FuNGI

L8X0V0

Protein Details

Accession

L8X0V0

Localization Confidence

High

Confidence Score

26.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-31	MSRPLKRIPIPEPKRRRPPPKDSTPKRETSA	Basic
133-153	EDDPKGKKKAKEDPNAKKKAF	Basic
510-534	PATPGASSQKKKKSKHDLVAPNGDP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
6-26	KRIPIPEPKRRRPPPKDSTPK
131-158	KKEDDPKGKKKAKEDPNAKKKAFMKKTR
520-521	KK

Subcellular Location(s)

nucl 23, cyto 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSRPLKRIPIPEPKRRRPPPKDSTPKRETSATPAPATSDGPQGAYVDYKLTSSRHSDKKWDVFKLQSHHDTPIDLHSWPAPVKLNRKDFKSRNQVEEAAGPLIPMLGEDGKPVIGADGKIVMLNADGTRVKKEDDPKGKKKAKEDPNAKKKAFMKKTRQVHMIPDEIRAFRKEHRKDWLLEDNGGGLAANQSWSGKYSDANDKQIYAFFAPVPGNDKEFRFIPVHRFYNFTRNNNVSTERVESQVGDITTDIHRPAYLPPIPKKEEEDEKPTRGGRRLRVVNNGRERYGGEGDYDEMEYEDEVQDDEEGPAELPQDEDEKEAVERQKREYLRNKVSERVEPESDEDEDDGKGYTEDGRQLKKLMKKMLNESDDEKNPYADSVGCLAVTFKMHTQGVRRMMKRMKRRINLSNHQLWELCLTHQHHRVHLHLALKAPSPINLHLSCPNQPRMLPMQTTLHSELLLRLWEDPLCSLNEQHLLILCKRKDHPDRAGTPTPPQKRPTPTPQSPSPATPGASSQKKKKSKHDLVAPNGDPLPEVITEEHAIEYLRKMGGAVQTGEVITYFKRALKHDPENQKRLTDALKKVSSQAQKGYIKLIPQYV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.87
2	0.9
3	0.92
4	0.91
5	0.92
6	0.92
7	0.92
8	0.93
9	0.93
10	0.92
11	0.9
12	0.86
13	0.79
14	0.75
15	0.66
16	0.63
17	0.63
18	0.58
19	0.51
20	0.45
21	0.43
22	0.39
23	0.39
24	0.32
25	0.28
26	0.22
27	0.21
28	0.22
29	0.2
30	0.19
31	0.18
32	0.16
33	0.13
34	0.12
35	0.13
36	0.14
37	0.15
38	0.18
39	0.24
40	0.33
41	0.4
42	0.44
43	0.52
44	0.59
45	0.67
46	0.72
47	0.7
48	0.67
49	0.64
50	0.66
51	0.64
52	0.63
53	0.61
54	0.55
55	0.53
56	0.48
57	0.43
58	0.38
59	0.37
60	0.31
61	0.23
62	0.22
63	0.19
64	0.21
65	0.2
66	0.22
67	0.24
68	0.28
69	0.38
70	0.46
71	0.55
72	0.57
73	0.63
74	0.71
75	0.7
76	0.74
77	0.76
78	0.74
79	0.7
80	0.7
81	0.66
82	0.57
83	0.53
84	0.45
85	0.35
86	0.28
87	0.21
88	0.15
89	0.13
90	0.1
91	0.07
92	0.07
93	0.07
94	0.07
95	0.08
96	0.09
97	0.09
98	0.09
99	0.09
100	0.08
101	0.08
102	0.08
103	0.08
104	0.09
105	0.09
106	0.09
107	0.09
108	0.08
109	0.07
110	0.08
111	0.07
112	0.09
113	0.11
114	0.12
115	0.16
116	0.17
117	0.19
118	0.22
119	0.3
120	0.37
121	0.46
122	0.55
123	0.61
124	0.71
125	0.77
126	0.76
127	0.77
128	0.77
129	0.76
130	0.77
131	0.79
132	0.79
133	0.83
134	0.87
135	0.79
136	0.76
137	0.73
138	0.73
139	0.72
140	0.71
141	0.71
142	0.71
143	0.8
144	0.8
145	0.79
146	0.7
147	0.67
148	0.62
149	0.59
150	0.5
151	0.46
152	0.42
153	0.37
154	0.37
155	0.31
156	0.28
157	0.27
158	0.37
159	0.39
160	0.41
161	0.49
162	0.52
163	0.53
164	0.57
165	0.6
166	0.52
167	0.47
168	0.41
169	0.33
170	0.28
171	0.25
172	0.17
173	0.08
174	0.06
175	0.05
176	0.05
177	0.05
178	0.05
179	0.05
180	0.07
181	0.09
182	0.09
183	0.1
184	0.14
185	0.24
186	0.28
187	0.33
188	0.32
189	0.31
190	0.31
191	0.31
192	0.28
193	0.19
194	0.16
195	0.11
196	0.13
197	0.12
198	0.12
199	0.16
200	0.15
201	0.17
202	0.18
203	0.18
204	0.18
205	0.18
206	0.21
207	0.19
208	0.2
209	0.24
210	0.3
211	0.33
212	0.31
213	0.35
214	0.33
215	0.41
216	0.46
217	0.42
218	0.41
219	0.4
220	0.41
221	0.4
222	0.41
223	0.32
224	0.27
225	0.28
226	0.22
227	0.21
228	0.2
229	0.17
230	0.15
231	0.17
232	0.14
233	0.11
234	0.1
235	0.1
236	0.1
237	0.11
