FuNGI

L8WTR0

Protein Details

Accession

L8WTR0

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.2

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
30-50	SATARRDKTPRVTTKPPSLVP	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
892-906	GRGRRRWGGGRGGGN

Subcellular Location(s)

mito 23, nucl 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR025762 DFDF IPR014720 dsRBD_dom IPR019050 FDF_dom IPR025761 FFD_box IPR025609 Lsm14-like_N IPR010920 LSM_dom_sf IPR000999 RNase_III_dom IPR036389 RNase_III_sf
Gene Ontology	GO:0005840 C:ribosome GO:0004525 F:ribonuclease III activity GO:0003723 F:RNA binding GO:0006396 P:RNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF09532 FDF PF12701 LSM14 PF14622 Ribonucleas_3_3
PROSITE	View protein in PROSITE PS51512 DFDF PS50137 DS_RBD PS51513 FFD PS50142 RNASE_3_2
CDD	cd00593 RIBOc

Amino Acid Sequences

MKPSSITIIARNIASRSSFATSSKQFLHVSATARRDKTPRVTTKPPSLVPTRPFPPPEGLSSNSDSATFDAKLWASMQPPPASALSALAARLRLSVASDANSDNTITLPLLAQIVTHPSFVDLHQRHYPHEAPPAHNGLLAALGNQLMGLFAMEWIVTTYPHLPTNVVKATVTAYVGPTTSAMIAKEWGVAPLVRWMRKVRALTKRPIYHDDALASVARAIVGLVYHANGSSVEKAREFVHAHFLSRELDIRPLLKYSDPKLALIHTVRKYQRDLLQESGRESNSPTFIVGVFSGEDKLGEGFGSSLDMAEYRAAENAMHRLYLTRQPVTNSMLPTTTFPSSLPVDDPTTSQEKPEHQFKLLELSASSSGLGSNDSKYTPGLLGDSEARYGSAGRSGIKVGSRGGAGSLSSIRRVLVIRVHPRRREGHASALHLLRRPSLPQRSRNIDLYVQQPHRIITRYSIDDIYSPRWPNHSRLLGTYAARISLTSVADIRYKGILMGINHAESTIQLSDVVSMGTESRRPPAEFIPPSDTSYGTVVFRATEVKDLAIDPTPPAAGLFRDPAVLGAGPQPPGPYGGYPQPGYGQMPMGPHGPQAGPPRGMGPPPGPHGGYPQPPQQRYMNGPPPPQNGPPPQPGKPNEQQPAQLAGASGEENAQSQPSTQGQPQAQPVRPVPSAGGVSSDIANQDAPGGTTRPNASVRSASATLEKVERAMDELRQPAPSNAPQGGRGGRRGGRGGGAQHTAGRVQVPDTDFDFEAMNAKFDKANLRPNESESDSESESEDDAPVEGDKKEKGAKFYNPQRSFFDDISSDSNLKNEGGNPVRGTWSGREECHYLTWLIGRGRGRGALGRQRREEERNRNLSTFGETGAGAGFNNGFGQGAGGFQGGSGGRGRRRWGGGRGGGNGRVGAKYTIKASIN

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.26
2	0.23
3	0.21
4	0.23
5	0.24
6	0.24
7	0.31
8	0.32
9	0.35
10	0.37
11	0.38
12	0.34
13	0.33
14	0.37
15	0.33
16	0.35
17	0.38
18	0.42
19	0.45
20	0.47
21	0.51
22	0.5
23	0.54
24	0.59
25	0.62
26	0.65
27	0.66
28	0.73
29	0.76
30	0.81
31	0.81
32	0.75
33	0.7
34	0.67
35	0.66
36	0.61
37	0.61
38	0.54
39	0.53
40	0.52
41	0.49
42	0.5
43	0.45
44	0.47
45	0.44
46	0.44
47	0.42
48	0.43
49	0.41
50	0.34
51	0.32
52	0.26
53	0.22
54	0.23
55	0.19
56	0.15
57	0.17
58	0.16
59	0.17
60	0.18
61	0.19
62	0.17
63	0.21
64	0.27
65	0.25
66	0.25
67	0.27
68	0.26
69	0.24
70	0.22
71	0.19
72	0.14
73	0.14
74	0.14
75	0.13
76	0.13
77	0.12
78	0.12
79	0.11
80	0.1
81	0.11
82	0.14
83	0.14
84	0.15
85	0.17
86	0.17
87	0.18
88	0.18
89	0.16
90	0.13
91	0.12
92	0.11
93	0.09
94	0.09
95	0.08
96	0.08
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.07
101	0.13
102	0.14
103	0.14
104	0.13
105	0.14
106	0.15
107	0.16
108	0.26
109	0.21
110	0.26
111	0.32
112	0.34
113	0.35
114	0.41
115	0.43
116	0.36
117	0.44
118	0.43
119	0.4
120	0.45
121	0.48
122	0.41
123	0.39
124	0.35
125	0.26
126	0.23
127	0.19
128	0.13
129	0.09
130	0.08
131	0.07
132	0.07
133	0.06
134	0.04
135	0.04
136	0.04
137	0.03
138	0.03
139	0.04
140	0.04
141	0.04
142	0.05
143	0.06
144	0.05
145	0.07
146	0.1
147	0.12
148	0.14
149	0.15
150	0.15
151	0.17
152	0.24
153	0.25
154	0.24
155	0.22
156	0.2
157	0.22
158	0.22
159	0.21
160	0.14
161	0.12
162	0.12
163	0.12
164	0.12
165	0.1
166	0.09
167	0.09
168	0.1
169	0.09
170	0.09
171	0.1
172	0.1
173	0.11
174	0.11
175	0.1
176	0.1
177	0.1
178	0.1
179	0.17
180	0.23
181	0.22
182	0.26
183	0.29
184	0.33
185	0.4
186	0.45
187	0.47
188	0.52
189	0.57
190	0.63
191	0.69
192	0.71
193	0.69
194	0.69
195	0.66
196	0.59
197	0.54
198	0.46
199	0.37
200	0.31
201	0.26
202	0.2
203	0.14
204	0.1
205	0.08
206	0.06
207	0.06
208	0.04
209	0.04
210	0.04
211	0.05
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.06
216	0.06
217	0.08
218	0.12
219	0.15
220	0.16
221	0.16
222	0.18
223	0.18
224	0.23
225	0.24
226	0.21
227	0.28
228	0.27
229	0.28
230	0.27
231	0.28
232	0.23
233	0.22
234	0.23
235	0.14
236	0.16
237	0.16
238	0.17
239	0.17
240	0.16
241	0.17
242	0.18
243	0.22
244	0.22
245	0.29
246	0.29
247	0.29
248	0.29
249	0.28
250	0.3
251	0.29
252	0.34
253	0.28
254	0.36
255	0.38
256	0.4
257	0.42
258	0.42
259	0.45
260	0.43
261	0.44
262	0.42
263	0.45
264	0.43
265	0.43
266	0.41
267	0.36
268	0.3
269	0.28
270	0.24
271	0.2
272	0.18
273	0.16
274	0.13
275	0.12
276	0.13
277	0.11
278	0.09
279	0.07
280	0.07
281	0.08
282	0.07
283	0.07
284	0.06
285	0.06
286	0.05
287	0.05
288	0.04
289	0.04
290	0.04
291	0.05
292	0.04
293	0.04
294	0.04
295	0.04
296	0.05
297	0.05
298	0.06
299	0.05
300	0.06
301	0.06
302	0.07
303	0.08
304	0.11
305	0.11
