Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8X2A9

Protein Details
Accession L8X2A9    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
245-268AGQKTKVKRKKASSLRQRNKNSLFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
249-271TKVKRKKASSLRQRNKNSLFRKR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 12.5, cyto 10.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039766  Vps53  
IPR038260  Vps53_C_sf  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Amino Acid Sequences MIPSAQGATRGDLVVGLEAAAEKASSIGGGGAKKGLALGSLSRKTEEPENKAGVPVLTVSLLVESLAQTREFENAMAKKFGVSFKELVEGVPLPGGTGQTLSSAFGKHMSVFVDAQDKLISDLLASHRGTNARSSLDATTTPSDPDTPAPSLLPSSTELFFAIGTGMDECLKLGGEGVMKLMCAMYKKWLKVYAGGWGLWGECDDLYHAYRSGQERKSIDTRFNPSEIQKLCIVLNTADYCQTTAGQKTKVKRKKASSLRQRNKNSLFRKRRCPLLLPGLTFRRVISTCLTLLLRELDNTTDPSFQTLLKFNWGSIDTVTGPSAWVEELGTATASVSQVIHDKIEPKKYVRSFCDRASNALVTRFTNALVKSRPIKGLGGEQLLLDLQSFKSSLLKIPGSGASTESMYARNVTKNISRLETLLKVIITPVVSARDDEAWITHLIQRSSPNVGAPLQVLDLKGTPKAEQNTLLDTLLTITSTRTELGSESFLTTLDMDPGSTSASSTTEADAPRTTETRREVFSDLRKLVSFTMRRERDKTVSGT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.13
2 0.11
3 0.08
4 0.07
5 0.07
6 0.07
7 0.06
8 0.05
9 0.04
10 0.05
11 0.05
12 0.04
13 0.04
14 0.06
15 0.1
16 0.11
17 0.12
18 0.13
19 0.13
20 0.13
21 0.13
22 0.11
23 0.09
24 0.09
25 0.14
26 0.22
27 0.27
28 0.28
29 0.3
30 0.3
31 0.33
32 0.41
33 0.44
34 0.42
35 0.44
36 0.48
37 0.47
38 0.47
39 0.45
40 0.35
41 0.27
42 0.21
43 0.15
44 0.1
45 0.1
46 0.09
47 0.08
48 0.07
49 0.07
50 0.06
51 0.06
52 0.08
53 0.1
54 0.1
55 0.1
56 0.11
57 0.13
58 0.13
59 0.13
60 0.19
61 0.22
62 0.25
63 0.25
64 0.25
65 0.24
66 0.26
67 0.3
68 0.25
69 0.25
70 0.23
71 0.23
72 0.27
73 0.25
74 0.22
75 0.21
76 0.19
77 0.15
78 0.14
79 0.13
80 0.1
81 0.1
82 0.1
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.08
87 0.08
88 0.1
89 0.1
90 0.1
91 0.1
92 0.12
93 0.12
94 0.11
95 0.13
96 0.13
97 0.14
98 0.14
99 0.15
100 0.18
101 0.17
102 0.18
103 0.17
104 0.15
105 0.14
106 0.14
107 0.13
108 0.07
109 0.1
110 0.12
111 0.17
112 0.17
113 0.17
114 0.19
115 0.21
116 0.22
117 0.22
118 0.22
119 0.18
120 0.19
121 0.2
122 0.19
123 0.19
124 0.19
125 0.19
126 0.19
127 0.18
128 0.18
129 0.16
130 0.16
131 0.15
132 0.17
133 0.17
134 0.16
135 0.16
136 0.16
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.14
141 0.12
142 0.13
143 0.13
144 0.13
145 0.13
146 0.12
147 0.12
148 0.1
149 0.08
150 0.05
151 0.05
152 0.05
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.05
161 0.06
162 0.06
163 0.06
164 0.07
165 0.07
166 0.07
167 0.07
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.08
172 0.15
173 0.2
174 0.22
175 0.25
176 0.29
177 0.29
178 0.32
179 0.32
180 0.3
181 0.27
182 0.26
183 0.23
184 0.19
185 0.18
186 0.14
187 0.13
188 0.07
189 0.05
190 0.05
191 0.06
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.13
198 0.18
199 0.25
200 0.26
201 0.3
202 0.31
203 0.35
204 0.42
205 0.4
206 0.41
207 0.38
208 0.42
