Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X4Q4

Protein Details
Accession L8X4Q4    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
44-72IRPISKRTGQPTSKRKKPRLLSQCRYGPRHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
49-62KRTGQPTSKRKKPR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001247  ExoRNase_PH_dom1  
IPR036345  ExoRNase_PH_dom2_sf  
IPR027408  PNPase/RNase_PH_dom_sf  
IPR020568  Ribosomal_S5_D2-typ_fold  
Gene Ontology GO:0000176  C:nuclear exosome (RNase complex)  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF01138  RNase_PH  
Amino Acid Sequences MAQHSNFDRRRINGPESSSYPIFENNEEDKIPTISRTTRKNDEIRPISKRTGQPTSKRKKPRLLSQCRYGPREIKAGSTYTENGRLKVEVKFSPFSCKRRRAPIRDAESPTLASQIHQSLLPAVRLELFPKSQLDVYVHILEVDGIESCVGAAATAASAALADAGIDMLGLAVSCTAAINRSVTGYAELLLDPNGQEADAARGLVMVTCLPALGTVTNMIQTGLVHPDEVIQCMDVCTKQCEDIHFVVAQSLLESAQTRSRKQE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.54
3 0.52
4 0.55
5 0.48
6 0.42
7 0.37
8 0.35
9 0.31
10 0.27
11 0.29
12 0.25
13 0.28
14 0.27
15 0.27
16 0.24
17 0.24
18 0.23
19 0.19
20 0.2
21 0.24
22 0.31
23 0.37
24 0.43
25 0.49
26 0.56
27 0.62
28 0.65
29 0.68
30 0.7
31 0.69
32 0.68
33 0.65
34 0.62
35 0.61
36 0.6
37 0.56
38 0.58
39 0.59
40 0.63
41 0.68
42 0.74
43 0.76
44 0.82
45 0.83
46 0.83
47 0.84
48 0.84
49 0.85
50 0.86
51 0.83
52 0.82
53 0.82
54 0.79
55 0.74
56 0.68
57 0.61
58 0.53
59 0.53
60 0.44
61 0.39
62 0.34
63 0.32
64 0.28
65 0.26
66 0.25
67 0.2
68 0.28
69 0.26
70 0.24
71 0.24
72 0.24
73 0.23
74 0.24
75 0.26
76 0.2
77 0.23
78 0.26
79 0.25
80 0.34
81 0.38
82 0.43
83 0.48
84 0.55
85 0.55
86 0.63
87 0.72
88 0.7
89 0.73
90 0.75
91 0.73
92 0.72
93 0.72
94 0.63
95 0.54
96 0.47
97 0.38
98 0.29
99 0.22
100 0.14
101 0.12
102 0.1
103 0.1
104 0.09
105 0.09
106 0.09
107 0.1
108 0.11
109 0.09
110 0.08
111 0.08
112 0.08
113 0.1
114 0.09
115 0.08
116 0.09
117 0.1
118 0.1
119 0.1
120 0.1
121 0.11
122 0.11
123 0.14
124 0.13
125 0.13
126 0.12
127 0.11
128 0.1
129 0.09
130 0.07
131 0.04
132 0.03
133 0.03
134 0.03
135 0.03
136 0.03
137 0.03
138 0.02
139 0.02
140 0.02
141 0.02
142 0.02
143 0.02
144 0.02
145 0.02
146 0.02
147 0.02
148 0.02
149 0.02
150 0.02
151 0.02
152 0.02
153 0.02
154 0.02
155 0.02
156 0.02
157 0.02
158 0.02
159 0.02
160 0.02
161 0.02
162 0.02
163 0.03
164 0.04
165 0.05
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.09
172 0.09
173 0.08
174 0.08
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.06
180 0.07
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.06
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.08
193 0.05
194 0.05
195 0.05
196 0.05
197 0.04
198 0.05
199 0.05
200 0.05
201 0.05
202 0.06
203 0.07
204 0.08
205 0.08
206 0.08
207 0.08
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.14
215 0.14
216 0.16
217 0.14
218 0.12
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.13
223 0.15
224 0.17
225 0.18
226 0.22
227 0.24
228 0.26
229 0.3
230 0.3
231 0.31
232 0.28
233 0.27
234 0.24
235 0.22
236 0.19
237 0.13
238 0.11
239 0.08
240 0.08
241 0.1
242 0.11
243 0.19
244 0.24