Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

L8WX38

Protein Details
Accession L8WX38    Localization Confidence Low Confidence Score 8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
86-112VDDGEKGKGKQKEKKGKNKAKDVSYSWBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
91-106KGKGKQKEKKGKNKAK
Subcellular Location(s) plas 11, mito 9, cyto 3.5, cyto_nucl 2.5, E.R. 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007198  Ssl1-like  
IPR012170  TFIIH_SSL1/p44  
IPR002035  VWF_A  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0000439  C:transcription factor TFIIH core complex  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF04056  Ssl1  
Amino Acid Sequences MKVINLHASPGIDFRRRSTSICYPEIPRLVVNRQSRAHTLKAPNAPTTSRDSPLTMAPRDDVSSGSEAGMEEDSDVEYTEKNNGAVDDGEKGKGKQKEKKGKNKAKDVSYSWEANYVRSWDQVQEDEGGNLAHSVEDLIARKRRQRLLGPSSAIRRAIIRHLVLLIDLSAAMADRDLRPTRFELALDCARAFVVEWCEQNPLGQIGVVGMRAGIGERIVEMTGNPHDVLRAIADKRKLEPAGEPSLQNAIEVARAGMRHVRLTREEIVIIFGSLTTCDPGDIYETLDSCVKDKIRISLVALAAEMKICKELCEKTEGSFGVALNEGHFKDLLFEHIPPPAHRAARTGNDKIPSSQTGKANPLNPNADLMLMGFPTRLPPTSAPALCVCHPSRMRAEGFLCPRCSAKLCEVPTDCDVCGLMVVSSPHLARSYHHLFPVGAYTAINEIGPDDTPSATCQGCTTPFRTDAPHSVPAGANDGISHLGRYRCPKFREVCCIIQLGEKTSPKNGPVDRDVTVCRSKSLRLVRARRPTRQGNDLETRACRHCAAGQRELRQDFRTGVGNCVEYGSGLGRIMNKGQRTFSQRRRRPTRIWIRTTLVSPLPLVAHLSPFSTLVLSTTMIARTLALALGAVLPLVAFAGNVTEGGSCSQSNTYLTPGSYQLNTDCDSRTYCNSGGTCAKKQCRKDDSELIARQSATTMWLSRTYLKCAPLANSDDCQNVLSVGSSCQLNRDDECEPAPDTSLSTPDNHRGAICLNYQCMCVFASGSWQNVTVGQPCVVENIAYIAYSTEGEFINIVSRGNCRHGLYCDAAQKICIATQDFGAACTADKECTSGNCLDNLTCGVSTDAPRKLGAWVYAVVAIAIVGGADSHTHLNMPR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.33
2 0.4
3 0.41
4 0.43
5 0.46
6 0.49
7 0.51
8 0.54
9 0.55
10 0.51
11 0.56
12 0.57
13 0.5
14 0.43
15 0.41
16 0.43
17 0.47
18 0.5
19 0.5
20 0.5
21 0.53
22 0.57
23 0.57
24 0.55
25 0.55
26 0.56
27 0.57
28 0.61
29 0.61
30 0.58
31 0.57
32 0.53
33 0.47
34 0.48
35 0.44
36 0.39
37 0.37
38 0.34
39 0.33
40 0.38
41 0.42
42 0.35
43 0.32
44 0.31
45 0.31
46 0.31
47 0.29
48 0.23
49 0.19
50 0.19
51 0.18
52 0.16
53 0.15
54 0.13
55 0.14
56 0.14
57 0.1
58 0.08
59 0.08
60 0.09
61 0.08
62 0.09
63 0.08
64 0.08
65 0.09
66 0.13
67 0.14
68 0.13
69 0.14
70 0.14
71 0.15
72 0.16
73 0.16
74 0.17
75 0.17
76 0.2
77 0.21
78 0.22
79 0.28
80 0.34
81 0.42
82 0.46
83 0.56
84 0.64
85 0.73
86 0.83
87 0.87
88 0.9
89 0.91
90 0.93
91 0.9
92 0.86
93 0.83
94 0.76
95 0.73
96 0.67
97 0.6
98 0.49
99 0.49
100 0.41
101 0.35
102 0.33
103 0.29
104 0.25
105 0.25
106 0.26
107 0.21
108 0.24
109 0.24
110 0.23
111 0.22
112 0.21
113 0.19
114 0.18
115 0.15
116 0.12
117 0.1
118 0.09
119 0.06
120 0.05
121 0.05
122 0.05
123 0.08
124 0.11
125 0.17
126 0.24
127 0.28
128 0.35
129 0.43
130 0.49
131 0.53
132 0.6
133 0.64
134 0.66
135 0.7
136 0.68
137 0.65
138 0.64
139 0.6
140 0.52
141 0.42
142 0.35
143 0.3
144 0.32
145 0.32
146 0.28
147 0.25
148 0.25
149 0.24
150 0.22
151 0.2
152 0.14
153 0.08
154 0.07
155 0.05
156 0.04
157 0.04
158 0.04
159 0.04
160 0.06
161 0.06
162 0.13
163 0.17
164 0.18
165 0.2
166 0.23
167 0.27
168 0.26
169 0.26
170 0.22
171 0.25
172 0.28
173 0.27
174 0.24
175 0.21
176 0.19
177 0.19
178 0.17
179 0.13
180 0.14
181 0.16
182 0.17
183 0.18
184 0.21
185 0.2
186 0.2
187 0.19
188 0.15
189 0.12
190 0.11
191 0.09
192 0.08
193 0.09
194 0.08
195 0.06
196 0.05
197 0.05
198 0.05
199 0.05
200 0.04
201 0.04
202 0.04
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.05
207 0.05
208 0.08
209 0.09
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.1
214 0.1
215 0.11
216 0.1
217 0.14
218 0.14
219 0.19
220 0.24
221 0.25
222 0.27
223 0.33
224 0.32
225 0.28
226 0.3
227 0.32
228 0.34
229 0.34
230 0.32
231 0.27
232 0.29
233 0.28
234 0.23
235 0.17
236 0.1
237 0.09
238 0.09
239 0.08
240 0.07
241 0.07
242 0.08
243 0.11
244 0.12
245 0.17
246 0.18
247 0.22
248 0.23
249 0.28
250 0.3
251 0.28
252 0.27
253 0.23
254 0.23
255 0.19
256 0.16
257 0.11
258 0.08
259 0.07
260 0.07
261 0.07
262 0.05
263 0.05
264 0.05
265 0.05
266 0.05
267 0.08
268 0.08
269 0.09
270 0.1
271 0.1
272 0.11
273 0.14
274 0.14
275 0.12
276 0.16
277 0.15
278 0.17
279 0.18
280 0.21
281 0.22
282 0.23
283 0.24
284 0.25
285 0.25
286 0.22
287 0.2
288 0.17
289 0.13
290 0.13
291 0.11
292 0.06
293 0.07
294 0.07
295 0.08
296 0.12
297 0.14
298 0.15
299 0.2
300 0.21
301 0.2
302 0.25
303 0.24
304 0.21
305 0.21
306 0.19
307 0.15
308 0.15
309 0.13
310 0.1
311 0.12
312 0.11
313 0.1
314 0.1
315 0.08
316 0.09
317 0.09
318 0.12
319 0.11
320 0.12
321 0.12
322 0.16
323 0.17
324 0.16
325 0.19
326 0.2
327 0.2
328 0.2
329 0.22
330 0.23
331 0.3
332 0.36
333 0.35
334 0.34
335 0.36
336 0.36
337 0.35
338 0.33
339 0.29
340 0.27
341 0.28
342 0.28
343 0.28
344 0.33
345 0.34
346 0.37
347 0.37
348 0.38
349 0.35
350 0.32
351 0.29
352 0.24
353 0.21
354 0.15
355 0.12
356 0.08
357 0.06
358 0.06
359 0.05
360 0.04
361 0.06
362 0.07
363 0.07
364 0.09
365 0.09
366 0.13
367 0.19
368 0.2
369 0.2
370 0.2
371 0.22
372 0.2
373 0.25
374 0.22
375 0.23
376 0.24
377 0.25
378 0.26
379 0.28
380 0.28
381 0.26
382 0.27
383 0.26
384 0.31
385 0.32
386 0.3
387 0.27
388 0.27
389 0.25
390 0.25
391 0.22
392 0.21
393 0.25
394 0.25
395 0.3
396 0.3
397 0.32
398 0.32
399 0.31
400 0.25
401 0.18
402 0.17
403 0.11
404 0.1
405 0.07
406 0.05
407 0.04
408 0.04
409 0.05
410 0.06
411 0.06
412 0.06
413 0.07
414 0.07
415 0.07
416 0.15
417 0.2
418 0.2
419 0.21
420 0.21
421 0.2
422 0.2
423 0.22
424 0.14
425 0.09
426 0.08
427 0.07
428 0.07
429 0.07
430 0.07
431 0.05
432 0.04
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.05
438 0.06
439 0.06
440 0.08
441 0.08
442 0.08
443 0.08
444 0.08
445 0.11
446 0.13
447 0.15
448 0.15
449 0.17
450 0.18
451 0.2
452 0.21
453 0.23
454 0.26
455 0.27
456 0.25
457 0.25
458 0.24
459 0.22
460 0.23
461 0.18
462 0.13
463 0.09
464 0.1
465 0.09
466 0.09
467 0.09
468 0.08
469 0.09
470 0.12
471 0.18
472 0.23
473 0.3
474 0.33
475 0.39
476 0.43
477 0.46
478 0.53
479 0.52
480 0.49
481 0.44
482 0.42
483 0.36
484 0.32
485 0.28
486 0.22
487 0.21
488 0.2
489 0.2
490 0.22
491 0.22
492 0.21
493 0.26
494 0.25
495 0.24
496 0.25
497 0.28
498 0.26
499 0.27
500 0.27
501 0.25
502 0.28
503 0.24
504 0.22
505 0.2
506 0.21
507 0.26
508 0.32
509 0.36
510 0.41
511 0.49
512 0.56
513 0.66
514 0.71
515 0.69
516 0.69
517 0.7
518 0.65
519 0.65
520 0.59
521 0.55
522 0.55
523 0.51
524 0.47
525 0.39
526 0.38
527 0.32
528 0.3
529 0.23
530 0.18
531 0.2
532 0.27
533 0.31
534 0.36
535 0.39
536 0.43
537 0.48
538 0.5
539 0.48
540 0.41
541 0.37
542 0.29
543 0.26
544 0.28
545 0.23
546 0.23
547 0.22
548 0.21
549 0.19
550 0.18
551 0.17
552 0.09
553 0.09
554 0.08
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.09
560 0.12
561 0.16
562 0.18
563 0.19
564 0.21
565 0.25
566 0.33
567 0.41
568 0.48
569 0.56
570 0.59
571 0.68
572 0.76
573 0.79
574 0.77
575 0.79
576 0.8
577 0.79
578 0.78
579 0.73
580 0.68
581 0.63
582 0.57
583 0.5
584 0.39
585 0.3
586 0.23
587 0.19
588 0.15
589 0.12
590 0.13
591 0.1
592 0.1
593 0.1
594 0.1
595 0.1
596 0.1
597 0.1
598 0.08
599 0.07
600 0.07
601 0.07
602 0.07
603 0.07
604 0.08
605 0.08
606 0.08
607 0.08
608 0.07
609 0.07
610 0.07
611 0.06
612 0.05
613 0.04
614 0.04
615 0.04
616 0.04
617 0.03
618 0.03
619 0.03
620 0.03
621 0.03
622 0.02
623 0.02
624 0.02
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.04
630 0.05
631 0.06
632 0.08
633 0.07
634 0.08
635 0.09
636 0.1
637 0.11
638 0.12
639 0.13
640 0.13
641 0.14
642 0.14
643 0.16
644 0.17
645 0.16
646 0.16
647 0.15
648 0.16
649 0.18
650 0.18
651 0.17
652 0.16
653 0.19
654 0.2
655 0.22
656 0.24
657 0.23
658 0.26
659 0.26
660 0.28
661 0.33
662 0.36
663 0.39
664 0.43
665 0.51
666 0.53
667 0.6
668 0.65
669 0.66
670 0.67
671 0.69
672 0.7
673 0.68
674 0.71
675 0.68
676 0.61
677 0.55
678 0.48
679 0.4
680 0.31
681 0.24
682 0.17
683 0.15
684 0.14
685 0.13
686 0.16
687 0.18
688 0.25
689 0.27
690 0.31
691 0.33
692 0.33
693 0.34
694 0.33
695 0.35
696 0.33
697 0.36
698 0.33
699 0.31
700 0.31
701 0.29
702 0.27
703 0.25
704 0.19
705 0.14
706 0.11
707 0.1
708 0.09
709 0.09
710 0.1
711 0.11
712 0.11
713 0.14
714 0.16
715 0.18
716 0.18
717 0.22
718 0.21
719 0.22
720 0.23
721 0.22
722 0.21
723 0.19
724 0.2
725 0.16
726 0.16
727 0.15
728 0.18
729 0.16
730 0.18
731 0.21
732 0.26
733 0.27
734 0.26
735 0.25
736 0.23
737 0.24
738 0.25
739 0.27
740 0.23
741 0.24
742 0.24
743 0.25
744 0.23
745 0.22
746 0.19
747 0.14
748 0.12
749 0.09
750 0.16
751 0.18
752 0.19
753 0.19
754 0.19
755 0.19
756 0.21
757 0.23
758 0.18
759 0.18
760 0.17
761 0.17
762 0.17
763 0.18
764 0.17
765 0.14
766 0.11
767 0.11
768 0.1
769 0.09
770 0.09
771 0.08
772 0.08
773 0.09
774 0.09
775 0.08
776 0.08
777 0.09
778 0.09
779 0.09
780 0.11
781 0.11
782 0.12
783 0.11
784 0.15
785 0.18
786 0.22
787 0.26
788 0.25
789 0.29
790 0.32
791 0.36
792 0.38
793 0.4
794 0.42
795 0.41
796 0.38
797 0.34
798 0.33
799 0.28
800 0.25
801 0.22
802 0.19
803 0.16
804 0.17
805 0.21
806 0.19
807 0.19
808 0.18
809 0.15
810 0.12
811 0.14
812 0.14
813 0.12
814 0.12
815 0.13
816 0.14
817 0.16
818 0.21
819 0.23
820 0.23
821 0.25
822 0.26
823 0.24
824 0.24
825 0.24
826 0.21
827 0.16
828 0.16
829 0.15
830 0.17
831 0.21
832 0.26
833 0.29
834 0.28
835 0.28
836 0.28
837 0.29
838 0.3
839 0.28
840 0.24
841 0.21
842 0.21
843 0.22
844 0.21
845 0.17
846 0.13
847 0.11
848 0.07
849 0.06
850 0.04
851 0.02
852 0.02
853 0.03
854 0.04
855 0.06
856 0.07
857 0.08