209 0.39
210 0.39
211 0.37
212 0.31
213 0.36
214 0.32
215 0.29
216 0.23
217 0.22
218 0.2
219 0.19
220 0.19
221 0.11
222 0.13
223 0.12
224 0.11
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.12
232 0.15
233 0.19
234 0.23
235 0.3
236 0.4
237 0.47
238 0.54
239 0.59
240 0.62
241 0.67
242 0.74
243 0.78
244 0.78
245 0.82
246 0.83
247 0.86
248 0.83
249 0.81
250 0.78
251 0.77
252 0.75
253 0.74
254 0.76
255 0.72
256 0.77
257 0.72
258 0.72
259 0.65
260 0.6
261 0.55
262 0.54
263 0.52
264 0.43
265 0.44
266 0.39
267 0.38
268 0.33
269 0.28
270 0.21
271 0.18
272 0.18
273 0.15
274 0.15
275 0.14
276 0.15
277 0.15
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.1
282 0.08
283 0.09
284 0.08
285 0.09
286 0.11
287 0.11
288 0.11
289 0.1
290 0.12
291 0.12
292 0.12
293 0.13
294 0.14
295 0.14
296 0.17
297 0.17
298 0.15
299 0.17
300 0.18
301 0.16
302 0.13
303 0.15
304 0.11
305 0.11
306 0.12
307 0.09
308 0.08
309 0.07
310 0.08
311 0.05
312 0.05
313 0.04
314 0.04
315 0.04
316 0.04
317 0.04
318 0.04
319 0.04
320 0.05
321 0.05
322 0.05
323 0.05
324 0.05
325 0.08
326 0.08
327 0.09
328 0.09
329 0.14
330 0.18
331 0.25
332 0.28
333 0.28
334 0.36
335 0.41
336 0.47
337 0.47
338 0.52
339 0.49
340 0.5
341 0.57
342 0.49
343 0.47
344 0.45
345 0.41
346 0.34
347 0.33
348 0.3
349 0.21
350 0.22
351 0.19
352 0.16
353 0.17
354 0.17
355 0.18
356 0.19
357 0.23
358 0.25
359 0.28
360 0.29
361 0.27
362 0.28
363 0.25
364 0.28
365 0.28
366 0.25
367 0.22
368 0.2
369 0.19
370 0.17
371 0.16
372 0.1
373 0.07
374 0.05
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.09
379 0.1
380 0.13
381 0.17
382 0.18
383 0.17
384 0.19
385 0.21
386 0.2
387 0.19
388 0.18
389 0.13
390 0.13
391 0.13
392 0.12
393 0.11
394 0.1
395 0.12
396 0.13
397 0.15
398 0.16
399 0.19
400 0.22
401 0.26
402 0.29
403 0.3
404 0.28
405 0.27
406 0.3
407 0.29
408 0.26
409 0.22
410 0.19
411 0.16
412 0.16
413 0.16
414 0.12
415 0.1
416 0.1
417 0.12
418 0.12
419 0.13
420 0.14
421 0.13
422 0.14
423 0.13
424 0.13
425 0.11
426 0.12
427 0.13
428 0.15
429 0.17
430 0.18
431 0.2
432 0.22
433 0.23
434 0.27
435 0.26
436 0.24
437 0.22
438 0.23
439 0.21
440 0.19
441 0.17
442 0.13
443 0.14
444 0.13
445 0.12
446 0.13
447 0.13
448 0.15
449 0.16
450 0.16
451 0.21
452 0.25
453 0.26
454 0.29
455 0.3
456 0.32
457 0.32
458 0.31
459 0.24
460 0.2
461 0.19
462 0.14
463 0.13
464 0.09
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.1
469 0.09
470 0.1
471 0.1
472 0.13
473 0.15
474 0.14
475 0.15
476 0.14
477 0.14
478 0.14
479 0.14
480 0.12
481 0.12
482 0.11
483 0.1
484 0.1
485 0.1
486 0.11
487 0.1
488 0.1
489 0.08
490 0.1
491 0.12
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.17
496 0.2
497 0.21
498 0.21
499 0.24
500 0.26
501 0.26
502 0.29
503 0.34
504 0.36
505 0.37
506 0.39
507 0.39
508 0.44
509 0.51
510 0.54
511 0.5
512 0.48
513 0.46
514 0.44
515 0.44
516 0.45
517 0.42
518 0.4
519 0.49
520 0.54
521 0.59
522 0.62
523 0.66
524 0.62