Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

F4R3W5

Protein Details
Accession F4R3W5    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-35EEIKIQTKDLRPKKSRTQAWDGWRPGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
71-74RKIR
Subcellular Location(s) nucl 14.5, cyto_nucl 11.333, cyto 7, cyto_pero 5.833, pero 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR045245  Pfs2-like  
IPR015943  WD40/YVTN_repeat-like_dom_sf  
IPR001680  WD40_repeat  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005847  C:mRNA cleavage and polyadenylation specificity factor complex  
GO:0098789  P:pre-mRNA cleavage required for polyadenylation  
KEGG mlr:MELLADRAFT_32275  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00400  WD40  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50082  WD_REPEATS_2  
PS50294  WD_REPEATS_REGION  
CDD cd00200  WD40  
Amino Acid Sequences MTDTTNSTPEEIKIQTKDLRPKKSRTQAWDGWRPGPYGPPSAPSMERRIAEESALEMAAISGHGRQDGRARKIRPRRTVDIGGSMARWNLMRSLKTCADEHYFIRPCIDHLVEFLPPQAYPRNPSTSILTKYVHTSTNKVRCPINIVRFTPDARRVLTGATSGEFTLWNALTFNFETILQAHDTAVRAVDWAKSGSWLVSGDNAGMIKYFQPNMNNLQVFEGHKDSVRDISFSPNDSRFVSCGDDGLIKLWGFEERREERNLVGHGWDVRCVKWHPTKGLLCSGGKDSLVKFWDPRSAKCLATLHGHKSSVQACAWNPNGHIVATGSRDQLIKVFDIRMMKELVALRGHKKEVCSLTWHPIHHDILTSGGSDGTILYWCLPESEPVDELEFAHDGCVWALDYHPLGHTLVSGSNDHTTRFWSRGRPGIKIANDKFHIGKEQAAMGRDLAAGKMKWKTPQSKGGGGGGGGGGGGGRGMSRWSTNINIGGADVTGELDEFGREIPPQNKDTGKNW
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.34
2 0.39
3 0.45
4 0.55
5 0.59
6 0.66
7 0.68
8 0.74
9 0.79
10 0.82
11 0.83
12 0.81
13 0.81
14 0.79
15 0.81
16 0.82
17 0.76
18 0.71
19 0.65
20 0.58
21 0.49
22 0.48
23 0.42
24 0.38
25 0.35
26 0.33
27 0.33
28 0.35
29 0.39
30 0.36
31 0.39
32 0.38
33 0.38
34 0.38
35 0.4
36 0.36
37 0.32
38 0.28
39 0.23
40 0.19
41 0.18
42 0.14
43 0.09
44 0.08
45 0.08
46 0.07
47 0.06
48 0.06
49 0.07
50 0.1
51 0.1
52 0.12
53 0.21
54 0.3
55 0.38
56 0.45
57 0.49
58 0.57
59 0.68
60 0.76
61 0.78
62 0.77
63 0.76
64 0.76
65 0.79
66 0.71
67 0.67
68 0.6
69 0.5
70 0.43
71 0.36
72 0.28
73 0.22
74 0.19
75 0.13
76 0.16
77 0.19
78 0.21
79 0.22
80 0.3
81 0.33
82 0.35
83 0.35
84 0.34
85 0.35
86 0.35
87 0.35
88 0.38
89 0.37
90 0.34
91 0.36
92 0.32
93 0.27
94 0.29
95 0.29
96 0.19
97 0.18
98 0.2
99 0.18
100 0.18
101 0.18
102 0.14
103 0.12
104 0.14
105 0.18
106 0.18
107 0.21
108 0.26
109 0.31
110 0.32
111 0.34
112 0.37
113 0.39
114 0.41
115 0.4
116 0.37
117 0.31
118 0.33
119 0.34
120 0.34
121 0.28
122 0.3
123 0.35
124 0.44
125 0.46
126 0.45
127 0.44
128 0.4
129 0.46
130 0.49
131 0.48
132 0.46
133 0.45
134 0.46
135 0.47
136 0.48
137 0.46
138 0.43
139 0.37
140 0.3
141 0.3
142 0.26
143 0.25
144 0.24
145 0.19
146 0.14
147 0.12
148 0.11
149 0.1
150 0.1
151 0.09
152 0.08
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.08
157 0.08
158 0.1
159 0.1
160 0.11
161 0.09
162 0.08
163 0.09
164 0.09
165 0.1
166 0.08
167 0.08
168 0.08
169 0.09
170 0.1
171 0.09
172 0.09
173 0.07
174 0.07
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.09
184 0.08
185 0.08
186 0.08
187 0.08
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.06
192 0.06
193 0.06
194 0.06
195 0.08
196 0.09
197 0.1
198 0.12
199 0.14
200 0.18
201 0.24
202 0.23
203 0.21
204 0.21
205 0.21
206 0.21
207 0.21
208 0.18
209 0.13
210 0.14
211 0.14
212 0.14
213 0.16
214 0.15
215 0.14
216 0.13
217 0.19
218 0.19
219 0.2
220 0.23
221 0.2
222 0.21
223 0.21
224 0.21
225 0.16
226 0.16
227 0.16
228 0.13
229 0.12
230 0.11
231 0.1
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.09
239 0.09
240 0.1
241 0.17
242 0.19
243 0.22
244 0.24
245 0.25
246 0.22
247 0.26
248 0.26
249 0.19
250 0.16
251 0.14
252 0.15
253 0.15
254 0.17
255 0.14
256 0.13
257 0.16
258 0.17
259 0.23
260 0.27
261 0.3
262 0.29
263 0.36
264 0.38
265 0.38
266 0.41
267 0.37
268 0.3
269 0.28
270 0.27
271 0.21
272 0.19
273 0.17
274 0.13
275 0.13
276 0.15
277 0.14
278 0.13
279 0.14
280 0.22
281 0.23
282 0.23
283 0.23
284 0.25
285 0.24
286 0.27
287 0.27
288 0.21
289 0.26
290 0.29
291 0.3
292 0.31
293 0.31
294 0.27
295 0.29
296 0.29
297 0.25
298 0.22
299 0.19
300 0.17
301 0.22
302 0.25
303 0.22
304 0.21
305 0.21
306 0.21
307 0.18
308 0.18
309 0.13
310 0.12
311 0.13
312 0.15
313 0.12
314 0.13
315 0.13
316 0.13
317 0.15
318 0.14
319 0.12
320 0.12
321 0.12
322 0.14
323 0.16
324 0.17
325 0.16
326 0.16
327 0.15
328 0.17
329 0.18
330 0.18
331 0.19
332 0.21
333 0.23
334 0.26
335 0.28
336 0.26
337 0.26
338 0.3
339 0.3
340 0.29
341 0.32
342 0.31
343 0.36
344 0.39
345 0.38
346 0.35
347 0.37
348 0.36
349 0.3
350 0.28
351 0.2
352 0.18
353 0.18
354 0.15
355 0.1
356 0.08
357 0.08
358 0.07
359 0.06
360 0.05
361 0.05
362 0.05
363 0.05
364 0.06
365 0.06
366 0.08
367 0.08
368 0.1
369 0.11
370 0.13
371 0.13
372 0.14
373 0.15
374 0.14
375 0.14
376 0.14
377 0.12
378 0.1
379 0.09
380 0.09
381 0.08
382 0.07
383 0.08
384 0.06
385 0.06
386 0.07
387 0.08
388 0.09
389 0.09
390 0.1
391 0.1
392 0.1
393 0.1
394 0.1
395 0.09
396 0.11
397 0.12
398 0.12
399 0.13
400 0.17
401 0.18
402 0.19
403 0.18
404 0.2
405 0.22
406 0.25
407 0.27
408 0.3
409 0.35
410 0.42
411 0.45
412 0.44
413 0.47
414 0.51
415 0.53
416 0.57
417 0.55
418 0.55
419 0.54
420 0.53
421 0.49
422 0.43
423 0.41
424 0.32
425 0.31
426 0.24
427 0.28
428 0.28
429 0.27
430 0.26
431 0.21
432 0.21
433 0.19
434 0.18
435 0.13
436 0.15
437 0.14
438 0.18
439 0.23
440 0.24
441 0.31
442 0.39
443 0.47
444 0.5
445 0.59
446 0.61
447 0.62
448 0.62
449 0.59
450 0.51
451 0.42
452 0.36
453 0.26
454 0.19
455 0.12
456 0.09
457 0.05
458 0.04
459 0.04
460 0.03
461 0.03
462 0.03
463 0.05
464 0.07
465 0.09
466 0.11
467 0.15
468 0.18
469 0.22
470 0.25
471 0.24
472 0.23
473 0.21
474 0.2
475 0.16
476 0.13
477 0.1
478 0.07
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.06
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.07
487 0.09
488 0.15
489 0.21
490 0.27
491 0.29
492 0.35
493 0.41