITDTPLEISHVESLLQVLIYDGLVEALPGSGLGSLPDMGSGSDNDSGSESDSETSDDESSRKKKRRKKDKEKSSSSNSKKGKKRPRDDSGSDSDDNSSDGSNVSVGRKKKRRKATDNGSDSDSAKSDSGSDSDEEDARAKKRRKSKSRSKSKSKSKSRRASSDSESDSGGDSGSSNSDSDSDDERGRRKSKSKSKSKSSSKSKSKSKSKVKREPSPVEVQFDANAGRVYRAIRPERVALGWAQSPCHTCPQFDFCHDDGPVNARECQYYSTWLNAGIADAE

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.54
3	0.48
4	0.49
5	0.51
6	0.54
7	0.58
8	0.59
9	0.55
10	0.62
11	0.65
12	0.64
13	0.67
14	0.67
15	0.66
16	0.73
17	0.8
18	0.78
19	0.83
20	0.84
21	0.81
22	0.75
23	0.7
24	0.64
25	0.6
26	0.52
27	0.42
28	0.34
29	0.27
30	0.24
31	0.19
32	0.15
33	0.09
34	0.09
35	0.08
36	0.12
37	0.12
38	0.13
39	0.12
40	0.15
41	0.19
42	0.2
43	0.23
44	0.23
45	0.25
46	0.3
47	0.32
48	0.31
49	0.29
50	0.31
51	0.29
52	0.26
53	0.24
54	0.18
55	0.16
56	0.13
57	0.12
58	0.08
59	0.07
60	0.06
61	0.06
62	0.08
63	0.08
64	0.08
65	0.13
66	0.22
67	0.26
68	0.31
69	0.37
70	0.41
71	0.47
72	0.5
73	0.46
74	0.39
75	0.39
76	0.4
77	0.37
78	0.35
79	0.3
80	0.29
81	0.29
82	0.35
83	0.41
84	0.37
85	0.35
86	0.33
87	0.33
88	0.32
89	0.38
90	0.33
91	0.23
92	0.21
93	0.23
94	0.27
95	0.29
96	0.35
97	0.34
98	0.37
99	0.39
100	0.41
101	0.47
102	0.46
103	0.43
104	0.43
105	0.46
106	0.47
107	0.5
108	0.57
109	0.57
110	0.64
111	0.69
112	0.67
113	0.65
114	0.62
115	0.59
116	0.55
117	0.52
118	0.48
119	0.47
120	0.45
121	0.39
122	0.36
123	0.33
124	0.27
125	0.22
126	0.15
127	0.1
128	0.07
129	0.11
130	0.12
131	0.12
132	0.12
133	0.14
134	0.15
135	0.16
136	0.17
137	0.14
138	0.13
139	0.14
140	0.16
141	0.13
142	0.13
143	0.12
144	0.11
145	0.1
146	0.11
147	0.1
148	0.1
149	0.09
150	0.1
151	0.14
152	0.18
153	0.24
154	0.26
155	0.29
156	0.28
157	0.32
158	0.34
159	0.34
160	0.33
161	0.3
162	0.32
163	0.31
164	0.33
165	0.38
166	0.46
167	0.5
168	0.55
169	0.58
170	0.61
171	0.62
172	0.67
173	0.6
174	0.5
175	0.42
176	0.41
177	0.37
178	0.32
179	0.28
180	0.23
181	0.22
182	0.22
183	0.21
184	0.13
185	0.12
186	0.11
187	0.1
188	0.1
189	0.09
190	0.09
191	0.08
192	0.08
193	0.08
194	0.07
195	0.08
196	0.08
197	0.09
198	0.09
199	0.1
200	0.11
201	0.11
202	0.1
203	0.1
204	0.08
205	0.09
206	0.08
207	0.08
208	0.07
209	0.06
210	0.06
211	0.05
212	0.05
213	0.04
214	0.03
215	0.03
216	0.03
217	0.03
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.02
224	0.02
225	0.02
226	0.03
227	0.02
228	0.02
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.03
233	0.04
234	0.04
235	0.04
236	0.04
237	0.04
238	0.06
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.08
243	0.08
244	0.09
245	0.09
246	0.08
247	0.06
248	0.07
249	0.07
250	0.07
251	0.08
252	0.08
253	0.08
254	0.09
255	0.14
256	0.21
257	0.3
258	0.38
259	0.45
260	0.54
261	0.64
262	0.75
263	0.81
264	0.86
265	0.88
266	0.91
267	0.93
268	0.93
269	0.9
270	0.87
271	0.86
272	0.8
273	0.78
274	0.74
275	0.72
276	0.71
277	0.74
278	0.76
279	0.76
280	0.8
281	0.8
282	0.82
283	0.82
284	0.79
285	0.75
286	0.7
287	0.65
288	0.56
289	0.47
290	0.38
291	0.29
292	0.25
293	0.19
294	0.12
295	0.07
296	0.07
297	0.06
298	0.06
299	0.07
300	0.1
301	0.14
302	0.19
303	0.29
304	0.38
305	0.47
306	0.56
307	0.65
308	0.73
309	0.78
310	0.84
311	0.85
312	0.87
313	0.83
314	0.76
315	0.68
316	0.59
317	0.51
318	0.41
319	0.31
320	0.22
321	0.16
322	0.13
323	0.11
324	0.1
325	0.1
326	0.1
327	0.1
328	0.1
329	0.12
330	0.12
331	0.12
332	0.14
333	0.17
334	0.19
335	0.27
336	0.32
337	0.37
338	0.47
339	0.57
340	0.65
341	0.73
342	0.8
343	0.83
344	0.88
345	0.92
346	0.94
347	0.93
348	0.94
349	0.94
350	0.94
351	0.94
352	0.93
353	0.93
354	0.9
355	0.89
356	0.84
357	0.8
358	0.74
359	0.72
360	0.64
361	0.55
362	0.47
363	0.38
364	0.33
365	0.26
366	0.2
367	0.11
368	0.08
369	0.07
370	0.08
371	0.08
372	0.07
373	0.07
374	0.09
375	0.1
376	0.12
377	0.15
378	0.17
379	0.2
380	0.24
381	0.29
382	0.36
383	0.38
384	0.43
385	0.47
386	0.55
387	0.62
388	0.69
389	0.75
390	0.78
391	0.85
392	0.89
393	0.91
394	0.91
395	0.91
396	0.92
397	0.91
398	0.91
399	0.9
400	0.9
401	0.9
402	0.9
403	0.9
404	0.9
405	0.91
406	0.91
407	0.91
408	0.91
409	0.9
410	0.87
411	0.83
412	0.82
413	0.75
414	0.69
415	0.6
416	0.51
417	0.41
418	0.35
419	0.28
420	0.2
421	0.18
422	0.13
423	0.13
424	0.14
425	0.16
426	0.19
427	0.28
428	0.32
429	0.35
430	0.38
431	0.41
432	0.43
433	0.41
434	0.38
435	0.3
436	0.28
437	0.29
438	0.26
439	0.24
440	0.24
441	0.27
442	0.27
443	0.36
444	0.33
445	0.29
446	0.34
447	0.39
448	0.41
449	0.41
450	0.46
451	0.37
452	0.43
453	0.42
454	0.37
455	0.32
456	0.33
457	0.34
458	0.3
459	0.32
460	0.26
461	0.28
462	0.28
463	0.3
464	0.27
465	0.28
466	0.27
467	0.28
468	0.28
469	0.27
470	0.26
471	0.23

L8WPB9

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer