Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WHL7

Protein Details
Accession L8WHL7    Localization Confidence High Confidence Score 19
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-41ALTTRTCPKMRQMFRKRKEASRSETHydrophilic
80-107EGASGSMVPKKRRKRREKEREREPSVEABasic
130-157IDSIIKPGKAGKRKKRKKGGDEEICRYQBasic
368-398AADVERRKANQERLRRMQRKLDTAKQKGSRAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
87-101VPKKRRKRREKERER
135-148KPGKAGKRKKRKKG
382-387RRMQRK
Subcellular Location(s) mito 16, mito_nucl 13.333, nucl 9.5, cyto_mito 9.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR035441  TFIIS/LEDGF_dom_sf  
IPR017923  TFIIS_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF08711  Med26  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51319  TFIIS_N  
Amino Acid Sequences MSQGGVSENSSVISLVALTTRTCPKMRQMFRKRKEASRSETPPARGDAGSDYNDEGTGNPPSSSLKFTKRKKSTGGTEGEGASGSMVPKKRRKRREKEREREPSVEADKMQDLTPEEREFGKRLELAQKIDSIIKPGKAGKRKKRKKGGDEEICRYQEIDAHGDEEVNRLRQAMHAAADRDIEANANKQPAVSKLKMLSEVMDTLQKSSLVQSVLDNNLLEGVRRWLEPLPDKSLPALSIQNAFFEILPKLDIETAVLKESGLGKIVLFYTKCKRVTPTIRRIADTLVANWSRPIVKRSASYRDRHVPTAETEVSVRTEKLNKLLERAATLSNNGRGRKNAVRIPESAIGRYTVAPKSGNAGVSANVAADVERRKANQERLRRMQRKLDTAKQKGSRA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.07
2 0.06
3 0.07
4 0.08
5 0.08
6 0.13
7 0.19
8 0.23
9 0.25
10 0.28
11 0.37
12 0.46
13 0.56
14 0.63
15 0.68
16 0.75
17 0.81
18 0.89
19 0.86
20 0.84
21 0.85
22 0.83
23 0.79
24 0.79
25 0.78
26 0.76
27 0.76
28 0.7
29 0.63
30 0.57
31 0.52
32 0.41
33 0.36
34 0.32
35 0.3
36 0.28
37 0.26
38 0.23
39 0.2
40 0.21
41 0.19
42 0.14
43 0.13
44 0.14
45 0.14
46 0.13
47 0.13
48 0.16
49 0.18
50 0.23
51 0.26
52 0.32
53 0.41
54 0.5
55 0.61
56 0.66
57 0.7
58 0.72
59 0.76
60 0.75
61 0.74
62 0.7
63 0.62
64 0.56
65 0.5
66 0.43
67 0.34
68 0.25
69 0.16
70 0.12
71 0.1
72 0.12
73 0.16
74 0.24
75 0.33
76 0.44
77 0.54
78 0.64
79 0.75
80 0.81
81 0.88
82 0.92
83 0.95
84 0.94
85 0.95
86 0.95
87 0.9
88 0.82
89 0.73
90 0.69
91 0.61
92 0.53
93 0.42
94 0.34
95 0.28
96 0.26
97 0.23
98 0.18
99 0.17
100 0.17
101 0.21
102 0.19
103 0.19
104 0.2
105 0.22
106 0.22
107 0.2
108 0.21
109 0.18
110 0.2
111 0.26
112 0.27
113 0.28
114 0.28
115 0.28
116 0.26
117 0.28
118 0.25
119 0.22
120 0.22
121 0.2
122 0.21
123 0.25
124 0.31
125 0.37
126 0.48
127 0.53
128 0.62
129 0.72
130 0.8
131 0.86
132 0.88
133 0.9
134 0.9
135 0.91
136 0.9
137 0.87
138 0.82
139 0.78
140 0.68
141 0.58
142 0.47
143 0.36
144 0.28
145 0.23
146 0.19
147 0.12
148 0.13
149 0.12
150 0.12
151 0.12
152 0.12
153 0.11
154 0.1
155 0.1
156 0.09
157 0.1
158 0.1
159 0.13
160 0.11
161 0.12
162 0.13
163 0.14
164 0.14
165 0.14
166 0.14
167 0.12
168 0.1
169 0.09
170 0.07
171 0.08
172 0.09
173 0.1
174 0.09
175 0.09
176 0.1
177 0.14
178 0.2
179 0.19
180 0.2
181 0.21
182 0.22
183 0.23
184 0.22
185 0.19
186 0.13
187 0.13
188 0.11
189 0.12
190 0.11
191 0.1
192 0.11
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.11
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.11
201 0.12
202 0.13
203 0.12
204 0.09
205 0.1
206 0.1
207 0.09
208 0.07
209 0.08
210 0.09
211 0.09
212 0.1
213 0.1
214 0.14
215 0.2
216 0.23
217 0.27
218 0.27
219 0.28
220 0.27
221 0.26
222 0.23
223 0.19
224 0.17
225 0.12
226 0.15
227 0.15
228 0.14
229 0.14
230 0.14
231 0.12
232 0.12
233 0.11
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.07
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.09
242 0.09
243 0.1
244 0.1
245 0.09
246 0.1
247 0.11
248 0.1
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.09
253 0.1
254 0.12
255 0.11
256 0.15
257 0.21
258 0.28
259 0.3
260 0.3
261 0.33
262 0.4
263 0.51
264 0.57
265 0.61
266 0.63
267 0.64
268 0.64
269 0.61
270 0.54
271 0.47
272 0.38
273 0.29
274 0.26
275 0.24
276 0.23
277 0.22
278 0.22
279 0.2
280 0.21
281 0.22
282 0.19
283 0.22
284 0.28
285 0.33
286 0.42
287 0.46
288 0.48
289 0.53
290 0.59
291 0.6
292 0.57
293 0.53
294 0.45
295 0.41
296 0.44
297 0.37
298 0.28
299 0.25
300 0.23
301 0.24
302 0.22
303 0.2
304 0.16
305 0.21
306 0.22
307 0.28
308 0.35
309 0.33
310 0.37
311 0.4
312 0.38
313 0.35
314 0.35
315 0.32
316 0.25
317 0.27
318 0.27
319 0.3
320 0.35
321 0.36
322 0.36
323 0.35
324 0.4
325 0.45
326 0.49
327 0.46
328 0.48
329 0.49
330 0.48
331 0.52
332 0.52
333 0.46
334 0.39
335 0.36
336 0.29
337 0.27
338 0.27
339 0.25
340 0.21
341 0.22
342 0.21
343 0.21
344 0.24
345 0.26
346 0.25
347 0.22
348 0.2
349 0.18
350 0.19
351 0.19
352 0.14
353 0.11
354 0.1
355 0.09
356 0.12
357 0.14
358 0.16
359 0.19
360 0.21
361 0.28
362 0.36
363 0.46
364 0.51
365 0.59
366 0.66
367 0.73
368 0.84
369 0.85
370 0.84
371 0.83
372 0.83
373 0.83
374 0.81
375 0.81
376 0.8
377 0.81
378 0.84