238	0.11
239	0.08
240	0.08
241	0.08
242	0.1
243	0.14
244	0.17
245	0.22
246	0.27
247	0.34
248	0.37
249	0.37
250	0.39
251	0.37
252	0.42
253	0.39
254	0.43
255	0.41
256	0.4
257	0.42
258	0.41
259	0.39
260	0.38
261	0.39
262	0.36
263	0.4
264	0.45
265	0.45
266	0.53
267	0.56
268	0.58
269	0.62
270	0.59
271	0.51
272	0.44
273	0.41
274	0.35
275	0.3
276	0.22
277	0.13
278	0.11
279	0.12
280	0.11
281	0.11
282	0.07
283	0.06
284	0.06
285	0.05
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.04
292	0.05
293	0.05
294	0.04
295	0.04
296	0.04
297	0.04
298	0.05
299	0.05
300	0.04
301	0.05
302	0.06
303	0.06
304	0.07
305	0.07
306	0.07
307	0.08
308	0.11
309	0.14
310	0.18
311	0.19
312	0.21
313	0.29
314	0.31
315	0.39
316	0.45
317	0.5
318	0.54
319	0.61
320	0.6
321	0.59
322	0.59
323	0.56
324	0.51
325	0.46
326	0.38
327	0.31
328	0.31
329	0.27
330	0.25
331	0.21
332	0.16
333	0.12
334	0.11
335	0.11
336	0.08
337	0.06
338	0.06
339	0.06
340	0.07
341	0.07
342	0.13
343	0.16
344	0.18
345	0.19
346	0.22
347	0.27
348	0.31
349	0.36
350	0.39
351	0.41
352	0.43
353	0.5
354	0.56
355	0.52
356	0.49
357	0.47
358	0.44
359	0.41
360	0.4
361	0.33
362	0.25
363	0.23
364	0.21
365	0.18
366	0.13
367	0.11
368	0.09
369	0.09
370	0.08
371	0.08
372	0.08
373	0.08
374	0.09
375	0.09
376	0.07
377	0.11
378	0.12
379	0.13
380	0.18
381	0.24
382	0.32
383	0.39
384	0.39
385	0.43
386	0.5
387	0.57
388	0.63
389	0.67
390	0.68
391	0.68
392	0.74
393	0.75
394	0.78
395	0.79
396	0.76
397	0.73
398	0.64
399	0.59
400	0.52
401	0.43
402	0.36
403	0.28
404	0.21
405	0.19
406	0.21
407	0.25
408	0.33
409	0.34
410	0.35
411	0.37
412	0.39
413	0.37
414	0.38
415	0.35
416	0.29
417	0.31
418	0.28
419	0.26
420	0.27
421	0.23
422	0.22
423	0.21
424	0.2
425	0.23
426	0.22
427	0.24
428	0.27
429	0.3
430	0.33
431	0.36
432	0.38
433	0.34
434	0.34
435	0.36
436	0.36
437	0.37
438	0.32
439	0.3
440	0.31
441	0.3
442	0.36
443	0.34
444	0.28
445	0.24
446	0.23
447	0.21
448	0.17
449	0.17
450	0.12
451	0.1
452	0.11
453	0.11
454	0.12
455	0.11
456	0.12
457	0.13
458	0.13
459	0.13
460	0.14
461	0.17
462	0.17
463	0.16
464	0.18
465	0.19
466	0.22
467	0.3
468	0.29
469	0.31
470	0.34
471	0.43
472	0.49
473	0.54
474	0.6
475	0.6
476	0.66
477	0.68
478	0.72
479	0.65
480	0.64
481	0.66
482	0.65
483	0.61
484	0.59
485	0.59
486	0.6
487	0.66
488	0.68
489	0.69
490	0.7
491	0.71
492	0.74
493	0.73
494	0.68
495	0.62
496	0.57
497	0.49
498	0.42
499	0.36
500	0.34
501	0.35
502	0.42
503	0.45
504	0.5
505	0.57
506	0.65
507	0.71
508	0.77
509	0.79
510	0.8
511	0.84
512	0.85
513	0.85
514	0.84
515	0.86
516	0.77
517	0.69
518	0.59
519	0.49
520	0.38
521	0.29
522	0.23
523	0.13
524	0.14
525	0.11
526	0.13
527	0.14
528	0.15
529	0.14
530	0.12
531	0.13
532	0.12
533	0.13
534	0.13
535	0.13
536	0.12
537	0.12
538	0.15
539	0.19
540	0.21
541	0.21
542	0.19
543	0.2
544	0.2
545	0.2
546	0.16
547	0.13
548	0.1
549	0.12
550	0.12
551	0.14
552	0.19
553	0.23
554	0.32
555	0.41
556	0.5
557	0.56
558	0.66
559	0.73
560	0.76
561	0.76
562	0.69
563	0.6
564	0.55
565	0.54
566	0.52
567	0.49
568	0.51
569	0.52
570	0.51
571	0.54
572	0.59
573	0.58
574	0.54
575	0.53
576	0.53
577	0.52
578	0.52
579	0.54
580	0.48
581	0.44

L8X0V0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer