FuNGI

L8X8N7

Protein Details

Accession

L8X8N7

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
358-384	VTRGAGFRKEKNKKKRGIRAGGRVRSQ	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
363-380	GFRKEKNKKKRGIRAGGR

Subcellular Location(s)

nucl 16.5, cyto_nucl 13.333, cyto 9, cyto_mito 5.833

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007718 Srp40_C
Gene Ontology	GO:0005730 C:nucleolus
Pfam	View protein in Pfam PF05022 SRP40_C

Amino Acid Sequences

MSRLPGWCCKCSIGPEQSDFLADIYRAVHAFLLEQGHTKAAQAVRKAALPVVDVDAPSDTTPKSLVEVYSTQAPVPSGNPNSDDSSSSSSEDEAVASPKKVSIVDRNKPGATNGAAKASAKTAKDSNESSSSEDDSSEESSSSSSNDSNDSSDSDSDSSSDEGDENEAKSLPKPAVDSKVKPTTNGVAKPTVNGKSKAKESDSSGDSSSSSSSEESESSSEDDSGSESSSESSSSESESESESEPETQPAAKKRKVDATSSVPVPATTTTKTKTTTVATTPETVTLTKSTTTSTTTSTDGTNGKNGKQKGPRKPVVPFSRIKADDVVYADPRLMNNSFDSKGGTINDYGERASRDLIVTRGAGFRKEKNKKKRGIRAGGRVRSQGWNWMGTVVERSEGVEQGAQCLTRRSQPPSTVHQGRRVCYIHVWCQVDCFIQEGRRLENGTEGAGMAWVPTEPHADKLSNERDRSLGVCTVVEPDPLLVNQAITAVQTQQTLNVLQNLGTEAADCAARGGGYHVNLMFIMC

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.49
2	0.5
3	0.49
4	0.46
5	0.43
6	0.38
7	0.29
8	0.22
9	0.16
10	0.13
11	0.11
12	0.13
13	0.11
14	0.11
15	0.11
16	0.09
17	0.1
18	0.12
19	0.15
20	0.14
21	0.16
22	0.16
23	0.17
24	0.17
25	0.17
26	0.2
27	0.21
28	0.25
29	0.26
30	0.3
31	0.31
32	0.33
33	0.34
34	0.3
35	0.26
36	0.22
37	0.21
38	0.19
39	0.19
40	0.16
41	0.16
42	0.16
43	0.15
44	0.15
45	0.15
46	0.12
47	0.11
48	0.12
49	0.12
50	0.13
51	0.14
52	0.14
53	0.16
54	0.18
55	0.19
56	0.24
57	0.24
58	0.22
59	0.21
60	0.21
61	0.18
62	0.19
63	0.24
64	0.2
65	0.22
66	0.24
67	0.26
68	0.29
69	0.29
70	0.29
71	0.25
72	0.27
73	0.27
74	0.26
75	0.23
76	0.19
77	0.19
78	0.17
79	0.15
80	0.11
81	0.13
82	0.14
83	0.14
84	0.14
85	0.14
86	0.16
87	0.16
88	0.19
89	0.26
90	0.35
91	0.42
92	0.5
93	0.54
94	0.53
95	0.52
96	0.49
97	0.43
98	0.36
99	0.34
100	0.28
101	0.26
102	0.26
103	0.25
104	0.25
105	0.24
106	0.26
107	0.2
108	0.22
109	0.23
110	0.26
111	0.3
112	0.31
113	0.32
114	0.32
115	0.33
116	0.32
117	0.31
118	0.29
119	0.25
120	0.23
121	0.19
122	0.16
123	0.16
124	0.14
125	0.12
126	0.1
127	0.1
128	0.1
129	0.1
130	0.1
131	0.09
132	0.1
133	0.11
134	0.12
135	0.13
136	0.14
137	0.14
138	0.15
139	0.14
140	0.15
141	0.14
142	0.13
143	0.12
144	0.12
145	0.11
146	0.09
147	0.09
148	0.08
149	0.07
150	0.1
151	0.1
152	0.09
153	0.1
154	0.11
155	0.11
156	0.11
157	0.14
158	0.12
159	0.12
160	0.15
161	0.18
162	0.26
163	0.31
164	0.33
165	0.38
166	0.47
167	0.46
168	0.44
169	0.42
170	0.4
171	0.41
172	0.42
173	0.37
174	0.33
175	0.33
176	0.34
177	0.36
178	0.36
179	0.34
180	0.34
181	0.35
182	0.35
183	0.39
184	0.41
185	0.39
186	0.35
187	0.36
188	0.38
189	0.36
190	0.33
191	0.29
192	0.25
193	0.23
194	0.2
195	0.16
196	0.11
197	0.1
198	0.08
199	0.08
200	0.08
201	0.08
202	0.09
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.08
209	0.08
210	0.08
211	0.08
212	0.07
213	0.06
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.07
218	0.06
219	0.07
220	0.07
221	0.07
222	0.08
223	0.07
224	0.08
225	0.08
226	0.09
227	0.09
228	0.1
229	0.09
230	0.11
231	0.11
232	0.11
233	0.1
234	0.1
235	0.13
236	0.2
237	0.27
238	0.28
239	0.32
240	0.34
241	0.42
242	0.43
243	0.44
244	0.41
245	0.41
246	0.41
247	0.37
248	0.35
249	0.26
250	0.24
251	0.21
252	0.17
253	0.12
254	0.11
255	0.13
256	0.13
257	0.16
258	0.18
259	0.18
260	0.19
261	0.19
262	0.21
263	0.2
264	0.22
265	0.21
266	0.22
267	0.21
268	0.19
269	0.18
270	0.15
271	0.14
272	0.11
273	0.11
274	0.1
275	0.1
276	0.1
277	0.1
278	0.12
279	0.12
280	0.14
281	0.15
282	0.15
283	0.16
284	0.15
285	0.17
286	0.16
287	0.16
288	0.19
289	0.19
290	0.21
291	0.26
292	0.28
293	0.33
294	0.4
295	0.48
296	0.53
297	0.62
298	0.64
299	0.62
300	0.65
301	0.67
302	0.66
303	0.63
304	0.55
305	0.48
306	0.52
307	0.48
308	0.45
309	0.37
310	0.3
311	0.27
312	0.26
313	0.25
314	0.17
315	0.16
316	0.15
317	0.14
318	0.13
319	0.14
320	0.12
321	0.11
322	0.12
323	0.15
324	0.16
325	0.16
326	0.17
327	0.14
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.12
332	0.13
333	0.14
334	0.13
335	0.13
336	0.13
337	0.13
338	0.12
339	0.13
340	0.12
341	0.11
342	0.12
343	0.12
344	0.12
345	0.12
346	0.12
347	0.16
348	0.15
349	0.18
350	0.2
351	0.27
352	0.36
353	0.46
354	0.55
355	0.62
356	0.71
357	0.76
358	0.84
359	0.87
360	0.87
361	0.87
362	0.86
363	0.86
364	0.87
365	0.84
366	0.77
367	0.69
368	0.61
369	0.54
370	0.46
371	0.43
372	0.35
373	0.29
374	0.26
375	0.25
376	0.22
377	0.18
378	0.2
379	0.12
380	0.11
381	0.09
382	0.1
383	0.11
384	0.11
385	0.11
386	0.11
387	0.11
388	0.13
389	0.14
390	0.13
391	0.13
392	0.16
393	0.16
394	0.21
395	0.26
396	0.3
397	0.36
398	0.42
399	0.47
400	0.52
401	0.6
402	0.62
403	0.62
404	0.64
405	0.63
406	0.57
407	0.6
408	0.54
409	0.46
410	0.42
411	0.44
412	0.43
413	0.46
414	0.47
415	0.39
416	0.39
417	0.39
418	0.34
419	0.28
420	0.23
421	0.18
422	0.18
423	0.24
424	0.24
425	0.25
426	0.28
427	0.29
428	0.27
429	0.28
430	0.26
431	0.21
432	0.2
433	0.16
434	0.13
435	0.12
436	0.11
437	0.06
438	0.06
439	0.05
440	0.05
441	0.06
442	0.11
443	0.12
444	0.16
445	0.19
446	0.2
447	0.22
448	0.3
449	0.39
450	0.42
451	0.43
452	0.41
453	0.39
454	0.4
455	0.39
456	0.34
457	0.27
458	0.2
459	0.19
460	0.18
461	0.21
462	0.2
463	0.19
464	0.15
465	0.13
466	0.14
467	0.13
468	0.15
469	0.11
470	0.1
471	0.1
472	0.11
473	0.1
474	0.09
475	0.1
476	0.09
477	0.11
478	0.13
479	0.13
480	0.14
481	0.16
482	0.17
483	0.18
484	0.2
485	0.19
486	0.17
487	0.18
488	0.18
489	0.17
490	0.15
491	0.13
492	0.1
493	0.1
494	0.1
495	0.09
496	0.08
497	0.08
498	0.08
499	0.07
500	0.1
501	0.14
502	0.15
503	0.18
504	0.18
505	0.18

L8X8N7

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer