FuNGI

L8X6F1

Protein Details

Accession

L8X6F1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.4

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
102-121	IVAPRAKMNQQRSRRFRAAQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
936-946	RRGGRGRGGGR

Subcellular Location(s)

cyto_mito 9, mito 8.5, cyto 8.5, nucl 5, cysk 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MLPCSTGVPALFRWLSKKYPKIVSQVVEEEPTRVPDADGNLVELPMDTSTPNPNGFELDCLYLDMNGIPAPETEEDMMVEVFNYTDRVVSMARPRKLLFMAIVAPRAKMNQQRSRRFRAAQEAKEKEEERKEAIKMFEALGHSVSEETTKKAWDSNAITPGTPFMDLLAQSLRYWVVQKQNSDPGWKNLQVIISDASVPGEGEHKIMDFIRRQRVNPGHDPNTRHVIYGLDADLIMLALATHEPHFRVLREDVFADSNKNSCRICGQEGHFAAQCTGKPKEKDTSKPPEKKPFIFLDVAVLREYLAIELNVPNIPFAFDLERAIDDWVFLIFFVGNDFLPHLPSLEIREGAIDTLLKIWKDELPRMGGYLAEHGQANKANVQIMLEGLAKREDEIFRKRREGPHKTIYIYPVQGELNINYDVAEERQEQNAKRRKVEQQRAKEREQDAQLVEVTQSSSAPSGPHGLPSRPTFDVFTGSSLPNNPTFGGSNSEVVANRAALRLANLSAADAMRAELAGATPLKPSSRATPVSKLTISAPVEQVPTPEQAADSKPEPEAPVAASEGPEETGEPDESVNPQPMDTDIVDGAVEALITSAVDRAVEPEGPRGIKRSVEEIEKDETDTPAEDEEPTVKKALKVNPDGTVEQEDTIKLWEPGYKERYYRSKFGAELNDTELRKQITTSYMEGLCWVLQYYYQGAPSWTWFYPYHFAPFAADFEDVEHMDIKFNLGQPFKPYEQLMGVFPAASRVHIPTPFQSLMTDEDSPIIDFYPTEFEIDMNGKKMSWQGVALLPFIDEKRLLGAMAERYPELSDDEVRRNKWGSNHIYVSDGNDLYDFFCGLYTKQRSEKPIPLDTRLSRGISGTVLHDPACVPDSSYPSPLTRVGLPDIVANRTLSAQFYYPRQITPHRSILLPGARLAPKVLGQADAEHVMRGGESRRGGRGRGGGRGGTPRDAGFVSSTGGYSDRPGAYERNGSRFSQYDSYNGGYGSGYSGNGGPGGYAGYGGNGGGGGYGGYGGGNGGDGGHRGGNDGYRGGGGGGRGGYNGYDRGSAQRGARGGLPRGGGRGGYNASGGYGGGGYGGYGGRGR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.29
2	0.37
3	0.44
4	0.51
5	0.52
6	0.59
7	0.64
8	0.67
9	0.7
10	0.65
11	0.62
12	0.59
13	0.53
14	0.48
15	0.43
16	0.37
17	0.31
18	0.3
19	0.26
20	0.22
21	0.2
22	0.19
23	0.23
24	0.26
25	0.25
26	0.25
27	0.23
28	0.22
29	0.21
30	0.18
31	0.15
32	0.1
33	0.1
34	0.08
35	0.09
36	0.15
37	0.19
38	0.21
39	0.21
40	0.21
41	0.23
42	0.23
43	0.24
44	0.21
45	0.2
46	0.18
47	0.18
48	0.18
49	0.15
50	0.15
51	0.12
52	0.11
53	0.09
54	0.09
55	0.08
56	0.08
57	0.11
58	0.11
59	0.13
60	0.13
61	0.13
62	0.13
63	0.14
64	0.14
65	0.1
66	0.09
67	0.07
68	0.07
69	0.07
70	0.08
71	0.06
72	0.07
73	0.07
74	0.09
75	0.1
76	0.15
77	0.25
78	0.33
79	0.36
80	0.4
81	0.4
82	0.43
83	0.43
84	0.41
85	0.32
86	0.27
87	0.3
88	0.28
89	0.33
90	0.29
91	0.28
92	0.26
93	0.27
94	0.3
95	0.32
96	0.4
97	0.44
98	0.54
99	0.65
100	0.72
101	0.79
102	0.81
103	0.78
104	0.74
105	0.76
106	0.75
107	0.74
108	0.76
109	0.72
110	0.68
111	0.7
112	0.65
113	0.61
114	0.59
115	0.53
116	0.49
117	0.49
118	0.47
119	0.45
120	0.45
121	0.41
122	0.35
123	0.32
124	0.3
125	0.25
126	0.24
127	0.2
128	0.18
129	0.14
130	0.13
131	0.12
132	0.13
133	0.13
134	0.15
135	0.15
136	0.17
137	0.17
138	0.2
139	0.22
140	0.26
141	0.3
142	0.33
143	0.38
144	0.38
145	0.37
146	0.34
147	0.34
148	0.27
149	0.22
150	0.16
151	0.1
152	0.11
153	0.11
154	0.13
155	0.14
156	0.13
157	0.13
158	0.14
159	0.14
160	0.12
161	0.14
162	0.17
163	0.25
164	0.28
165	0.32
166	0.37
167	0.45
168	0.46
169	0.51
170	0.5
171	0.46
172	0.49
173	0.47
174	0.43
175	0.37
176	0.37
177	0.3
178	0.29
179	0.24
180	0.18
181	0.16
182	0.14
183	0.13
184	0.1
185	0.1
186	0.08
187	0.08
188	0.08
189	0.08
190	0.08
191	0.08
192	0.1
193	0.11
194	0.15
195	0.2
196	0.27
197	0.36
198	0.39
199	0.4
200	0.49
201	0.55
202	0.58
203	0.61
204	0.63
205	0.61
206	0.64
207	0.67
208	0.62
209	0.62
210	0.55
211	0.46
212	0.37
213	0.3
214	0.25
215	0.24
216	0.2
217	0.12
218	0.11
219	0.1
220	0.09
221	0.08
222	0.06
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.04
228	0.06
229	0.07
230	0.08
231	0.12
232	0.14
233	0.14
234	0.18
235	0.21
236	0.22
237	0.23
238	0.23
239	0.22
240	0.23
241	0.23
242	0.21
243	0.19
244	0.21
245	0.2
246	0.23
247	0.21
248	0.19
249	0.23
250	0.24
251	0.27
252	0.3
253	0.32
254	0.37
255	0.38
256	0.4
257	0.38
258	0.34
259	0.31
260	0.26
261	0.24
262	0.21
263	0.24
264	0.27
265	0.28
266	0.32
267	0.4
268	0.45
269	0.52
270	0.55
271	0.62
272	0.66
273	0.74
274	0.78
275	0.8
276	0.79
277	0.74
278	0.71
279	0.65
280	0.59
281	0.5
282	0.42
283	0.39
284	0.33
285	0.31
286	0.25
287	0.2
288	0.15
289	0.14
290	0.14
291	0.07
292	0.06
293	0.05
294	0.06
295	0.07
296	0.08
297	0.09
298	0.09
299	0.08
300	0.08
301	0.08
302	0.07
303	0.09
304	0.09
305	0.09
306	0.1
307	0.11
308	0.12
309	0.11
310	0.12
311	0.11
312	0.08
313	0.08
314	0.07
315	0.06
316	0.05
317	0.05
318	0.04
319	0.04
320	0.05
321	0.05
322	0.05
323	0.05
324	0.07
325	0.07
326	0.08
327	0.08
328	0.08
329	0.07
330	0.08
331	0.12
332	0.12
333	0.13
334	0.11
335	0.12
336	0.12
337	0.11
338	0.11
339	0.07
340	0.06
341	0.08
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.1
346	0.14
347	0.16
348	0.19
349	0.19
350	0.21
351	0.21
352	0.22
353	0.21
354	0.18
355	0.15
356	0.15
357	0.14
358	0.11
359	0.11
360	0.1
361	0.12
362	0.13
363	0.14
364	0.13
365	0.12
366	0.12
367	0.12
368	0.12
369	0.11
370	0.09
371	0.1
372	0.1
373	0.09
374	0.09
375	0.1
376	0.09
377	0.09
378	0.12
379	0.12
380	0.16
381	0.26
382	0.32
383	0.36
384	0.41
385	0.45
386	0.52
387	0.6
388	0.63
389	0.61
390	0.63
391	0.63
392	0.6
393	0.58
394	0.52
395	0.45
396	0.37
397	0.3
398	0.23
399	0.19
400	0.18
401	0.16
402	0.14
403	0.13
404	0.12
405	0.11
406	0.09
407	0.1
408	0.09
409	0.08
410	0.1
411	0.1
412	0.11
413	0.15
414	0.19
415	0.2
416	0.29
417	0.38
418	0.39
419	0.4
420	0.44
421	0.5
422	0.57
423	0.66
424	0.67
425	0.69
426	0.77
427	0.79
428	0.77
429	0.74
430	0.65
431	0.61
432	0.53
433	0.46
434	0.35
435	0.3
436	0.27
437	0.2
438	0.18
439	0.12
440	0.1
441	0.06
442	0.06
443	0.05
444	0.05
445	0.05
446	0.06
447	0.06
448	0.1
449	0.1
450	0.14
451	0.16
452	0.17
453	0.2
454	0.21
455	0.25
456	0.22
457	0.23
458	0.2
459	0.18
460	0.2
461	0.17
462	0.17
