Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X5J6

Protein Details
Accession L8X5J6    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
241-261NHDLDKRSKFSRKRNNEEEGDBasic
267-286ERNRVFNKKVRASPPKHMFIHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MSDNSQVPAATPETGHKDVSPEVHAESGGSDSGGEDAVDSEGKSGSATPLTESSTGGKATIEERAARMEALRAKMRESTAANRKDLIAEHNKAKFSVKEAARLEKQRRLAETLRESMDAEERGEDMERKKNWDYSIEENDEWEKRQARKERRADFQFHDDAHAARRKYKKDLDLIKPDLAAYQAQKEAAMSQGSALQNFSSGSSSNAVTASEQLYRDANTLLYGDNKPSEEAIDRVVGKLNHDLDKRSKFSRKRNNEEEGDITYINERNRVFNKKVRASPPKHMFILTIVQIARFYDKYTAETRASFERGTAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.28
3 0.25
4 0.26
5 0.28
6 0.3
7 0.28
8 0.22
9 0.21
10 0.21
11 0.2
12 0.17
13 0.15
14 0.13
15 0.11
16 0.09
17 0.07
18 0.07
19 0.07
20 0.07
21 0.06
22 0.05
23 0.05
24 0.07
25 0.07
26 0.07
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.08
31 0.08
32 0.09
33 0.1
34 0.1
35 0.12
36 0.13
37 0.16
38 0.16
39 0.17
40 0.17
41 0.18
42 0.18
43 0.16
44 0.14
45 0.12
46 0.13
47 0.16
48 0.16
49 0.15
50 0.15
51 0.18
52 0.18
53 0.17
54 0.16
55 0.17
56 0.2
57 0.23
58 0.28
59 0.26
60 0.27
61 0.3
62 0.31
63 0.31
64 0.3
65 0.34
66 0.38
67 0.42
68 0.42
69 0.39
70 0.39
71 0.35
72 0.33
73 0.31
74 0.29
75 0.28
76 0.34
77 0.36
78 0.37
79 0.36
80 0.37
81 0.31
82 0.27
83 0.32
84 0.27
85 0.32
86 0.34
87 0.4
88 0.43
89 0.5
90 0.51
91 0.48
92 0.54
93 0.49
94 0.49
95 0.48
96 0.46
97 0.45
98 0.45
99 0.43
100 0.38
101 0.35
102 0.33
103 0.28
104 0.27
105 0.2
106 0.15
107 0.12
108 0.1
109 0.1
110 0.11
111 0.12
112 0.12
113 0.19
114 0.19
115 0.24
116 0.26
117 0.28
118 0.29
119 0.31
120 0.32
121 0.31
122 0.37
123 0.35
124 0.33
125 0.31
126 0.32
127 0.28
128 0.25
129 0.22
130 0.21
131 0.2
132 0.28
133 0.37
134 0.44
135 0.53
136 0.62
137 0.65
138 0.68
139 0.7
140 0.68
141 0.62
142 0.58
143 0.5
144 0.41
145 0.36
146 0.28
147 0.24
148 0.23
149 0.24
150 0.19
151 0.23
152 0.29
153 0.3
154 0.36
155 0.41
156 0.42
157 0.46
158 0.54
159 0.56
160 0.58
161 0.59
162 0.53
163 0.47
164 0.42
165 0.34
166 0.26
167 0.19
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.1
172 0.1
173 0.1
174 0.09
175 0.1
176 0.09
177 0.07
178 0.06
179 0.11
180 0.12
181 0.12
182 0.12
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.11
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.1
197 0.1
198 0.11
199 0.11
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.13
204 0.12
205 0.11
206 0.09
207 0.09
208 0.09
209 0.12
210 0.12
211 0.13
212 0.14
213 0.14
214 0.14
215 0.14
216 0.15
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.16
221 0.15
222 0.15
223 0.19
224 0.18
225 0.18
226 0.23
227 0.25
228 0.27
229 0.28
230 0.32
231 0.36
232 0.43
233 0.45
234 0.46
235 0.53
236 0.55
237 0.65
238 0.72
239 0.75
240 0.78
241 0.82
242 0.83
243 0.77
244 0.73
245 0.65
246 0.57
247 0.49
248 0.39
249 0.32
250 0.26
251 0.26
252 0.22
253 0.24
254 0.21
255 0.25
256 0.32
257 0.39
258 0.42
259 0.46
260 0.55
261 0.59
262 0.67
263 0.7
264 0.74
265 0.73
266 0.78
267 0.8
268 0.76
269 0.69
270 0.62
271 0.53
272 0.45
273 0.44
274 0.35
275 0.3
276 0.24
277 0.22
278 0.22
279 0.22
280 0.24
281 0.18
282 0.18
283 0.19
284 0.21
285 0.24
286 0.28
287 0.32
288 0.3
289 0.31
290 0.33
291 0.33
292 0.35
293 0.31