Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WMT3

Protein Details
Accession L8WMT3    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
392-418STPTTAKPAPKSKPKKSKPKNEDDEEDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
398-411KPAPKSKPKKSKPK
Subcellular Location(s) mito 19.5, cyto_mito 13.333, mito_nucl 11.666, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045864  aa-tRNA-synth_II/BPL/LPL  
IPR004154  Anticodon-bd  
IPR036621  Anticodon-bd_dom_sf  
IPR041715  HisRS-like_core  
IPR033656  HisRS_anticodon  
Gene Ontology GO:0004821  F:histidine-tRNA ligase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF03129  HGTP_anticodon  
PF13393  tRNA-synt_His  
CDD cd00773  HisRS-like_core  
cd00859  HisRS_anticodon  
Amino Acid Sequences MLRLASGLTRSVLVGLGPGRRTIMASTPDLAALRANITALNEHIHTLKSQSADPATIAAENKKLGELKKQLGQLGGTAKGDSKKDNKLALKTPKGTRDWSPLEMSIREHIFSTLQRVFKAHGGVTIDTPVFELRDILTGKYGEDSKLIYDLQDQGGELYNDSQVPFARFLAMNGTTYPTIKRYHIAKVYRRDAPAMTKGRMREFYQCDFDIAGLYDPMVPDAEVLCILSEALTALDIKDFTIKINHRKILDGIFGLCGVPVDKTRSISSAVDKLDKLPWADVKKEMVEEKGLPEEVADKIGEYVKLKGGPELLTQLRESPLASNESAKAGMEDMELLFKYLNVFGITHQMSFDLSLARGLDYYTGLIYEAVVEGSAPPAASNTSALPSTSASTPTTAKPAPKSKPKKSKPKNEDDEEDIDESQVGVGSIAAGGRYDDLVGMFASAAAGKASASGSGSGSGSASGKIPCVGVSVGVERVFSILMQREKERGRSKATEVFVVSVGEGLIEERMRLAKELWDVGIKAEYMYKITPRLDAQFKVMDKELIPYAVMLGPDEVKEGKVKVKIQQYSAGGEDAGSQVTISREELIPWLKQRLSN
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.12
2 0.14
3 0.18
4 0.18
5 0.19
6 0.2
7 0.2
8 0.21
9 0.2
10 0.24
11 0.24
12 0.25
13 0.26
14 0.26
15 0.27
16 0.26
17 0.24
18 0.18
19 0.14
20 0.13
21 0.11
22 0.11
23 0.1
24 0.11
25 0.12
26 0.12
27 0.14
28 0.13
29 0.14
30 0.15
31 0.15
32 0.15
33 0.16
34 0.18
35 0.18
36 0.18
37 0.22
38 0.23
39 0.23
40 0.22
41 0.21
42 0.19
43 0.19
44 0.2
45 0.18
46 0.19
47 0.19
48 0.19
49 0.2
50 0.24
51 0.23
52 0.31
53 0.35
54 0.37
55 0.42
56 0.45
57 0.44
58 0.42
59 0.41
60 0.35
61 0.31
62 0.29
63 0.24
64 0.21
65 0.22
66 0.25
67 0.26
68 0.29
69 0.31
70 0.36
71 0.42
72 0.5
73 0.52
74 0.55
75 0.62
76 0.66
77 0.69
78 0.68
79 0.69
80 0.69
81 0.66
82 0.64
83 0.6
84 0.59
85 0.55
86 0.51
87 0.48
88 0.43
89 0.43
90 0.4
91 0.37
92 0.33
93 0.29
94 0.26
95 0.23
96 0.2
97 0.19
98 0.19
99 0.24
100 0.24
101 0.24
102 0.25
103 0.25
104 0.27
105 0.28
106 0.3
107 0.23
108 0.21
109 0.22
110 0.22
111 0.22
112 0.23
113 0.19
114 0.16
115 0.16
116 0.13
117 0.1
118 0.09
119 0.09
120 0.07
121 0.12
122 0.13
123 0.13
124 0.15
125 0.15
126 0.15
127 0.17
128 0.17
129 0.13
130 0.13
131 0.13
132 0.12
133 0.14
134 0.13
135 0.11
136 0.12
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.13
141 0.11
142 0.14
143 0.14
144 0.12
145 0.1
146 0.1
147 0.1
148 0.1
149 0.11
150 0.1
151 0.12
152 0.12
153 0.12
154 0.13
155 0.13
156 0.13
157 0.17
158 0.17
159 0.15
160 0.15
161 0.17
162 0.15
163 0.16
164 0.16
165 0.14
166 0.16
167 0.17
168 0.21
169 0.22
170 0.29
171 0.36
172 0.43
173 0.49
174 0.55
175 0.6
176 0.6
177 0.58
178 0.52
179 0.46
180 0.43
181 0.44
182 0.4
183 0.37
184 0.34
185 0.36
186 0.38
187 0.4
188 0.37
189 0.37
190 0.37
191 0.39
192 0.4
193 0.38
194 0.35
195 0.31
196 0.29
197 0.21
198 0.16
199 0.12
200 0.07
201 0.07
202 0.06
203 0.06
204 0.06
205 0.06
206 0.05
207 0.05
208 0.05
209 0.05
210 0.05
211 0.05
212 0.04
213 0.04
214 0.04
215 0.04
216 0.03
217 0.03
218 0.03
219 0.03
220 0.03
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.05
225 0.06
226 0.07
227 0.07
228 0.14
229 0.18
230 0.26
231 0.33
232 0.36
233 0.35
234 0.36
235 0.37
236 0.33
237 0.31
238 0.23
239 0.16
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.09
244 0.07
245 0.05
246 0.05
247 0.06
248 0.1
249 0.11
250 0.13
251 0.13
252 0.15
253 0.17
254 0.17
255 0.19
256 0.2
257 0.2
258 0.21
259 0.2
260 0.2
261 0.2
262 0.2
263 0.18
264 0.14
265 0.18
266 0.18
267 0.2
268 0.2
269 0.2
270 0.19
271 0.2
272 0.19
273 0.15
274 0.14
275 0.13
276 0.13
277 0.12
278 0.12
279 0.1
280 0.09
281 0.09
282 0.08
283 0.08
284 0.07
285 0.06
286 0.06
287 0.07
288 0.08
289 0.08
290 0.09
291 0.09
292 0.11
293 0.12
294 0.12
295 0.12
296 0.12
297 0.12
298 0.15
299 0.14
300 0.13
301 0.13
302 0.14
303 0.13
304 0.12
305 0.12
306 0.09
307 0.1
308 0.11
309 0.11
310 0.12
311 0.12
312 0.12
313 0.12
314 0.1
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.06
319 0.05
320 0.05
321 0.06
322 0.06
323 0.06
324 0.05
325 0.05
326 0.06
327 0.05
328 0.06
329 0.06
330 0.06
331 0.06
332 0.13
333 0.13
334 0.13
335 0.12
336 0.12
337 0.11
338 0.11
339 0.11
340 0.06
341 0.06
342 0.06
343 0.07
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.05
349 0.06
350 0.05
351 0.05
352 0.05
353 0.05
354 0.05
355 0.04
356 0.04
357 0.04
358 0.03
359 0.03
360 0.03
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.04
366 0.05
367 0.05
368 0.06
369 0.06
370 0.07
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.09
375 0.1
376 0.1
377 0.11
378 0.11
379 0.12
380 0.14
381 0.14
382 0.19
383 0.19
384 0.22
385 0.27
386 0.35
387 0.41
388 0.5
389 0.59
390 0.65
391 0.74
392 0.81
393 0.85
394 0.87
395 0.91
396 0.9
397 0.91
398 0.9
399 0.85
400 0.8
401 0.73
402 0.67
403 0.58
404 0.5
405 0.38
406 0.29
407 0.22
408 0.17
409 0.12
410 0.08
411 0.05
412 0.04
413 0.03
414 0.03
415 0.04
416 0.04
417 0.04
418 0.03
419 0.04
420 0.04
421 0.04
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.05
426 0.05
427 0.05
428 0.05
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.04
434 0.04
435 0.03
436 0.04
437 0.05
438 0.05
439 0.06
440 0.07
441 0.07
442 0.08
443 0.09
444 0.08
445 0.08
446 0.08
447 0.08
448 0.08
449 0.1
450 0.09
451 0.09
452 0.1
453 0.1
454 0.09
455 0.1
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.11
460 0.13
461 0.13
462 0.13
463 0.11
464 0.11
465 0.11
466 0.09
467 0.11
468 0.14
469 0.18
470 0.21
471 0.23
472 0.29
473 0.33
474 0.42
475 0.46
476 0.45
477 0.49
478 0.51
479 0.54
480 0.56
481 0.55
482 0.5
483 0.43
484 0.4
485 0.33
486 0.28
487 0.22
488 0.15
489 0.13
490 0.08
491 0.07
492 0.05
493 0.06
494 0.06
495 0.06
496 0.07
497 0.09
498 0.1
499 0.12
500 0.12
501 0.15
502 0.18
503 0.2
504 0.2
505 0.21
506 0.21
507 0.2
508 0.21
509 0.17
510 0.14
511 0.15
512 0.15
513 0.14
514 0.16
515 0.18
516 0.21
517 0.22
518 0.26
519 0.26
520 0.32
521 0.36
522 0.35
523 0.37
524 0.39
525 0.39
526 0.39
527 0.37
528 0.33
529 0.27
530 0.29
531 0.26
532 0.2
533 0.19
534 0.15
535 0.15
536 0.15
537 0.14
538 0.12
539 0.11
540 0.12
541 0.12
542 0.14
543 0.12
544 0.12
545 0.15
546 0.16
547 0.21
548 0.26
549 0.3
550 0.36
551 0.45
552 0.49
553 0.49
554 0.55
555 0.51
556 0.49
557 0.46
558 0.4
559 0.3
560 0.25
561 0.23
562 0.16
563 0.14
564 0.1
565 0.08
566 0.09
567 0.1
568 0.12
569 0.11
570 0.13
571 0.13
572 0.14
573 0.2
574 0.22
575 0.26
576 0.29
577 0.35