Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X5Q6

Protein Details
Accession L8X5Q6    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
117-137ENKEDTKSKRGSRDRPPDAKGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-142KSKRGSRDRPPDAKGKDRRK
Subcellular Location(s) mito 13.5, nucl 9.5, cyto_mito 9.333, cyto_nucl 7.333
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR001878  Znf_CCHC  
Gene Ontology GO:0003676  F:nucleic acid binding  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00098  zf-CCHC  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50158  ZF_CCHC  
Amino Acid Sequences MSIGESIQSIRAQALGHWLLLLPHPAPLWRQCPTRSLTLQCLTTTLLDTKAGEDAARTEIQGKAKLPRVFNSMFGSHYDPHARSNGPSSPSKPGGKSQPEQAKSNSLLSRLGMIPNENKEDTKSKRGSRDRPPDAKGKDRRKQTDDERTRAQEMPQTDGNSAHHRWPRSPSPNKLEEIPLSELPVEQLFFVDTGPPSGVNSGQEQHLPPGTGIGFTTSNAPGSGAIPNAKAIKKPLTKESRKEFQGSEEGKVSGDTPGRGPNEVEFIGGSALVVEDQATGSSTAAAAAGKIATLSNFLTESTQAEVVKPTTDGGTKSNGLSLPEHVTLWVEGNDVPALEGSTAALEIEDGIEYLDYEDDQATGISRYFAPESAASSRKACRTCGEEGHIAKYCKKLIVGRDKEHSSKRGVKANLDGQTCPQPRGRIGCDRCGSSKHIPQRCPEQFKTYVYLSEEERLQVLKQRESLKSIGFGEGGEGYIAPHIWCYNCGNGGHWGDTPSPRAYLLSLVHSVPSMQVEGHSVNWIIHMDVTEIYPDLLGLMTTPTSKMLVAGARRQT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.2
2 0.19
3 0.18
4 0.18
5 0.18
6 0.17
7 0.19
8 0.21
9 0.13
10 0.13
11 0.14
12 0.16
13 0.2
14 0.25
15 0.29
16 0.32
17 0.38
18 0.39
19 0.44
20 0.47
21 0.51
22 0.51
23 0.51
24 0.53
25 0.52
26 0.52
27 0.46
28 0.43
29 0.36
30 0.3
31 0.28
32 0.21
33 0.18
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.17
38 0.16
39 0.13
40 0.12
41 0.12
42 0.15
43 0.15
44 0.14
45 0.15
46 0.19
47 0.23
48 0.27
49 0.27
50 0.3
51 0.38
52 0.43
53 0.44
54 0.44
55 0.47
56 0.44
57 0.45
58 0.44
59 0.37
60 0.33
61 0.33
62 0.33
63 0.27
64 0.3
65 0.32
66 0.27
67 0.29
68 0.32
69 0.3
70 0.27
71 0.32
72 0.33
73 0.32
74 0.36
75 0.36
76 0.4
77 0.45
78 0.48
79 0.45
80 0.46
81 0.52
82 0.55
83 0.54
84 0.56
85 0.59
86 0.59
87 0.6
88 0.56
89 0.53
90 0.47
91 0.51
92 0.43
93 0.35
94 0.32
95 0.29
96 0.29
97 0.24
98 0.24
99 0.18
100 0.19
101 0.22
102 0.25
103 0.29
104 0.26
105 0.26
106 0.28
107 0.35
108 0.37
109 0.42
110 0.46
111 0.48
112 0.57
113 0.66
114 0.72
115 0.74
116 0.8
117 0.8
118 0.8
119 0.78
120 0.77
121 0.73
122 0.74
123 0.74
124 0.74
125 0.71
126 0.73
127 0.77
128 0.73
129 0.76
130 0.76
131 0.77
132 0.75
133 0.73
134 0.7
135 0.66
136 0.64
137 0.57
138 0.49
139 0.42
140 0.34
141 0.33
142 0.3
143 0.28
144 0.24
145 0.25
146 0.26
147 0.27
148 0.27
149 0.3
150 0.3
151 0.31
152 0.33
153 0.38
154 0.45
155 0.5
156 0.57
157 0.59
158 0.62
159 0.65
160 0.64
161 0.59
162 0.53
163 0.44
164 0.4
165 0.35
166 0.27
167 0.23
168 0.22
169 0.19
170 0.16
171 0.15
172 0.11
173 0.07
174 0.07
175 0.06
176 0.06
177 0.06
178 0.07
179 0.06
180 0.07
181 0.07
182 0.07
183 0.07
184 0.08
185 0.09
186 0.08
187 0.1
188 0.1
189 0.11
190 0.13
191 0.13
192 0.14
193 0.14
194 0.13
195 0.11
196 0.12
197 0.11
198 0.1
199 0.09
200 0.1
201 0.09
202 0.08
203 0.11
204 0.1
205 0.1
206 0.1
207 0.1
208 0.08
209 0.09
210 0.1
211 0.08
212 0.09
213 0.09
214 0.1
215 0.14
216 0.14
217 0.14
218 0.16
219 0.24
220 0.28
221 0.3
222 0.38
223 0.45
224 0.5
225 0.57
226 0.62
227 0.61
228 0.58
229 0.59
230 0.5
231 0.43
232 0.46
233 0.4
234 0.34
235 0.28
236 0.25
237 0.22
238 0.22
239 0.19
240 0.13
241 0.12
242 0.11
243 0.1
244 0.15
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.14
249 0.16
250 0.15
251 0.14
252 0.09
253 0.08
254 0.08
255 0.07
256 0.06
257 0.03
258 0.03
259 0.03
260 0.03
261 0.02
262 0.02
263 0.02
264 0.03
265 0.03
266 0.04
267 0.04
268 0.04
269 0.04
270 0.04
271 0.04
272 0.04
273 0.03
274 0.03
275 0.03
276 0.03
277 0.03
278 0.03
279 0.03
280 0.04
281 0.05
282 0.05
283 0.05
284 0.06
285 0.06
286 0.07
287 0.07
288 0.07
289 0.09
290 0.09
291 0.09
292 0.1
293 0.1
294 0.1
295 0.09
296 0.08
297 0.08
298 0.09
299 0.1
300 0.1
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.15
307 0.15
308 0.15
309 0.15
310 0.15
311 0.15
312 0.13
313 0.13
314 0.11
315 0.12
316 0.1
317 0.07
318 0.06
319 0.07
320 0.07
321 0.07
322 0.06
323 0.05
324 0.05
325 0.04
326 0.04
327 0.03
328 0.03
329 0.03
330 0.03
331 0.03
332 0.03
333 0.03
334 0.03
335 0.03
336 0.03
337 0.03
338 0.03
339 0.03
340 0.04
341 0.04
342 0.03
343 0.04
344 0.04
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.05
349 0.05
350 0.06
351 0.06
352 0.06
353 0.08
354 0.09
355 0.09
356 0.1
357 0.1
358 0.13
359 0.17
360 0.2
361 0.19
362 0.21
363 0.24
364 0.29
365 0.3
366 0.28
367 0.27
368 0.3
369 0.33
370 0.35
371 0.36
372 0.37
373 0.36
374 0.39
375 0.41
376 0.38
377 0.36
378 0.35
379 0.32
380 0.27
381 0.28
382 0.28
383 0.32
384 0.41
385 0.47
386 0.47
387 0.52
388 0.55
389 0.59
390 0.6
391 0.54
392 0.5
393 0.51
394 0.52
395 0.53
396 0.51
397 0.49
398 0.5
399 0.54
400 0.53
401 0.46
402 0.41
403 0.36
404 0.44
405 0.42
406 0.37
407 0.33
408 0.3
409 0.31
410 0.37
411 0.4
412 0.41
413 0.44
414 0.5
415 0.5
416 0.5
417 0.49
418 0.46
419 0.47
420 0.44
421 0.48
422 0.48
423 0.53
424 0.53
425 0.56
426 0.64
427 0.66
428 0.68
429 0.63
430 0.61
431 0.58
432 0.57
433 0.57
434 0.47
435 0.42
436 0.35
437 0.34
438 0.28
439 0.27
440 0.25
441 0.21
442 0.2
443 0.18
444 0.16
445 0.21
446 0.24
447 0.24
448 0.29
449 0.35
450 0.36
451 0.4
452 0.42
453 0.37
454 0.37
455 0.35
456 0.3
457 0.24
458 0.21
459 0.18
460 0.16
461 0.14
462 0.1
463 0.08
464 0.07
465 0.07
466 0.08
467 0.06
468 0.07
469 0.08
470 0.09
471 0.12
472 0.14
473 0.17
474 0.21
475 0.21
476 0.22
477 0.27
478 0.29
479 0.29
480 0.27
481 0.26
482 0.26
483 0.28
484 0.3
485 0.25
486 0.24
487 0.22
488 0.22
489 0.2
490 0.21
491 0.21
492 0.21
493 0.22
494 0.21
495 0.21
496 0.2
497 0.2
498 0.16
499 0.15
500 0.11
501 0.09
502 0.1
503 0.12
504 0.14
505 0.14
506 0.16
507 0.15
508 0.14
509 0.15
510 0.15
511 0.12
512 0.12
513 0.12
514 0.11
515 0.11
516 0.12
517 0.11
518 0.11
519 0.1
520 0.09
521 0.08
522 0.07
523 0.06
524 0.06
525 0.05
526 0.06
527 0.07
528 0.08
529 0.09
530 0.1
531 0.11
532 0.11
533 0.11
534 0.13
535 0.19
536 0.23