Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WPD3

Protein Details
Accession L8WPD3    Localization Confidence High Confidence Score 17.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-78SWMLATVTTKRTRRKRRKVNRRSQRTRMMRNSDRTPSHydrophilic
187-206AVRSKKKASLRDKQKKLRAHBasic
318-337EEFRRKFKAYQSPAPRKSHNHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
51-100KRTRRKRRKVNRRSQRTRMMRNSDRTPSKSPKRPATKEAESGGGSAAKRK
130-133KKAK
142-214SIQKGREGREKFGSAKGKKKKDVPSSSTNREKARNKPLMMILASGAVRSKKKASLRDKQKKLRAHIDRAKKAK
Subcellular Location(s) mito 22.5, cyto_mito 12.5, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027312  Sda1  
IPR007949  SDA1_C  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042273  P:ribosomal large subunit biogenesis  
GO:0000055  P:ribosomal large subunit export from nucleus  
Pfam View protein in Pfam  
PF05285  SDA1  
Amino Acid Sequences MLVPMLALKMVTVGTVGMLNPTRTSLHRHPRAGSMWSLIARSWMLATVTTKRTRRKRRKVNRRSQRTRMMRNSDRTPSKSPKRPATKEAESGGGSAAKRKLAVLEAQKKANAQNPGDVFLSEGDIEGPRKKAKADYEERMASIQKGREGREKFGSAKGKKKKDVPSSSTNREKARNKPLMMILASGAVRSKKKASLRDKQKKLRAHIDRAKKAKGDGYLINSARQAECRRLGDDHVRFTCAEIIIAGTGLVGFTTTRLSVNALGDTYKVSGRRFTMIASRSVAAAARVHKPMIHFLGKQPHVPAPHPAAPPESRTTFEEFRRKFKAYQSPAPRKSHNEDVQVYNDIWDAPSRFWRNQLVISEREMNAVMSGVSSPKMYSIPS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.06
2 0.07
3 0.07
4 0.1
5 0.13
6 0.14
7 0.14
8 0.16
9 0.18
10 0.19
11 0.28
12 0.34
13 0.43
14 0.51
15 0.55
16 0.56
17 0.61
18 0.63
19 0.58
20 0.5
21 0.43
22 0.38
23 0.34
24 0.32
25 0.25
26 0.23
27 0.19
28 0.17
29 0.14
30 0.12
31 0.11
32 0.12
33 0.15
34 0.2
35 0.27
36 0.34
37 0.41
38 0.49
39 0.59
40 0.69
41 0.77
42 0.81
43 0.86
44 0.9
45 0.95
46 0.96
47 0.97
48 0.97
49 0.97
50 0.95
51 0.93
52 0.93
53 0.92
54 0.91
55 0.89
56 0.88
57 0.86
58 0.83
59 0.81
60 0.79
61 0.77
62 0.72
63 0.7
64 0.7
65 0.71
66 0.73
67 0.75
68 0.75
69 0.79
70 0.79
71 0.79
72 0.78
73 0.74
74 0.7
75 0.63
76 0.56
77 0.46
78 0.4
79 0.33
80 0.27
81 0.21
82 0.2
83 0.2
84 0.17
85 0.17
86 0.17
87 0.17
88 0.16
89 0.22
90 0.28
91 0.35
92 0.38
93 0.4
94 0.4
95 0.4
96 0.41
97 0.4
98 0.36
99 0.28
100 0.31
101 0.3
102 0.32
103 0.31
104 0.28
105 0.23
106 0.16
107 0.16
108 0.1
109 0.09
110 0.07
111 0.08
112 0.1
113 0.11
114 0.14
115 0.14
116 0.15
117 0.16
118 0.21
119 0.26
120 0.34
121 0.4
122 0.42
123 0.47
124 0.47
125 0.47
126 0.43
127 0.37
128 0.29
129 0.25
130 0.22
131 0.2
132 0.22
133 0.24
134 0.31
135 0.33
136 0.35
137 0.36
138 0.37
139 0.35
140 0.39
141 0.46
142 0.42
143 0.49
144 0.55
145 0.57
146 0.59
147 0.65
148 0.67
149 0.68
150 0.72
151 0.69
152 0.7
153 0.7
154 0.73
155 0.73
156 0.68
157 0.61
158 0.6
159 0.59
160 0.58
161 0.6
162 0.6
163 0.53
164 0.51
165 0.5
166 0.45
167 0.39
168 0.31
169 0.21
170 0.16
171 0.14
172 0.11
173 0.1
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.13
178 0.16
179 0.22
180 0.31
181 0.39
182 0.47
183 0.58
184 0.67
185 0.75
186 0.78
187 0.81
188 0.78
189 0.75
190 0.75
191 0.71
192 0.71
193 0.69
194 0.7
195 0.7
196 0.69
197 0.66
198 0.56
199 0.5
200 0.44
201 0.38
202 0.31
203 0.26
204 0.26
205 0.3
206 0.29
207 0.29
208 0.26
209 0.25
210 0.21
211 0.23
212 0.2
213 0.18
214 0.22
215 0.22
216 0.24
217 0.24
218 0.27
219 0.33
220 0.34
221 0.36
222 0.33
223 0.32
224 0.3
225 0.3
226 0.29
227 0.2
228 0.16
229 0.1
230 0.09
231 0.07
232 0.07
233 0.06
234 0.03
235 0.03
236 0.03
237 0.03
238 0.02
239 0.02
240 0.03
241 0.04
242 0.05
243 0.05
244 0.06
245 0.08
246 0.1
247 0.11
248 0.12
249 0.11
250 0.11
251 0.11
252 0.11
253 0.11
254 0.11
255 0.13
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.25
263 0.25
264 0.27
265 0.26
266 0.24
267 0.22
268 0.22
269 0.2
270 0.14
271 0.15
272 0.16
273 0.18
274 0.19
275 0.19
276 0.2
277 0.21
278 0.25
279 0.28
280 0.29
281 0.26
282 0.3
283 0.4
284 0.41
285 0.42
286 0.39
287 0.37
288 0.36
289 0.36
290 0.37
291 0.34
292 0.4
293 0.39
294 0.37
295 0.38
296 0.37
297 0.39
298 0.39
299 0.33
300 0.29
301 0.31
302 0.36
303 0.36
304 0.43
305 0.49
306 0.46
307 0.51
308 0.56
309 0.57
310 0.53
311 0.57
312 0.6
313 0.58
314 0.65
315 0.69
316 0.74
317 0.78
318 0.81
319 0.78
320 0.74
321 0.73
322 0.73
323 0.69
324 0.66
325 0.63
326 0.6
327 0.58
328 0.54
329 0.47
330 0.37
331 0.3
332 0.22
333 0.18
334 0.18
335 0.16
336 0.15
337 0.25
338 0.3
339 0.31
340 0.36
341 0.42
342 0.42
343 0.46
344 0.51
345 0.47
346 0.44
347 0.47
348 0.48
349 0.42
350 0.4
351 0.34
352 0.27
353 0.22
354 0.2
355 0.14
356 0.09
357 0.09
358 0.09
359 0.09
360 0.1
361 0.09
362 0.11