463	0.15
464	0.14
465	0.14
466	0.14
467	0.15
468	0.13
469	0.13
470	0.12
471	0.11
472	0.11
473	0.12
474	0.15
475	0.14
476	0.14
477	0.13
478	0.14
479	0.13
480	0.13
481	0.12
482	0.08
483	0.08
484	0.07
485	0.07
486	0.06
487	0.07
488	0.07
489	0.06
490	0.07
491	0.06
492	0.06
493	0.06
494	0.06
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.04
499	0.04
500	0.04
501	0.03
502	0.03
503	0.04
504	0.05
505	0.05
506	0.05
507	0.06
508	0.06
509	0.08
510	0.09
511	0.11
512	0.17
513	0.21
514	0.23
515	0.28
516	0.3
517	0.32
518	0.31
519	0.28
520	0.24
521	0.25
522	0.24
523	0.2
524	0.18
525	0.16
526	0.17
527	0.16
528	0.16
529	0.12
530	0.11
531	0.1
532	0.09
533	0.08
534	0.08
535	0.09
536	0.11
537	0.1
538	0.11
539	0.11
540	0.11
541	0.12
542	0.11
543	0.1
544	0.08
545	0.08
546	0.08
547	0.08
548	0.07
549	0.06
550	0.06
551	0.06
552	0.06
553	0.05
554	0.05
555	0.06
556	0.06
557	0.06
558	0.06
559	0.06
560	0.09
561	0.09
562	0.11
563	0.1
564	0.09
565	0.09
566	0.09
567	0.11
568	0.09
569	0.09
570	0.07
571	0.07
572	0.07
573	0.07
574	0.06
575	0.04
576	0.04
577	0.02
578	0.02
579	0.02
580	0.02
581	0.02
582	0.03
583	0.03
584	0.03
585	0.03
586	0.05
587	0.06
588	0.07
589	0.08
590	0.1
591	0.12
592	0.13
593	0.13
594	0.15
595	0.15
596	0.16
597	0.16
598	0.19
599	0.19
600	0.22
601	0.23
602	0.23
603	0.24
604	0.22
605	0.23
606	0.19
607	0.17
608	0.14
609	0.13
610	0.1
611	0.08
612	0.08
613	0.07
614	0.07
615	0.1
616	0.11
617	0.11
618	0.12
619	0.12
620	0.14
621	0.2
622	0.25
623	0.29
624	0.33
625	0.34
626	0.37
627	0.39
628	0.37
629	0.33
630	0.3
631	0.23
632	0.19
633	0.17
634	0.13
635	0.1
636	0.11
637	0.1
638	0.07
639	0.08
640	0.1
641	0.11
642	0.18
643	0.23
644	0.24
645	0.25
646	0.3
647	0.39
648	0.41
649	0.43
650	0.41
651	0.4
652	0.39
653	0.42
654	0.43
655	0.36
656	0.33
657	0.33
658	0.35
659	0.31
660	0.3
661	0.27
662	0.22
663	0.19
664	0.18
665	0.15
666	0.13
667	0.16
668	0.17
669	0.18
670	0.18
671	0.17
672	0.18
673	0.16
674	0.13
675	0.1
676	0.09
677	0.05
678	0.05
679	0.07
680	0.09
681	0.09
682	0.1
683	0.1
684	0.11
685	0.11
686	0.13
687	0.16
688	0.13
689	0.16
690	0.16
691	0.19
692	0.22
693	0.22
694	0.24
695	0.21
696	0.21
697	0.19
698	0.19
699	0.17
700	0.15
701	0.14
702	0.1
703	0.1
704	0.12
705	0.1
706	0.1
707	0.1
708	0.09
709	0.09
710	0.09
711	0.1
712	0.1
713	0.13
714	0.17
715	0.17
716	0.17
717	0.21
718	0.26
719	0.26
720	0.26
721	0.24
722	0.21
723	0.21
724	0.22
725	0.19
726	0.15
727	0.14
728	0.12
729	0.11
730	0.13
731	0.12
732	0.11
733	0.11
734	0.12
735	0.15
736	0.16
737	0.18
738	0.16
739	0.23
740	0.23
741	0.22
742	0.2
743	0.18
744	0.2
745	0.22
746	0.2
747	0.14
748	0.14
749	0.15
750	0.14
751	0.13
752	0.1
753	0.07
754	0.06
755	0.07
756	0.1
757	0.1
758	0.11
759	0.11
760	0.1
761	0.12
762	0.16
763	0.16
764	0.14
765	0.14
766	0.13
767	0.13
768	0.16
769	0.16
770	0.14
771	0.13
772	0.13
773	0.16
774	0.18
775	0.17
776	0.15
777	0.13
778	0.13
779	0.13
780	0.12
781	0.09
782	0.08
783	0.09
784	0.1
785	0.09
786	0.08
787	0.11
788	0.14
789	0.15
790	0.16
791	0.14
792	0.15
793	0.15
794	0.16
795	0.14
796	0.12
797	0.15
798	0.18
799	0.26
800	0.31
801	0.32
802	0.34
803	0.34
804	0.35
805	0.36
806	0.41
807	0.4
808	0.42
809	0.43
810	0.41
811	0.42
812	0.39
813	0.36
814	0.31
815	0.24
816	0.18
817	0.15
818	0.14
819	0.12
820	0.12
821	0.1
822	0.06
823	0.06
824	0.07
825	0.08
826	0.17
827	0.2
828	0.25
829	0.31
830	0.36
831	0.42
832	0.48
833	0.55
834	0.52
835	0.57
836	0.57
837	0.55
838	0.58
839	0.52
840	0.51
841	0.47
842	0.42
843	0.33
844	0.3
845	0.26
846	0.2
847	0.19
848	0.16
849	0.15
850	0.15
851	0.14
852	0.14
853	0.13
854	0.14
855	0.15
856	0.12
857	0.11
858	0.14
859	0.2
860	0.22
861	0.25
862	0.25
863	0.24
864	0.27
865	0.27
866	0.25
867	0.21
868	0.22
869	0.22
870	0.21
871	0.2
872	0.21
873	0.22
874	0.21
875	0.2
876	0.18
877	0.16
878	0.16
879	0.16
880	0.13
881	0.13
882	0.14
883	0.15
884	0.18
885	0.24
886	0.24
887	0.25
888	0.29
889	0.34
890	0.4
891	0.45
892	0.49
893	0.44
894	0.43
895	0.43
896	0.46
897	0.44
898	0.37
899	0.31
900	0.3
901	0.29
902	0.29
903	0.29
904	0.23
905	0.19
906	0.21
907	0.21
908	0.16
909	0.16
910	0.17
911	0.18
912	0.2
913	0.18
914	0.15
915	0.14
916	0.12
917	0.11
918	0.12
919	0.12
920	0.14
921	0.18
922	0.2
923	0.27
924	0.3
925	0.31
926	0.34
927	0.4
928	0.38
929	0.41
930	0.42
931	0.36
932	0.37
933	0.44
934	0.42
935	0.37
936	0.35
937	0.28
938	0.27
939	0.26
940	0.24
941	0.18
942	0.15
943	0.14
944	0.13
945	0.13
946	0.11
947	0.12
948	0.11
949	0.11
950	0.16
951	0.15
952	0.15
953	0.18
954	0.2
955	0.23
956	0.32
957	0.34
958	0.36
959	0.39
960	0.39
961	0.4
962	0.4
963	0.41
964	0.38
965	0.36
966	0.32
967	0.33
968	0.34
969	0.31
970	0.28
971	0.24
972	0.17
973	0.17
974	0.15
975	0.12
976	0.1
977	0.1
978	0.11
979	0.1
980	0.11
981	0.1
982	0.07
983	0.07
984	0.07
985	0.06
986	0.06
987	0.06
988	0.06
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.05
993	0.05
994	0.04
995	0.04
996	0.03
997	0.03
998	0.03
999	0.03
1000	0.03
1001	0.03
1002	0.03
1003	0.03
1004	0.03
1005	0.03
1006	0.04
1007	0.04
1008	0.05
1009	0.07
1010	0.09
1011	0.09
1012	0.1
1013	0.12
1014	0.14
1015	0.16
1016	0.16
1017	0.15
1018	0.14
1019	0.14
1020	0.13
1021	0.13
1022	0.1
1023	0.11
1024	0.11
1025	0.11
1026	0.11
1027	0.11
1028	0.11
1029	0.13
1030	0.14
1031	0.13
1032	0.14
1033	0.15
1034	0.2
1035	0.23
1036	0.26
1037	0.26
1038	0.29
1039	0.29
1040	0.29
1041	0.34
1042	0.35
1043	0.35
1044	0.35
1045	0.36
1046	0.32
1047	0.33
1048	0.33
1049	0.28
1050	0.23
1051	0.24
1052	0.23
1053	0.2
1054	0.2
1055	0.17
1056	0.16
1057	0.16
1058	0.14
1059	0.1
1060	0.07
1061	0.06
1062	0.05
1063	0.05
1064	0.05
1065	0.06
1066	0.06

L8X6F1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer