Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

E3RT55

Protein Details
Accession E3RT55    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
581-601DGKPAAKKVKKETKVKGEDGDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
565-594RGKPVEKKRPAGGTDADGKPAAKKVKKETK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 12, cyto 6.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006165  Ku70  
IPR006164  Ku70/Ku80_beta-barrel_dom  
IPR027388  Ku70_bridge/pillars_dom_sf  
IPR047087  KU70_core_dom  
IPR005160  Ku_C  
IPR005161  Ku_N  
IPR003034  SAP_dom  
IPR036361  SAP_dom_sf  
IPR016194  SPOC-like_C_dom_sf  
IPR036465  vWFA_dom_sf  
Gene Ontology GO:0099115  C:chromosome, subtelomeric region  
GO:0140445  C:chromosome, telomeric repeat region  
GO:0043564  C:Ku70:Ku80 complex  
GO:0005721  C:pericentric heterochromatin  
GO:0035861  C:site of double-strand break  
GO:0005524  F:ATP binding  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0003678  F:DNA helicase activity  
GO:0016787  F:hydrolase activity  
GO:0042162  F:telomeric DNA binding  
GO:0006310  P:DNA recombination  
GO:0006303  P:double-strand break repair via nonhomologous end joining  
GO:0120290  P:stalled replication fork localization to nuclear periphery  
GO:0000723  P:telomere maintenance  
KEGG pte:PTT_12162  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02735  Ku  
PF03730  Ku_C  
PF03731  Ku_N  
CDD cd00788  KU70  
cd01458  vWA_ku  
Amino Acid Sequences MADPQDNRPGEEEEEEEDVEEPNYKTIKDAVLFAIDVSPSMLQQPPKSDNKKAERDSPTSAALKCAYQLMQQRIISNPNDMMGILLFGTEKTDMGDGDNAFEHCYLLADLDVPSAQDVKRLRDLVDNEEEAEEILKPAKGGASISNVLFCANQIFTTKAPNFSSRRLFLVTDNDYPVKVKADKDTAVTRARDLYDLGCTIDLFPISQPDHSFDRSRFYDDLVYPTSPSDPDAPVAIPSTTKVAKSGEGISLLKQLISSINSKATPRRALFSLPLELGPDFRIGVKGYILIKRQEHIKSCYIWVGGEKPQIATSSTAQISDDISRNIEKAEIRKAYKFGGDAITFTPEEITQIRQCFGEPIIRIIGFKPLSSVPIWANTNKSIFIYPSETDYIGSTRVFSALQQKLIKSKKMGLVWFIARRNAAPTLAALIPGAEKINGDGEQTMPPGLWLVPLPFADDIRQFPTPPEQPLKTTDALTDKMRLIIEQLQLPKGIYDPSKYPNPDLQWFYRILQALALEEELPDHPDDKTIPRYKQIDKRCGEYIEDYGKEFQEAYAQQHSEALAHRGKPVEKKRPAGGTDADGKPAAKKVKKETKVKGEDGDGEDGLTDEQMAELNNSGQISKQTVAVLKQWLSSRNQSIAGKKAGLLERVQDYLERKGL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.25
3 0.22
4 0.19
5 0.17
6 0.15
7 0.17
8 0.14
9 0.16
10 0.17
11 0.17
12 0.18
13 0.2
14 0.25
15 0.22
16 0.24
17 0.22
18 0.23
19 0.23
20 0.22
21 0.21
22 0.15
23 0.14
24 0.13
25 0.11
26 0.09
27 0.12
28 0.15
29 0.17
30 0.21
31 0.28
32 0.34
33 0.44
34 0.5
35 0.55
36 0.62
37 0.68
38 0.75
39 0.73
40 0.75
41 0.73
42 0.72
43 0.7
44 0.64
45 0.59
46 0.54
47 0.49
48 0.43
49 0.37
50 0.32
51 0.26
52 0.26
53 0.21
54 0.22
55 0.3
56 0.32
57 0.38
58 0.39
59 0.41
60 0.41
61 0.45
62 0.41
63 0.36
64 0.31
65 0.24
66 0.22
67 0.2
68 0.17
69 0.12
70 0.11
71 0.07
72 0.06
73 0.06
74 0.05
75 0.07
76 0.07
77 0.07
78 0.07
79 0.08
80 0.08
81 0.1
82 0.14
83 0.13
84 0.14
85 0.16
86 0.15
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.09
91 0.1
92 0.09
93 0.07
94 0.07
95 0.07
96 0.07
97 0.08
98 0.08
99 0.07
100 0.07
101 0.1
102 0.09
103 0.14
104 0.16
105 0.21
106 0.27
107 0.29
108 0.3
109 0.34
110 0.37
111 0.38
112 0.42
113 0.37
114 0.32
115 0.3
116 0.29
117 0.22
118 0.2
119 0.13
120 0.08
121 0.09
122 0.08
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.08
127 0.1
128 0.11
129 0.15
130 0.17
131 0.17
132 0.18
133 0.17
134 0.17
135 0.16
136 0.13
137 0.1
138 0.09
139 0.09
140 0.1
141 0.12
142 0.12
143 0.21
144 0.22
145 0.25
146 0.27
147 0.33
148 0.35
149 0.4
150 0.46
151 0.4
152 0.41
153 0.39
154 0.37
155 0.33
156 0.37
157 0.36
158 0.32
159 0.33
160 0.3
161 0.28
162 0.28
163 0.26
164 0.22
165 0.2
166 0.2
167 0.21
168 0.26
169 0.27
170 0.3
171 0.32
172 0.33
173 0.36
174 0.35
175 0.31
176 0.29
177 0.28
178 0.25
179 0.23
180 0.19
181 0.15
182 0.15
183 0.15
184 0.12
185 0.11
186 0.1
187 0.1
188 0.09
189 0.07
190 0.07
191 0.11
192 0.11
193 0.13
194 0.13
195 0.16
196 0.19
197 0.21
198 0.25
199 0.21
200 0.27
201 0.27
202 0.31
203 0.28
204 0.26
205 0.29
206 0.26
207 0.3
208 0.26
209 0.25
210 0.21
211 0.21
212 0.2
213 0.14
214 0.15
215 0.13
216 0.11
217 0.11
218 0.12
219 0.12
220 0.11
221 0.12
222 0.11
223 0.09
224 0.08
225 0.11
226 0.11
227 0.11
228 0.12
229 0.12
230 0.13
231 0.15
232 0.16
233 0.14
234 0.16
235 0.16
236 0.15
237 0.17
238 0.16
239 0.14
240 0.12
241 0.11
242 0.1
243 0.12
244 0.13
245 0.11
246 0.14
247 0.15
248 0.17
249 0.2
250 0.24
251 0.29
252 0.28
253 0.29
254 0.28
255 0.29
256 0.3
257 0.29
258 0.27
259 0.2
260 0.19
261 0.17
262 0.16
263 0.15
264 0.12
265 0.1
266 0.07
267 0.07
268 0.08
269 0.07
270 0.08
271 0.07
272 0.1
273 0.12
274 0.15
275 0.17
276 0.2
277 0.2
278 0.21
279 0.27
280 0.28
281 0.29
282 0.3
283 0.31
284 0.29
285 0.3
286 0.3
287 0.24
288 0.2
289 0.17
290 0.16
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.14
295 0.15
296 0.15
297 0.15
298 0.14
299 0.12
300 0.14
301 0.13
302 0.13
303 0.13
304 0.12
305 0.13
306 0.13
307 0.13
308 0.09
309 0.1
310 0.1
311 0.1
312 0.1
313 0.11
314 0.1
315 0.11
316 0.18
317 0.21
318 0.23
319 0.24
320 0.26
321 0.25
322 0.25
323 0.22
324 0.17
325 0.17
326 0.15
327 0.14
328 0.14
329 0.15
330 0.13
331 0.13
332 0.12
333 0.07
334 0.09
335 0.08
336 0.11
337 0.11
338 0.12
339 0.13
340 0.13
341 0.13
342 0.13
343 0.13
344 0.15
345 0.12
346 0.13
347 0.14
348 0.14
349 0.14
350 0.13
351 0.18
352 0.14
353 0.14
354 0.14
355 0.13
356 0.14
357 0.14
358 0.16
359 0.1
360 0.15
361 0.17
362 0.16
363 0.18
364 0.18
365 0.19
366 0.17
367 0.17
368 0.14
369 0.12
370 0.13
371 0.15
372 0.13
373 0.15
374 0.16
375 0.15
376 0.15
377 0.15
378 0.14
379 0.11
380 0.11
381 0.09
382 0.08
383 0.08
384 0.08
385 0.08
386 0.17
387 0.18
388 0.23
389 0.24
390 0.25
391 0.32
392 0.36
393 0.38
394 0.31
395 0.34
396 0.35
397 0.37
398 0.37
399 0.32
400 0.32
401 0.34
402 0.37
403 0.34
404 0.3
405 0.26
406 0.25
407 0.26
408 0.23
409 0.18
410 0.13
411 0.11
412 0.13
413 0.13
414 0.12
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.08
420 0.05
421 0.05
422 0.05
423 0.08
424 0.08
425 0.08
426 0.08
427 0.09
428 0.1
429 0.11
430 0.1
431 0.08
432 0.07
433 0.07
434 0.07
435 0.06
436 0.06
437 0.06
438 0.08
439 0.09
440 0.1
441 0.1
442 0.11
443 0.12
444 0.13
445 0.14
446 0.16
447 0.17
448 0.16
449 0.17
450 0.24
451 0.25
452 0.28
453 0.33
454 0.31
455 0.32
456 0.36
457 0.39
458 0.33
459 0.31
460 0.29
461 0.26
462 0.27
463 0.27
464 0.26
465 0.21
466 0.22
467 0.22
468 0.18
469 0.18
470 0.2
471 0.21
472 0.22
473 0.24
474 0.22
475 0.23
476 0.23
477 0.2
478 0.16
479 0.17
480 0.14
481 0.15
482 0.17
483 0.22
484 0.29
485 0.31
486 0.33
487 0.36
488 0.39
489 0.42
490 0.44
491 0.43
492 0.39
493 0.39
494 0.37
495 0.35
496 0.31
497 0.25
498 0.21
499 0.18
500 0.15
501 0.14
502 0.13
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.08
507 0.09
508 0.09
509 0.09
510 0.09
511 0.1
512 0.13
513 0.16
514 0.26
515 0.32
516 0.34
517 0.41
518 0.47
519 0.54
520 0.61
521 0.66
522 0.67
523 0.62
524 0.64
525 0.61
526 0.57
527 0.51
528 0.45
529 0.41
530 0.38
531 0.36
532 0.33
533 0.3
534 0.28
535 0.26
536 0.23
537 0.17
538 0.17
539 0.18
540 0.21
541 0.25
542 0.25
543 0.25
544 0.26
545 0.26
546 0.22
547 0.22
548 0.23
549 0.21
550 0.21
551 0.24
552 0.27
553 0.31
554 0.39
555 0.48
556 0.53
557 0.56
558 0.61
559 0.65
560 0.69
561 0.66
562 0.62
563 0.55
564 0.49
565 0.5
566 0.45
567 0.4
568 0.33
569 0.32
570 0.28
571 0.32
572 0.36
573 0.33
574 0.39
575 0.48
576 0.58
577 0.66
578 0.74
579 0.78
580 0.8
581 0.83
582 0.8
583 0.74
584 0.67
585 0.64
586 0.58
587 0.51
588 0.4
589 0.31
590 0.27
591 0.23
592 0.18
593 0.12
594 0.08
595 0.04
596 0.05
597 0.05
598 0.06
599 0.06
600 0.07
601 0.08
602 0.1
603 0.11
604 0.11
605 0.11
606 0.13
607 0.16
608 0.16
609 0.18
610 0.19
611 0.22
612 0.25
613 0.28
614 0.31
615 0.28
616 0.32
617 0.34
618 0.35
619 0.38
620 0.43
621 0.45
622 0.42
623 0.47
624 0.48
625 0.5
626 0.53
627 0.52
628 0.45
629 0.41
630 0.45
631 0.43
632 0.41
633 0.37
634 0.35
635 0.33
636 0.33
637 0.33
638 0.29
639 0.28