306	0.1
307	0.1
308	0.11
309	0.14
310	0.2
311	0.23
312	0.21
313	0.22
314	0.24
315	0.27
316	0.3
317	0.31
318	0.25
319	0.22
320	0.21
321	0.2
322	0.2
323	0.2
324	0.16
325	0.13
326	0.12
327	0.15
328	0.15
329	0.15
330	0.15
331	0.13
332	0.15
333	0.15
334	0.15
335	0.15
336	0.18
337	0.17
338	0.18
339	0.19
340	0.21
341	0.25
342	0.32
343	0.31
344	0.29
345	0.3
346	0.29
347	0.33
348	0.28
349	0.24
350	0.17
351	0.17
352	0.16
353	0.15
354	0.14
355	0.07
356	0.07
357	0.07
358	0.08
359	0.07
360	0.07
361	0.08
362	0.08
363	0.09
364	0.09
365	0.1
366	0.08
367	0.08
368	0.07
369	0.06
370	0.08
371	0.09
372	0.09
373	0.09
374	0.08
375	0.08
376	0.08
377	0.08
378	0.07
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.09
383	0.1
384	0.11
385	0.12
386	0.13
387	0.1
388	0.11
389	0.1
390	0.09
391	0.09
392	0.07
393	0.07
394	0.06
395	0.09
396	0.08
397	0.08
398	0.09
399	0.08
400	0.09
401	0.1
402	0.11
403	0.13
404	0.2
405	0.29
406	0.39
407	0.46
408	0.47
409	0.51
410	0.53
411	0.53
412	0.54
413	0.47
414	0.46
415	0.43
416	0.43
417	0.42
418	0.4
419	0.36
420	0.3
421	0.28
422	0.21
423	0.18
424	0.18
425	0.22
426	0.29
427	0.35
428	0.4
429	0.46
430	0.51
431	0.54
432	0.54
433	0.49
434	0.41
435	0.37
436	0.34
437	0.35
438	0.29
439	0.28
440	0.25
441	0.23
442	0.23
443	0.23
444	0.19
445	0.15
446	0.18
447	0.18
448	0.19
449	0.19
450	0.17
451	0.17
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.17
457	0.22
458	0.23
459	0.25
460	0.31
461	0.32
462	0.29
463	0.29
464	0.32
465	0.29
466	0.28
467	0.26
468	0.19
469	0.14
470	0.13
471	0.12
472	0.09
473	0.09
474	0.09
475	0.07
476	0.08
477	0.09
478	0.1
479	0.1
480	0.1
481	0.08
482	0.08
483	0.08
484	0.08
485	0.1
486	0.09
487	0.12
488	0.12
489	0.12
490	0.12
491	0.12
492	0.1
493	0.08
494	0.09
495	0.06
496	0.05
497	0.05
498	0.05
499	0.06
500	0.06
501	0.06
502	0.04
503	0.04
504	0.04
505	0.05
506	0.07
507	0.07
508	0.1
509	0.13
510	0.13
511	0.15
512	0.17
513	0.26
514	0.25
515	0.28
516	0.31
517	0.3
518	0.31
519	0.3
520	0.27
521	0.2
522	0.19
523	0.17
524	0.11
525	0.1
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.09
530	0.08
531	0.1
532	0.1
533	0.09
534	0.1
535	0.1
536	0.11
537	0.1
538	0.1
539	0.08
540	0.08
541	0.08
542	0.07
543	0.07
544	0.06
545	0.06
546	0.07
547	0.08
548	0.08
549	0.08
550	0.08
551	0.08
552	0.09
553	0.08
554	0.07
555	0.09
556	0.1
557	0.11
558	0.11
559	0.11
560	0.1
561	0.12
562	0.12
563	0.09
564	0.1
565	0.14
566	0.17
567	0.17
568	0.18
569	0.17
570	0.18
571	0.18
572	0.16
573	0.13
574	0.12
575	0.12
576	0.13
577	0.13
578	0.12
579	0.11
580	0.12
581	0.11
582	0.14
583	0.2
584	0.23
585	0.22
586	0.22
587	0.24
588	0.24
589	0.24
590	0.22
591	0.19
592	0.19
593	0.21
594	0.23
595	0.21
596	0.2
597	0.25
598	0.27
599	0.29
600	0.29
601	0.33
602	0.39
603	0.39
604	0.42
605	0.41
606	0.4
607	0.41
608	0.47
609	0.48
610	0.45
611	0.49
612	0.51
613	0.52
614	0.52
615	0.48
616	0.46
617	0.44
618	0.44
619	0.47
620	0.47
621	0.46
622	0.51
623	0.51
624	0.53
625	0.53
626	0.56
627	0.53
628	0.51
629	0.5
630	0.44
631	0.46
632	0.38
633	0.31
634	0.23
635	0.17
636	0.16
637	0.14
638	0.11
639	0.07
640	0.06
641	0.07
642	0.07
643	0.07
644	0.06
645	0.06
646	0.09
647	0.12
648	0.14
649	0.15
650	0.21
651	0.22
652	0.26
653	0.33
654	0.38
655	0.37
656	0.39
657	0.4
658	0.39
659	0.38
660	0.35
661	0.28
662	0.24
663	0.23
664	0.18
665	0.18
666	0.13
667	0.14
668	0.13
669	0.13
670	0.1
671	0.09
672	0.09
673	0.07
674	0.07
675	0.06
676	0.07
677	0.08
678	0.09
679	0.09
680	0.13
681	0.14
682	0.17
683	0.2
684	0.2
685	0.22
686	0.23
687	0.23
688	0.26
689	0.26
690	0.23
691	0.23
692	0.23
693	0.21
694	0.21
695	0.19
696	0.14
697	0.14
698	0.13
699	0.13
700	0.14
701	0.15
702	0.17
703	0.21
704	0.21
705	0.23
706	0.24
707	0.23
708	0.27
709	0.27
710	0.27
711	0.27
712	0.27
713	0.26
714	0.29
715	0.33
716	0.31
717	0.31
718	0.33
719	0.33
720	0.35
721	0.36
722	0.33
723	0.3
724	0.3
725	0.3
726	0.28
727	0.27
728	0.24
729	0.23
730	0.22
731	0.2
732	0.18
733	0.16
734	0.12
735	0.11
736	0.15
737	0.15
738	0.16
739	0.18
740	0.2
741	0.19
742	0.19
743	0.19
744	0.14
745	0.18
746	0.16
747	0.16
748	0.13
749	0.14
750	0.14
751	0.15
752	0.23
753	0.22
754	0.31
755	0.34
756	0.41
757	0.42
758	0.44
759	0.49
760	0.44
761	0.42
762	0.36
763	0.35
764	0.29
765	0.28
766	0.25
767	0.2
768	0.18
769	0.17
770	0.14
771	0.1
772	0.09
773	0.09
774	0.09
775	0.1
776	0.1
777	0.12
778	0.12
779	0.15
780	0.23
781	0.25
782	0.3
783	0.35
784	0.44
785	0.52
786	0.61
787	0.69
788	0.67
789	0.67
790	0.66
791	0.66
792	0.62
793	0.52
794	0.46
795	0.36
796	0.34
797	0.34
798	0.32
799	0.27
800	0.22
801	0.23
802	0.2
803	0.19
804	0.18
805	0.16
806	0.22
807	0.25
808	0.28
809	0.29
810	0.29
811	0.31
812	0.3
813	0.32
814	0.27
815	0.32
816	0.32
817	0.32
818	0.34
819	0.35
820	0.36
821	0.35
822	0.33
823	0.24
824	0.22
825	0.23
826	0.25
827	0.23
828	0.26
829	0.26
830	0.26
831	0.28
832	0.28
833	0.27
834	0.27
835	0.34
836	0.39
837	0.47
838	0.52
839	0.55
840	0.59
841	0.65
842	0.68
843	0.71
844	0.71
845	0.73
846	0.74
847	0.73
848	0.69
849	0.63
850	0.56
851	0.51
852	0.41
853	0.31
854	0.23
855	0.18
856	0.17
857	0.16
858	0.15
859	0.09
860	0.09
861	0.08
862	0.07
863	0.07
864	0.07
865	0.06
866	0.06
867	0.07
868	0.06
869	0.06
870	0.07
871	0.07
872	0.06
873	0.06
874	0.09
875	0.08
876	0.1
877	0.14
878	0.19
879	0.24
880	0.28
881	0.33
882	0.37
883	0.44
884	0.5
885	0.53
886	0.57
887	0.59
888	0.61
889	0.63
890	0.61
891	0.57
892	0.51
893	0.46
894	0.37
895	0.31
896	0.27
897	0.25
898	0.23
899	0.23
900	0.24

L8WTR0

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer