Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WYW9

Protein Details
Accession L8WYW9    Localization Confidence High Confidence Score 17
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
24-43KPQTGEKKGNYNPRRKIHTLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
20-53KGGQKPQTGEKKGNYNPRRKIHTLDPAASKKPKP
266-271GPRKGR
303-312GRKGKGKGRK
344-356PKSGGGGKGRKKK
Subcellular Location(s) nucl 20.5, cyto_nucl 14, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013699  Signal_recog_part_SRP72_RNA-bd  
IPR026270  SRP72  
IPR031545  SRP_TPR-like  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005783  C:endoplasmic reticulum  
GO:0005786  C:signal recognition particle, endoplasmic reticulum targeting  
GO:0008312  F:7S RNA binding  
GO:0006614  P:SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane  
Pfam View protein in Pfam  
PF08492  SRP72  
PF17004  SRP_TPR_like  
Amino Acid Sequences MTTMPSQKPGAAKKTPVSTKGGQKPQTGEKKGNYNPRRKIHTLDPAASKKPKPAEVRIKQLFASLCAQIDGAHLTNAIKTCDKILRLTPDDADVIQTKLFLLLQTDQYARALEIVETVSGGSDSRQLEKAYLLYRLHKEKEAKAVVDQAKGKGASDGGFDHLDAQIAYRLGDYSVSKEIYDRILDEGELNAEEQTDINTNLSAVQSHIDFLQSGFYDSLRASGVNVSQLEDTPAPAPPVAANTLSIALVQKDTTNEEATAPAPLKGPRKGRLPKHVVLGVTPMPDPERWIKKRERTYVTFAQGRKGKGKGRKEGATAGYSQGVNVAPAVAGVMEGGGSGSGHVPKSGGGGKGRKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.64
3 0.6
4 0.59
5 0.58
6 0.62
7 0.66
8 0.69
9 0.65
10 0.64
11 0.66
12 0.7
13 0.73
14 0.69
15 0.66
16 0.62
17 0.66
18 0.68
19 0.74
20 0.73
21 0.73
22 0.76
23 0.78
24 0.81
25 0.74
26 0.73
27 0.71
28 0.73
29 0.7
30 0.66
31 0.66
32 0.63
33 0.67
34 0.67
35 0.6
36 0.56
37 0.55
38 0.57
39 0.55
40 0.59
41 0.63
42 0.65
43 0.74
44 0.71
45 0.67
46 0.59
47 0.57
48 0.47
49 0.39
50 0.34
51 0.25
52 0.2
53 0.18
54 0.18
55 0.13
56 0.14
57 0.13
58 0.11
59 0.09
60 0.1
61 0.1
62 0.12
63 0.13
64 0.15
65 0.13
66 0.13
67 0.17
68 0.21
69 0.22
70 0.23
71 0.27
72 0.32
73 0.35
74 0.37
75 0.33
76 0.31
77 0.3
78 0.27
79 0.24
80 0.17
81 0.15
82 0.12
83 0.12
84 0.1
85 0.09
86 0.1
87 0.07
88 0.09
89 0.1
90 0.12
91 0.14
92 0.15
93 0.15
94 0.15
95 0.15
96 0.12
97 0.11
98 0.1
99 0.07
100 0.08
101 0.07
102 0.07
103 0.06
104 0.06
105 0.05
106 0.05
107 0.05
108 0.04
109 0.08
110 0.09
111 0.12
112 0.14
113 0.14
114 0.15
115 0.16
116 0.18
117 0.15
118 0.2
119 0.19
120 0.21
121 0.26
122 0.3
123 0.32
124 0.34
125 0.37
126 0.34
127 0.42
128 0.4
129 0.36
130 0.32
131 0.38
132 0.35
133 0.36
134 0.34
135 0.26
136 0.26
137 0.25
138 0.24
139 0.16
140 0.14
141 0.1
142 0.1
143 0.1
144 0.09
145 0.09
146 0.09
147 0.09
148 0.09
149 0.08
150 0.07
151 0.07
152 0.06
153 0.06
154 0.06
155 0.06
156 0.06
157 0.06
158 0.07
159 0.07
160 0.08
161 0.1
162 0.1
163 0.1
164 0.11
165 0.11
166 0.11
167 0.11
168 0.1
169 0.08
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.07
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.05
178 0.04
179 0.04
180 0.04
181 0.05
182 0.06
183 0.06
184 0.06
185 0.06
186 0.06
187 0.07
188 0.07
189 0.06
190 0.05
191 0.06
192 0.05
193 0.06
194 0.06
195 0.06
196 0.06
197 0.06
198 0.08
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.08
203 0.09
204 0.08
205 0.09
206 0.07
207 0.07
208 0.07
209 0.08
210 0.08
211 0.11
212 0.11
213 0.11
214 0.11
215 0.11
216 0.13
217 0.12
218 0.12
219 0.1
220 0.1
221 0.1
222 0.09
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.1
227 0.1
228 0.09
229 0.09
230 0.1
231 0.1
232 0.1
233 0.08
234 0.07
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.08
239 0.11
240 0.13
241 0.14
242 0.13
243 0.13
244 0.14
245 0.14
246 0.15
247 0.14
248 0.12
249 0.13
250 0.17
251 0.22
252 0.28
253 0.34
254 0.37
255 0.46
256 0.55
257 0.61
258 0.67
259 0.7
260 0.67
261 0.67
262 0.64
263 0.55
264 0.46
265 0.43
266 0.34
267 0.27
268 0.24
269 0.18
270 0.17
271 0.16
272 0.19
273 0.23
274 0.32
275 0.34
276 0.41
277 0.5
278 0.58
279 0.67
280 0.73
281 0.73
282 0.69
283 0.74
284 0.75
285 0.73
286 0.7
287 0.61
288 0.6
289 0.56
290 0.54
291 0.51
292 0.49
293 0.5
294 0.53
295 0.62
296 0.63
297 0.66
298 0.68
299 0.67
300 0.67
301 0.63
302 0.56
303 0.48
304 0.4
305 0.36
306 0.3
307 0.25
308 0.21
309 0.17
310 0.14
311 0.13
312 0.11
313 0.07
314 0.07
315 0.07
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.03
320 0.03
321 0.03
322 0.03
323 0.03
324 0.03
325 0.04
326 0.06
327 0.09
328 0.1
329 0.1
330 0.11
331 0.11
332 0.16
333 0.2
334 0.22
335 0.27
336 0.36